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World File Search System变异
粘多糖化类型的遗传变异
常染色体隐性粘膜性糖尿病I（MPS-I）是一种天生的代谢误差，其中硫酸乙酰肝素和硫酸乙酰肝素硫酸盐由于酶α-iduronidase（IDUA）的缺乏而在细胞中积聚在细胞中，这在直系群中更为普遍。以前，据报道α-辅助酶（IDUA）基因中的变体引起MPS-1表型。本研究的目的是确定十个无关的MPS-1的IDUA基因中的遗传变异，影响了巴基斯坦伊斯兰堡的巴基斯坦医学科学研究所（PIMS），巴基斯坦伊斯兰堡的儿童医院。收集了受影响和未受影响的家庭成员的血液样本，并进行了IDUA基因的测序。在对所有鉴定出的引起疾病变体的硅分析中进行了检查，以检查其对蛋白质结构和功能的影响。对所有MPS-1患者的临床检查均表现出粗糙的面部特征，骨骼畸形，疝气，角膜阴影，腹部延伸和肝肾上腺全球。iDUA基因的测序显示了十种错义变化和八个同义变化。在包括突变品尝器，筛分，多形和普罗普兰在内的有机工具中提出了三种变体，是引起疾病的三种变体。在疾病引起的变异中，在我们的分析家庭的80％中鉴定出了先前报道的错义变体，即c.1469t> c引起p.leu490pro。此外，这是一种新颖的14个核苷酸缺失，即C.568_581DEL AACGTCTCCATGAC引起P.ASN190HIFFS*204和单个核苷酸缺失，即C.784DELC引起P.His262thrfs*55造成了与P.His262thrfs*55造成了与MMS-spy sectize seectize。这项研究报告了80％的筛查家庭中的先前报道的错义变体，一种小说（C.568_581DEL AACGTCTCCATGAC）和先前报道的引起疾病的缺失。
线粒体 DNA 拷贝数变异：关键因素......
摘要：胶质母细胞瘤 (GBM) 是一种源自中枢神经系统神经干细胞的高度侵袭性和致命性肿瘤，具有显著的组织病理学变异和基因组复杂性，这导致其快速进展和治疗耐药性。线粒体 DNA (mtDNA) 拷贝数 (CN) 的改变在 GBM 的发展和进展中起着至关重要的作用，影响肿瘤生物学的各个方面，包括能量产生、氧化应激调节和细胞适应性。mtDNA 水平的波动，无论是升高还是降低，都会损害线粒体功能，可能破坏氧化磷酸化并扩增活性氧的产生，从而促进肿瘤生长并影响治疗反应。了解 mtDNA-CN 变异的机制及其与肿瘤微环境中遗传和环境因素的相互作用，对于推进诊断和治疗策略至关重要。针对 mtDNA 改变可以增强治疗效果，减轻耐药性并最终改善这种侵袭性脑肿瘤患者的预后。本综述总结了现有的有关线粒体 DNA 变异的文献，特别强调了线粒体 DNA-CN 的变化及其与 GBM 的关联，通过调查 1996 年至 2024 年期间发表的文章，这些文章来自 Scopus、PubMed 和 Google Scholar 等数据库。此外，本综述还简要概述了线粒体基因组结构、有关线粒体 DNA 完整性和 CN 调节的知识，以及线粒体如何显著影响 GBM 肿瘤发生。本综述进一步介绍了恢复线粒体 DNA-CN 的治疗方法，这些方法有助于优化线粒体功能并改善健康结果。
基因组编辑结果的变异性：研究可重复性和临床安全性的挑战
HAL 是一个多学科开放存取档案库，用于存放和传播科学研究文献，无论这些文献是否已出版。这些文献可能来自法国或国外的教学和研究机构，也可能来自公共或私人研究中心。
TWAS 通过大豆基因表达、结构变异和可变剪接促进基因尺度性状遗传解剖
全基因组关联研究 (GWAS) 可以识别与性状相关的基因座，但识别致病基因可能是一个瓶颈，部分原因是连锁不平衡 (LD) 衰减缓慢。全转录组关联研究 (TWAS) 通过识别基因表达-表型关联或将基因表达数量性状基因座与 GWAS 结果整合来解决这一问题。在这里，我们使用自花授粉大豆 (Glycine max [L.] Merr.) 作为模型来评估 TWAS 在 LD 衰减缓慢的植物物种性状遗传解析中的应用。我们为大豆多样性面板生成了 RNA 测序数据，并识别了 29 286 个大豆基因的遗传表达调控。不同的 TWAS 解决方案受 LD 的影响较小，并且对表达源具有稳健性，可以识别与来自不同组织和发育阶段的性状相关的已知基因。通过 TWAS 鉴定出新的豆荚颜色基因 L2，并通过基因组编辑对其进行了功能验证。通过引入新的外显子比例特征，我们显著提高了由结构变异和可变剪接导致的表达变异的检测。因此，通过我们的 TWAS 方法鉴定出的基因表现出多种多样的因果变异，包括 SNP、插入或缺失、基因融合、拷贝数变异和可变剪接。使用这种方法，我们鉴定出与开花时间相关的基因，包括以前已知的基因和以前未与此特性关联的新基因，从而为 GWAS 的见解提供了补充。总之，这项研究支持将 TWAS 应用于 LD 衰减率较低的物种的候选基因鉴定。
2025; 13：1-5。 doi：10.7150/jgen.104110简短的研究论文COMT和MTHFR遗传变异对青少年特发性脊柱侧弯progroge
目的：编码低COMT和MTHFR活性的遗传变异与特发性脊柱侧弯有关。COMT和MTHFR对青少年特发性脊柱侧弯（AIS）进展的综合影响尚不清楚。这项研究调查了COMT和MTHFR低活性变体是否与AIS进程相关。方法：AIS的患者，至少两次COBB角度测量在青春期，以及低COMT（RS4680 AA）和低MTHFR（A1298C AC和C677T CT； A1298C AA和C677T TT）的患者（A1298C AC和C677T）活性（1组）或GG（组1） （A1298C AA和C677T CT； A1298C AC和C677T CC； A1298C AA和C677T CC）活动（第2组）。排除了神经肌肉或综合脊柱侧弯的人。主要结果是脊柱侧弯的进展，被定义为诊断和骨骼成熟时间之间至少20度或脊柱手术的COBB角增加。通过卡方检验分析了主要结果。结果：具有AIS诊断和所需COBB角度测量的72名患者的COMT和MTHFR结果符合第1组（n = 41）或第2组（n = 31）的标准。关于主要结果，第1组中的78.0％（32/41）进展，第2组患者的48.4％（15/31）（p = 0.009）。结论：与COMT和MTHFR的中间或正常活性变异的患者相比，低COMT和低MTHFR活性变异的患者具有AIS的进展。进一步了解COMT和MTHFR的作用可能会为有关治疗方式的研究提供信息。
组织和液体活检样本中的敏感变异分析
根据 Illumina 无细胞 DNA 富集制备用户指南中的详细说明，从碎片化的 FFPE DNA 或 cfDNA 制备 Illumina 无细胞 DNA 富集制备文库。对于 FFPE DNA，超声处理后，将 45 μl 碎片 DNA（~40 ng）转移到 96 孔 PCR 板中以进行最终修复反应。对于 ctDNA 样本，将 20 ng DNA 输入文库制备中。对“浓缩索引文库”步骤进行了更改，按质量而不是体积进行汇集，以适应在本研究期间测试的单个文库制备中的 1 重、4 重和 12 重文库汇集。使用 Qubit dsDNA BR 检测（Thermo Fisher Scientific，目录号 Q32853）对文库进行量化。为了适应更大的体积，每个文库汇集了 250 ng，并对协议进行了一些修改。富集是使用定制的 79 基因探针面板进行的，如 Illumina 无细胞 DNA 富集准备用户指南中所述。
使用多祖先长序列进行结构变异的推断...
长读测序技术的进步加速了大型结构变异 (SV) 的研究。我们通过对来自 1000 基因组计划的 888 个样本进行长读测序，创建了一个精选的、公开可用的多祖先 SV 归因面板。这个高质量的面板用于归因于大约 500,000 名英国生物库参与者的 SV。我们证明了在生物库规模上使用与呼吸、心脏代谢和肝脏疾病相关的 32 种疾病相关表型以及 1,463 个蛋白质水平进行全基因组 SV 关联研究的可行性。该分析确定了数千个全基因组显著的 SV 关联，包括数百个条件独立信号，从而实现了新的生物学见解。专注于肺功能的遗传关联研究
QGS/QPS软件的心肌灌注和功能解释和可重复性中的Intera Interabserver变异性
Aim: To assess three different level experienced nuclear medicine specialists' intra- and interobserver variability of semiquantitative visual interpretations of left ventricular (LV) myocardial perfusion, wall motion (WM), and wall thickening (WT) in gated myocardial perfusion single- photon emission tomography (gMPS), and to compare the compatibility between the observers' and coronary angiography (CAG) reports.方法：使用5点灌注量表，WM的6分尺度和WT的4分制来评分每个段。图像由3个观察者分别解释了3次至少一个月的间隔。随后，通过求和相应的分段灌注得分来计算应力（SSS）和REST（SRS）的视觉半定量求和分数。总结得分（SDS）也被计算为SSS和SRS之间的差异。通过将所有相应的分段分数求和，从应力图像中计算出视觉半定量WM和WT分数。结果：在全球灌注评估中观察者的一致性具有统计学意义（71.9-100％）。在所有LAD-SS，CX-SSS，VE RCA-SSS解释中都有一个重大的共识。在3个观察者的3个读数之间有很好的一致性（p = 0.0）。由于全球评估中的高观察者一致性水平，1。的平均值和2。解释（平均1.-2。int。），并与该新值和3。解释进行区域比较。在3个区域SSS解释中达成了重大协议。尽管在LAD动脉领域计算了最低的协议率，但协议水平在统计上是统计的，并且在所有领土上都非常重要。在CX和RCA领土中，协议水平在统计学上是显着的（p <0.05）。结论：灌注解释的观察者间和观察者的一致性水平在全球和区域基础中都很重要。视觉解释和CAG结果之间存在重大一致性，尤其是在CX和RCA动脉领域。在WM评分中，观察者中的观察者和观察者协议高于壁厚分数。
胼胝体发育不全胎儿大脑解剖变异性分析
胼胝体发育不全 (CCA) 是最常见的先天性畸形之一，其神经发育结果不确定，尤其是当疾病被孤立时。为了向父母提供明智的咨询，在怀孕早期确定与预测结果相关的解剖标记至关重要。使用 CCA 对胎儿大脑进行定量探索的情况很少见，而且主要限于对特定大脑结构的研究。在这里，我们提出了一种基于微分同胚变换的胎儿大脑磁共振成像 (MRI) 分析流程。它包括两个步骤：半自动胎儿 MRI 预处理程序和量化与正常发育的解剖偏差的流程。MRI 预处理之后，使用配准将每个体积胎儿大脑与年龄匹配的健康模板大脑在全球范围内进行比较。将变形并行传输到同一空间以纠正胎儿之间的年龄差异。使用主成分分析和分类确定了 CCA 特有的变形模式。该流程在回顾性选择的 38 个健康胎儿和 73 个 CCA 胎儿的 MRI 上进行了测试。根据更多局部分析，最相关的 14 分类变形模式将众所周知的大脑改变与 CCA 相结合。15 这项初步工作有望定量探索异常胎儿大脑 16 并将在未来用于识别与不良临床结果相关的解剖特征 17。18
血液友善儿童的心率变异性和QT变化
先天性心脏病是出生时出现的心脏异常。抗烷虫先天性心脏病患者的患者最多，包括患有心房间隔缺陷（ASD）和心室间隔缺陷（VSD）的患者。这种情况的心脏手术涉及肺部旁通机（CPB），可引起炎症反应。 氯胺酮是一种麻醉剂，通过抑制炎症细胞因子的合成来发挥抗炎作用。 这项研究旨在证明氯胺酮对接受心肺旁通机接受心脏手术的患者的炎症细胞因子的减少。 这项研究采用了准实验分析方法。 建立了两个研究组：A组（n = 3）接收到芬太尼，而B组（n = 7）在心肺旁路机（CPB）运行之前和之后接收了氯胺酮。 血液样本是在诱导麻醉之前和从患者中移除CPB装置后一小时收集的。 这项研究利用Mann-Whitney检验评估两组之间的白介素-6（IL-6）和肿瘤坏死因子-Alpha（TNF-α）水平的差异。 发现A组的TNF-α水平为9.97±1.84，IL-6水平为29.30±6.33。 B组显示出10.57±4.33和IL-6值的TNF-α水平为26.36±12.16。 两组的测试结果均显示TNF-α水平（p = 0.569）和IL-6水平（p = 0.819）没有显着差异。这种情况的心脏手术涉及肺部旁通机（CPB），可引起炎症反应。氯胺酮是一种麻醉剂，通过抑制炎症细胞因子的合成来发挥抗炎作用。这项研究旨在证明氯胺酮对接受心肺旁通机接受心脏手术的患者的炎症细胞因子的减少。这项研究采用了准实验分析方法。建立了两个研究组：A组（n = 3）接收到芬太尼，而B组（n = 7）在心肺旁路机（CPB）运行之前和之后接收了氯胺酮。血液样本是在诱导麻醉之前和从患者中移除CPB装置后一小时收集的。这项研究利用Mann-Whitney检验评估两组之间的白介素-6（IL-6）和肿瘤坏死因子-Alpha（TNF-α）水平的差异。发现A组的TNF-α水平为9.97±1.84，IL-6水平为29.30±6.33。B组显示出10.57±4.33和IL-6值的TNF-α水平为26.36±12.16。两组的测试结果均显示TNF-α水平（p = 0.569）和IL-6水平（p = 0.819）没有显着差异。本研究的发现表明，使用CPB机器后，氯胺酮给药并未降低IL-6和TNF-Alpha的水平。