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World File Search System原位杂交
早期大脑发育过程中结节性硬化症中的 microRNA-34a 激活可能导致皮质发生受损
图 1 出生后早期发育过程中皮质结节中 miR-34a 表达增加。 (A、B) TaqMan RT-qPCR 分析：(A) 与尸检对照组织 (n = 27) 相比，结节性硬化症 (TSC) 患者 (n = 37) 切除的皮质结节中 miR-34a 表达较高 (中位 FC = 3.4，p < 0.001)； (B) 与年龄匹配的尸检对照组 (n = 13) 相比，0–4 岁 TSC 年龄组的 MiR-34a 较高 (FC =17.5, p < 0.001)，但在 4–12 岁 (n = 10 vs. n = 5) 和 >12 岁 (n = 8 vs. n = 9) 的 TSC 与年龄匹配的对照组之间没有显着差异；(C, D) MiR-34a-5p 原位杂交：婴儿 TSC 皮质 (8 个月大) 与尸检衍生的对照皮质 (9 个月大) 的灰质 (C) 和白质 (D) 相比；miR-34a 原位杂交信号 (IHS) 的双标记，以蓝色显示，NeuN (C，插图) 和 GFAP (D，插图)，以红色显示； (E, F) 双标记显示 miR-34a IHS 与 NeuN 在正常和畸形神经元（DN；E）中共定位，且与 GFAP 在巨细胞（GC；E、F）中共定位；*** p < 0.001；(A) 中的 Mann–Whitney 和 (B) 中的 Kruskal–Wallis 与 Dunn 的事后检验，中位数、误差线表示最小-最大范围。
多功能的Wnt调节器是啮齿动物条纹模式的演变
信件和材料请求应发给Ricardo Mallarino。rmallarino@princeton.edu。作者贡献M.R.J.和R.M.构思了该项目并设计了实验。M.R.J. 进行了RNA-SEQ实验和大量RNA-Seq分析。 S.L. 在S.A.M.的帮助下，在条纹小鼠中进行了体外和体内基因组编辑。 和J.A.R.-P。 M.R.J. 和S.L. 对基因组编辑的动物进行了所有下游加工和分析。 下午和S.Y.S. 进行了数学建模。 C.F.G.-J. 在M.R.J.的支持下领导了SCRNA-SEQ分析。 和Q.N. M.R.J.，B.J.B. 和R.M. 进行原位杂交。 M.R.J.，B.J.B.，S.A.M。 和R.M. 进行了条纹小鼠和实验室小鼠组织的表型表征，包括免疫荧光和组织学。 M.R.J. 和S.A.M. 进行了黑素细胞细胞培养实验。 J.A.M. 进行了进化分析。 C.Y.F. 产生了横纹肌的MUS基因组和抬高注释。 J.G. 和A.P. 生成了永生的横纹纤维细胞。 M.R.J. 和R.M. 用所有作者的输入写了手稿。M.R.J.进行了RNA-SEQ实验和大量RNA-Seq分析。S.L. 在S.A.M.的帮助下，在条纹小鼠中进行了体外和体内基因组编辑。 和J.A.R.-P。 M.R.J. 和S.L. 对基因组编辑的动物进行了所有下游加工和分析。 下午和S.Y.S. 进行了数学建模。 C.F.G.-J. 在M.R.J.的支持下领导了SCRNA-SEQ分析。 和Q.N. M.R.J.，B.J.B. 和R.M. 进行原位杂交。 M.R.J.，B.J.B.，S.A.M。 和R.M. 进行了条纹小鼠和实验室小鼠组织的表型表征，包括免疫荧光和组织学。 M.R.J. 和S.A.M. 进行了黑素细胞细胞培养实验。 J.A.M. 进行了进化分析。 C.Y.F. 产生了横纹肌的MUS基因组和抬高注释。 J.G. 和A.P. 生成了永生的横纹纤维细胞。 M.R.J. 和R.M. 用所有作者的输入写了手稿。S.L.在S.A.M.的帮助下，在条纹小鼠中进行了体外和体内基因组编辑。和J.A.R.-P。 M.R.J.和S.L.对基因组编辑的动物进行了所有下游加工和分析。下午和S.Y.S. 进行了数学建模。 C.F.G.-J. 在M.R.J.的支持下领导了SCRNA-SEQ分析。 和Q.N. M.R.J.，B.J.B. 和R.M. 进行原位杂交。 M.R.J.，B.J.B.，S.A.M。 和R.M. 进行了条纹小鼠和实验室小鼠组织的表型表征，包括免疫荧光和组织学。 M.R.J. 和S.A.M. 进行了黑素细胞细胞培养实验。 J.A.M. 进行了进化分析。 C.Y.F. 产生了横纹肌的MUS基因组和抬高注释。 J.G. 和A.P. 生成了永生的横纹纤维细胞。 M.R.J. 和R.M. 用所有作者的输入写了手稿。下午和S.Y.S.进行了数学建模。C.F.G.-J. 在M.R.J.的支持下领导了SCRNA-SEQ分析。 和Q.N. M.R.J.，B.J.B. 和R.M. 进行原位杂交。 M.R.J.，B.J.B.，S.A.M。 和R.M. 进行了条纹小鼠和实验室小鼠组织的表型表征，包括免疫荧光和组织学。 M.R.J. 和S.A.M. 进行了黑素细胞细胞培养实验。 J.A.M. 进行了进化分析。 C.Y.F. 产生了横纹肌的MUS基因组和抬高注释。 J.G. 和A.P. 生成了永生的横纹纤维细胞。 M.R.J. 和R.M. 用所有作者的输入写了手稿。C.F.G.-J.在M.R.J.的支持下领导了SCRNA-SEQ分析。和Q.N.M.R.J.，B.J.B. 和R.M. 进行原位杂交。 M.R.J.，B.J.B.，S.A.M。 和R.M. 进行了条纹小鼠和实验室小鼠组织的表型表征，包括免疫荧光和组织学。 M.R.J. 和S.A.M. 进行了黑素细胞细胞培养实验。 J.A.M. 进行了进化分析。 C.Y.F. 产生了横纹肌的MUS基因组和抬高注释。 J.G. 和A.P. 生成了永生的横纹纤维细胞。 M.R.J. 和R.M. 用所有作者的输入写了手稿。M.R.J.，B.J.B.和R.M.进行原位杂交。M.R.J.，B.J.B.，S.A.M。 和R.M. 进行了条纹小鼠和实验室小鼠组织的表型表征，包括免疫荧光和组织学。 M.R.J. 和S.A.M. 进行了黑素细胞细胞培养实验。 J.A.M. 进行了进化分析。 C.Y.F. 产生了横纹肌的MUS基因组和抬高注释。 J.G. 和A.P. 生成了永生的横纹纤维细胞。 M.R.J. 和R.M. 用所有作者的输入写了手稿。M.R.J.，B.J.B.，S.A.M。和R.M.进行了条纹小鼠和实验室小鼠组织的表型表征，包括免疫荧光和组织学。M.R.J. 和S.A.M. 进行了黑素细胞细胞培养实验。 J.A.M. 进行了进化分析。 C.Y.F. 产生了横纹肌的MUS基因组和抬高注释。 J.G. 和A.P. 生成了永生的横纹纤维细胞。 M.R.J. 和R.M. 用所有作者的输入写了手稿。M.R.J.和S.A.M.进行了黑素细胞细胞培养实验。J.A.M. 进行了进化分析。 C.Y.F. 产生了横纹肌的MUS基因组和抬高注释。 J.G. 和A.P. 生成了永生的横纹纤维细胞。 M.R.J. 和R.M. 用所有作者的输入写了手稿。J.A.M.进行了进化分析。C.Y.F. 产生了横纹肌的MUS基因组和抬高注释。 J.G. 和A.P. 生成了永生的横纹纤维细胞。 M.R.J. 和R.M. 用所有作者的输入写了手稿。C.Y.F.产生了横纹肌的MUS基因组和抬高注释。J.G. 和A.P. 生成了永生的横纹纤维细胞。 M.R.J. 和R.M. 用所有作者的输入写了手稿。J.G.和A.P.生成了永生的横纹纤维细胞。M.R.J. 和R.M. 用所有作者的输入写了手稿。M.R.J.和R.M.用所有作者的输入写了手稿。
水生生物疾病 62:255
摘要：传统上，螺原体仅从花和其他植物部位的表面、各种昆虫的内脏和血淋巴以及维管植物的液体（韧皮部汁液）和以这些液体为食的昆虫中分离出来。在本文中，我们报告了在虾中发现的第一种致病螺原体，以及通过组织学评估、原位杂交测定、透射电子显微镜、16S rRNA 序列同源性和注射感染性研究对其进行表征的结果。此外，还介绍了为检测这种微生物而开发的分子方法，该微生物被确定为哥伦比亚养殖的南美白对虾的病原体，导致其死亡率很高。使用标准组织学方法和原位杂交测定，证实南美白对虾感染了这种致病螺原体。组织学分析显示受影响器官/组织出现全身性炎症反应。为了鉴定细菌，使用来自初始流行区的冷冻感染南美白对虾样本对 16S rRNA 基因进行测序并开发分子检测方法。通过 PCR 扩增 16S rRNA 基因，然后进行测序。使用 GenBank BLAST 搜索分析序列数据，结果显示与柑橘树病原体柑橘螺原体有 98% 的同源性。对 16S rRNA 序列数据进行评估以开发针对假定螺原体的独特 PCR 引物。使用针对螺原体属的螺旋素基因开发的 PCR 引物，开发并测试了地高辛标记的探针。该探针是物种特异性的，与以此形式测试的其他细菌样本没有发生阳性反应或交叉反应。
慢性乙型肝炎患者的横断面研究
摘要 目的 我们前期报告中对慢性乙型肝炎 (CHB) 患者肝切片中的 HBV DNA 进行了可视化，发现了病毒抗原和核酸的马赛克分布。本文我们旨在进一步探索 HBV DNA 原位杂交 (ISH) 检测的临床实用性。方法 对 313 名未经治疗的 CHB 患者进行了 HBV DNA 原位杂交以及 HBsAg、HBcAg 的免疫组织化学 (IHC) 和常规组织病理学分析。除了基本的生化和病毒学参数外，还测量了血清 HBcrAg 和 HBcAb 滴度。结果 HBV DNA、HBsAg 和 HBcAg 的 ISH 阳性率分别为 95.2%、97.1% 和 42.8%。HBV DNA 的染色模式与 HBsAg 的染色模式有显著不同。肝内 HBV DNA 与病毒载量、HBcrAg 和 HBsAg 滴度呈高度相关性。在 HBeAg 阴性患者中，肝内较高的 HBV DNA 与肝脏炎症和纤维化的组织学证据有关，而在 HBeAg 阳性患者中没有观察到这种趋势。最后，开发了一种结合 HBV DNA、HBsAg 和胶原纤维检测的三重染色方案，以便在疾病进展的背景下更好地评估病毒复制和抗原表达。结论 HBV DNA ISH 检测反映了肝内病毒复制的活力。它与常规病毒抗原 IHC 检测相补充，也与肝病的组织病理学进展有关。HBV DNA ISH 检测的应用可能有助于更好地评估 CHB 患者的病毒学和病理状况。
癌症治疗的生物标志物检测
荧光原位杂交 (FISH) — 这种实验室技术用于评估染色体上的基因和/或 DNA 序列。使用血液或骨髓测试去除细胞和组织。在实验室中，将荧光染料添加到 DNA 片段中；将修饰后的 DNA 添加到载玻片上的细胞或组织中。当这些 DNA 片段与载玻片上的特定基因或染色体区域结合时，在具有特殊光线的显微镜下观察时，它们会“发光”。通过这种方式，可以识别出染色体中数量增加或减少或重新排列的部分。FISH 有助于诊断、评估风险和治疗需求，以及监测治疗效果。
主题基因工程的教学指南
基因表达的空间和时间模式的定义。 div>北部方法。 div>基因表达的全局分析。 div><用显微镜划分。 div>ADNC（RNASEQ）的质量测序。 div>基因表达产物的位置。原位杂交技术。 div>证人基因。 div>确定基因空间表达模式和蛋白质下位置的构造。 div>调节序列位置的方法。 div>凝胶延迟。 div>脚印与DNASA I.染色质的免疫沉淀（CHIP）。 div>组合技术用于分析基因组级别的调节序列：芯片芯片和芯片序列。 div>蛋白质之间物理相互作用的演示。 div>主题8：转基因和诱变 div>
Vibhav Gautam，博士-varanasi
博士学位：在我的博士学位期间，我有机会获得了高级显微镜的专业知识，包括激光捕获显微解剖（LCM），多极子共聚焦显微镜，活细胞成像和扫描电子显微镜（SEM）。除了我在基本微生物学和分子生物学技术方面的熟练程度外，我还获得了基因表达相关方法的实践知识。其中包括基因表达微阵列分析，miRNA微阵列分析，北印迹，电泳迁移率转移测定法（EMSA），原位杂交，定量逆转录聚合酶链反应（QRT-PCR），STEM-LOOP QRT QRT-PCR以及其数据的解释。此外，我在组织固定方面开发了专业知识，使用石蜡蜡和微落部分的加工来进行薄切片。
基于人工智能的 NSCLC 中 ALK 和 ROS1 融合检测...
肺癌是癌症相关死亡的主要原因，每年全球约有 176 万人死于肺癌。间变性淋巴瘤激酶 ( ALK ) 和 c-ROS 致癌基因 1 ( ROS1 ) 基因融合是非小细胞肺癌 (NSCLC) 中公认的关键因素。尽管它们的发生频率相对较低，但它们的检测对于治疗决策和靶向治疗的实施至关重要。用于检测它们的公认方法是免疫组织化学 (IHC) 和荧光原位杂交 (FISH) 检测，以及基于 DNA 和 RNA 的测序检测。在这里，我们提出了一种基于图像的解决方案，可直接从苏木精和伊红 (H&E) 染色的病理切片图像进行分子分析。