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World File Search System丰度
baumannii vieuvirus噬菌体的丰度和多样性的地理变化
病毒是地球上最丰富的生物学实体（Breitbart和Rohwer，2005年）。噬菌体或噬菌体，特别是感染了脑原生物的微生物。这些噬菌体通过裂解循环复制，裂解循环是典型的有毒噬菌体的，或以预言整合到宿主基因组中，或者在宿主细胞质中复制为质粒（Piligrigimova等，2021）。综合噬菌体基因组（预言）与宿主染色体一起复制，并通过细胞分裂从初始感染细胞转移到其后代（Maurice等，2013）。整合到细菌染色体中可以改变宿主表型，并将新基因和功能引入细菌代谢库中（Ramisetty和Sudhakari，2019年）。预言编码负责抗生素耐药性和/或毒力因子的基因（Costa等，2018; Kondo等，2021;López-Leal等，2020;Piña-González等，2024，2024），为其细菌宿主提供适应性益处（Li et al。
使用 DNA 宏条形码进行丰度估计
全球生物多样性正以惊人的速度下降，迫切需要进行大规模监测以了解其变化及其驱动因素。虽然传统的物种分类学鉴定耗时耗力，但与基于 DNA 的方法相结合可以扩大监测活动的规模，以实现更大的空间覆盖范围和增加采样工作量。但是，当需要估计每个物种的个体数量和/或生物量时，基于 DNA 的方法仍然存在挑战。已有多种方法学进展可提高 DNA 宏条形码用于丰度分析的潜力，但仍需要进一步评估。在这里，我们讨论了实验室以及一些生物信息学对 DNA 宏条形码工作流程的调整，以了解它们从节肢动物群落样本中估计物种丰度的潜力。我们的综述包括标本拍照等实验室前处理方法、使用掺入 DNA 作为内标等实验室方法以及校正因子等生物信息学进展。我们得出的结论是，标本摄影与 DNA 条形码相结合目前最有可能实现对每个物种个体数量和生物量估计的估计，但诸如峰值和校正因子等方法是有希望进一步研究的方法。
二氧化碳固定微生物的多样性，丰度和生物地理学
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。它是此预印本版本的版权持有人，该版本发布于2025年2月7日。 https://doi.org/10.1101/2025.02.07.637021 doi：Biorxiv Preprint
侵入性外星杂草物种的丰度和地理分布
尚未在西阿姆哈拉地区发现的植物入侵者开始出现并产生负面影响。 进行了这项研究，以评估西部阿姆哈拉地区侵入性外星杂草（IAW）的丰度和地理分布。 以5-10 km的定期间隔进行了140个字段，并使用Garmin GPS接收器记录采样点的地理坐标，以绘制主要IAWS侵扰的程度。 iaws类型及其丰度是从每个采样点记录的。 计算频率和平均覆盖率分别量化了IAW的地理分布和丰度。 这项研究的结果表明，在路边，放牧的土地和农田的不同栖息地和农业水平上，在不同栖息地和农业生态的西部地区记录了14个IAW。 在这些IAWS Argemone墨西哥，Datura Stramonium，Senna Didymobotrya和Tagetes minuta中被广泛分布在研究区域，频率分别为51.4％，73％，66％和51.4％，但其他人的频率低于25％。 该研究的结果还表明，大多数IAW具有较低的丰度水平，除了三个物种（墨西哥armexana，datura stramonium和senna didymobotrya），这些物种经常达到丰富水平。 因此，应采取适当的管理实践的早期检测和消除，以减少少量出现在放牧和裁剪土地上的IAW风险。 此外，提高公众意识也将为解决IAW提供协同效果。 简介尚未在西阿姆哈拉地区发现的植物入侵者开始出现并产生负面影响。进行了这项研究，以评估西部阿姆哈拉地区侵入性外星杂草（IAW）的丰度和地理分布。以5-10 km的定期间隔进行了140个字段，并使用Garmin GPS接收器记录采样点的地理坐标，以绘制主要IAWS侵扰的程度。iaws类型及其丰度是从每个采样点记录的。频率和平均覆盖率分别量化了IAW的地理分布和丰度。这项研究的结果表明，在路边，放牧的土地和农田的不同栖息地和农业水平上，在不同栖息地和农业生态的西部地区记录了14个IAW。在这些IAWS Argemone墨西哥，Datura Stramonium，Senna Didymobotrya和Tagetes minuta中被广泛分布在研究区域，频率分别为51.4％，73％，66％和51.4％，但其他人的频率低于25％。该研究的结果还表明，大多数IAW具有较低的丰度水平，除了三个物种（墨西哥armexana，datura stramonium和senna didymobotrya），这些物种经常达到丰富水平。因此，应采取适当的管理实践的早期检测和消除，以减少少量出现在放牧和裁剪土地上的IAW风险。此外，提高公众意识也将为解决IAW提供协同效果。简介关键词：丰度，分布，侵入性对齐杂草物种，西部阿姆哈拉地区。
寻求宿主的ixodes的季节性ricinus若虫丰度与气候有关
人们对气候变化及其对人类健康的影响越来越关注。特别是，全球变暖可能会增加新兴的传染病的可能性，尤其是由于疾病媒介（例如蚊子和壁虱）的地理和季节性分布的变化。为了进行检查，ixodes ricinus是欧洲最常见和最广泛的壁虱物种的范围，目前正在向北扩展和较高的高度。然而，对于不同气候中滴答的季节性变化知之甚少。I. Ricinus的季节性通常是基于专家意见，而领域调查通常受到限制。我们的目标是描述不同气候下的ricinus丰度的季节性变化。为此，一项为期七年的纵向研究，每月对综合体宿主寻求若虫的每月集合，在法国进行，在与不同气候相对应的六个位置进行。tick数据在几年之间进行了对数转换和分组，以便在典型的一年中获得海洋变化。在研究期间测量每日平均温度。使用线性谐波回归为六个不同的位置建立了若虫丰度的季节性模式。为每个位置分别估计模型参数。季节性的餐具似乎不同。西部温带地点显示出早春的峰，夏季的最低限度和中等的秋季和冬季丰度。更多的连续地点显示在春季的峰值，冬季最少。山峰在夏天发生在山区，冬天没有tick虫。在所有情况下，除山区外，春季峰的时机可能与自年初以来的学位天数有关。冬季丰度与相应温度正相关。我们的结果突出显示了与不同气候相对应的不同地点的清晰模式，这可以进一步预测气候条件下的tick季节性。
环境 DNA 条形码与基于等级的丰度 1 之间存在密切的关系
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控制海洋中硝化微生物的相对丰度和速率
摘要。硝化作用控制了可生物利用氮的氧化状态。不同的化学自动微生物 - 主要是氨氧化的Ar- chaea（AOA）和二硝酸盐氧化细菌（NOB） - 调节海洋中硝酸盐的两个步骤，但要对其贡献的贡献量进行，但可以通过贡献量来指导，并通过贡献率进行了贡献。碳固定仍未解决。 使用具有硝化功能类型的机械性微生物生态系统模型，我们在深层氧化的开阔海洋中为AOA和NOB的控件提供了简单的表达式。 AOA和NOB的相对生物量产生，损失率和细胞配额控制其相对丰度，尽管我们不需要调用损失率的差异来解释观察到的相对丰度。 铵的供应，而不是AOA或NOB的特征，在稳态下控制相对相等的AM-MONIA和亚硝酸盐氧化速率。 单独使用AOA和NOB的相对屈服将其相对大量的碳固定速率设置在水柱中。 定量关系船与多个原位数据集一致。 在整体全球生态系统模型中，硝化作用是在各种海洋环境中动态出现的，由于某些环境中的物理运输和复杂的生态相互作用，氨和亚硝酸盐氧化及其相关的碳偶联速率被解耦。 然而，简单的表达式将全局模式捕获到第一阶。 模型不同的化学自动微生物 - 主要是氨氧化的Ar- chaea（AOA）和二硝酸盐氧化细菌（NOB） - 调节海洋中硝酸盐的两个步骤，但要对其贡献的贡献量进行，但可以通过贡献量来指导，并通过贡献率进行了贡献。碳固定仍未解决。使用具有硝化功能类型的机械性微生物生态系统模型，我们在深层氧化的开阔海洋中为AOA和NOB的控件提供了简单的表达式。AOA和NOB的相对生物量产生，损失率和细胞配额控制其相对丰度，尽管我们不需要调用损失率的差异来解释观察到的相对丰度。铵的供应，而不是AOA或NOB的特征，在稳态下控制相对相等的AM-MONIA和亚硝酸盐氧化速率。单独使用AOA和NOB的相对屈服将其相对大量的碳固定速率设置在水柱中。定量关系船与多个原位数据集一致。在整体全球生态系统模型中，硝化作用是在各种海洋环境中动态出现的，由于某些环境中的物理运输和复杂的生态相互作用，氨和亚硝酸盐氧化及其相关的碳偶联速率被解耦。然而，简单的表达式将全局模式捕获到第一阶。模型
青藏高原高寒草地植物物种丰富度及其与环境因子和生物量的关系
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主要的环境驱动因素的丰度，多样性和社区结构在稻田中
最近发现的完整氨氧化剂（comammox硝基螺旋体）包含了进化枝A和B，该进化枝A和B建立了一个独立的一步硝化过程。但是，对于农业土壤中的环境驱动因素或栖息地分布知之甚少。先前对稻田中硝基核心的研究主要集中在小型样品上，并且缺乏对稻田中comammamox硝基螺旋体的多站点研究。在这项研究中，我们对36个稻田的调查进行了调查，旨在了解Comammox硝基核心社区结构，丰富性和多样性以及它们受环境因素的影响程度。comammox硝基螺旋藻被发现广泛分布在稻土中。comammox硝基螺旋向进化枝A的丰度大多低于进化枝B，而其多样性大多高于Bade B.相关分析表明，多个因素影响了Comammox硝基螺旋体的丰度，包括pH，土壤有机物，总碳，总氮，纬度，平均年温度和平均年降水量（P <0.05）。此外，comammox硝基螺旋藻群落和栖息地之间存在明显的关系，表明某些扩增子序列变体（ASV）在特定栖息地中具有独特的主导地位。的系统发育分析表明，comammox硝基螺旋藻的ASV是由稻田中已知序列聚集的，与其他栖息地中的已知序列有显着差异。这可能与稻田的独特栖息地有关。相比之下，comammox硝基螺旋向进化枝B没有显示出明显的栖息地依赖性。这些结果支持稻田中硝基核心的广泛分布和大量的丰富性，并提供了对农业生态系统中氮循环和营养管理的新见解。