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分子系统和系统发育分析，对氢氯巴鲁斯Sp的共生细菌。产生抗生素酶藻酸盐裂解酶
摘要。藻类细菌群落以生产破坏藻酸盐的抗生素酶而闻名，这些酶是生物膜的主要成分的藻酸盐。生物膜相关感染是危险的，因为它们对抗生素和人类免疫系统产生了抗性。这项工作报告了基于分子系统学和系统发育分析16S rRNA的几种海洋藻素细菌，可能是新的物种。它们是从不同的棕色藻类氢层sp中分离出来的。居住在印度尼西亚Wakatobi的Hoga岛周围的海洋中。这项研究旨在揭示这些细菌分离株的分子身份和亲属关系，以理解其更多的特性，即氢氯拉斯sp的共生体。分子鉴定和系统发育树的结构是根据使用27F-1492R引物的聚合酶链反应对16S rRNA基因扩增的序列进行的。可以获得总共31种棕色藻类氢氯拉鲁斯共生细菌的分离株，表明藻类是海洋细菌的有吸引力的共生菌宿主。能够产生藻酸盐裂解酶和琼脂酶的分离株数量为15。然而，在用最小藻酸盐培养基进行确认测试后，只有15个分离株中只有12个是藻酸盐裂解酶生产者。在具有最高藻体级指数的8个分离物上的分子鉴定显示了与3种不同属的最接近的关系：颤音，拟南芥和aestuariibacter。基于BLAST（基本局部对齐搜索工具）分析，5比其对齐结果的最高命中率低于97％的相似性水平，表明它们可能是新物种。这些发现表明了海洋棕色藻类氢层sp的潜力。是藻素溶液的潜在宿主。关键词：琼脂酶，藻酸盐裂解酶，海洋细菌，瓦卡托比。简介。抗生素酶是可用于控制和去除细菌生物膜的酶的类型。这些酶溶解了包含细菌细胞外基质的多糖，蛋白质和核酸。抗生素酶包括脂肪酶，可防止纤维旁溶血生物膜和纤维素酶的生长，这些脂肪酶会分解大多数生物膜中存在的纤维素（Gutiérrez2019）。也已经证明了脂肪酶，纤维酶和蛋白酶K等组合酶在预防和消除副溶血性生物膜上有效（Li et al 2022）。其他生物膜控制酶包括β-葡萄糖酶，蛋白酶和淀粉酶，它们可以分解EPS基质并防止生物膜的产生。抗生素酶被认为比传统方法更有效，更环保，例如侵袭性化学物质，例如氢氧化钠或次氯酸钠，它们可以腐蚀机械和材料（Blackman 2021）。
工业共生技能联盟：可持续过程工业的跨部门蓝图（SPIRE-SAIS）工业共生和能源
该交付成果的目标是描述欧洲能源密集型产业（EIIs）中工业共生（IS）和能源效率（EE）概念的实施现状（任务 2.1）以及可持续产业集群的可能情景，紧随循环经济（CE）的未来发展（任务 2.2），并允许它们演变为加强跨部门合作，实现可持续增长并在全球市场上综合增强竞争力。此外，还开发了一个未来情景，描述五到十年内过程工业的运营，将主要的技术发展类别与相关的必需技能和能力结合起来（任务 2.3）。所取得的成果为 WP3 中的行业技能要求和 WP4 中的 VET 系统奠定了基础。此外，它们为 WP5 中的蓝图开发奠定了基础。
共生细菌和真菌在滞育中增殖，并可能在孤独的蜜蜂中增强冬季的生存
宿主 - 微生物相互作用是包括蜜蜂在内的许多宏观生物的发展和适应性的基础。尽管许多社会蜜蜂受益于垂直传播的肠道细菌，但当前的数据表明，孤立的蜜蜂构成了蜜蜂中绝大多数物种多样性，但缺乏高度专业的肠道微生物组。在这里，我们研究了整个野生蜜蜂bonthophora bomboides Standfordiana的整个生命周期中细菌和真菌的成分和丰度。与期望相反，未成熟的蜜蜂阶段保持了一个独特的核心微生物组，该核心体由静脉细菌属（链霉菌，诺卡氏菌）和真菌Moniliella spathulata组成。休眠（尿布）幼虫蜜蜂占据了最丰富，最独特的细菌和真菌，分别达到其初始拷贝数的33和52倍。我们测试了关于尿布蜜蜂的微生物功能的两个自适应假设。首先，使用孤立的细菌和真菌，我们发现来自育雏细胞的链霉菌抑制了多种致病性丝状真菌的生长，这表明当蜜蜂面对高病原体压力时，在越冬期间在病原体保护中起作用。第二，糖酒精成分随着真菌丰度的重大变化而变化，这表明与蜜蜂冷耐受性或越冬的生物学有联系。我们发现，炸弹抗体有一个保守的核心微生物组，可以通过幼虫的发育和滞育提供关键的适应性优势，这提出了一个问题，即如何维持和忠实地传播这种微生物组。我们的结果表明，关注成熟或活跃的昆虫发育阶段的微生物组可能会忽略宿主休眠期间特定阶段的共生体和微生物适应性的贡献。
共生肠道微生物及其代谢物针对细菌病原体的保护作用
抽象的多药微生物已成为全球主要的公共卫生问题。肠道微生物组是用于保护人体免受病原体的生物活性化合物的金矿。我们使用了一种多摩学方法，该方法通过代谢组分析整合了74个共生肠道微生物组分离株的全基因组测序（WGS），以发现它们与沙门氏菌和其他抗生素耐药病原体的代谢相互作用。我们根据WGS注释曲线评估了这些选定分离株的功能潜力差异。此外，确定了选定的共生肠道微生物组分离株的共培养上清液中最大的代谢产物，包括一系列二肽，并检查了其防止各种抗生素抗性细菌生长的能力。我们的结果提供了令人信服的证据，表明肠道微生物组会产生代谢产物，包括可能应用于抗感染药物的二肽的化合物类别，尤其是针对抗生素耐药的病原体。我们既定的肠道微生物组生物活性代谢产物的发现和验证的管道是作为多种耐药感染的新候选者，这是发现抗菌铅结构的新途径。
来自共生根瘤菌的II型分泌sublase ...
植物的根在与微生物社区相关的群体中生长，称为根际微生物组。免疫Acɵvaɵ响应于诸如艾氏蛋白酶衍生的表位（G22）之类的引发剂限制了植物根部的细菌，但也抑制了植物的生长。一些共同的根部相关细菌能够抑制植物对引起剂的免疫反应。在这项研究中，我们提高了165种根相关细菌抑制含量G22诱导的免疫Acɵvaɵ和生长式restricɵon的能力。我们证明，来自Dyella Japonica菌株MF79的II型分泌的亚lase，我们称其为免疫抑制亚抑制作用A（ISSA）A（ISSA），使免疫Eliciɵngpepɵdepepɵdetof g22裂解并有助于免疫抑制。在其他与植物相关的共同体中发现了ISSA同源物，在xanthomonadales的顺序中具有高度高的保守。这代表了一种新型机制，通过该机制，共生微生物在根际微生物组中调节了抗G22诱导的免疫力。
可富集的微生物共生菌群落降解了 Kyphosus 鱼中的大型藻类多糖
摘要 沿海食草鱼类以大型藻类为食，这些藻类随后被其消化道中的微生物降解。然而，关于进行这种降解的微生物群的基因组信息很少。本研究通过计算机模拟研究碳水化合物活性酶和硫酸酯酶序列，探索了 Kyphosus 胃肠道微生物共生体协同降解和发酵红、绿和棕色大型藻类中的多糖的潜力。从先前描述的 Kyphosus 肠道宏基因组和新测序的生物反应器富集物中回收宏基因组组装基因组 (MAG) 揭示了 Kyphosus 肠道中主要微生物类群之间的酶活性差异。回收的 MAG 中用途最广泛的是来自拟杆菌门，其 MAG 中含有能够分解各种藻类多糖的酶集合。 Bacillota（Vallitalea 属）和 Verrucomi crobiota（Kiritimatiellales 目）基因组的独特酶和预测降解能力凸显了多个门的代谢贡献对拓宽多糖降解能力的重要性。很少有基因组含有单独完全降解任何复杂硫酸化藻类多糖所需的酶。来自不同分类群的 MAG 之间合适酶的分布，以及在候选酶中广泛检测到信号肽，与这些碳水化合物的协同细胞外降解相一致。这项研究利用基因组证据揭示了 Kyphosus 共生体在酶和菌株水平上尚未开发的多样性及其对大型藻类分解的贡献。生物反应器富集为降解和发酵过程提供了基因组基础，对于将从该系统获得的知识转化为水产养殖和生物能源领域至关重要。
16个ixodes的深度测序ricinus ticks揭示了他们与内共生体的相互作用的见解
背景：ixodes ricinus tick是众多病原体的媒介，这些病原体呈现出严重的健康威胁。此外，它们具有垂直传播的共生体，其中一些与疾病有关。隔离和培养这些共生体的困难阻碍了我们对它们的生物学作用，引起疾病的潜力和传播方式的理解。为了扩展我们对与人类疾病有关的tick共生二氯乙醇中心核的理解，并在人类中与疾病有关，我们使用了16个成年女性tick虫进行了深入的测序。其中，八个是从沿海沙丘环境中收集的，另外八个是从荷兰的森林地区获得的。结果：通过采用下一代和第三代测序技术的组合，我们成功地重建了来自11个个体的线粒体M. M. helvetica的完整基因组，来自八个个体的Helvetica和来自所有tick的线粒体基因组。此外，我们可视化了Helvetica在tick器官和两个共生体的构造基因组代谢模型（GEM）中的位置，以研究其与生长相关的环境依赖性。我们的分析表明，线粒体和线粒体基因组之间存在很强的辅助性，表明频繁的母体传播。相比之下，helvetica和线粒体基因组之间不存在Cophyly，并在雌性的ini ricinus internis seminis中的存在，提高了helvetica的父亲传播的可能性。值得注意的是，除了rick a毒力基因外，发现Helvetica的遗传多样性非常低，在该基因中，在33nt-long重复的插入中的存在导致了显着的差异。但是，这种变化无法解释荷兰八个不同位置观察到的感染率的差异。结论：通过采用深层测序，可以直接从其宿主生物体中提取共生体的完整基因组和遗传数据变得可行。这种方法是一种强大的方法，可以使他们对其相互作用的新见解。我们的观察结果表明，R. helvetica的父亲传播是一种相对尚未开发的壁虱传播方式，需要通过实验研究进行验证。rick中鉴定出的遗传变异r。
微生物行为：法定感测，生物膜，共生性...
•QS是全球监管控制•克，革兰氏 +和古细菌中存在的QS•许多细菌响应在其自己物种的其他细胞周围的周围环境中的存在，并且在某些物种中，监管途径控制了他们自己的细胞的细胞丰富性，由其自身的细胞丰富性•QS•QS是QS的示例，不需要评估人群的典型范围（>成功的人群）（>成功的人群）（>成功的人群）（>总体上：总体上的表现：整个人群，整个人口级别，总体上，总体上，>因子产生，次生代谢产物7，DNA吸收能力，生物膜形成，物种组成
健身权衡和内共生的起源
内共生生物中，其中一种生物的细胞生活在另一种生物的细胞（或器官）中，在整个生命之树中，在各种各样的分类单元中都进化了很多次，并且通常涉及不同王国生物不同生物之间的亲密相互作用[1]。通过使特殊性获得完全新颖的特征，这种以前独立物种的进化合并在进化创新中具有重要作用[2]。共生介导的创新的显着例子包括自身肉芽的增长和氮固定的增益[4]。这种创新允许共生生物入侵新的生态区[5]，并导致形成了全新的生物群落，例如珊瑚礁。因此，内共生体的基础是跨越陆生，淡水和海洋栖息地的许多不同生态系统的功能[6]。通过开放新的生态机会，内共生植物可以充当关键创新，而在进化时段标准可以催化多样化和燃料适应性辐射[7-9]，尽管并非总是[10]。除了它们在生物多样性中的作用外，内共生性还可以通过将功能分隔为专业结构或器官，从而使更复杂的生物体的演变[11]，从而增加了有机体多功能性和模态性[12]。最重要的是，这在真核细胞的细胞器的共生起源中很明显，这些细胞的细胞器具有专门的代谢功能，如果在大量细胞质中表现出效率（或不可能）。这种提高的效率被认为提供了
桥接古老的智慧和现代科学：探索阿育吠陀和当代观点中的阿格尼与马纳斯之间的共生关系
本文研究了阿育吠陀和现代科学观点的Agni（消化火）和Manas（Mind）之间的关系。利用阿育吠陀的丰富遗产，探索了阿格尼和马纳斯之间的复杂联系，强调了它们在维持整体健康中的作用。阿育吠陀文学阐明了Agni状态如何影响心理健康，反之亦然，强调了平衡两者在最佳健康方面的重要性。此外，本文集成了现代科学研究，以提供有关AGNI - Manas关系基础的生理机制的见解，包括肠脑轴以及神经递质对消化和情绪的影响。通过这种当代的理解，为整体健康促进提供了途径，与传统的智慧和科学证据产生共鸣。