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World File Search Systemtrichoderma
社论：内生真菌：次生代谢物以及植物生物和非生物应力管理
内生菌可以生活在植物组织中，而不会引起宿主的明显症状（Hardoim等，2015）。内生真菌在研究中引起了极大的关注，因为它们不仅提供了多种药物的骨干的生物活性次级代谢产物（SMS）的新来源，而且还可以保护宿主植物免受生物和非生物胁迫的影响，从而对作物食品安全和安全构成严重威胁。因此，内生真菌对医学，农业和工业以及经济产生了相当大的影响。先前的研究（Torkamani等，2014; Tashackori等，2018; Salehi等，2019）呈现了真菌引起剂的显着潜力，以及在Corelus Avellus Avellus Avellus Avellus Avellus Crunture中的Paclitaxel Biosynthesis增量的内生性真菌和植物细胞的共处。在这个研究主题中，Zhang等人。表明，接种内生菌的根促进了巴黎多形根茎中多晶林的产生，抗病毒，镇痛，抗菌和抗炎性剂的产生，可能是由于下游细胞色素p450 p450和udp-glycosylthers composen composen composen composen composen composen composen comply cons comply comply consement consyla consyla。Santra和Banerjee将内生弯曲的Eragrostidis描述为有效的抗微生物生产者。这种分离的产生的挥发性有机化合物（VOC）可以通过防止危险植物病的生长来用作可持续农业的工具。此外，许多研究表明，大多数trichoderma spp。可以生物合成生物活性化合物并显示出引起植物性疾病的线虫和真菌的拮抗作用（Yao等人此外，曲线曲霉产生的生物活性代谢产物可以是传统抗生素的有力替代品，并有效地遏制了人群中由多种耐药的革兰氏阴性阳性和革兰氏阴性细菌病原体引起的致命疾病。）。这些生物活性化合物包括细胞壁降解酶和二级代谢产物，可以有效地降低植物性疾病，促进作物耐药性并增强植物的生长（Yao等人。）。Gangaraj等。表明，尼日尔曲霉产生了不同的抗菌代谢物，并且对包括番石榴枯萎病等的土壤传播疾病的生物防治具有很高的潜力。几个
牛粪中细菌和真菌的筛选与鉴定
*电子邮件：endusharma@gmail.com 摘要 牛粪 (CD) 或牛粪是牛科动物的排泄物，几个世纪以来牛粪传统上被用作印度次大陆农业的有机肥料。牛粪的成分约 80% 是水，还有一些未消化的植物材料，这些材料含有大量有机物质，这是由于牛粪微生物群分泌的抗菌代谢物。牛粪肥料可增强土壤矿物质，还可增强植物对害虫和植物疾病的抵抗力。牛粪 (CD) 微生物群用于农业领域，例如生物防治、促进生长、有机肥料、磷溶解。 CD 已用于其他几种与环境有关的应用，如生物降解、生物修复和重金属生物吸附等。CD 具有丰富的微生物多样性，包含近 60 种细菌（芽孢杆菌属、乳酸杆菌属、棒状杆菌属）、真菌（曲霉菌、木霉菌）、100 种原生动物和酵母菌（酿酒酵母和念珠菌）。在本研究中，我们研究了牛粪的微生物负荷。用营养琼脂、血琼脂和麦康凯琼脂从牛粪中分离细菌。萨氏葡萄糖琼脂 (SDA) 用于真菌分离。根据菌落特征、形态、革兰氏染色、显微镜检查和生化测试对分离的细菌进行鉴定。牛粪的微生物负荷以样品的 cfu/gm 计算。在稀释度 10 -3 时细菌种群数量达到最大，范围为 170×10 -4 cfu/ml。从牛粪中分离出共 20 种分离菌，包括革兰氏阴性杆菌、革兰氏阳性球菌和革兰氏阳性杆菌大肠杆菌、微球菌属和芽孢杆菌属。使用 Sabouraud 葡萄糖琼脂 (SDA) 进行真菌分离。在稀释度 10 -2 时真菌种群数量达到最大，范围为 35×10 -3 cfu/ml，观察到了黑曲霉和烟曲霉的不同真菌菌落。这些有益微生物将用于进一步的研究工作。关键词：牛粪，微生物负荷，细菌，真菌，微生物组。1. 引言在印度，养牛历史悠久，主要与农业有关。许多阿育吠陀配方使用由牛奶、酥油、凝乳、尿液和粪便制成的各种产品（Sharma 和 Singh，2015 年）。牛粪 (CD) 是通过消化系统后未消化的植物材料残留物。其成分包括水（80%）、未消化的残留物（14.4%）和微生物（5.6%），pH 值范围为 7.1 至 7.4（Nene 等人，2003 年；Teo 和 Teoh，2011 年；Radha 和 Rao，2014 年）。由于含有多种具有益生菌活性的微生物，包括植物乳杆菌、干酪乳杆菌、嗜酸乳杆菌、枯草芽孢杆菌、乳酸肠球菌、双歧杆菌和酵母菌（酿酒酵母），牛肠道下部具有益生菌活性Ware等人（1988）。它包括大量天然存在的有益细菌，乳酸杆菌和球菌，以及一些已知和未知的放线菌，真菌和酵母（Muhammad和Amusa，2003； Radha和Rao，2014； Sharma和Singh，2015）。牛粪具有丰富的微生物多样性，包含近60种细菌（芽孢杆菌属、乳酸杆菌属、棒状杆菌属）、真菌（曲霉菌和木霉菌）、100种原生动物和酵母（酿酒酵母和假丝酵母）（Gupta等人，2016年； Bhatt和Maheswari，2019年）。根据 Muhammad 和 Amusa (2003) 的研究，细菌和真菌等土壤污染物经常侵入陈牛粪。生物技术应用（如酶、生物甲烷和生物氢）和环境应用，以及微生物的生物技术多样性、生物动力学制备和牛粪在农业中的用途。自本世纪初以来，生物学家一直对 CD（粪生生物）的微生物多样性感兴趣（McGranaghan 等人，1999 年；Kim 和 Wells，2016 年）。在可持续循环经济的背景下，CD 微生物用于生物技术、环境和农业应用。许多研究已经证明了新鲜牛粪和尿液分别具有抗菌和抗真菌特性，这可能是因为粪便中存在的微生物群会分泌抗菌代谢物（Nene 等人，2003 年；Sharma 和 Singh，2015 年）。几个世纪以来，牛粪一直是印度次大陆农业中用作有机肥料的传统材料。牛粪中还含有多种微生物群，可进一步增强土壤生物地球化学过程（Akinde 和 Obire 2008）。大量研究已经证明了新鲜牛粪和牛尿分别具有抗菌和抗真菌特性，这可能是因为牛粪中的微生物群会分泌抗菌代谢物（Nene 等人，2003 年；Sharma 和 Singh，2015 年）。几个世纪以来，牛粪一直是印度次大陆农业中用作有机肥料的传统材料。牛粪还含有多种微生物群，可进一步增强土壤生物地球化学过程（Akinde 和 Obire，2008 年）。大量研究已经证明了新鲜牛粪和牛尿分别具有抗菌和抗真菌特性，这可能是因为牛粪中的微生物群会分泌抗菌代谢物（Nene 等人，2003 年；Sharma 和 Singh，2015 年）。几个世纪以来，牛粪一直是印度次大陆农业中用作有机肥料的传统材料。牛粪还含有多种微生物群，可进一步增强土壤生物地球化学过程（Akinde 和 Obire，2008 年）。
HyGenesis 系统：
测试的代表性微生物：（部分概要）HyGenesis 系统：细菌 醋酸钙不动杆菌 1 真菌 黑曲霉 基于独特的抗菌技术，可有效控制各种处理物品和基质上的细菌、真菌、藻类 枯草芽孢杆菌 烟曲霉 和酵母。抗菌活性物质是在美国环境保护局和全球类似监管机构注册的猪布鲁氏菌 杂色曲霉 布鲁氏菌 出芽短梗霉 伯克霍尔德菌 洋葱毛壳菌。这种抗菌剂已安全有效地使用了三十多年。产气荚膜梭菌 镰刀菌 鲍氏棒状杆菌 粉红粘帚菌 本表是应众多要求编制的，要求提供该技术有效的微生物清单。我们选择了大肠杆菌 ATCC 23266 白色青霉菌，以提供测试谱，其中大肠杆菌 1 黄青霉菌 代表所有重要类型和猪嗜血杆菌 柑橘青霉菌 微生物种类。流感嗜血杆菌 秀丽隐杆线虫 肺炎克雷伯菌 ATCC 4352 绳状青霉 干酪乳杆菌 腐殖质青霉 乳酸明串珠菌 青霉菌 单核细胞增多性李斯特菌 变异青霉 耐甲氧西林葡萄球菌 金黄色葡萄球菌 黑根霉 微球菌 sp. Stachybotrys atra 耻垢分枝杆菌 黄木霉 结核分枝杆菌 趾间毛癣菌 痤疮丙酸杆菌 须毛癣菌 奇异变形杆菌 藻类 奇异变形杆菌1 鱼腥藻 B-1446-1C 普通变形杆菌 小球藻 铜绿假单胞菌 Gium sp. LB 9c 铜绿假单胞菌 PRD-10 波恩颤菌 LB143 铜绿假单胞菌 1 胸膜球菌属 LB11 洋葱假单胞菌 四尾假单胞菌 细长月牙藻 B-325 猪霍乱沙门氏菌 团藻属 LB 9 伤寒沙门氏菌 酵母菌 金黄色葡萄球菌（无色素）1 白色念珠菌 金黄色葡萄球菌（有色素）1 酿酒酵母 表皮葡萄球菌 1 病毒 粪链球菌 禽流感 变形链球菌 HIV B 万古霉素耐药肠球菌 (VRE) 甲型流感 野油菜黄单胞菌 SARS
肠道菌群，免疫细胞和冠状动脉疾病之间的因果关系：介导的孟德尔随机分析
心血管疾病是全球死亡的最常见原因。冠心病（CHD）是最常见的心血管疾病类型。它的特征是由于冠状动脉变窄而导致心肌功能障碍，导致血液供应不足。CHD是全球老年患者的死亡原因之一，其风险持续上升。在小鼠模型中，可以通过肠道微生物（GM）转移传播对CHD和血栓形成的敏感性（Brown and Hazen，2018）。这种传播可能与以下事实有关：微生物群落影响宿主代谢，并通过微生物相关的分子模式通过宿主模式识别受体感知，这会影响心血管疾病的发病机理。针对微生物的治疗策略有望预防或治疗心血管疾病（Brown and Hazen，2018）。正常个体和冠状动脉疾病患者之间的GM组成中存在显着差异。在健康的人中，肠道菌群主要包括坚硬，细菌植物，肌动杆菌和子宫菌，它们在维持肠道健康和免疫系统方面起着关键作用。相比之下，冠心病患者的肠道成分和结构发生了显着变化。这些变化包括某些细菌组的增加或减少，例如毛霉菌蛋白酶科和Ruminococaccaceae，以及病原体或机会性病原体的数量增加（Dai等人，2020年）。迄今报道的潜在生物标志物包括三甲胺氧化胺（TMAO），短链脂肪酸（SCFA）和次胆汁酸。例如，tmao是一种肠道的代谢产物，与动脉粥样硬化的形成密切相关和CHD的发展。研究表明，TMAO通过影响血小板活性和胆固醇代谢来促进动脉粥样硬化的形成（Tang and Hazen，2017； Witkowski等，2020）。先前的研究表明，GM与CHD之间存在很强的因果关系（Jiang等，2023; Yang等，2024），GM和代谢物的丰度变化可能会影响CHD的进展（Wang等，2024）。大量证据表明，转基因在诸如代谢性疾病和心血管疾病等疾病的发作和进展中起着至关重要的作用（Wen等，2022； Qiao等，2023）。临床研究发现，CHD和认知障碍患者的GM发生了显着变化（Sun等，2019； Paiva等，2020）。GM的变化可以通过诸如慢性炎症，促进动脉粥样硬化和促进血栓形成的机制来介导CHD的发展（Liyu等，2022）。一项研究从转录组的角度分析了GM和CHD之间的关系，发现fusicatenibacter可以通过影响几个与CHD相关的靶标，即GBP2，MLKL和CPR65高度相关（Chen等，2023）。另一项研究表明，与CHD相关的肠道菌群中的性别营养不良，有可能导致心血管疾病发生率中观察到的性别差异（Garcia-Fernandez等，2024）。许多草药也可以通过调节GM的组成，降低三甲胺-N-氧化物（TMAO）水平来对CHD进行干预，从而增加
链格孢属植物的拉曼和量子化学研究。
纸上的真菌色素：链格孢属菌种的拉曼和量子化学研究。Victor V. Volkov 和 Carole C. Perry* 诺丁汉特伦特大学科学技术学院跨学科生物医学研究中心，克利夫顿巷，诺丁汉 NG11 8NS，英国。摘要为了加深对影响图书馆、博物馆和档案馆的文化遗产的真菌分子生物化学的了解，我们研究了拉曼光谱在识别纸上真菌有色发色团组成的诊断能力。在本研究中，我们探索了共振拉曼在区分高湿度下在纸上生长的真菌丝中的发色团的诊断能力，重点是表征链格孢属菌种的发色团。为了促进分子分析，我们对在紫外-可见光谱范围内具有光吸收的代表性代谢物进行了量子化学计算。通过理论与实验的比较，我们发现，在成熟的菌丝丝中存在 fonsecin、erythroglaucin 和 aurasperone 类型的发色团，而 β-胡萝卜素在纸面上的酵母沉积物中占主导地位。成熟丝的共振拉曼光谱表明，比 β-胡萝卜素更长的胡萝卜素对光谱特征的贡献更大。利用微观分辨率，我们在丝从酵母沉积物开始的空间区域中区分了丰富的拉曼特征集，这些特征集被归因于木质素、flavoglaucin、核黄素、cycloleucomelon(e) 和 asperyellone 分子成分。在这些区域中，丝的微结构刺激了成熟三维支架的发育，拉曼共振的多样性证实了发育结构具有丰富的生物化学性质。这里介绍的特征真菌发色团和代谢物的光学和光谱响应计算库对于理解真菌对各种纸制品（包括书籍、版画、素描、水彩画、雕刻甚至雕塑）的影响以及设计基于真菌菌丝垫的下一代材料至关重要。 关键词 拉曼、显微镜、真菌、纸、光学、密度泛函理论 引言 真菌界早期 [1] 的专业化归因于原真菌细胞在概念上依赖可渗透壁的生物学来提供快速分子运输和外部消化食物。后者在我们的生活中对真菌起着至关重要的作用：在工业和文化中。如果说系统地使用真菌作为生产剂的理念自直观的古代发酵以来一直发展缓慢，直到 19 世纪末设计出第一种草酸生产的药物化学方案 [2]，那么，人们直到最近几十年才开始意识到真菌作为我们日常生活中的积极参与者，无论是作为病原体，还是作为共生体，或者作为一种冷漠竞争的生命力，只有在了解这些生物组成了自己的王国之后，我们才能理解它们之间的区别 [3]。真菌对人类文化有着巨大的影响，这里我们讨论的是保存在纸质文物中的遗产。纸是一种由纤维素纤维制成的片状材料。在过去的两千年里，纸张是日常使用中信息存储和传输的主要“载体”，取代了蜡和粘土板、桦树皮和皮革羊皮纸。作为一种由多糖链构成的吸湿性有机材料，纸可能是许多微生物的营养来源。真菌是导致纸张降解的主要菌群 [4 ]。它们是图书馆、档案馆和博物馆中书面和印刷遗产的主要威胁 [5 ]。各种曲霉菌、镰刀菌、木霉菌、漆霉和青霉菌都能在纸上有效生长，并引起纸张基质的化学改变。