FungidB(https://fungidb.org)是一种宝贵的在线资源,它无缝地集成了广泛的真菌和卵形物种的基因组和相关的大规模数据。作为VEUPATHDB生物信息学资源中心的组成部分(https:// veupathdb。org),真菌不断整合出已发表和未发表的数据,以解决真菌生物学的各个方面。成立于2011年初,该数据库已演变为支持674个数据集。数据集包含超过300个跨越各种类群的基因组(例如ascomycota,basidiomycota,blastocladiomycota,chytridiomycota,Mucoromycota,以及白曲霉中心,peronosporporales,Pythiales和Saprolecniales)。除了基因组组件和注释外,还可以提供超过300个额外的数据集,其中包含不同的信息(例如表达和变异数据)。资源还提供了一个直观的基于网络的接口,从而促进了数据挖掘和可视化的全面方法。用户可以测试其假设,并使用内置搜索策略系统通过OMICS规模数据集进行导航。此外,FungidB通过集成的VeupathDB Galaxy平台提供了私人数据分析的功能。FunGIDB还允许通过用户注释系统捕获专家知识以及用于结构和功能基因策划的Apollo基因组注释编辑器来改进基因组。真菌促进了数据探索和分析,并通过捕获真菌和卵形物种的专家知识来促进研究工作。
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