该项目是关于在同种异体干细胞移植的背景下开发新的收养免疫疗法,尤其是条件。为此,应通过遗传和逆转录病毒转导来对NK细胞(原代NK细胞以及NK细胞系)进行基因修饰,以表达CD38和CD45建立的嵌合抗原受体(CARS)。
荆瑞平,焦佩玲,陈建军,孟晓燕博士,吴晓,段永刚博士,尚凯,钱琳,孙杰教授 浙江大学医学院附属第一医院细胞生物学系和骨髓移植中心 杭州 310058,中国 电子邮件:sunj4@zju.edu.cn 荆瑞平,焦佩玲,陈建军,孟晓燕博士,吴晓,段永刚博士,尚凯,钱琳,孙杰教授 浙江大学血液学研究所 & 浙江省干细胞与免疫治疗工程实验室 杭州 310058,中国 荆瑞平,焦佩玲,陈建军,孟晓燕博士,吴晓,段永刚博士,尚凯,孙杰教授 浙江省系统与精准医学实验室 浙江大学医学中心 杭州 310058,中国 黄勇,高晓燕教授浙江省西湖大学生命科学学院杭州 310058 刘菁,尹文教授浙江大学生物医学工程与仪器科学学院生物医学工程教育部重点实验室杭州 310058
间充质干细胞(MSC)是多素的成年干细胞,对基于细胞的再生疗法有很大潜力。体外扩展改变其表观遗传和细胞特性,对DNA损伤反应(DDR)和基因组稳定性的影响很差。我们在这里报告了基于转录组的基于转录组的途径分析的结果,该途径分析了体外 - 脱落的人骨骨髓衍生的间充质干细胞(HBM-MSC),并补充了针对DNA双链断裂(DSB)修复的细胞测定。使用基因,KEGG和GSEA映射受体外衰老影响的基因途径,并被发现涉及DNA修复,同源重组(HR),细胞周期控制和染色体复制。在HBM-MSC中对X射线诱导的X射线诱导的DNA DSB的识别(C-H2AX + 53BP1焦点)的测定表明,在8周的体外衰减期间(即10个双倍的时间),细胞表现出较高的DDRADNA ddra。此外,观察到对DNA DSB识别受损的细胞的明显亚群。通过HR(例如Rad51,Rad54,BRCA1)参与DNA修复中的几个基因显示2.3至四倍降低了QRT-PCR的mRNA表达。我们得出的结论是,HMSC的体外扩张会导致与DNA断裂的识别和修复的衰老相关损害。
摘要:胸膜间皮瘤 (PM) 是一种可观察到上皮样、双相性和肉瘤样组织类型的癌症。肉瘤样 PM 以间充质特征为特征。多组学已用于在分子水平上表征上皮-间充质 (EMT) 表型。我们通过纳入 RNA 编辑分析为此做出了贡献。我们从两个 PM 队列中提取了上皮评分最高与最低的样本,并观察到 EMT 后内含子中的 RNA 编辑增加而 3′UTR 中的 RNA 编辑减少。在通过转录组学分析分层为两组的原代 PM 原代培养物中也观察到了同样的情况,其中一组富集了间充质特征。我们的数据表明,与在其他癌症类型中观察到的情况一样,RNA 编辑与 PM 中的 EMT 表型相关。
在气液界面 (ALI) 生长的分化原代细胞的转录谱与体内气道上皮非常相似,这表明使用原代培养物和存在气液界面对于重现气道上皮生物学非常重要。此外,不同人类供体内部和之间的气管和支气管来源细胞之间非常相似,这表明气道细胞具有特有的强大表达谱 [1]。因此,体外 ALI 模型被推荐用于研究呼吸道的生理和病理生理反应、分子事件以及不同细胞类型的作用方式和相互作用 [2]。分化良好的体外气道上皮培养物的特点是形成假复层上皮和相邻环境之间的屏障功能。尽管气道上皮细胞在塑料上的二维培养中不会分化,但它们在气液界面的多孔膜上生长时可以发生粘液纤毛分化。气液界面通过支持上皮细胞的分化来实现上皮细胞的极化[3]。
要了解细胞如何在神经系统中进行通信,必须定义其分泌组,这对于原代细胞的挑战很大,因为需要大细胞数。在这里,我们通过开发“用点击糖的高性能分泌蛋白富集”(HISPECS)方法来小型分泌组分析。为了证明其广泛的效用,HISPEC用于确定脑切片对LPS诱导的神经炎症的分泌反应,并使用原代星形胶质细胞,微神经胶质,神经元和寡聚细胞来建立细胞类型分辨的小鼠脑秘密资源。该资源允许映射CSF蛋白的细胞起源,并揭示出意外的体外和体内分泌的蛋白质出乎意料的是蛋白水解裂解的膜蛋白extodomain。两个例子是神经分泌的Adam 22和CD 200,我们将其确定为阿尔茨海默氏症连接蛋白酶贝丝的底物1。hispecs和脑部分泌资源可以被广泛利用,以系统地研究蛋白质分泌和脑功能,并鉴定CNS疾病的细胞类型特异性生物标志物。
小胶质细胞是大脑中的常驻免疫细胞,在驱动神经炎症(神经退行性疾病的标志)中起关键作用。可诱导的小胶质细胞样细胞已被开发为用于分子和治疗假说产生和测试的体外平台。然而,没有系统地评估这些细胞与原代人小胶质细胞的相似性以及它们对大脑原代细胞期望的外部提示的反应。在这项研究中,我们通过散装和单细胞RNA测序对市售人类诱导的多能干细胞(IPSC)衍生的小胶质细胞(IPSC)细胞进行了转录表征,以评估其与原发性人类小胶质细胞的相似性。为了评估其刺激反应性,用肝X受体(LXR)途径激动剂处理IMGL细胞及其以散装和单细胞RNA测序为特征的转录反应。批量转录组分析表明,IMGL细胞具有与新鲜分离的人类原代小胶质细胞相似的总体表达谱,并表达许多关键的小胶质细胞转录因子以及功能和疾病相关的基因。值得注意的是,在单细胞水平上,IMGL细胞表现出不同的转录亚群,代表了正常和患病的原发性小胶质细胞中存在的稳态和激活状态。用LXR途径对IMGL细胞进行处理,激动剂会诱导脂质代谢和细胞周期的牢固转录变化。在单细胞水平上,我们观察到稳态和活化状态和激活状态的细胞亚群之间的响应异质性以及反应散装的表达会变化为其相应的单细胞态。总之,我们的结果表明,IMGL细胞表现出复杂的转录曲线和反应性,让人联想到体内小胶质细胞,因此代表了神经变性中治疗性发育的有希望的模型系统。
到目前为止,使用嵌合抗原受体 (CAR) 的细胞免疫疗法几乎只使用自体外周血来源的 T 细胞作为免疫效应细胞。然而,对于患有恶性肿瘤和造血功能紊乱且接受过大量预先治疗的患者,收集足够数量的 T 细胞通常具有挑战性。此外,这种 CAR 产品始终针对单个患者。相反,由于这些先天免疫细胞缺乏同种反应,因此可以在非 HLA 匹配环境中进行 NK 细胞输注。尽管如此,输注的 NK 细胞仍会被患者的免疫系统识别和排斥,从而限制了它们在体内的寿命并破坏了多次输注的可能性。在这里,我们设计了基因组编辑和先进的慢病毒转导方案,使原代人类 NK 细胞对受体 CD8 + T 细胞的同种异体反应不敏感/有抵抗力。通过 CRISPR/Cas9 靶向 B2M 基因敲除 HLA I 类分子的表面表达后,我们还共表达了单链 HLA-E 分子,从而通过“缺失自我”诱导的裂解防止 NK 细胞与 B2M 敲除 (KO) 细胞自相残杀。重要的是,这些基因工程 NK 细胞在表型和对不同 AML 细胞系的天然细胞毒性方面与未改造的 NK 细胞在功能上没有区别。在共培养试验中,B2M-KO NK 细胞既不会诱导同种异体 T 细胞的免疫反应,也不会重新激活使用相应 NK 细胞供体的辐照 PBMNC 扩增/引发的同种异体 T 细胞。我们的研究证明了在原代同种异体 NK 细胞中进行基因组编辑的可行性,可以减少不匹配的 T 细胞对其的识别和杀伤,并且是使用非 HLA 匹配的原代人类 NK 细胞作为现成的“现成的”免疫效应物用于人类癌症的各种免疫治疗适应症的重要先决条件。
间充质干细胞(MSC)是多素的成年干细胞,对基于细胞的再生疗法有很大潜力。体外扩展改变其表观遗传和细胞特性,对DNA损伤反应(DDR)和基因组稳定性的影响很差。我们在这里报告了基于转录组的基于转录组的途径分析的结果,该途径分析了体外 - 脱落的人骨骨髓衍生的间充质干细胞(HBM-MSC),并补充了针对DNA双链断裂(DSB)修复的细胞测定。使用基因,KEGG和GSEA映射受体外衰老影响的基因途径,并被发现涉及DNA修复,同源重组(HR),细胞周期控制和染色体复制。在HBM-MSC中对X射线诱导的X射线诱导的DNA DSB的识别(C-H2AX + 53BP1焦点)的测定表明,在8周的体外衰减期间(即10个双倍的时间),细胞表现出较高的DDRADNA ddra。此外,观察到对DNA DSB识别受损的细胞的明显亚群。通过HR(例如Rad51,Rad54,BRCA1)参与DNA修复中的几个基因显示2.3至四倍降低了QRT-PCR的mRNA表达。我们得出的结论是,HMSC的体外扩张会导致与DNA断裂的识别和修复的衰老相关损害。