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Ascomycota构成了真菌王国中最大的门,并显示出广泛的生活方式,有些涉及植物的社会。基因组数据可用于许多对植物致病性的蛋白酶,但是无症状的植物居民的内生植物相对研究。在这里,使用短读和长阅读技术,我们对CABI培养物收集的15种内生菌菌株进行了测序和组装基因组。我们使用系统发育分析来完善分类单元的分类,这表明我们的15个基因组组件中有7个是第一个用于属和/或物种的。我们还证明,细胞量学基因组大小估计值可以作为评估组装“完整性”的有价值的度量,单独使用BUSCO时可以很容易地高估,并且对基因组组装计划具有更广泛的IM层面。在生产这些新的基因组资源时,我们强调了采矿的价值,以产生可以帮助解决与植物 - 菌件相互作用有关的主要研究问题的数据。

真菌内生菌的挖掘文化收集

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