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DHX36 通过解开 G‐ 来维持基因组完整性...
含有假定的 G-四链体形成序列的寡核苷酸（PQS；G ≥ 3 N x G ≥ 3 N x G ≥ 3 N x G ≥ 3）在阳离子存在下的生理缓冲条件下（Bochman 等人，2012 年）。由于其高热力学稳定性，组装的 G4 需要通过酶促分解。已经开发出体外用于监测 G4 形成的方法（Balasubramanian 等人，2011 年；Bryan 和 Baumann，2011 年）。使用这些方法已经证明了分解 G4 的酶活性。这些酶包括具有 G4 结合和解旋活性的 DNA 解旋酶，例如 BLM、WRN、PIF1、FANCJ、XPD、DNA2 和 RTEL1（Bochman 等人，2012 年；Maizels，2015 年）。使用计算机分析或荧光成像、免疫沉淀或 pull-down 实验来预测体内 G4 的形成，使用有价值的工具 - 例如特异性识别 G4 的免疫球蛋白和单链可变片段 (scFv) (Henderson 等人，2013)、G4 结合化合物 (Mendoza 等人，2016) 或 G4 结合蛋白 (Maizels，2015)。使用这些工具，可以通过免疫沉淀或针对纯化的基因组 DNA 或染色质的 pull-down 来识别 G4 位点，并且这些位点中的很大一部分重现了 PQS (Chambers 等人，2015；Hänsel-Hertsch 等人，2016；Lam 等人，2013；Muller 等人，2010)。 PQS 在基因的调控区（例如启动子、内含子或非翻译区 [UTR]）中过度表达，包括致癌基因、重复区（例如端粒和 rDNA）和复制起点 (Maizels & Gray, 2013 )。使用抗体在人类细胞中进行的全基因组 G4 映射揭示了 G4 存在于基因调控区和端粒中 (Hänsel-Hertsch et al., 2016 ; Liu et al., 2016 )。许多 G4 被映射在转录起始位点周围，G4 形成的频率与相应基因的转录水平呈正相关 (Spiegel et al., 2021 ; Zheng et al., 2020 )。使用抗体对 G4-DNA 进行荧光标记，显示细胞核或染色体上存在颗粒状信号；一些信号位于端粒或着丝粒上 (Biffi et al., 2013; Henderson et al., 2013)。使用荧光标记化合物对 G4- DNA 进行可视化，可显示位于核仁中的较大信号，以及位于细胞核中的一些较小信号 (Rodriguez et al., 2012)，或整个细胞核中均匀分布的信号 (Shivalingam et al., 2015)。然而，人们对使用体内成像获得的许多未表征信号的亚细胞或基因组位置了解甚少。越来越多的证据表明，在基因体内或周围形成的 G4 通过促进或抑制转录来调节基因活性 (Bochman et al., 2012; Mendoza et al., 2016)。尽管具有这些生物学含义，但 G4 在空间上阻碍了 DNA 复制和转录 (Bochman et al., 2012; Maizels, 2015)。这些生物事件的拖延会增加基因毒性损害的风险；G4 结构清除不足可能
重复元素处 R 环的调节和功能 - ArTS
R 环是一种非典型的三链核酸结构，包含一段 RNA：DNA 杂合体和一个不成对的单链 DNA 环。R 环具有生理相关性，可作为基因表达、染色质结构、DNA 损伤修复和 DNA 复制的调节剂。然而，非计划和持续的 R 环具有诱变性，可介导复制-转录冲突，如果不加以控制，会导致 DNA 损伤和基因组不稳定。详细的转录组分析表明，85% 的人类基因组（包括重复区域）都具有转录活性。这预示着 R 环管理在基因组的调控和完整性中起着核心作用。预计此功能对占人类基因组 75% 的重复序列具有特别的相关性。在这里，我们回顾了 R 环对着丝粒、端粒、rDNA 阵列、转座因子和三联体重复扩增等重复区域的功能和稳定性的影响，并讨论了它们与相关病理状况的相关性。
runx1家族血小板疾病概况人类基因组项目以外的基因组学和人类遗传学的年度综述：完整的人类基因组序列和Pangenome参考的时代
人类基因组项目是一个巨大的成就，为人类物种的遗传学和基因组学探索了无数的基础。多年来，人类基因组参考序列仍然不完整，并且缺乏人类遗传多样性的代表。最近，已经出现了两个重大进展来解决这些缺点：完全无间隙的人类基因组序列，例如由端粒到telomere群结的结合所开发的，以及高质量的pangenomes，例如由人类Pangenome Pangenome参考联盟中的dna序列组成和基因组合的依赖性，例如，由人类Pangenome PangeNome参考核心组成的核心和基因组合的核心，历史上难以顺序的区域，包括着丝粒，端粒和分段重复。同时，Pangenomes捕获了全世界种群中广泛的遗传多样性。共同发展了基因组学研究的新时代，增强了基因组分析的准确性，铺平了精确医学的道路，并有助于更深入地了解人类生物学。
分子对接与动力学模拟研究...
sherin.dr@iiitmk.ac.in & manojtk@iiitmk.ac.in 摘要：正常细胞的基因组身份受端粒保护，有时由于细胞连续分裂导致端粒酶缩短，从而观察到染色体不稳定性。报告表明，端粒酶长度对于确定端粒酶活性至关重要，而端粒酶活性又会导致癌症发生。据报道，端粒长度调节已被确定为一种可行的癌症诊断和治疗策略。在本 MS 中，我们使用计算方法探索了儿茶素类似物及其低聚物的端粒酶抑制活性。使用密度泛函理论计算了 MS 中讨论的不同配体的结构性质。使用计算方法探索了不同色烯亚基（例如 2R、3R 构象）的构象效应。还研究了这些配体对受体结合的立体化学贡献，例如配体内 π 相互作用。我们在此提出，儿茶素及其低聚物的立体化学方面是决定与端粒酶 N 端结构域有效结合的最重要因素，而这种结合是癌症治疗的有效策略。
细胞衰老与肺癌预后
除了限制细胞不受控制的增殖之外，细胞衰老也是肿瘤抑制和衰老的主要因素。在各种类型的细胞衰老中，我们可以区分由端粒缩短介导的复制性衰老和不涉及端粒缩短的应激性过早衰老。尽管许多因素可以在细胞变老之前导致细胞衰老——“过早衰老”，但 DNA（脱氧核糖核酸）损伤反应 (DDR) 信号缺陷被认为是细胞衰老表型诱导和维持的常见原因之一 (1)。端粒功能障碍通常会激活 DDR 信号，启动染色体融合，并在随后的细胞周期进程中引起断裂桥融合循环，导致基因组不稳定和细胞衰老 (2)。此外，治疗诱导性衰老是指癌细胞在接受某些化疗药物和电离辐射 (3) 治疗后发生衰老，通过诱导不可修复的 DNA 损伤，介导持续的 DDR 信号 (4) 和先天免疫反应 (5-7)（图 1）。
当前的患者衍生肿瘤的研究发展...
低5年生存率。这种不良的预后可能与NSCLC的肿瘤异质性及其对治疗药物的内在抗药性有关。已经提出，与端粒酶抑制作用的联合治疗可能是治疗药物敏感和耐药类型癌症的有效策略。端粒酶是细胞存活的关键酶，约90％的人类癌症通过激活端粒酶来维持端粒，这是由端粒酶逆转录酶（TERT）上调驱动的。已经在多种癌症类型中描述了端粒酶重新激活的几种机制，包括TERT启动子突变，通过TERT启动子进行表观遗传修饰，TERT扩增和TERT重排。本研究的目的是全面回顾端粒酶活性及其与NSCLC的临床特征和预后的关联，并分析TERT激活端粒酶并确定其在NSCLC中的潜在临床应用的潜在机制。更重要的是，已经对NSCLC中针对TERT的当前治疗策略进行了总结，目的是促进发现NSCLC未来治疗的新型策略。
烟熏本米亚纳的完整基因组组装揭示了centromeres的遗传和表观遗传景观
Nicotiana Benthamiana是一种在植物生物学和生物技术中广泛采用的模型生物。自2012年最初发行以来，其基因组研究已落后。为了进一步提高其实用性，我们生成和相位的同种异体二磷酸n. benthamiana的完整的2.85 GB基因组组装，所有19个centromeres和38个端粒完全分析。我们发现，尽管甲酸溶剂粒粒子被TY3/GYPSY逆转录座子广泛主导，但基于卫星的centromeres在N. Benthamiana中令人惊讶的是，在N. Benthamiana中，有11个Cendromeres中有11个由超级范围层面卫星阵列展出。有趣的是，富含卫星的和无卫星的丝粒被独特的吉普赛逆转录子广泛入侵，其中CENH3蛋白更优选地占据了CENH3蛋白，这表明它们在中心仪功能中至关重要。我们证明rDNA是丝粒卫星的主要起源，线粒体DNA可以用作Centromere的核心成分。亚基因组分析表明，卫星阵列的出现可能会在多倍体化后基因组休克期间驱动着丝粒的形成和成熟。总的来说，我们提出了本氏菌Centromeres通过Neocentromere的形成，卫星扩张，逆转录转座子富集和mtDNA整合而发展。
建立永生海洋鱼细胞系作为体外工具，促进环境监测、生物技术和生物多样性的研究
永生化细胞系对研究人员来说非常宝贵，因为它们可以无限增殖，从而可以培养多代。与寿命有限的原代细胞不同，永生化细胞系（也称为连续细胞系）可以避免伦理问题、提取困难、传代能力有限以及由于细胞来源不同而导致的结果不一致等挑战。实验室条件下的大多数细胞都面临海弗利克极限，即端粒随着每次分裂而缩短，导致衰老。永生化细胞系克服了这些限制，可以进行稳定的长期研究，同时无需重复分离和培养细胞，从而节省了研究的时间和资源。连续细胞系可以在体外无限增殖，为广泛的研究目的提供可持续和可重复的系统。这些细胞系为在细胞和分子水平上研究生物体提供了一个独特的平台，提供了全生物模型并不总是能够提供的见解。它复制了宿主的细胞和遗传同质性，同时最大限度地减少了体内系统固有的变异性。因此，人们越来越关注开发新的细胞系以支持更广泛的生物学研究。
Telo Genomics任命Baechler董事会执行主席
2025年3月12日-Telo Genomics Corp.（TSX -V：TELO）（OTCQB：TDSGF）（TDSGF）（“公司”或“ Telo Genomics”）是开发诊断和预后测试人类疾病诊断和预后测试的领导者，通过分析Chromosomal Telomeres，Chromosomal telomers的主持人，可以宣布指挥官Baech Mr. Baech baech baech baech to n of Guido baech baech to n of Guido baech。在扩大角色中，Baechler先生将提供更积极的战略领导力，与公司的创始人Sabine Mai博士紧密合作，并与执行团队紧密合作，以进一步促进Telo Genomics的开创性机器学习（ML）驱动的3D Telomere Platform in concology，目前专注于多发性骨髓瘤和前列腺癌。 Baechler先生于2019年2月28日加入Telo Genomics董事会担任独立董事，并于2020年5月6日被任命为董事长。 他在生命科学和医学诊断行业中带来了超过30年的领导经验，并具有推动增长和创新的良好记录。 在加入TELO基因组学之前，Baechler先生在全球领先的诊断公司Roche Diagnostics度过了近二十年的时间，在那里他在欧洲和北美担任各种高级领导职务。 他在推进实力诊断技术和商业化临床解决方案方面的深厚专业知识使他良好地定位了他，以帮助指导Telo基因组学通过其下一阶段的增长和商业化。 “我很高兴能够更多地参与领导Telo Genomics的创新测试从临床研究到商业产品的发展，” Telo Genomics执行董事长Guido Baechler说。 我们根据平台技术看到了额外的其他商业机会。在扩大角色中，Baechler先生将提供更积极的战略领导力，与公司的创始人Sabine Mai博士紧密合作，并与执行团队紧密合作，以进一步促进Telo Genomics的开创性机器学习（ML）驱动的3D Telomere Platform in concology，目前专注于多发性骨髓瘤和前列腺癌。Baechler先生于2019年2月28日加入Telo Genomics董事会担任独立董事，并于2020年5月6日被任命为董事长。他在生命科学和医学诊断行业中带来了超过30年的领导经验，并具有推动增长和创新的良好记录。在加入TELO基因组学之前，Baechler先生在全球领先的诊断公司Roche Diagnostics度过了近二十年的时间，在那里他在欧洲和北美担任各种高级领导职务。他在推进实力诊断技术和商业化临床解决方案方面的深厚专业知识使他良好地定位了他，以帮助指导Telo基因组学通过其下一阶段的增长和商业化。“我很高兴能够更多地参与领导Telo Genomics的创新测试从临床研究到商业产品的发展，” Telo Genomics执行董事长Guido Baechler说。我们根据平台技术看到了额外的其他商业机会。“借助Mai博士使用端粒来测量基因组不稳定性的大量研究，我们的Telo平台已被证明可以显示出几种恶性疾病的临床实用性，并且由于其具有固有的敏感性，它是一种挑衅性的液体生物生物群体，用于早期发现和监测最小残留疾病（MRD）。具体来说，我们很高兴使用我们的测试为多发性骨髓瘤，霍奇金病和前列腺癌提供可行的结果。我们的TeloView®平台经过设计，可无缝整合到临床实验室中，而我们的CLIA/CAP认证的基于多伦多的测试设施则良好，可为Pharma和Biotech Partners提供高影响力的精确医学数据，以支持药物开发和患者护理。我还想借此机会报告约翰·米基森（John Meekison）离开了电视委员会。约翰是我们团队中极为有价值的成员，并代表董事会，我要感谢他对公司的承诺和代表我们的努力。”该公司还报告说，与该公司前总裁Sherif Louis的咨询安排尚未续签在Baechler先生的指导下，高级管理团队的成员将在临时承担路易斯先生的职责。