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World File Search System三联
具有 Cys-His-Asp 三联体的无金属 α/β-水解酶的超高通量定向进化为高效的磷酸三酯酶
摘要：寻找新的机制解决方案以应对生物催化挑战是酶进化适应以及设计新催化剂的关键。最近人造物质被释放到环境中，为观察生物催化创新提供了动态试验场。用作杀虫剂的磷酸三酯最近才被引入环境中，而它们并没有天然对应物。为了应对这一挑战，酶已迅速进化以水解磷酸三酯，并趋向于相同的机制解决方案，即需要二价阳离子作为催化的辅助因子。相比之下，先前发现的宏基因组混杂水解酶 P91（乙酰胆碱酯酶的同源物）实现了由金属独立的 Cys-His-Asp 三联体介导的缓慢磷酸三酯水解。在这里，我们通过对 P91 进行定向进化来探究这种新催化基序的可进化性。通过将聚焦库方法与液滴微流体的超高通量相结合，我们仅通过两轮进化就将 P91 的活性提高了约 360 倍（达到 ak cat / KM ≈ 7 × 10 5 M − 1 s − 1 ），可与自然进化的金属依赖性磷酸三酯酶的催化效率相媲美。与其同源物乙酰胆碱酯酶不同，P91 不会遭受自杀抑制；相反，快速的去磷酸化速率使共价加合物的形成而不是水解速率成为限制因素。定向进化改进了这一步骤，中间体的形成速度提高了 2 个数量级。将聚焦的组合库与液滴微流体的超高通量相结合，可以用于识别和增强自然界中尚未达到高效率的机制策略，从而产生具有新型催化机制的替代试剂。■ 简介
晚期黑色素瘤患者免疫检查点抑制和靶向治疗失败后，使用抗 PD-(L)1 加 BRAF/MEK 抑制剂（三联疗法）
a 德国埃森大学医院皮肤科、西德癌症中心、杜伊斯堡-埃森大学和德国癌症联盟 (DKTK) 皮肤科 b 瑞士苏黎世苏黎世大学医院皮肤科 c 澳大利亚新南威尔士州悉尼大学澳大利亚黑色素瘤研究所 d 德国海德堡大学医院皮肤科和国家肿瘤疾病中心 (NCT) e 德国埃尔朗根大学医院和埃尔朗根-纽伦堡欧洲大都会区综合癌症中心 (CCC ER-EMN) 皮肤科 f 德国图宾根大学医院皮肤科 g 美国田纳西州纳什维尔范德堡大学医学中心医学部、血液学和肿瘤学分部和范德堡-英格拉姆癌症中心 h德国埃森 i 澳大利亚新南威尔士州悉尼皇家北岸医院和 Mater 医院肿瘤内科 j 德国埃森校区国家肿瘤疾病中心 (NCT)-西部、鲁尔研究联盟、杜伊斯堡-埃森大学健康研究中心
五重肝癌芯片揭示 EMT 三联体相关...
原发性肝癌新发病例数为 90.6 万，在恶性肿瘤增长中位居第六位。此外，肝癌死亡人数为 83 万，在死亡率方面位居第三位（Sung et al.，2021）。肝细胞癌 (HCC) 是原发性肝癌的最重要形式，约占肝癌病例的 90%（Anwanwan et al.，2020）。多种风险因素可导致原发性肝癌的发展，包括乙型肝炎病毒 (HBV) 感染、丙型肝炎病毒 (HCV) 感染、纤维化慢性肝损伤、黄曲霉毒素 B1 和过量饮酒（Akinyemiju et al.，2017；欧洲肝脏研究协会和欧洲癌症研究与治疗组织，2012 年）。 HCC从具有微小基因突变的异常增生病变持续发展到HCC晚期，表现出涉及多种分子的显著分子异质性（Marquardt et al., 2015）。HCC发展多个阶段的广泛肿瘤异质性阻碍了患者的分层和有效治疗（Giannelli et al., 2016）。因此，探索HCC的肿瘤异质性将有助于对患者进行分层和有效治疗。HCC的肿瘤转化通常起源于肝细胞和祖细胞，两者都是上皮细胞类型。这些上皮细胞的可塑性变化通常被称为上皮-间质转化（EMT），增加了细胞异质性的复杂性（Giannelli et al., 2016）。癌细胞中的EMT程序可以在侵袭和转移过程中以不同程度暂时或稳定地激活。粘附分子高表达可增强细胞的迁移能力和侵袭性。大量证据表明，EMT在癌症侵袭和转移中起着重要作用（Nieto et al.，2016；Thiery et al.，2009；Thiery，2002；Hanahan and Weinberg，2011）。通过分析恶性上皮性肝细胞的各种EMT表型，研究人员可以评估HCC的复杂性和细胞异质性。很少有研究在大量的活检样本中研究几种EMT标志物，因此很难仅根据单一标志物来判断EMT的发生（Yang et al.，2009）。E-cadherin与occludin或细胞角蛋白一起代表了最常用的上皮特征标志物，而N-cadherin和vimentin是最常见的EMT标志物。
社会、经济和技术三联画
1,2,3 管理科学博士，哈桑二世大学，摩洛哥 摘要：本文从社会、经济和技术三个角度探讨了创新的多方面挑战。本文首先概述了创新的历史重要性及其不断发展的定义，然后深入探讨了创新的概念格局，将创新分为发明、创造力和新产品开发。然后讨论转向创新挑战，从社会问题开始，例如社会包容和公共当局在创新治理中不断变化的作用。本文讨论了经济挑战，强调了经济增长需要创新，同时认识到创新可能破坏就业和颠覆行业。最后，本文探讨了技术挑战，包括数据安全、可持续性和公平使用。本文具有三重贡献，因为它强调了应对这些挑战以促进社会包容、经济公平和技术负责的创新的重要性。因此，创新为进步提供了机会，但谨慎的管理和道德考虑对于可持续和平衡的未来至关重要。
了解牙周病原体三联征
3. Lourenço TGB、Heller D、Silva-Boghossian CM、Cotton SL、Paster BJ、Colombo APV 等。牙周健康和患病患者的微生物特征谱。临床牙周病学杂志。2014；41(11)：1027-36。4. Arora N、Mishra A、Chugh S。微生物在牙周炎中的作用：我们到达顶峰了吗？除了红色复合体之外，还有一些未被发现的细菌。印度牙周病学会杂志。2014；18(1)：9-13。5. Belibasakis GN、Belstrøm D、Eick S、Gursoy UK、Johansson A、Könönen E 等。牙周微生物学和牙周病的微生物病因：历史概念和当代观点。牙周病学 2000。 2023；第 1-17 页。6. Socransky SS、Haffajee AD。牙周微生物生态学。牙周病学。2000；38(1):135-87。7. Mohanty R、Asopa S、Joseph M、Singh B、Rajguru J、Saidath K 等人。红色复合体：口腔菌群中的多微生物聚集体：综述。家庭医学初级护理杂志。2019；8(11):3480-6。8. Shaikh HM、Patil S、Pangam T、Rathod K。多微生物协同作用和菌群失调：概述。印度牙周病学会杂志。2018；22(2):101-6。 9. Joshi V、Bhat K、Kugaji M、Ingalgi P。印度慢性牙周炎患者和牙周健康成人中伴放线杆菌的出现情况。印度牙周病学会杂志。2016；20(2)：141-4。10. Holt SC、Kesavalu L、Walker S、Genco CA。牙龈卟啉单胞菌的毒力因子。牙周病学。1999；20：168-238。11. Slots J、Listgarten MA。牙龈拟杆菌、中间拟杆菌和伴放线杆菌与人类牙周病的关系。临床牙周病学杂志。1988；15(2)：85-93。 12. Potempa J、Sroka A、Imamura T、Travis J。牙龈卟啉单胞菌的主要半胱氨酸蛋白酶和毒力因子：多域蛋白复合物的结构、功能和组装。Curr Protein Pept Sci。2003；4(6)：397-407。13. Mayrand D、Grenier D。外膜囊泡的生物活性。Can J Microbiol。1989；35(6)：607-13。14. Mihara J、Holt SC。从牙龈卟啉单胞菌W50中分离的成纤维细胞活化因子的纯化和表征。Infect Immun。1993；61(2)：588-95。15. Mihara J、Yoneda T、Holt SC。牙龈卟啉单胞菌衍生的成纤维细胞活化因子在骨吸收中的作用。感染免疫。1993；61（8）：3562-4。16. Onishi S、Honma K、Liang S、Stathopoulou P、Kinane D、Hajishengallis G 等人。Tannerella forsythia 亮氨酸富集重复蛋白 BspA 在牙龈上皮细胞中表达 Toll 样受体 2 介导的白细胞介素 8。感染免疫。2008；76（1）：198-205。17. Armitage GC、Dickinson WR、Jenderseck RS、Levine SM、Chambers DW。龈下螺旋体百分比与牙周病严重程度的关系。牙周病学杂志。 1982；53(9)：550–6。 18. Honma K、Inagaki S、Okuda K、Kuramitsu HK、Sharma A。连翘胞外多糖合成操纵子在生物膜发育中的作用。微生物病原体。 2007；42(4)：156–66。 19. Socransky SS、Haffajee AD、Cugini MA、Smith C、Kent RL。龈下牙菌斑中的微生物复合体。临床牙周病学杂志。1998；25(2):134-44。20. Hajishengallis G. 牙周炎：从微生物免疫颠覆到全身炎症。自然免疫学评论。2015；15(1):30-44。21. Lamont RJ、Koo H、Hajishengallis G. 口腔微生物群：动态群落和宿主相互作用。自然微生物学评论。2009；16(12):745-59。22. Chakar C、Menassa G、Khayat R. 牙周微生物组第一部分：文献综述。国际阿拉伯牙科杂志。2021；12(1):41-7。23. Priyadharsini JV。通过计算机模拟验证非抗生素药物对乙酰氨基酚和布洛芬作为抗红色复合病原体的抗菌剂。《牙周病学杂志》。2019；90(12)：1441-8。24. Ushanthika T、Girija ASS、Paramasivam A、Priyadharsini JV。通过计算机模拟方法识别利血平靶向的红色复合病原体中的毒力因子。《天然产物研究》。2021；35(11)：1893-8。25. Maheaswari R、Kshirsagar J、Lavanya N。聚合酶链反应：牙周病学的分子诊断工具。《印度社会科学杂志》
SBFI-26 增强多西他赛治疗的三联疗法中的细胞凋亡......
摘要简介：脂肪酸结合蛋白 5 (FABP5) 在三阴性乳腺癌中表现出较高的表达水平。FABP5 的抑制剂 Stony Brook 脂肪酸结合蛋白抑制剂 26 (SBFI-26) 已证明具有抑制细胞增殖、迁移和侵袭的能力。本研究深入探讨了 SBFI-26 与多西他赛联合治疗三阴性乳腺癌 MDA-MB-231 细胞的功能机制和影响。方法：选择不同浓度的多西他赛和 SBFI-26 进行单独或联合治疗。使用流式细胞术评估 SBFI-26、多西他赛或它们的组合对细胞周期停滞和细胞凋亡的影响。采用Western印迹法检测凋亡相关蛋白的表达，即半胱氨酸天冬氨酸特异性蛋白酶3（Caspase3）、B细胞白血病/淋巴瘤2（Bcl- 2）和Bcl-2相关X（Bax），同时用荧光分光光度计测定细胞内活性氧（ROS）水平。结果：SBFI-26和多西他赛抑制MDA-MB-231细胞的IC50值分别为106.1μM和86.14nM。与对照组相比，联合治疗使G1期（凋亡）细胞的比例增加了3.67倍（P <0.0001）。联合组细胞凋亡率是多西紫杉醇组的 2.59 倍（ P < 0.0001），与 SBFI-26 组相比显著增加 1.82 倍（ P < 0.001）。分析显示，对于 MDA-MB-231 细胞，联合组 Bcl-2 蛋白表达降低，Bax 和 Caspase3 蛋白表达增加。此外，联合治疗组的 ROS 荧光强度是对照组的 2.97 倍（ P < 0.0001），与 SBFI-26 治疗组相比显著增加 1.39 倍（ P < 0.01），与多西紫杉醇治疗组相比显著增加 1.70 倍（ P < 0.0001）。结论：这些研究结果表明，SBFI-26 与多西他赛联合给药可通过提高细胞内 ROS 水平有效增强三阴性乳腺癌 MDA-MB-231 细胞的凋亡。
DNA模板链中的特定碱基三联素为5 ...
DNA模板链中的一个特定碱基三联体为5'Agt 3'。此序列对应于密码子：O3'UCA 5。问题22（2分）以下哪项是密码子不正确的？它永远不会代码多个氨基酸；它是遗传密码的基本单位；它代码甲硫氨酸停止；它可能与另一个密码子相同的氨基酸编码；或它由三个核苷酸组成。将mRNA转化为多肽的主要结构的准确性取决于：核糖体与mRNA的结合，反密码子与密码子的键，核糖体的A和P位点的形状，氨基酸与TRNA的附着；或以上所有选项。模板链以3'至5'的方向读取，而mRNA则以5'至3'方向读取。在mRNA中发现的相应密码子将是UCA。
序列改变如何增强 DNA 三联体重复域的稳定性并延缓其扩展
DNA 重复域内的 DNA 序列改变莫名其妙地增强了中断重复域的稳定性并延迟了其扩展。在这里，我们提出了合理化这种意外结果的机制。具体而言，我们描述了 DNA 重复域的中断如何通过引入环迁移的能量障碍来限制可用于动态、滑出、重复凸起环的集合空间。我们解释了这种障碍是如何产生的，因为一些可能的环异构体会导致重复域双链部分出现能量昂贵的错配。我们认为，集合空间的减少是导致观察到的重复 DNA 扩展延迟的原因。我们进一步假设，在某些扩展 DNA 中观察到的中断重复的丢失反映了环异构体位置的瞬时占据，这导致双链体茎因能量障碍的“泄漏”而出现错配。我们认为，如果这种低概率事件的寿命允许错配修复系统识别，那么就可以发生重复中断的“修复”；从而合理化了最终扩增的 DNA“产品”中没有出现中断的原因。我们提出的机制途径为被描述为“令人费解”的观察结果提供了合理的解释，同时也对一组具有生物医学重要性的耦合基因型现象提供了深刻的见解，这些现象描绘了 DNA 折纸热力学和表型疾病状态之间的联系。
关于技术-组织-人员三联画的一些澄清
简介 过去两年来，国际系统工程理事会 (INCOSE) 的人机系统集成 (HSI) 工作组一直在编写一个 3 页的章节来综合 HSI。我们绘制了下图（图 1），其中 TOP 模型（技术-组织-人员 [5]）是环境中支持的中心并行设计和管理流程。事实上，如果没有技术、组织和人员活动以及随之而来的工作的并行和增量设计，就无法思考 HSI。环境是定义 TOP 模型的地方（例如，医疗环境、空域、战场）。应该从各个角度来看待这一点：安全；能力和专业精神；可持续性；宜居性；职业健康；社会、文化和组织因素；培训；HSI 规划；人为因素工程；劳动力规划；综合后勤支持和维护。这些观点需要四个核心学科和实践：系统工程；人为因素和人体工程学 (HFE)；信息技术；以及相关的作战领域。
社会工效学：关于技术-组织-人员三联画的一些澄清
在过去的两年里，国际系统工程理事会 (INCOSE) 人机系统集成 (HSI) 工作组正在编写一个综合 HSI 的 3 页章节。我们得出了下图（图 1），其中 TOP 模型（技术-组织-人员；Boy，2020）是环境中的中心并行设计和管理流程支持。事实上，如果没有技术、组织和人员活动的并行和增量设计，以及随之而来的工作，就无法思考 HSI。环境是定义 TOP 模型的地方（例如，医疗环境、空域、战场）。这应该从各个角度来看：安全；能力和专业精神；可持续性；宜居性；职业健康；社会、文化和组织因素；培训；HSI 规划；人为因素工程；劳动力规划；综合后勤支持和维护。这些观点需要四个核心学科和实践：系统工程；人为因素和人体工程学 (HFE)；信息技术；以及相关的作战领域。