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对现实世界中大量小细胞肺癌患者的综合分析，可识别出不同的基因亚型，并深入了解组织学转化
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可，根据 未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者（此版本于 2022 年 7 月 29 日发布。；https://doi.org/10.1101/2022.07.27.501738 doi：bioRxiv 预印本
针对血液系统恶性肿瘤中的 SHP2 磷酸酶
含 Src 同源性-2 的蛋白酪氨酸磷酸酶 2 (SHP2) 是一种由 PTPN11 基因编码的广泛表达的非受体蛋白酪氨酸磷酸酶 [3]。SHP2 是一种经过广泛研究的致癌酪氨酸磷酸酶，与各种信号转导通路相关，包括激活 RAS/MAPK、PI3K/AKT、JAK/STAT、PD-1/PD-L1、mTOR 和 Hippo 通路 [4–7]。PTPN11 基因的种系突变可导致努南综合征 (NS)，这是一种以身体部位发育不全为特征的常染色体显性遗传病，以及伴有多发性雀斑的努南综合征 (NS-ML) [8,9]。此外，PTPN11 基因的体细胞获得功能 (GOF) 突变会导致多种血液系统恶性肿瘤，如幼年型粒单核细胞白血病 (JMML)、急性髓系白血病 (AML)、B 细胞急性淋巴细胞白血病 (B-ALL)、骨髓增生异常综合征 (MDS) 和多种实体癌 [7,10]。重要的是，患有基于 NS 的激活性 PTPN11 突变的婴儿可能会患上 JMML 或 JMML 样骨髓增生性疾病 (MPD) [11]。最近在横纹肌样肿瘤细胞系中进行的全基因组 CRISPR（成簇的规律间隔的短回文重复序列）和小分子筛选揭示了 SHP2 和受体酪氨酸激酶 (RTK) 之间存在治疗相关的依赖性 [12]。几种 SHP2 特异性抑制剂正在接受测试，以确定其作为抗癌药物的治疗潜力。在这篇综述中，我们重点关注 SHP2 的功能、其突变对各种信号通路的多样化影响以及 PTPN11 突变在血液系统恶性肿瘤治疗管理中的意义。
GSK-3 在慢性血液系统恶性肿瘤中的病理生物学和治疗相关性
摘要：糖原合酶激酶 3 (GSK-3) 是一种进化保守、普遍表达的多功能丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，参与调节多种生理过程。GSK-3 包含两种同工型（α 和 β），它们最初于 1980 年被发现，通过抑制糖原合酶的磷酸化参与葡萄糖代谢。与其他蛋白激酶不同，GSK-3 同工型在静息细胞中具有组成活性，其调节主要涉及通过上游调控网络的抑制。20 世纪 90 年代初，GSK-3 同工型被认为是癌细胞病理生物学中的关键参与者。活性 GSK-3 促进多种致癌蛋白的破坏，包括 β -catenin 和细胞周期进入和增殖代谢的主要调节器 (c-Myc)。因此，GSK-3 最初被认为是一种肿瘤抑制因子。一直以来，GSK-3 经常通过失调的上游信号通路在癌细胞中失活。然而，在过去的 10-15 年里，越来越多的研究强调，在某些癌症环境中，GSK-3 亚型会抑制肿瘤抑制通路，因此充当肿瘤促进剂。在本文中，我们将讨论 GSK-3 亚型在某些慢性血液系统恶性肿瘤（慢性粒细胞白血病、慢性淋巴细胞白血病、多发性骨髓瘤和 B 细胞非霍奇金淋巴瘤）中发挥的多种且往往神秘的作用，这些恶性肿瘤是最常见的血液癌细胞类型。我们还将总结针对 GSK-3 的可能新策略，以创新治疗这些疾病。
阿尔茨海默病的深度学习：绘制大规模组织学 tau 蛋白图谱以进行神经影像生物标志物验证
异常的 tau 内含物是阿尔茨海默病的标志，也是临床衰退的预测指标。有几种 tau PET 示踪剂可用于神经退行性疾病研究，为体内分子诊断开辟了途径。然而，很少有人获准用于临床。了解 PET 信号验证的神经生物学基础仍然存在问题，因为它需要 PET 和（免疫）组织学信号之间大规模的体素到体素相关性。整个人脑的维度很大，组织变形会影响配准，而处理 TB 级信息的计算要求阻碍了正确的验证。我们开发了一个计算管道，用于识别和分割十亿像素数字病理图像中的感兴趣粒子，以生成定量的 3D 密度图。针对免疫组织化学样本的拟议卷积神经网络 IHCNet 是该管道的核心。我们已成功使用三种磷酸化 tau 抗体（AT100、AT8 和 MC1）处理并免疫染色了来自两个完整人脑的 500 多张载玻片，这些载玻片包含数 TB 的图像。我们的人工神经网络从大脑图像中估计了 tau 的包含情况，其对 AT100、AT8 和 MC1 的 ROC AUC 分别为 0.87、0.85 和 0.91。自省研究进一步评估了我们训练的模型学习 tau 相关特征的能力。我们提出了一种端到端流程来创建 TB 级的 3D tau 包含密度图，并将其与 MRI 联合配准，以方便验证 PET 示踪剂。
FDA 批准的治疗血液系统恶性肿瘤的药物——...
摘要：血液系统恶性肿瘤，也称为血癌，是一组涉及异常细胞生长并持续存在于血液、淋巴结或骨髓中的疾病。包括小分子抑制剂、单克隆抗体、双特异性 T 细胞接合剂、抗体-药物偶联物、重组免疫毒素以及嵌合抗原受体 T (CAR-T) 细胞在内的新型靶向疗法的开发改善了血癌的临床结果。在这篇综述中，我们总结了 2011 年至 2021 年期间美国食品药品管理局 (FDA) 批准的用于治疗血液系统恶性肿瘤的 52 种药物，这些药物分为小分子和大分子药物。其中 40 种也已获得欧洲药品管理局 (EMA) 的批准。我们通过研究 FDA 批准的药物的结构和作用机制对其进行了分析。应该强调的是，靶向药物的数量（46 种药物）明显高于化疗药物（6 种药物）。我们重点介绍了治疗血液系统恶性肿瘤的药物设计方面的最新进展，这些进展使药物更有效、毒性更小。
表征有效的paracaspase malt1抑制剂用于血液系统恶性肿瘤
在酶测定中测量了Schrodinger的MALT1抑制剂的效力。用于OCI-LY3和OCI-LY10细胞中的体外靶标参与测定法，通过使用MSD测定法（Messoscale discovery）测量了细胞裂解物中未溶解的BCL10的MALT1抑制剂24小时的浓度处理24小时。用于在OCI-LY3和OCI-LY10细胞中的细胞增殖测定法，用浓度的MALT1抑制剂处理96小时，然后用CellTiter-Glo分析（Promega）处理以测量细胞活力。
NCRI 血液肿瘤学组
急性淋巴细胞白血病 (ALL) 亚组 (主席，Clare Rowntree 博士) 成就 Tom Fox 博士是血液肿瘤组和 ALL 亚组的实习代表，他整理了感染 COVID-19 的血液肿瘤患者的结局，并于 2020 年在 BJHaem 上发表。他目前正在与多伦多的同事合作，整理更大规模的患者系列 (3500 例)。这些患者的结果将在 Blood 2021 上发表。虽然这项工作由于显而易见的原因没有在我们的 2020-21 年战略中概述，但这些数据对英国血液肿瘤学家在与患者讨论 COVID-19 感染风险时非常有价值。由于新冠疫情，经过漫长的审批程序后，CRUK 拒绝了 ALL 子小组为 UKALL 15 提供的资助申请。Fielding 教授和 Clare Rowntree 博士目前正在与欧洲各地 ALL 工作组的同事合作，作为欧洲成人工作组的一部分
Aurora激酶抑制在血液恶性肿瘤中的相关性
摘要。Aurora激酶是丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶的家族，在真核细胞分裂中起着核心作用。对癌症中极光激酶的过度表达及其作为细胞周期的主要调节剂的作用迅速启发了以下观点：他们的抑制作用可能是治疗肿瘤患者时可能是潜在途径的观念。在过去的几十年中，寻找和测试能够抑制Aurora活动的分子的设计和测试助长了许多临床前和临床研究。在这项研究中，对过去10年的体外和体内研究以及临床试验进行了汇总和讨论，利用Aurora激酶抑制剂作为血液学恶性肿瘤的治疗剂，旨在突出这些抑制剂作为新型单疗法模型或同行常规化学的疗法。虽然仍然有很多要阐明，但很明显，这些激酶在肿瘤发生中起着关键作用，它们的可管理毒性和潜在的协同作用仍然使它们成为联合临床试验中未来研究的关注点。