GBS(测序基因分型)以前被证明是一种经济高效且可靠的方法,可用于对几种牧草进行基因分型 [1; 2]。GBS 通过使用限制性酶来限制要扩增和测序的基因组部分(基因座)来降低基因组的复杂性 [3]。在某些情况下,当基因座数量相对于测序工作量而言很高时,就会生成许多基因座缺失数据的基因分型矩阵。因此,需要优化 GBS 协议以获得最多的基因座数量和最少的缺失数据比例。我们测试了几种限制性酶,并评估了在紫苜蓿(Medicago sativa)和鸭茅(Dactylis glomerata)两个物种中获得的基因座数量。对于紫苜蓿,我们还确定了在 1 066 个种质中获得的 SNP 和缺失数据的数量。
与韩国的车辆(以下称杀手)发生碰撞已成为这些动物的重大危害。先前的一项研究估计,每年大约有60,000辆鹿在韩国道路上死亡(4)。另一项研究表明,从2004年到2019年,韩国的甘旺省的道路杀伤事故数量最多,水鹿构成最大的比例(5)。Roadkill不仅是环境问题,而且是公共卫生问题。定期记录此类事件的欧洲国家的数据表明,与鹿相关的事故中有2-5%通常导致人类伤害。在欧洲大陆,据估计,由于与蹄子的野生动植物发生碰撞,大约有300人丧生,每年30,000人受伤(6)。此外,随着野生动物尸体分解,它们为tick传播的细菌病原体创造了理想的繁殖地,吸引了威胁附近人群的疾病媒介(7)。此外,鹿道路杀手也有巨大的财务成本。在美国,国家公路交通安全管理局报告说,1996年俄亥俄州立大学造成的鹿车祸损失超过5200万美元(8)。更多的研究估计,这一成本每年高达11亿美元(9),平均汽车维修费用从密歇根州的648美元到宾夕法尼亚州的1,000–2,000美元不等(10,11)。
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本(未经同行评审认证)提供的,他已授予Biorxiv的许可证,以在2025年1月27日发布的此版本中显示此版本的版权持有人。 https://doi.org/10.1101/2025.01.27.634676 doi:Biorxiv Preprint
在生态学和进化领域,大多数旨在将基因型与表型联系起来的研究很少使用功能工具来验证已识别的基因座。RNA 干扰 (RNAi) 和成簇的规律间隔回文重复序列 (CRISPR)-Cas 基因组编辑的最新发展大大提高了功能验证的可行性。然而,当应用于新兴模式生物时,这些方法面临着特定的挑战,包括基因沉默的空间控制有限、敲入效率低和功能验证的通量低。此外,迄今为止的许多功能研究并没有重现生态相关的变异,这限制了它们对进化过程的更深入了解范围。因此,我们认为,通过同源定向修复 (HDR) 进行等位基因替换的基因编辑的增加使用将极大地有利于生态学和进化领域。
(稿件收到日期 2024 年 8 月 17 日;接受日期 2025 年 1 月 15 日;在线发表日期 2025 年 1 月 25 日)摘要:根据形态特征和核糖体 DNA 区域内部转录间隔区的系统发育分析,本文将 Coltricia sharmae 列为一个新物种。形态学和分子数据的结合证实了该物种的新颖性及其在 Coltricia 属中的属下位置。该物种与 Rhododendron arboreum 和 Quercus leucotrichophora 相关,主要特征是一年生担子,规则圆形的菌盖,同心分区,中心有深褐色环,边缘为淡橙褐色,不规则有棱角,担孢子球形至亚球形。关键词:Coltricia abieticola、nrITS、系统发育、多孔菌、分类学、北阿坎德邦。简介
。cc-by 4.0国际许可证是根据作者/资助者提供的,他已授予MedRxiv的许可证,以永久显示预印本。(未通过同行评审认证)
在我们先前对韩国的enchytraeid(Clitellata)动物区系的研究中,我们描述了30种新物种和两个新属(Dózsa-Farkas&Hong&Hong,Christensen&Dózsa-Farkas,20122015,Hong&Dózsa-farkas 2018,Dózsa-Farkas等。 2018,2019a,2019b,Felföldi等。 2020,Dózsa-Farkas等。 2022)。 这些新物种的类型地区分布在宽阔的地理区域,涵盖了韩国大陆和济州岛岛,其中在包括森林土壤及其垃圾层在内的一系列栖息地类型中收集了标本,以及耕种的农业领域和草地的土壤(Felfelldi等。 2020,Dózsa-Farkas等。 2022)。 2016年9月,从Seongsan Ilchulbong Tuff锥和Mt. 中收集了土壤样品 baekam国家公园,其中我们确定了一种新的小脆性物种,而2018年10月,在从山>>山中收集的土壤样品中,还确定了另外两种新的Mesenchytraeus物种。 Gwaebangsan和Mt. jeombong。 与上述先前的研究一致,在我们对这些新物种候选物的标本的分析过程中,对邻苯二甲酸的形态学观察补充了靶向线粒体胞浆胞浆c氧化酶c氧化酶亚基1(CO1)基因的分子分类分析,核核核核核苷(CO1)的核核核苷(CO1)核心核心(CO1)(CO1)的3.基因。2015,Hong&Dózsa-farkas 2018,Dózsa-Farkas等。2018,2019a,2019b,Felföldi等。2020,Dózsa-Farkas等。 2022)。 这些新物种的类型地区分布在宽阔的地理区域,涵盖了韩国大陆和济州岛岛,其中在包括森林土壤及其垃圾层在内的一系列栖息地类型中收集了标本,以及耕种的农业领域和草地的土壤(Felfelldi等。 2020,Dózsa-Farkas等。 2022)。 2016年9月,从Seongsan Ilchulbong Tuff锥和Mt. 中收集了土壤样品 baekam国家公园,其中我们确定了一种新的小脆性物种,而2018年10月,在从山>>山中收集的土壤样品中,还确定了另外两种新的Mesenchytraeus物种。 Gwaebangsan和Mt. jeombong。 与上述先前的研究一致,在我们对这些新物种候选物的标本的分析过程中,对邻苯二甲酸的形态学观察补充了靶向线粒体胞浆胞浆c氧化酶c氧化酶亚基1(CO1)基因的分子分类分析,核核核核核苷(CO1)的核核核苷(CO1)核心核心(CO1)(CO1)的3.基因。2020,Dózsa-Farkas等。2022)。这些新物种的类型地区分布在宽阔的地理区域,涵盖了韩国大陆和济州岛岛,其中在包括森林土壤及其垃圾层在内的一系列栖息地类型中收集了标本,以及耕种的农业领域和草地的土壤(Felfelldi等。2020,Dózsa-Farkas等。 2022)。 2016年9月,从Seongsan Ilchulbong Tuff锥和Mt. 中收集了土壤样品 baekam国家公园,其中我们确定了一种新的小脆性物种,而2018年10月,在从山>>山中收集的土壤样品中,还确定了另外两种新的Mesenchytraeus物种。 Gwaebangsan和Mt. jeombong。 与上述先前的研究一致,在我们对这些新物种候选物的标本的分析过程中,对邻苯二甲酸的形态学观察补充了靶向线粒体胞浆胞浆c氧化酶c氧化酶亚基1(CO1)基因的分子分类分析,核核核核核苷(CO1)的核核核苷(CO1)核心核心(CO1)(CO1)的3.基因。2020,Dózsa-Farkas等。2022)。2016年9月,从Seongsan Ilchulbong Tuff锥和Mt.baekam国家公园,其中我们确定了一种新的小脆性物种,而2018年10月,在从山>>山中收集的土壤样品中,还确定了另外两种新的Mesenchytraeus物种。Gwaebangsan和Mt.jeombong。与上述先前的研究一致,在我们对这些新物种候选物的标本的分析过程中,对邻苯二甲酸的形态学观察补充了靶向线粒体胞浆胞浆c氧化酶c氧化酶亚基1(CO1)基因的分子分类分析,核核核核核苷(CO1)的核核核苷(CO1)核心核心(CO1)(CO1)的3.基因。
3在Tegner Anker,H&Egelund Olsen,B:EU物种保护法律和风能中,可以找到有关RED III和EUS生物多样性义务的讨论的宝贵贡献:当前的挑战和丹麦经验(欧洲能源和环境法评论,2023年2月2023日,欧洲能源和环境法)36–47),Malafry,M:可再生能源活动 - 超越生物多样性的利益?(在håll-barhet ur etträttsligtperspektiv,de lege,uppsala Universitet的法律学院2022年。Iustus 2023),Jendroska,J Anapyaova,A:迈向绿色能源转移:重新指令与环境ACQIS?环境法国际网络(ELNI)2023 pp。1-5和Montini,M:解决与气候相关的可再生能源目标与环境保护利益之间的冲突(欧洲法律公开赛(2024年),pp。 209–219剑桥大学出版社)。 Fur- ther, there are also quite a few scholarly contributions on RED III within the discourse of Energy law, out of which Seeking to deliver renewable energy infrastructure within a ‘incomplete and vague' legal framework (Carbon and Climate Law review (CCLR) 2022 pp. 192–204)以及气候,能量和环境? 欧盟环境法与欧盟气候法的实施现实的和解(气候法2022页。 242–272),均可提及艾莉森·哈迪曼(Alison Hardiman)。 至于环境问题,我从未遇到过这种当地对动植物和动物群的影响是决定性的,至少与欧盟自然指令的应用无关。1-5和Montini,M:解决与气候相关的可再生能源目标与环境保护利益之间的冲突(欧洲法律公开赛(2024年),pp。209–219剑桥大学出版社)。Fur- ther, there are also quite a few scholarly contributions on RED III within the discourse of Energy law, out of which Seeking to deliver renewable energy infrastructure within a ‘incomplete and vague' legal framework (Carbon and Climate Law review (CCLR) 2022 pp.192–204)以及气候,能量和环境?欧盟环境法与欧盟气候法的实施现实的和解(气候法2022页。242–272),均可提及艾莉森·哈迪曼(Alison Hardiman)。至于环境问题,我从未遇到过这种当地对动植物和动物群的影响是决定性的,至少与欧盟自然指令的应用无关。即使在这种话语中的legal学者解决了气候与生物多样性之间的真正冲突,但从它们的角度讨论这些问题是一项挑战,因为人们普遍认为,将兴趣的利益描述为“障碍”,但据此,允许机构和法庭对“当地的植物群和Fau-na na-na”的兴趣,以及与之相关的兴趣。关于当地社区的反对,《能源法》话语中的总体主题似乎是需要减少公众参与和司法公众的要求。奇怪的是,这些想法似乎仅适用于有关的公众,而不是对操作员。在这里,我将自己的讨论划分为讨论,因为我将司法保护的原则视为欧盟内部环境民主的关键支柱之一,这可能不会受到质疑。
摘要:环境 DNA (eDNA) 有可能在稀有和濒危水生物种调查中发挥重要作用。eDNA 采样是一种非侵入性技术,对于难以调查的小型隐蔽物种,它可能是一种比传统技术更可行、更有效且更便宜的替代方法。我们使用 eDNA 调查了美国新墨西哥州查韦斯县苦湖国家野生动物保护区的 5 种濒危春季特有物种。2018 年 7 月对泉水中的 40 个水样进行了评估,以确定其中是否存在 Gambusia nobilis、Gammarus desperatus、Juturnia kosteri、Pyrgulopsis roswellensis 和 Assiminea pecos 的残留 DNA。我们在 50% 的地点检测到了 G. nobilis 的 eDNA,在 42.5% 的地点检测到了 J. kosteri 的 eDNA,在 27.5% 的地点检测到了 P. roswellensis 的 eDNA,在 20% 的地点检测到了 G. desperatus 的 eDNA,但在任何地点均未检测到 A. pecos eDNA。我们还研究了影响这些濒危物种占用模式的栖息地条件,并制定了栖息地参数阈值,以指导保护决策。盐度和溶解氧影响 G. desperatus 、 P. roswellensis 和 J. kosteri 的样本占用率,但只有溶解氧影响 G. nobilis 的样本占用率。结果强调了使用 eDNA 监测 5 种春季特有物种中的 4 种的有效性,并深入了解了每种物种的栖息地偏好,这将有助于推动保护活动。关键词:濒危物种·eDNA·占用·湿地·软体动物·鱼类
作物驯化是由植物与人之间的共同进化过程产生的,从而为人类提供了可预测和改善的资源。在成千上万的食用物种中,许多是为食物收集或种植的,但只有少数人被驯化,甚至更少的人类消耗的基于植物的卡路里。为什么不了解这么少的物种变得完全圆顶。在这里,我们提出了植物基因组和表型的三个方面,这些方面只能促进少数几个野生植物的驯化,即可塑性,性状链接和突变率的差异。我们可以利用当代生物学知识来识别为什么只有某些物种适合驯化的因素。这些研究将促进未来的驯化和改进工作。
