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肠道微生物组对慢性肾脏疾病患者尿毒毒素减少的影响：系统评价和网络荟萃分析
。cc-by 4.0国际许可证是根据作者/资助者提供的，他已授予MedRxiv的许可证，以永久显示预印本。（未通过同行评审认证）
使用根瘤菌在加工西红柿中增强植物防御：一种克服早期疫病和替代毒素的生物培训方法
具有对植物致病真菌的拮抗活性的植物生长根瘤菌（PGPR）是基于生物防治活性开发新型植物保护产品的宝贵候选者。这种产品制定的第一步是筛选所选微生物的潜在效果。在这项研究中，从番茄植物的根际分离了非致病性根瘤菌，并评估了其对三种产生霉菌毒素的替代品的生物防治活性。对其生物防治潜力的评估涉及研究真菌生物量和替代毒素的减少。开发的排名系统允许在最初的85个分离株中识别12种表现最佳菌株。几个根瘤菌显示出真菌生物量（高达76％）和/或霉菌毒素产生（高达99.7％）的显着降低。此外，相同的分离株还表现出植物生长促进（PGP）特征，例如铁载体或IAA产生，无机磷酸盐溶解和氮固定，从而确保PGPR的多面性质。芽孢杆菌种，尤其是双链球菌和两种枯草芽孢杆菌菌株，在减少真菌生物量方面表现出最高的效率，并且在降低霉菌毒素的产生方面也有效。分离物，例如肠杆菌Ludwigii，肠杆菌，肠杆菌，Nematodiphila，Pantoea groglomerans和Kosakonia cowanii表现出适度的效果。结果表明，通过利用不同微生物菌株的多种能力，一种基于财团的方法将提供更广泛的效果，从而为可持续农业提供了更令人鼓舞的解决方案，并解决了与作物相关的生物挑战的多面性质。
评估小分子抑制剂马立马司他对蛇毒毒素的靶向特异性：热蛋白质组分析的新应用
能够规避传统抗蛇毒疗法缺陷的新疗法对于解决全球蛇咬伤问题至关重要。许多蛇毒毒素抑制剂已显示出在体内和体外有希望的跨物种中和医学上重要的蛇毒毒素的效果。开发用于筛选此类抑制剂的高通量方法可以加速它们的鉴定、测试和实施，因此具有改善全球蛇咬伤治疗和结果的巨大潜力。基于能量学的蛋白质组学方法，包括热蛋白质组分析和蛋白质组整体溶解度改变 (PISA) 检测，代表了用于高通量、全蛋白质组鉴定药物靶点和配体的“深度蛋白质组学”方法。在以下研究中，我们应用热蛋白质组分析和 PISA 方法来表征 Crotalus atrox（西部响尾蛇）的毒液毒素蛋白质形式与蛇毒金属蛋白酶 (SVMP) 抑制剂马立马司他之间的相互作用。我们研究了其对毒液蛋白质组的影响，并表征了其与特定 SVMP 蛋白质形式的相互作用，以及其对非 SVMP 毒液毒素家族的潜在靶向性。我们还使用两种抑制剂浓度比较了 PISA 热窗口和可溶性上清液与不溶性沉淀物的性能，首次证明了灵敏的高通量基于 PISA 的方法来评估蛇毒小分子抑制剂的直接靶标的实用性。
Pathofact 2.0：一种用于预测宏基因组中抗菌抗性基因，毒力因子，毒素和生物合成基因簇的综合管道
摘要摘要：抗菌抗性基因（ARGS）和毒力因子（VFS）是围绕药物抗药性感染的全球健康危机的核心因素。Pathofact是2021年引入的生物信息学管道，从元基因组数据中提供了对ARGS，VFS和细菌毒素的见解。但是，生物信息学的最新进展突出了对Pathofact的更新版本的需求。我们引入了Pathofact 2.0，这是改进的ARG，VF和毒素预测的增强管道。关键更新包括用于VF识别的更新机器学习（ML）模型，用于毒素识别的新ML模型，扩展了隐藏的Markov模型配置文件以及用于预测生物合成基因簇的Antismash 7.0集成。这些升级使Pathofact 2.0成为预测基于微生物组的致病性和抵抗力的更强大，用户友好的平台，提供了一种至关重要的工具，以更好地理解和应对抗菌素抵抗和感染性疾病所带来的挑战。
敲除两个 ABC 转运蛋白基因对小菜蛾抗苏云金芽孢杆菌毒素 Cry1Ac 和 Cry1Fa 的独立和协同作用
摘要：来自苏云金芽孢杆菌 (Bt) 的杀虫蛋白被广泛用于喷雾剂和转基因作物中以控制害虫。然而，害虫的抗性进化会降低 Bt 毒素的有效性。在这里，我们分析了小菜蛾 (Plutella xylostella) 对 Bt 毒素 Cry1Ac 和 Cry1Fa 的抗性，小菜蛾是世界上最具破坏性的蔬菜作物害虫之一。我们利用 CRISPR/Cas9 基因编辑创建了 ATP 结合盒 (ABC) 转运蛋白基因 PxABCC2 、PxABCC3 或两者均被敲除的菌株。生物测定结果表明，单独敲除任一基因最多会导致抗性增加 2.9 倍，但同时敲除两个基因会导致对 Cry1Ac 的抗性增加 10,320 倍以上，对 Cry1Fa 的抗性增加 380 倍。双基因敲除菌株的 Cry1Ac 抗性是隐性的，与 PxABCC2/PxABCC3 基因座有遗传关联。这些结果为了解小菜蛾对 Cry1Fa 的交叉抗性机制提供了见解。它们还证实了之前对这种害虫的研究，即破坏两个基因的突变比仅影响 PxABCC2 或 PxABCC3 的突变对 Cry1Ac 的抗性更强。结合之前的研究，本文的结果强调了使用单基因和多基因敲除的价值，可以更好地了解假定的 Bt 毒素受体对 Bt 毒素抗性的独立和协同作用。
德国官方分析方法（ASU）
食物过敏原分子二醇。方法 - 微生物学分子生物学。植物 - /动物种类差异。Mycotoxins Plant toxins Plant toxins – sub-WG opium alkaloids Pesticides Phycotoxins Animal species differentiation - meat Veterinary drug residues in food Viruses in food Vitamin analysis Mass spectrometric protein analysis § 28b GenTG WG § 28b GenTG - sub-WG gv-microorganismn NGS - bacterial characterization NGS - bacterial characterization - sub-WG “ dyllab” ngs-物种识别NGS-物种识别 - sub –wg“生物信息学”
微生物学中的第3单元问题
3.2.5新出现的毒素毒素的原因是由植物，动物和微生物在内的生物体产生的化学物质。某些生物会生产某些毒素，以保护自己免受捕食者的侵害或与其他生物竞争。这是出现毒素的一些原因：1。环境变化：环境的变化，例如气候变化，污染和栖息地破坏，可以创造有利于有毒生物的生长或产生毒素的条件。2。人类活动：人类活动，例如农业，工业过程以及使用农药和其他化学物质的使用可能导致环境中毒素的产生。3。食品污染：毒素可以通过自然污染或由于人类活动（例如使用农药或储存习惯）污染食品作物。4。细菌过度生长：细菌过度生长可能在某些食物或环境中发生，从而导致细菌产生毒素。5.遗传突变：某些生物可能会经历基因突变，从而导致新毒素的产生或增加现有毒素的产生。6.自然灾难：诸如洪水或野火等自然灾害会产生促进有毒生物的生长或产生毒素的疾病。
生物毒素安全工作实践
生物毒素安全工作实践I.引言生物毒素是由某些微生物，动物和植物产生的有毒物质。生物来源毒素的例子包括白喉毒素，四毒素，百日咳毒素，肉毒杆菌神经毒素，蛇毒素毒素，蛋白毒素和ricin。尽管毒素是从生物材料中得出的，但它们不复制，因此不被视为感染性。但是，它们的数量很少，必须像工作场所中的危险化学物质一样受到处理。必须进行控制，以确保保护人员免于暴露。暴露途径包括吸入，眼睛，鼻子和粘膜接触，经皮和皮肤吸收，具体取决于所使用的稀释剂。实验室中关注的主要问题是意外暴露于与口，眼睛，皮肤和粘膜接触引起的毒素，对毒素粉或气溶胶的吸入无意中产生，或者是由针刺发生的。与生物来源的毒素合作必须包括在您的实验室特异性化学卫生计划中。在开始工作之前，所有实验室人员都需要记录有关实验室特定标准操作程序（SOP）的毒素特异性危害培训和培训。培训必须包括但不限于毒素的健康和身体危害，与暴露，适当的工作实践，个人保护设备和紧急程序相关的体征和症状。II。 实验室计划和使用准备II。实验室计划和使用准备某些生物来源的毒素被认为是选择的毒素，美国卫生与公共服务部（HHS）和农业部门（USDA）决定对公共卫生和植物健康，动物或植物产品构成严重威胁。疾病控制与预防中心（CDC）在其选择代理程序中调节这些特定生物学剂和毒素的所有物体。与CDC列出的研究工作选择毒素可能具有其他安全和安全要求，包括与UW Select Agent计划和CDC进行注册。
章节：藻毒素检测的化学方法：HPLC 和 LC/MS/MS
1 码头调查研究所。Unidad Asociada de Fitoplancton Tóxico (CSIC-IEO)。Vigo 2 Laboratorio de Sanidad 外观。领土政治和公共行政部。Vigo pilar.riobo@vi.ieo.es 目录 1.摘要 2.亲水性毒素：2.1。PSP 毒素：STX 2.2 组。ASP 毒素：多莫酸 3.亲脂性毒素 3.1 一般提取程序 3.2 DSP 毒素：冈田酸组 3.3 AZP：Azaspiracids 3.4 海葵毒素 3.5 雪卡毒素 3.6 NSP：短藻毒素 4. div>尚未证实对人类有影响的脂溶性毒素 4.1 YTX 组 4.2 PTX 组 4.3 环状亚胺组：Espirolids、Gymnodimines、Pinnatoxins 和 Pteriatoxins 5.结论 6.< div> 致谢 7.参考文献 1.摘要 藻毒素是海洋生物合成的天然产物微藻，尤其是属于甲藻类的微藻。目前已知约有 20 种甲藻和少量硅藻会产生藻毒素，这些藻类占所有微藻种类的不到 2%。众所周知，它们会在从热带到极地纬度的整个食物链中产生中毒综合症 (Hallegraeff, 1993)。海洋生物毒素是结构差异很大的非蛋白质化合物，其分子量介于250-3500道尔顿。它们的物理化学性质根据其极性、亲脂性、热稳定性、对pH、氧气和光的敏感性等而变化。生物毒素中毒的危险对人类的影响在于其急性和慢性影响。食用受海洋生物毒素污染的海鲜可能会导致严重疾病，影响：麻痹性贝类中毒 (PSP) 中的神经系统、腹泻性贝类中毒 (DSP) 中的肠道系统以及失忆性贝类中的记忆丧失中毒（ASP）。在多个国家的海鲜中发现的其他知名毒素是短尾藻毒素 (BTX)、雪卡毒素 (CTX)、海葵毒素 (PLTX) 和河豚毒素 (TTX)。它们的作用方式尚不清楚，（Hu 等人，2001；Miles 等人，