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在什么时机寄生虫攻击并消耗其宿主
图1。NPC的延迟移植可改善势后的长期移植物存活。（a）示意图显示了实验设计。免疫缺陷rag2 - / - 小鼠在1 dpi（急性）或7 dpi（延迟）处局部移植Rfluc表达NPC的局部移植。（b）激光多普勒成像证实中风后脑血流（CBF）减少。（c）中风诱导后2小时对CBF进行定量。（d）代表性的生物发光成像（BLI）说明了两组选定时间点的6周内NPC存活。（e）两组移植后的前3天内对BLI信号的定量。（g）在移植后7天使用EDU掺入的增生评估的示意性时间表，在42天（急性）和35天（延迟）移植后移植时进行染色，以跟踪移植物增殖。（h）在移植后7天，在35 dpi（延迟）和42 dpi（急性）天以35 dpi（延迟）和42 dpi（急性）天的7天和KI67 + NPC对EDU + NPC进行定量的代表性免疫荧光图像。（j）显示具有多能标记Nanog，NPC标记PAX6，Neuronal标记NEUN和星形胶质细胞标记GFAP的表型面板。（k）移植后六周移植的NPC（HUNU+）的代表性免疫荧光图像。比例尺：50µm。（l）急性移植组中移植物组成的定量。数据显示为平均分布，其中红点表示平均值。框图表示数据的25％至75％四分位数。总共使用了8只动物，每组4只动物。箱形图：图中的每个点代表一种动物。线图被绘制为平均值±SEM。使用未配对的Mann-Whitney U检验（C和E）或未配对的t检验（I）评估平均差异的显着性。统计显着性设置为 *，p <0.05； **，p <0.01; ***，p <0.001。
全基因组对大肠杆菌中替代性肽聚糖交联所需的基因的鉴定揭示了-lactams的意外影响多层网络中的遗传合作性暗示了亨廷顿氏病小鼠与症状同步的纹状体中的细胞存活和衰老
动机：亨廷顿氏病（HD）可以通过基因放松来发展。然而，基因放松管制对HD遗传合作的动力学的影响仍然很差。在这里，我们在HD敲入小鼠的大脑（等位基因HDH小鼠）的大脑中建立了一个多层网络模型。为了增强生物学精度和基因优先序列，我们整合了三个源网络的互补家族，所有这些都从HDH小鼠中的相同RNA-SEQ时间序列数据推断为加权 - 边缘网络，在该网络中，Edge-Edge-Edge-lates跨源网络跨源网络跨源网络和时点的路径长度变化。结果：加权边缘网络识别出富含受管化基因（临界阶段）的紧密遗传合作性的连续波，在皮质中曾经久经术，与纹状体呈现，并与纹状体相关，与细胞的存活有关（例如hipk4）与细胞增殖相互缠绕（例如scn4b）和细胞衰老（例如CDKN2A产品）响应。顶部纹状体加权边缘在HD发病机理的无脊椎动物模型中富含有缺陷行为的调节剂，从而验证了它们与体内神经元功能障碍的相关性。共同揭示了HDH小鼠大脑中遗传合作的高度动态的时间特征，其中2步逻辑突出了症状小鼠纹状体中细胞维持和延伸的重要性，提供了高度优先的靶标。联系人：Christian.neri@inserm.fr补充信息：补充数据可在Online BioInformatics获得。可用性和实现：加权边缘网络分析（WENA）数据和源代码，用于执行信号（SDS）的光谱分解（SDS）和Wena分析，均为使用Python编写，可在http://www.broca.inserm.inserm.inserm.fr/hd-wena/上获得。
使用基因组学破译候选门辐射的神秘特性和存活适应
摘要：微生物生态学是理解微生物在各种环境和健康相关过程中的组成，多样性和功能的关键领域。通过独立的方法发现候选门辐射（CPR）已引入了一种新的微生物划分，其特征在于以共生/寄生的生活方式，小细胞大小和小基因组为特征。尽管知之甚少，但CPR近年来由于它们在各种环境和临床样本中的广泛发现而引起了显着关注。与其他微生物相比，已经发现这些微生物表现出高度的遗传多样性。几项研究揭示了它们在全球生物地球化学周期中的潜在重要性及其对各种人类活动的影响。在这篇评论中，我们提供了CPR发现的系统概述。然后，我们专注于描述CPR的基因组特征如何帮助它们与不同生态壁ches中其他微生物进行互动并适应其他微生物。未来的工作应集中于发现CPR的代谢能力，并在可能的情况下隔离它们以更好地了解这些微生物。
评估用atezolizumab或化学疗法治疗的复发性尿路上皮癌患者的器官特异性病变动力学对生存的影响
1巴黎大学，Inserm iame，F-75018法国巴黎8 2 2巡回大学，南特大学，Inserm Sphere，UMR 1246，France，法国旅游9 3 3 3 Institut Roche，Boulogne-Billancourt，Boulogne-Billancourt，Boulogne-Billance，法国10 4临床药理学，Genetech/Roche，genetech/Roche，Bioft，Paref paref paref paref ost paref。瑞士12 6临床药理学，Genentech Inc.，南旧金山，加利福尼亚州，美国13 7产品开发，Genentech Inc.，南旧金山，美国加利福尼亚州，美国141巴黎大学，Inserm iame，F-75018法国巴黎8 2 2巡回大学，南特大学，Inserm Sphere，UMR 1246，France，法国旅游9 3 3 3 Institut Roche，Boulogne-Billancourt，Boulogne-Billancourt，Boulogne-Billance，法国10 4临床药理学，Genetech/Roche，genetech/Roche，Bioft，Paref paref paref paref ost paref。瑞士12 6临床药理学，Genentech Inc.，南旧金山，加利福尼亚州，美国13 7产品开发，Genentech Inc.，南旧金山，美国加利福尼亚州，美国14
特定的NQO2抑制剂S29434，仅略微改善了多巴胺神经元在MPTP感染小鼠中的存活
摘要：多年来，有证据表明胞质喹酮还原酶NQO2在帕金森氏症诱导的多巴胺神经元变性模型中可能的贡献作用，但大多数数据已在体外获得。因此，我们问了一个问题，NQO2是否参与MPTP的体内毒性，MPTP是一种经典用于帕金森氏病诱导神经变性的神经毒素。首先，我们表明NQO2在小鼠黑质中表达，nigra多巴胺能细胞体和人多巴胺能SH-SY5Y细胞也表达。一种高度特异性的NQO2抑制剂S29434能够减少具有星形胶质细胞U373细胞的SH-SY5Y细胞的共培养系统中MPTP诱导的细胞死亡，但在SHSY5Y单一培养物中无活性。我们发现S29434仅略微防止MPTP中毒在体内中的MPTP中的黑质酪氨酸羟化酶 +细胞损失。该化合物在第7天产生了多巴胺能细胞存活的略有增加，MPTP治疗后21个，尤其是1.5 mg和3 mg/kg剂量方案。未达到统计显着性的救援效应（除了在第7天进行了一个实验），并且在最新时间点随着4.5 mg/kg剂量的降低。尽管在小鼠MPTP模型中缺乏NQO2抑制剂的强大保护活性，但我们不能排除酶在帕金森氏变性中的可能作用，尤其是因为它在多巴胺能神经元中基本上表达。
循环死亡后受控捐赠中的心脏移植：使用重建的事件时间数据
CDCD心的总数占2021年在美国（美国）可用于移植的5.4％的捐赠者心脏，但是随着采用方法的采用和每种采购技术的普及，在未来几年中估计这可能会增加到30％（5）。有两种主要的技术来运输和灌注同种异体移植物，即直接采购方案（DPP）和正常热区域灌注（NRP）（6）。这两种技术旨在克服CDCD心脏移植的主要挑战，这在其“冷”和“温暖”阶段都可以最小化缺血时间。两种采购技术之间的主要区别在于插管的顺序和机器灌注阶段的性质。dpp涉及在插管前插管和机器灌注之前去除心脏，然后将器官放在植入前冷藏中。因此，前后机器灌注阶段之前和之后存在冷缺血时间。相反，NRP涉及在植入前的爆发前使用心肺旁路（CPB）和体内心脏的机器灌注（7）。两种策略都遭受了最初的“功能性缺血时间”，一旦启动了WLST，就会宣布死亡并完成手术通道时，灌注状态低。
重新分析的APOL1肾脏数据支持“种族”的新道德
精确药物需要准确鉴定临床相关的患者亚组。16电子健康记录为利用机器学习的主要机会提供了17种新的患者子组的方法。然而，许多现有的方法未能充分捕获诊断轨迹与疾病之间的复杂相互作用 - 19个相关风险事件，导致亚组在事件20风险中仍然可以显示出很大的异质性，并潜在的分子机制。为了应对这一挑战，我们实施了21个Vadesc-Ehr，这是一种基于变压器的自动编码器，用于聚类从电子健康记录中提取的纵向22生存数据。我们表明，Vadesc-ehr 23在合成和现实世界基准数据集上均优于具有24个已知地面真实集群标签的合成和现实基准数据集的基线方法。在应用于克罗恩病的应用中，vadesc-ehr 25成功地识别了四个不同的亚组，具有不同的诊断轨迹和风险26个特征，从而揭示了克罗恩病的临床和遗传相关因素。我们的结果27表明，Vadesc-ehr可以成为在28中发现精密医学方法的开发中发现新型患者子组的强大工具。29
Genomeocean：在大规模宏基因组组件上训练的有效基因组基础模型
补充图2。nf-k b调节肠道干细胞的增殖。（a）与野生型（ESG TS /+）相比，祖细胞特异性NF-K B耗竭（ESG TS /REL RNAI）10天后蝇的后肠。DNA用Hoechst（青色）标记的DNA，用ESG（黄色）标记的祖细胞，由ProS（Magenta）标记的肠内分泌细胞和由Armadillo（Magenta）标记的细胞边界。（b）与野生型相比，祖细胞特异性耗竭30天后蝇的后肠中肠。（c）野生型和祖细胞特异性的中肠中的pH3+有丝分裂细胞在10和30天后枯竭。使用ANOVA进行了显着性，然后进行成对Tukey测试。（d）pH3+细胞在IKK G同源物kenny（键）（e）在祖细胞特异性重击中的30天老蝇中每个核ESG+祖细胞的祖细胞特异性敲低后的pH3+细胞。（f）来自ESG TS，UAS-CFP，SU（H）-GFP的图像在祖细胞特异性耗竭30天后苍蝇。用ESG（黄色）和Notch阳性肠肠细胞前体标记的祖细胞（h）（Magenta）。（g）祖细胞池中祖细胞库内的su（h）+肠球前体的比例在特定于祖细胞的NF K B敲低时。使用学生的t检验发现了D，E和G的意义。A和B的比例尺为25 µm。A和B的比例尺为25 µm。
持续诱导自噬可提高蝾螈细胞在长期饥饿状态下的存活率
蝾螈表现出极强的抗饥饿能力，这让它们能够在自然栖息地中忍受长时间的无食物状态。虽然自噬（一种涉及进化上保守的蛋白质的过程）有助于在食物匮乏的情况下生存，但它如何导致蝾螈细胞极端的抗饥饿能力仍未被探索。我们的研究使用了蝾螈物种 Pleurodeles waltl，结果表明蝾螈初级成纤维细胞在长期细胞饥饿期间保持恒定的自噬激活。与正常哺乳动物成纤维细胞不同（在急性饥饿期间自噬体形成会增加，但在长时间后会回到基线水平），蝾螈细胞在自噬开始 4 天后仍保持较高的自噬体数量，超过在营养丰富条件下观察到的水平。与营养丰富和饥饿状态下的哺乳动物细胞相比，独特的 P. waltl mTOR 直系同源物均表现出降低的溶酶体定位。然而，蝾螈细胞在饥饿条件下表现出 mTOR 底物的去磷酸化，类似于哺乳动物细胞。这些观察结果表明，蝾螈可能已经进化出一种独特的系统来平衡看似相互冲突的因素：高再生能力和饥饿期间自噬介导的生存。
白色三叶草根茎分离s11n9的生存
抽象的新西兰牧民受益于白色三叶草侵蚀性共生的n 2，但根瘤菌的n固定能力差异很大。Rhizobium leguminosarum S11N9, isolated in NZ, outperforms the current commercial isolate TA1 in laboratory, glasshouse, and field trials.这项研究调查了S11N9的生产和保质期，以确立其作为白色三叶草的潜在新根茎接种剂的可行性。Freeze dried and peat inoculants were prepared for both the S11N9 and TA1 rhizobia.Peat inoculants were subsequently formulated into granules and seed coatings using AgResearch technologies.Both isolates produced similar fermentation yields.S11N9 stored as freeze-dried powder at 4 o C survived longer than TA1 (12 vs. 10 months, respectively).同样，当存储在4°C（分别为44.7 vs. 21.7个月）和20°C（分别为17.2 vs 9.1个月）时，S11N9泥炭接种剂的保存期比TA1更长。涂有S11N9的种子的初始载荷高于TA1（10 7 vs 10 6根瘤/g种子），但在20°C下以类似速率存储的种子上下降。在泥炭颗粒中，两个分离株在20°C下均稳定两个月，但TA1在三个月后降至目标规格以下，而S11N9保持在阈值以上。结果表明，分离株S11N9是TA1的有前途替代品，并且具有很高的潜力，可以作为白色三叶草的商业接种剂。