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固氮细菌的分离、特性和鉴定
氮是植物生长的关键元素，可促进植物的生机、光合作用和整体活力。本研究重点是从孟加拉国库尔纳市孙德尔本斯的无瓣海桑根际中分离、鉴定和鉴定固氮细菌，目的是评估它们作为生物肥料的潜力。尽管孙德尔本斯的微生物多样性丰富，但由于培养困难，目前鉴定出的种类不到 5-10%，这限制了对其应用的探索。在本研究中，使用无氮培养基（包括酵母提取物甘露醇琼脂 (YEMA) 和 Burks 培养基）分离固氮细菌，然后进行氨化试验以选择产氨细菌。该过程产生了十种能够产生吲哚-3-乙酸 (IAA) 的固氮细菌分离物。进行了各种生化测试，包括氧化酶、过氧化氢酶、甲基红、吲哚、脲酶、柠檬酸、三糖铁和淀粉水解。这些分离物被命名为 AK1 至 AK10，分别被鉴定为 Rossellomorea sp.、Clostridium sp.、Achromobacter sp.、Pseudomonas sp.、Gluconacetobacter sp.、Scytonema sp.、Pseudomonas sp.、Nesterenkonia sp.、Gluconacetobacter sp. 和 Bacillus sp.。此外，分离物 AK1、AK3、AK4 和 AK10 已通过 16S rRNA 测序得到确认。盆栽试验进一步表明，分离物 AK-1 显著刺激了玉米幼苗的生长和发育。未来需要研究这些细菌分离物对作物产量和种子质量的影响，以更好地确定它们是否适合用作生物肥料。
几丁质降解菌的筛选与鉴定...
序列号 细菌分离物 透明区 (mm) 1. SSCL1 7 2 SSCL2 7.5 3 SSCL3 7 4 SSCL4 8.1 5 SSCL5 9 6 SSCL6 8.5 7 SSCL7 8.3 8 SSCL8 7 9 SSCL9 7.8 10 SSCL10 14 11 SSCL11 8.2 12 SSCL12 7.1 13 SSCL13 9 14 SSCL14 11 15 SSCL15 8.3 16 SSCL16 8.4 仅产生透明区超过 5mm 的分离物被挑选出来并进行二次
检测和鉴定医学重要性细菌
引言葡萄球菌是在环境中抵抗最大的非孢子细菌。在干燥的临床样品中可能存活数月，具有相对耐热性，可以耐受盐浓度升高。然而，尽管存在抗菌素，改善了卫生条件和医院感染控制措施，但这种微生物仍然是人类最重要的病原体之一。健康的个体通过金黄色葡萄球菌从母乳喂养中间歇性地殖民，并且可以在鼻咽中容纳微生物，偶尔在皮肤上，而在阴道中很少。在这些部位，金黄色葡萄球菌可能通过直接接触或气溶胶污染患者的皮肤和粘膜，无生命的物体或其他患者，从而导致致命的感染因毒力或对当前使用的抗菌药物的抗性而导致致命感染。葡萄球菌葡萄球菌引起的感染病例部分抗性抗生素，例如万古霉素，而阴性葡萄球菌凝结酶的报道必须发展出抗性。因此，需要快速有效地识别这些微生物出现的所有情况。链球菌是抗抗生素时代医院感染的最大原因，导致感染和产后妇女死亡。肠球菌的重要性越来越重要，因为由于传统上用于治疗这些感染的抗生素几乎完全抵抗力，引起了医院感染。尽管目前不是医院感染的重要原因，但是即使在免疫能力的患者中，它们也会引起非常严重且经常致命的疾病，并且该药物的快速诊断很重要。最常见的肠球菌是：粪肠球菌（占病例的90％）和肠球菌粪便，患者的殖民能力较大，医院使用的污染表面或设备。它们对称为糖肽的抗生素具有敏感性或可变性，例如万古霉素和二甲苯蛋白酶。目前有天然可抗性的共生菌株可以从住院的患者中隔离，但尚无法引起暴发，但应正确识别。初步鉴定链球菌和葡萄球菌的鉴定基于液体培养基中存在的形态。由于链球菌是通常的长链，葡萄球菌以椰子的形式证明了葡萄卷曲或分组。识别推定始于对RAM血板上的主要接种，该接种应在5％CO²中孵育（蜡烛方法或煤炭2）。葡萄球菌菌落通常更大，凸面，着色范围从白色到黄色，并且可能有溶血。应注意的是，金黄色葡萄球菌中淡黄色的发育仅在室温下长时间孵育（72 h）后才发生。链球菌菌落倾向于较小（untiforms），并且总溶血卤素（β和α溶血）。p riva da c atalase带有细菌环或牙签将可疑菌落的中心收集，并摩擦到玻璃刀片中。将3％过氧化氢下降到此涂片上，并观察到气泡的形成。对于家族微核心素（葡萄球菌），证明通常为正，而对于链球菌家族（链球菌）为阴性。
鉴定新的免疫突触定位...
摘要 尽管已鉴定出许多免疫突触 (IS) 蛋白种类，但仍有许多 IS 定位蛋白种类未知。了解靶细胞和淋巴细胞之间 IS 的蛋白质组对于推进免疫肿瘤学至关重要。然而，IS 的低丰度和缺乏明确的富集标记阻碍了有效的蛋白质组学分析。在本研究中，我们利用 MicroscoopTM，这是一种集成显微镜、机器学习和光化学标记的创新系统，可以精确且空间特异性地富集 IS 蛋白，从而促进 IS 的蛋白质组学发现。我们使用 Raji B 细胞作为抗原呈递细胞 (APC)，并用 Jurkat T 细胞诱导 IS 形成。该系统首先采用 CD3（Jurkat T 细胞中常见的 IS 标记）的免疫荧光成像，并利用基于卷积神经网络的深度学习算法从 CMTPX 染色的 Raji B 细胞中识别 IS 形成。我们的自动化系统通过多轮成像、深度学习驱动的模式生成和光化学标记，成功实现了 IS 处蛋白质的空间靶向生物素标记。随后的链霉亲和素下拉和质谱分析使 IS 特异性蛋白质得以鉴定。值得注意的是，我们的空间蛋白质组学方法分离和鉴定了 IS 界面上的数百种不同物种，包括与 T 细胞受体 (TCR) 信号通路关键成分相关的蛋白质，例如 TCR/CD3 复合物、Src 和 Tec 家族酪氨酸激酶和关键 NF-kB 信号蛋白。此外，我们还发现了大量以前与 IS 不相关的蛋白质。我们的研究不仅阐明了 IS 界面上免疫调节的未知方面，而且对癌症研究具有重要意义，特别是在理解和操纵免疫反应以用于治疗目的方面。
鉴定针对 SARS 的潜在候选疫苗...
6. 参考文献 1. Holshue, ML, et al., 美国首例 2019 新型冠状病毒病例。新英格兰医学杂志，2020 年。 2. https://www.cnbc.com/2020/03/11/who-declares-the-coronavirus-outbreak-a-global-pandemic.html。 3. （https://www.worldometers.info/coronavirus/）。 4. Mishra, S. 和 S. Sinha, 基于 T 细胞表位的癌症免疫治疗的免疫信息学和建模视角：整体图景。生物分子结构与动力学杂志，2009 年。27 (3): p. 293- 305。 5. Mishra, D., 基于 T 细胞表位的针对大流行新型冠状病毒 2019-nCoV 的疫苗设计。 2020。6. Enjuanes, L. 等人，冠状病毒毒力的分子基础和疫苗开发，病毒研究进展。2016，爱思唯尔。第 245-286 页。7. Du, L. 等人，SARS-CoV 的刺突蛋白——疫苗和治疗开发的靶点。自然微生物学评论，2009 年。7 (3)：第 226-236 页。8. Ullah, MA、B. Sarkar 和 SS Islam，利用反向疫苗学方法设计抗埃博拉病毒新型亚单位疫苗。medRxiv，2020。9. Gupta, E.、SR Gupta 和 RRK Niraj，在麻风分枝杆菌中鉴定药物和疫苗靶点：一种反向疫苗学方法。 International Journal of Peptide Research and Therapeutics，2019 年：第 1-14 页。10. Pickett, BE 等人，ViPR：一个开放的生物信息学数据库和病毒学研究分析资源。核酸研究，2012 年。40 (D1)：第 D593-D598 页。11. Walker, JM，蛋白质组学协议手册。2005 年：Springer。12. Doytchinova, IA 和 DR Flower，VaxiJen：一个用于预测保护性抗原、肿瘤抗原和亚单位疫苗的服务器。BMC 生物信息学，2007 年。8 (1)：第 4 页。
鉴定糖酵解相关的预后基因...
这些金属从矿山，矿石加工单元和其他类似行业的提取过程每年在化学过程中产生大量的废水。废水中相对较高的or浓度浓度清楚地表明了其净化的必要性，以保护环境的健康[8]。去除重金属和放射性金属的常见方法包括一种或一种蒸发方法的组合，化学沉积[9]，电化学处理[10]，离子交换[11，12]，溶剂提取[13，14]，反渗透[15]，膜过程[16-18]，以及膜过程[16-18]，以及ADSOREPTIONS [19-–21]。这些方法中的每一种都有优点和缺点，根据条件，选择了每种方法或它们的组合。吸附过程用于从水溶液中去除重金属。因此，由于其经济学，灵活性和可重复性，吸附方法比其他方法更有趣[22-24]。
使用核酸探针鉴定微生物
•支原体肺炎•淋病奈瑟氏菌•rubeola（麻疹）•金黄色葡萄球菌•金黄色葡萄球菌，耐甲氧西林•抗甲氧基•链球菌•链球菌，A组，A组，A•链球菌，B型链球菌，trichomonas agaginalis•Zikika•Zikika•Zikika Virus。在政策＃171中介绍了分子诊断的使用来诊断和管理Borrelia burgdorferi感染（莱姆病）。在策略＃711中介绍了多白素聚合酶链反应测试诊断细菌性阴道病的诊断。对于念珠菌物种，酵母菌的培养仍然是识别和区分这些生物的标准标准。对于核酸扩增测试（NAAT）的灵敏度和特异性高于标准测试方法，但CDC和其他关联指南不建议NAAT作为念珠菌物种的一线测试。CDC疾病控制与预防中心（2015年）将简单的外阴阴道念珠菌归类为零星或不常见；或轻度至中度；或者，在非免疫力低下的妇女中，是白色念珠菌引起的。可以在临床护理环境中进行推定诊断。然而，对于复杂的感染，CDC指出，NAAT可能需要测试多个念珠菌亚种。复杂的外阴阴道念珠菌病被归类为复发或严重；或者，对于患有不受控制的糖尿病，虚弱或免疫抑制的女性，白色念珠菌物种引起的可能性较小。链球菌的抗生素敏感性通常不是用于喉咙培养的。许多探针已被合并为测试面板。但是，如果考虑了抗生素敏感性，那么最有效的诊断方法将是一种培养和抗生素敏感性。在评估B组链球菌中，与传统培养技术相比，DNA探针技术的主要优点是结果的迅速。 这个优势表明，最适当的DNA探针技术是在即将到来的劳动力中，为此，迅速的结果可以允许启动产前抗生素疗法。 应注意的是，定量技术包括扩增和直接探针；因此，不保证使用放大或直接探针同时编码进行定量。 出于本政策的目的，除了胃肠道病原体面板和中枢神经系统面板之外，仅审查了单个探针。 使用直接或扩增的探针技术（有或没有定量的病毒载量）使用核酸测试是用于以下微生物在医学上所必需的：•巨细胞病毒•肝炎B病毒•丙型肝炎病毒•乙型肝炎病毒•HIV-1•HIV-1•HIV-2•HIV-2•HUMHARPESVIRUS 6。 使用核酸测试对病毒载量进行定量的使用被认为是针对未包括在有或没有定量的探针的微生物列表中的微生物的研究。在评估B组链球菌中，与传统培养技术相比，DNA探针技术的主要优点是结果的迅速。这个优势表明，最适当的DNA探针技术是在即将到来的劳动力中，为此，迅速的结果可以允许启动产前抗生素疗法。应注意的是，定量技术包括扩增和直接探针；因此，不保证使用放大或直接探针同时编码进行定量。出于本政策的目的，除了胃肠道病原体面板和中枢神经系统面板之外，仅审查了单个探针。使用直接或扩增的探针技术（有或没有定量的病毒载量）使用核酸测试是用于以下微生物在医学上所必需的：•巨细胞病毒•肝炎B病毒•丙型肝炎病毒•乙型肝炎病毒•HIV-1•HIV-1•HIV-2•HIV-2•HUMHARPESVIRUS 6。使用核酸测试对病毒载量进行定量的使用被认为是针对未包括在有或没有定量的探针的微生物列表中的微生物的研究。
鉴定免疫原性死亡相关基因...
阿尔茨海默氏病（AD）是全球痴呆症的主要原因，最近的研究强调了免疫原性死亡（ICD）在这种神经退行性疾病的发病机理中的潜在作用。总共包括52例健康对照和64例AD患者。与对照组相比，AD患者表现出2392个差异表达的基因（DEG），其中1015和1377分别上调和下调基因。中，通过将与AD相关的模块基因与DEG和ICD相关基因相交的九个共同基因。基因本体论（GO）分析进一步揭示了“细胞因子产生的阳性调节”是最重要的术语。此外，富集的分子功能主要与炎症体复合物有关，而重叠基因在脂多糖结合中显着富集。基因和基因组（KEGG）分析的京都百科全书还表明，这些重叠基因主要富含免疫，炎症和脂质代谢途径。此外，使用机器学习算法检测到以下四个集线器基因：P2RX7，HSP90AA1，NT5E和NLRP3。这些基因在AD和健康对照组之间表现出显着差异（P <0.05）。此外，这四个基因的曲线值下面的面积均> 0.7，表明它们的AD的潜在诊断值。我们进一步验证了3XTG-AD和C57BL/6J小鼠海马中这四个基因的蛋白质水平，显示了与先前分析的趋势一致的P2RX7和HSP90AA1表达水平。最后，单样本基因集富集分析（SSGSEA）算法通过证明免疫细胞浸润的关键作用及其与HUB基因在AD进展中的联系提供了其他证据。我们的研究结果表明，ICD介导的HSP90AA1和P2RX7水平的升高以及导致TAU高磷酸化和神经炎症的诱导在AD致病机制中至关重要。
挥发性有机化合物的高质量鉴定（...
抽象引入挥发性有机化合物（VOC）可能是由潜在的代谢引起的，并且可以在呼气的呼吸中检测到，因此为非侵入性诊断提供了有希望的途径。稳健，精确且可重复的呼吸测量平台能够识别可与背景污染物区分的呼吸中的VOC，这是基于呼吸的生物标志物的自信污染物。建立可靠的呼吸收集和分析方法的目标，该方法可以在异质人口的呼吸中产生全面的VOC列表。方法分析队列由90对呼吸和背景样品组成，这些样品从异质群中收集。Owlstone Medical的呼吸活检®Omni®平台，包括样品收集，TD-GC-MS分析和特征提取。vot至少符合三个预定义的指标中的至少一个，则确定为“呼吸”。使用保留索引和高分辨率准确的质谱匹配，通过与纯化的化学stan dards进行比较来鉴定呼吸。结果在> 80％的样品（呼吸和背景）中存在1471个VOC，至少一个度量为585个。已确定为148个，涵盖了广泛的化学类别。结论已经开发了一种强大的呼吸收集和相对定量分析方法，该方法产生了148个呼吸ov的列表，该清单使用异源种群中的纯化化学标准标识。此外，此VOC列表可用于促进跨研究数据比较，以改善标准化。提供真正呼吸的确认的VOC身份，将促进未来的生物标志物发现以及随后的临床研究生物标志物验证。
从药物部位隔离和鉴定细菌
抗生素污染是一个重要而广泛的环境问题，甚至对人类健康的威胁。生物降解是一种主要机制，可去除环境中的污染物。因此，本研究旨在筛选和分离抗生素降解细菌，这些细菌可以有效地降解阿奇霉素，克拉霉素，头孢霉素和头孢霉素抗生素。从药物废物位点分离出六种抗生素降解细菌，每种菌株的抗生素降解率通过TMSUS方法确定。使用革兰氏染色反应和生化测试在形态上鉴定了细菌菌株。调查表明，药物废物由细菌群落组成，这些废物对人类有用，可用于对药物废物的生物降解以恢复资源。