转移起始细胞 (MIC) 具有干细胞样特征,可引起转移性复发并抵抗化疗,从而导致患者死亡。我们在此表明,前列腺癌和乳腺癌患者体内含有高表达 CX3CR1、OCT4a (POU5F1) 和 NANOG 的肿瘤细胞。CX3CR1 表达或信号传导受损会阻碍细胞系形成肿瘤球体,我们从中分离出与患者肿瘤相似的共表达 CX3CR1 和干细胞相关标志物的小亚群。这些罕见的 CX3CR1 High 细胞在小鼠模型中显示出转录组谱,这些转录组谱富含调节多能性的途径并具有转移起始行为。缺乏这些特征的癌细胞 (CX3CR1 Low) 能够随着时间的推移重新获得 CX3CR1 相关特征,这意味着 MIC 可以不断从非干细胞癌细胞中出现。CX3CR1 表达还赋予了对多西他赛的抗性,而长期用多西他赛治疗会选择具有去富集转录组谱的 CX3CR1 High 表型,以进行凋亡途径。这些发现提名 CX3CR1 作为类干细胞肿瘤细胞的新标记,并为未来开发针对 CX3CR1 信号传导和(重新)表达的方法作为预防或控制转移起始的治疗手段提供了概念基础。
采用可电离脂质的脂质纳米颗粒 (LNP) 是将 RNA(尤其是 mRNA)递送至细胞的最先进技术。LNP 代表具有明确定义的核心 - 壳颗粒,可有效封装核酸、降低免疫原性和增强功效。虽然人们对 LNP 的结构和活性了解甚多,但对 LNP 摄取、细胞质转移和蛋白质表达的时间关注较少。然而,LNP 动力学是决定递送效率的关键因素。因此,定量了解 LNP 的多级联途径对于阐明递送机制至关重要。在这里,我们回顾了实验以及 LNP 摄取、mRNA 释放和蛋白质表达时间的理论建模。我们将 LNP 递送描述为一系列随机转移过程,并回顾了随后从 mRNA 进行蛋白质翻译的数学模型。我们汇编了从时间分辨显微镜获得的概率和数字。具体而言,单细胞阵列活细胞成像 (LISCA) 可以高通量采集数千个单独的 GFP 报告基因表达时间过程。这些轨迹可以得出 mRNA 寿命、表达率和表达开始时间的分布。相关性分析揭示了基因表达效率和转染开始时间的反向依赖关系。最后,我们讨论了为什么在多个核酸物种的共传递背景下,mRNA 释放的时间至关重要,例如在 mRNA 共表达或 CRISPR/Cas 基因编辑的情况下。
结果:我们发现PWEO的主要成分是单萜和倍半萜类化合物。PWEO具有强大的抗真菌活性,而PWEO的MIC对两种皮肤植物的MIC均为3.600 mg/ml。PWEO显着抑制菌丝体的生长,并且随着浓度的增加,抑制作用显着增加。当pWeo浓度达到1.8mg/ml时,菌丝体的生长被完全抑制。显微镜观察表明,PWEO破坏了菌丝的结构。细胞膜通透性测试表明,皮肤植物的细胞膜受到PWEO的破坏。细胞丙二醛(MDA)含量与PWEO的浓度呈正相关,这表明皮肤植物的脂质过氧化是由PWEO引起的。荧光显微镜图像显示,PWEO处理后,ROS的产生过多,MMP破坏了。葡萄球菌的生理实验显示,用0.450 mg/mL PWEO治疗三个小时后,蛋白质渗出,细胞外电导率和细胞内MDA含量的显着差异。通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定了五个集线器基因,其中长链脂肪酸COA连接酶1(ACSL1)被显着上调表达。减少上调的72(MUG72)和GDP甘露糖转运蛋白基因1(GMT1)在PWEO治疗后显着下调,这影响了葡萄球菌的生长和繁殖。这些结果表明,PWEO可以用作可持续应用的天然抗真菌剂。
受体酪氨酸激酶 (RTK) 共表达促进肿瘤耐药性,这是由于磷脂酰肌醇-3'-激酶/蛋白激酶 B 和 KRAS/细胞外信号调节激酶信号通路等存在冗余。致癌 RTK 肝细胞生长因子受体 (MET)、表皮生长因子受体 (EGFR) 和人表皮生长因子受体 2 (HER2) 之间的串扰与肿瘤对 RTK 靶向疗法的耐药性有关。方法:在相关肾细胞癌患者来源的异种移植模型中,我们使用 89 Zr 标记的抗 RTK 抗体 (免疫 PET) 奥那妥珠单抗、帕尼单抗和曲妥珠单抗分别监测 MET、EGFR 和 HER2 蛋白水平,在使用模型对其有耐药性(西妥昔单抗)或敏感(INC280 和曲美替尼)的药物治疗期间。结果:西妥昔单抗治疗导致肿瘤持续生长,以及免疫 PET 和细胞水平的离体肿瘤中所有 RTK 蛋白水平增加。相反,在双重 MET/丝裂原活化蛋白激酶抑制后,肿瘤生长明显减缓,并且与 RTK 水平降低相对应。结论:这些数据表明 RTK 靶向免疫 PET 可用于注释 RTK 蛋白表达变化并告知肿瘤对靶向治疗的反应。
脱落的小圆细胞肿瘤(DSRCT)是一种恶性间充质肿瘤,通常发生在腹部[1]。它是男性的主要疾病,发病率达到约90%[2]。该肿瘤具有EWSR1-WT1基因的融合,并且显示出具有多种标记物共表达的多种型免疫转元[1,3-5]。它最初是由杰拉尔德(Gerald)和罗西(Rosai)于1989年描述的,他们提出它是在发育阶段源自祖细胞的[1]。这是一种高度恶性的小细胞肿瘤,具有独特的相互染色体易位t(11; 22)(p13; q12)[6]。临床表现包括腹痛,张力或肠梗阻,可将其视为呕吐或便秘。显微镜下,它看起来像是在脱落基质中的小蓝色细胞的巢穴,具有多个阳性标记,例如上皮(细胞角蛋白和上皮膜抗原),肌原(Desmin),间充质(间质),神经元(Vermin)和神经元(神经元)(神经元)(神经元)和神经元(神经元)。dsrct主要影响年轻的成年男性,其偏爱涉及腹腔内器官和腹膜。颅内转移非常罕见,有一些病例报告[3]。在这里,我们提出了一个颅内转移性dsrct的病例,该病例延伸到头骨和皮下组织,作为头皮肿块独特地呈现。
摘要CRISPR/CAS已彻底改变了植物中的基因组工程。然而,尚未探索使用抗Crispr蛋白作为防止CRISPR/CAS介导的基因编辑和植物中基因激活的工具。这项研究描述了烟熏本米那(Nicotiana Benthamiana)的两种抗Crispr蛋白Acriia4和Acrva1的表征。我们的结果表明,当与CRISPR/CAS9瞬时共表达时,Acriia4可防止叶片位置定向的诱变。以类似的方式,AcRVA1能够防止CRISPR/CAS12A介导的基因编辑。此外,使用N. benthamiana系组成表达Cas9,我们表明,使用烟草蚀刻病毒的Acriia4的病毒递送能够完全废除当用病毒传递引导RNA时获得的高编辑水平,在这种情况下,在这种情况下是马铃薯病毒X。我们还表明,Acriia4和AcRVA1抑制基于记者基因的基于CRISPR/DCAS的转录激活。在Acriia4的情况下,这种抑制以高度有效的剂量依赖性方式出现。此外,生长素脱脂与Acriia4的融合导致下游报告基因的生长素调节的激活。此处报道的Acriia4和Acrva1的强抗CAS活性为植物中基因编辑和基因表达的定制控制开辟了新的可能性。
抽象的先天免疫在防止病原微生物的侵袭中起着至关重要的作用。然而,先天免疫是一把双刃剑,其过度激活对免疫稳态有害,甚至导致受感染宿主的“细胞因子风暴”。宿主开发了一系列负调节机制,以衡量免疫反应。在这里,我们报告了由miRNA介导的鸡肉先天免疫的负调节机制。在GEO数据库中,我们发现MiR-126-5p在感染RNA病毒感染的鸡中明显上调。然后,通过细胞模型和体内检测进一步显示了RNA病毒对miR-126-5p的上调。miR-126-5p的过表达显着抑制了由RNA病毒诱导的干扰素和炎性细胞因子相关基因的表达。miR-126-5p表达敲低后,取得了相反的结果。生物信息学分析确定TRAF3是miR-126-5p的候选靶基因。在实验上,miR-126-5p可以靶向TRAF3,如miR-126-5p对TRAF3内源性表达的影响以及TRAF3 3'UTR驱动的荧光素酶报道器测定法。此外,我们证明了miR-126-5p通过通过共表达测定法阻断MAVS-TRAF3-TBK1轴来负调节的先天免疫性。总体而言,我们的结果表明,miR-126-5p参与了鸡肉先天免疫的负调节,这可能有助于维持免疫平衡。关键字:鸡肉,mir-126-5p,traf3,RNA病毒,先天免疫
多态毒素是细菌战争的武器,用于限制竞争对手、帮助亲属选择和塑造细菌群落。多态毒素系统 (PTS) 在革兰氏阴性细菌中得到了充分研究,但对革兰氏阳性细菌的研究有限。在枯草芽孢杆菌中,已报道了几种毒素免疫蛋白对,包括 YeeF-YezG、YobL-Y、obK YxiD- YxxD。很少有研究描述这些毒素-免疫对的结构/机制细节。这种毒素需要 VII 型分泌系统。我们已经证明 YeeF 的 C 端结构域 (YeeF-CT) 含有具有 DNase 活性的毒素。YeeF-CT 的表达会导致大肠杆菌的生长缺陷并导致形态变化。而毒素-免疫对的共表达可恢复正常的细菌生长。在这里,我们报告了 YeeF-CT 与其同源抗毒素 YezG 结合的晶体结构,分辨率为 2.1 Å。晶体结构表明,毒素 (YeeF-CT) 在与其同源免疫蛋白 (YezG) 结合后会发生重大构象变化。比较结构分析表明,毒素的六个 β 片层(核酸酶活性所必需的)在与免疫蛋白结合后被撕裂成两个子域。这种机制不同于其他 II 型毒素-抗毒素系统,其中抗毒素的内在无序区域与毒素的活性位点结合,从而在空间上阻断其底物的结合。我们目前正在研究这种毒素-免疫蛋白对的结构指导详细表征。
摘要:复杂的形态模式如何在发育生物学中是一个有趣的问题。但是,产生复杂模式的机制在很大程度上未知。在这里,我们试图确定在果蝇的腹部和翅膀上以多种斑点猪的模式中调节棕褐色基因的遗传机制。以前,我们表明黄色(y)基因表达完全预测了该物种的腹部和翅膀色素模式。在当前的研究中,我们证明了t基因与Y基因以几乎相同的模式共表达,这两种转录本都预示着成年腹部和翅膀黑色素斑点模式。我们鉴定了T的顺式调节模块(CRM),其中一个将记者表达在发育中的pupal腹部的六个纵向行中,而第二个CRM则在斑点的翅膀模式中激活了记者基因。比较了Y和T的腹部斑点CRM,我们发现了推定转录因子结合位点的类似组成,这些组合被认为可以调节两个末端色素沉着基因y和t的复杂表达模式。相比之下,Y和T机翼斑点似乎受到不同上游因素的调节。我们的结果表明,D. guttifera腹部和翅膀黑色素点模式是通过Y和T的调节确定的,阐明了如何通过下游靶基因的平行配位来调节复杂的形态性状。
生长素诱导降解 (AID) 系统已成为一种强大的工具,可有条件地消耗多种生物体和细胞类型的蛋白质。在这里,我们描述了一种工具包,用于增强秀丽隐杆线虫中 AID 系统的使用。我们已经生成了一组单拷贝、组织特异性(生殖系、肠道、神经元、肌肉、咽喉、皮下组织、接缝细胞、锚细胞)和全体细胞 TIR1 表达菌株,这些菌株携带共表达的蓝色荧光报告基因,以便在实验中使用红色和绿色通道。这些转基因被插入常用的、特征明确的基因座中。我们证实,我们的 TIR1 表达菌株对几种核和细胞质 AID 标记的内源性底物产生了预期的消耗表型。我们还构建了一组质粒,用于构建修复模板,以通过 CRISPR/Cas9 介导的基因组编辑生成荧光蛋白::AID 融合。这些质粒与秀丽隐杆线虫群体中常用的基因组编辑方法(Gibson 或 SapTrap 组装质粒修复模板或 PCR 衍生的线性修复模板)兼容。这些试剂将共同补充现有的 TIR1 菌株,并促进快速和高通量的基因荧光蛋白::AID 标记。这组新的 TIR1 表达菌株和模块化、高效的克隆载体可作为直接组装 CRISPR/Cas9 修复模板的平台,用于条件性蛋白质消耗。