叶际代表一个独特的生态位,其中微生物获得了降解木质纤维素 (1) 的能力,以便在贫营养条件下生存。从叶际回收的微生物中,存在属于类芽孢杆菌科和糖芽孢杆菌属的细菌 (2)。糖芽孢杆菌属菌株 WB 17 是从 2018 年 1 月从法国香槟-阿登地区采集的小麦麸皮叶际培养物中回收的。培养在 30°C 的 1 M3 培养基 (3) 上进行,培养基中添加了小麦麸皮,有氧培养。糖芽孢杆菌属 WB 17 是根据其 16S rRNA 基因序列进行鉴定的,与糖芽孢杆菌属有关。为了进一步表征糖芽孢杆菌属的代谢潜力。 WB 17 及其分离木质纤维素的能力,对其整个基因组进行了测序。Saccharibacillus sp. WB 17 在 Luria-Bertani 培养基中在 30°C 下生长 48 小时,并使用 PureLink 基因组 DNA 迷你试剂盒(赛默飞世尔科技)提取其基因组 DNA。使用 Nextera DNA 样品制备试剂盒(Illumina,美国加利福尼亚州圣地亚哥)按照制造商的用户指南进行全基因组散弹枪测序(2 150 bp),并在 NovaSeq 系统(MR DNA [Molecular Research],美国德克萨斯州 Shallowater)上进行测序。总共获得了 30,007,734 个读数。使用 FastQC (4) 对序列数据文件进行质量过滤,然后通过 SOAPdenovo(版本 2.04)(5)进行从头组装;所有软件均使用默认参数。共检测到47个contig,测序覆盖度为409倍。N 50 值为205,341 bp。组装基因组大小为5,391,836 bp。该菌株的基因组大小介于两个最接近的Saccharibacillus亲属之间(Saccharibacillus sacchari GR21 T 为6.08 Mbp,Saccharibacillus kuerlensis HR1 T 为4.69 Mbp)。Saccharibacillus sp. WB 17的GC含量为58.82%。该值在Saccharibacillus基因组已知值范围内。事实上,之前测序的基因组记录的 GC 含量值如下:58.4 mol% ( Saccharibacillus qingshengii H6 T ) (6)、57.8 mol% ( S. sacchari GR21 T ) (7)、50.5 mol% ( S. kuerlensis HR1 T ) (8) 和 55.5 mol% ( Saccharibacillus deserti WLJ055 T ) (9)。Saccharibacillus sp. WB 17 的基因组草图由 NCBI 原核生物基因组注释流程 (PGAP) ( https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/annotation_prok ) 注释;它包含 73 个 tRNA、4,826 个基因和 4,730 个编码序列 (CDS)。仅注释了 1,139 个 CDS,占基因组内容的 22%。根据碳水化合物活性酶数据库 (CAZy) 数据库 (10),基因组共编码 236 个碳水化合物活性酶,分为五类,即糖苷水解酶 (145 个 CDS)、糖基转移酶 (31 个 CDS)、多糖裂解酶 (3 个 CDS)、碳水化合物酯酶 (31 个 CDS) 和碳水化合物结合模块 (21 个 CDS);然而,
关键术语 1. 州标准:指纽约州下一代学习标准,与纽约州实施时间表保持一致,以及文化响应-可持续教育期望,这反映了州政府致力于通过创建完善的、文化响应-可持续的、公平的支持系统来提高所有学生的学习成绩,从而显著提高学生的学习成绩 2. 大学和职业准备让所有学生走上充满选择的生活道路;它应该包括中学后的成果和途径,即学生离开高中时做好准备,走上独立生活和符合他们热情和目标、能提供长期经济保障的职业道路。这种准备包括但不限于与兴趣、技能和需求相符的强有力计划;下一步的领先一步,包括早期大学学分和/或行业认可的资历;职业经验和与市场相符的职业主题指导;持久技能,包括金融知识、数字技术和计算思维 3. 所有学生/学习者包括学校人口中的所有人口群体,包括历史上被边缘化的群体 4. 严谨的习惯或高阶技能:韦伯的知识深度 (DOK) 工具和赫斯的认知严谨矩阵告知了“严谨的习惯”和“高阶技能” 5. 英语语言学习者(称为 ML/ELL,以强调这些学生作为多语言学习者所带来的资产和先前知识)是母语或主要语言不是英语且需要支持以达到英语语言水平的学生。多语言学习者 (ML) 包括当前的英语语言学习者 (ELL)、曾经是 ELL 但已退出 ELL 身份的学生、从未是 ELL 且以另一种语言为母语的学生以及世界语言学生 6。通过在学校质量评估标准中识别历史上被边缘化的群体,可以承认我们的学校存在于社会、经济和政治体系中,这些体系在历史上一直存在教育不平等,并且基于种族、经济背景、性别、语言、性取向、国籍、宗教和能力而对学生群体产生不成比例的结果。在无数数据点上,与白人和普通教育学生相比,纽约市公立学校的有色人种学生、英语语言学习者和残疾学生取得的结果历来不公平。然而,纽约市学校系统中学生在学业成长和成就方面最大的差距始终是基于种族。当其他所有人口统计数据保持不变时,与白人学生相比,黑人和拉丁裔/西班牙裔学生的成就率仍然低得离谱。虽然历史上的边缘化影响了许多群体,但在本评分标准中使用该术语是为了除了关注 ML/ELL 和残疾学生之外,还关注有色人种学生。这一关注将支持对不成比例数据的认识,因为我们努力为每个学校人口中的所有学习者实现加速学习和显着进步 7. 访问:通用学习设计(UDL)为本评分标准的课程规划和访问修订提供信息 8. 共同评估:教师使用一种共享评估或使用衡量共同技能的不同评估来评估学生在各个班级和一段时间内的进步 9. 包容性文化:纽约州教育厅将文化理解为一个人身份的多个组成部分,包括但不限于:种族、经济背景、性别、语言、性取向、国籍、宗教和能力。包容性文化响应和维持文化,并将其视为学习的资产 10. 学术和个人行为包含一系列支持复原力以及大学入学和坚持的指标。这些行为分为五类