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World File Search System单倍体
作物单倍体组织基因编辑研究进展
摘要：气候变化的新威胁要求快速开发对非生物和生物因素具有更高耐受性的优良品种。尽管传统农业实践取得了成功，但仍需要精确操纵作物基因组的新技术。几十年来，双单倍体 (DH) 方法已在主要作物中使用，以在短时间内在优良背景中固定所需的等位基因。DH 植物还广泛用于数量性状基因座 (QTL) 的定位、标记辅助选择 (MAS)、基因组选择 (GS) 和杂交生产。最近发现的负责单倍体诱导 (HI) 的基因允许通过基因编辑 (GE) 在不同作物的非诱导品种中设计这种性状。直接编辑配子或单倍体胚胎可在染色体加倍后产生无效纯合植物，从而提高 GE 效率。对单倍体植物中负责自发染色体加倍的潜在遗传机制的深入了解可能允许将这种性状转移到不同的优良品种中。总体而言，进一步提高 DH 技术效率并结合优化的 GE 可以加速主要作物的育种工作。
双倍体和单倍体诱导者介导的基因组编辑系统的机会和挑战
摘要：在过去的四十年中，双倍的双倍体在库瑟育种中发挥了重要作用。通过辐照花粉的原位孤立生成是获得单倍倍体的首选技术，然后在葫芦科中将其染色体倍增，例如瓜，黄瓜，南瓜，南瓜和冬南瓜。与其他物种中的单倍体过程加倍相反，库班的原位孤立生成提出了许多限制因素，这些因素阻碍了单倍体的有效产生。此外，这是非常耗时的和劳动力密集的。但是，单倍体诱导者介导的基因组编辑系统是一种可产生双倍双倍体的突破性技术。使用CRISPR / CAS9系统中的几份报告描述了库糖库物种，尽管其应用具有许多瓶颈，但CENH3基因的靶向敲除将允许育种者获得可用于获得多倍性诱导剂线，以获得py源性胚胎。在这篇综述中，我们讨论了使用CURSPR / CAS9技术在葫芦物种中的双倍单倍体和单倍体诱导剂基因型的发展方面取得的进展。本综述为应用单倍体诱导剂介导的基因组编辑系统的应用提供了见解
基因组编辑供体来源的 T 细胞以产生同种异体嵌合抗原受体修饰的 T 细胞：优化 αβ T 细胞耗竭的单倍体相合细胞
1 美国加利福尼亚州斯坦福大学医学院儿科系；2 美国德克萨斯州休斯顿莱斯大学生物工程系；3 美国加利福尼亚州斯坦福大学医学院细胞与基因医学实验室；4 丹麦奥胡斯大学生物医学系；5 丹麦奥胡斯大学奥胡斯高等研究院 (AIAS) 和 6 美国加利福尼亚州斯坦福大学干细胞生物学与再生医学研究所。
Consensify：一种从古基因组数据集生成伪单倍体基因组序列并降低错误率的方法
摘要：古基因组分析的标准做法是将映射的短读数据转换为伪单倍体序列，通常是从映射读堆栈中随机选择一个高质量的核苷酸。这可以控制由于差异测序覆盖率而导致的偏差，但不能控制差异率和测序错误类型，这些错误在从古代样本获得的数据集中通常很大且多变。这些错误可能会扭曲系统发育和种群聚类分析，并误导使用 D 统计量的混合测试。我们介绍了一种生成伪单倍体序列的方法 Consensify，它可以控制由差异测序覆盖率导致的偏差，同时大大降低错误率。错误校正直接来自数据本身，无需额外的基因组资源或简化假设（例如同时采样）。对于系统发育和种群聚类分析，我们发现与基于单读采样的方法相比，Consensify 受人工制品的影响较小。对于 D 统计量，Consensify 对假阳性的抵抗力更强，并且与其他常用方法相比，不同实验室协议导致的偏差似乎影响较小。尽管 Consensify 是针对古基因组数据开发的，但它适用于任何低到中等覆盖率的短读数据集。我们预测，Consensify 将成为未来古基因组研究的有用工具。
通过双倍的单倍体繁殖（向日葵）加速繁殖：基因组编辑时代过去和未来前景的见解
对其起源知之甚少，但du toit（Zoe。cit。）和La·Wrence（1946）建议它可能已经从北部引入了南部非洲。关于传输方式的当前知识以及向量的喂养习惯，条纹腿的tick hyalomma transiens，使这一建议合理。感染性tick虫本可以被哺乳动物和鸟类在广阔的地区传播。这将很清楚，如果人们认为两个宿主hyalomma spp的未成熟阶段。经常在候鸟上遇到。Schulze（1930）记录了透明的MMA若虫从埃及引入斯堪的纳维亚半岛，而Enigk（1944）则观察到从亚热带地区向德国的此类壁虱的年度介绍。因此，可以想象的是，候鸟可以将感染性H. transiens的未成熟阶段带入南部非洲。