Ascomycota构成了真菌王国中最大的门,并显示出广泛的生活方式,有些涉及植物的社会。基因组数据可用于许多对植物致病性的蛋白酶,但是无症状的植物居民的内生植物相对研究。在这里,使用短读和长阅读技术,我们对CABI培养物收集的15种内生菌菌株进行了测序和组装基因组。我们使用系统发育分析来完善分类单元的分类,这表明我们的15个基因组组件中有7个是第一个用于属和/或物种的。我们还证明,细胞量学基因组大小估计值可以作为评估组装“完整性”的有价值的度量,单独使用BUSCO时可以很容易地高估,并且对基因组组装计划具有更广泛的IM层面。在生产这些新的基因组资源时,我们强调了采矿的价值,以产生可以帮助解决与植物 - 菌件相互作用有关的主要研究问题的数据。
摘要使用昆虫病作用真菌(EF)用作内生植物是一种可持续食品生产的环保替代品,因为当前农作物保护的范式基于使用有机合成农药的使用,每年有超过200万吨全球范围内有超过200万吨; EF具有作为内生菌的植物组织中的能力,可以用作生物遗产。在这种情况下,本综述分析并讨论了内生昆虫病作用真菌(EEF)的全球状况,它们在植物保护植物疾病和虫害中的潜力以及作为植物生长促进者的潜力。的成功和失败以及现场申请的前景。已经发布了7000多个关于EEF的研究,并具有重要的成功案例。但是,有必要了解农业生产是基于外部投入(主要是农药)的使用。尽管发生了渐进式的变化,但研究这些物质对EEF功效和持久性的影响是至关重要的,而不会忽略对生物和非生物因素对EEF的影响的缺乏知识是造成故障的重要原因。未来的研究应集中于阐明以下方面,例如:应用策略,内生持续和传输途径,以提高农业生产的可持续性。关键字:内生;增长促进者;综合害虫管理;植物疾病。
它专注于植物相关的微生物组的管理,该植物相关的微生物群在一个健康概念中提供了解决植物保护和植物营养问题,以承认植物,动物,环境和人们的健康是相互联系的和相互依存的。微生物中的相互作用对土壤,植物和农业生态系统健康具有深远的影响,进而影响土壤的生育能力,作物产量以及食物质量和安全性。有益的微生物通常被分离为接种剂,内生植物或施加的微生物产物,同时忽略了它们嵌入的农业微生物组的复杂网络。此外,涉及微生物组组装的遗传因素在很大程度上仍然难以捉摸。对微生物组结构和功能的理解将确定导致有益活动的共同线程,并有助于重新设计生产系统。研讨会包括来自世界各地的九次演讲,满足未来的需求,并讨论通往新的生物学,化学和育种策略的途径,以确保农业减少投入而不会危害食品生产和粮食安全的农业。该会议为来自不同学科的研究人员提供了一个独特的机会,可以将研究成果进行比较并建立合作,以促进对微生物组的理解和增强及其在植物健康中的作用,同时对农业可持续性对人类福利构成重大挑战。
•生理与发展:/细胞间信号传导,长距离信号传导,生理学,发育,生态 - devo,表型可塑性,运输,生物化学。•环境:全球变化和地球系统功能,环境压力,生态生理学,植物 - 土壤相互作用,重金属。•相互作用:植物 - 生物相互作用(包括病毒,原核生物,卵菌,真菌/菌根,病毒,病毒,线虫和昆虫),共生菌,内生植物,病原体,植物微生物组,真菌基因组学,真菌基因组学,植物 - 植物 - 植物 - 微生物 - 微生物 - 菌群 - 摩西 - 摩西 - 摩西 - 摩西 - 摩尔 - 摩尔 - 氧化型。•进化:分子进化,种群或定量遗传学,交配系统,系统发育,物种,植物 - 富集共同进化,EVO-DEVO。•变革植物生物技术:植物生物工程,植物生物技术,植物基因编辑,植物生物合成途径或调节回路或信号级联的植物生物合成途径的基因操纵或工程,植物合成生物学。频率:新的植物学家每年出版24次。格式:新的植物学家是一本仅在线期刊,目前以混合模型出版,作者可以开放访问。文章在准备就绪后立即在线发表,并将其整理成问题。提交,文章格式和接受率:该期刊发布研究,审查和讨论文章。在2023年提交了3500篇文章,并在该日历年发表了801篇文章。可以在此处找到有关文章类型和格式的更多信息:https://nph.onlinelibrary.wiley.com/hub/journal/14698137/about/author-guidelines。编辑委员会结构:主编领导国际社论和咨询委员会。文章由编辑和副编辑处理,超过70位国际研究人员履行了该期刊的这一角色。部分(见上文)由五个部分编辑器表示。顾问委员会由全球200多名植物科学研究人员组成。主编是由新植物学家基金会的受托人任命的,编辑是由编辑与编辑委员会协商的主持人任命的,顾问由编辑提名任命。编辑办公室的支持:杂志和新植物学家基金会的运营之家是中央办公室,位于英国兰开斯特大学,同行评审,生产和促销活动是协调的。指标:2023年收到的期刊已获得超过740万本全文视图,所有12个月或以上的所有条款均可免费访问。2022年的引用指标为:CitesCore,17.6;期刊影响因子,9.4; 5年期刊影响因子,10.5;期刊引文指标,2.14。
内生菌是生活在植物组织中的微生物。由于他们与宿主的亲密关联,他们可以对植物生理产生强大的影响(Hardoim等,2008; Johnston-Monje和Raizada,2011; Hardoim等,Hardoim等,2012; Hardoim等,2015; Truyens等,2015)。内生菌可以通过提供养分,增加营养摄取,调节和分泌植物素的养分来促进植物生长,并防御植物的病原体(Hu等,2003; Johnston-Monje和Raizada,2011; Mousa et al。,2016; Shehata等,2017,2017年)。植物似乎选择了特定的内生菌,尤其是在幼苗出现期间,这些内生植物可能由种子跨几代人培养,以保护幼苗免受环境压力的影响(Truyens等,2015; Pitzschke,2016; 2016; Shahzad et al。例如,少年玉米植物中内生菌种的显着部分是种子来源的,并从其含种子的父母继承(Johnston-Monje等,2014; Johnston-Monje等,2016)。与植物相关的微生物群可以源自环境和父母,尽管每个人的相对贡献并不总是很清楚(Aleklett和Hart,2013年)。一些微生物内生菌似乎在被子植物,与土壤环境无关,甚至在无菌底物上生长时都广泛保守。这表明至少某些植物相关的微生物是种子衍生的(Johnston-Monje等,2014,Johnston-Monje等,2021)。此外,发现杆菌的特异性细菌被发现是所有研究的所有大麻基因型的内生细菌。此外,有些植物似乎具有“核心”微生物群,这些植物对物种的大多数人来说都是共有的(Sánchez-lóPez等,2018)(Johnston-Monje等,2014; Truyens等,2015; Walitang et al。,2018)。最近第一次证明了大麻中种子传播微生物遗传的这种现象(Dumigan和Deyholos,2022年)。这项研究表明,在加拿大西部的多个位置生长的大麻和药物大麻品种载体生物活性和抗真菌性内生细菌,再到下一代幼苗。然而,这项先前的研究仅限于可培养的微生物,并且是在轴原条件下进行的,因此未测试土壤对内生微生物组的影响。用于加拿大医疗和娱乐市场的药物大麻植物通常在Soilless培养基中生长。这为种植者提供了对可以从土壤转移的病原体的更多控制。然而,它还限制了可能是土壤的潜在有益的微生物,并可能无意中改变了大麻植物的微生物组。一个重要的问题来自这个很大程度上未研究的主题:土壤和种子衍生因素对大麻幼苗内生菌社区组成的相对影响是什么?在当前的研究中,我们假设土壤将对大麻幼苗endosphere的微生物组产生显着影响,而大麻幼苗的胚芽细菌的组成部分将来自种子 - 生物元素细菌,与土壤条件无关。我们使用基于16S的扩增子宏基因组学测试了这一假设,以比较两种土壤类型的作用,无论是否有或没有灭菌,对三种不同的大麻基因型中的endosphere微生物组组成。