抗生素耐药性 (AMR) 的威胁日益严重,这凸显了持续供应新型抗菌剂的必要性。作为共生体寄生在植物组织内的内生菌微生物一直是潜在抗菌物质的来源。然而,许多新型和有效的抗菌剂尚未从这些内生菌中发现。本研究探讨了内生真菌作为具有抗菌能力的新型生物活性化学物质来源的潜力。这些真菌通过聚酮合酶 (PKS) 和非核糖体肽合成酶 (NRPS) 途径合成聚酮和肽等次级代谢产物。诸如异戊烯基吲哚生物碱和富马酸等著名物质已显示出对抗多重耐药性感染性病原体的良好抗菌和抗真菌特性。本综述还强调了内生菌与其宿主植物之间的共生关系,这对于次级代谢产物的产生至关重要。该研究重点关注内生菌分离方法的重要性,并提出将其用于可持续农业、生物修复和医学。未来的研究将内生菌生物多样性分析与新一代测序 (NGS) 和纳米技术相结合,可以提供对抗抗菌药物耐药性的新技术,并为多个行业的可持续发展做出贡献。