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CRISPR/Cas 与核糖核蛋白复合物和瞬时选择端粒载体可在灰葡萄孢菌中实现高效的无标记和多重基因组编辑
CRISPR/Cas 已成为多种生物体中遗传操作的最先进的技术，能够以前所未有的效率进行有针对性的遗传改变。本文中，我们报告了在重要的坏死性植物病原体灰霉病中首次建立强大的 CRISPR/Cas 编辑，该方法基于将优化的 Cas9-sgRNA 核糖核蛋白复合物 (RNP) 引入原生质体。通过开发一种将 RNP 递送与含端粒的瞬时稳定载体共转化相结合的新策略，进一步提高了编辑产量，从而允许临时选择和方便地筛选无标记编辑事件。我们证明，与现有的基于 CRISPR/Cas 的丝状真菌方法（包括模型植物病原体稻瘟病菌）相比，这种方法提供了更高的编辑率。编辑菌株的基因组测序显示很少有额外的突变，也没有 RNP 介导的脱靶证据。端粒载体介导编辑的高性能通过随机诱变 sdhB 基因的 272 个密码子得到证实，该基因是琥珀酸脱氢酶抑制剂 (SDHI) 杀菌剂抗性的主要决定因素，方法是将 272 个密码子批量替换为编码所有 20 种氨基酸的密码子。在没有选择的情况下，所有交换的频率都相似，但 SDHI 选择允许识别新的氨基酸替换，这些替换赋予了对不同 SDHI 杀菌剂的不同抗性水平。基于 RNP 的共转化效率提高且易于操作，有望加速 B . cinerea 和其他真菌的分子研究。
研究文章 深度迁移学习人工智能可在便携式胸部 X 光片上准确分期 COVID-19 肺部疾病严重程度
本研究采用深度学习卷积神经网络在便携式胸部X光 (CXR) 上对冠状病毒病 2019 (COVID-19) 感染的肺部疾病严重程度进行分期，并以放射科医生的疾病严重程度评分为基本事实。本研究包括 84 名 COVID-19 患者 (51 名男性 55.1 ± 14.9 岁；29 名女性 60.1 ± 14.3 岁；4 项信息缺失) 的 131 张便携式 CXR。三位专家胸部放射科医生根据不透明度 (0-3) 和地理范围 (0-4) 分别对左肺和右肺进行评分。深度学习卷积神经网络 (CNN) 用于预测肺部疾病严重程度评分。数据分为 80% 的训练数据集和 20% 的测试数据集。分析了 AI 预测评分与放射科医生评分之间的相关性。并与传统学习和迁移学习进行了比较。平均不透明度得分为 2.52（范围：0-6），三位读者的标准差为 0.25（9.9%）。平均地理范围得分为 3.42（范围：0-8），三位读者的标准差为 0.57（16.7%）。评分者间一致性得出不透明度得分的 Fleiss' Kappa 为 0.45，范围得分的 Fleiss' Kappa 为 0.71。人工智能预测的分数与放射科医生的分数高度相关，其中顶级模型的相关系数（R 2 ）为 0.90（范围：传统学习为 0.73-0.90，迁移学习为 0.83-0.90），平均绝对误差为 8.5%（范围：分别为 17.2-21.0% 和 8.5%-15.5）。迁移学习通常表现更好。总之，深度学习 CNN 可在便携式 COVID-19 肺部感染胸部 X 光片上准确分级疾病严重程度。这种方法可能有助于分级肺部疾病严重程度、预测和预测治疗反应和生存率，从而为风险管理和资源分配提供信息。
CD24 靶向术中荧光图像引导手术可在临床前原位手术模型中改善卵巢癌细胞减灭术
背景：切除的完整性是卵巢癌患者的关键预后指标，而肿瘤靶向荧光图像引导手术 (FIGS) 的应用提高了细胞减灭术中腹膜转移的检测率。CD24 在卵巢癌中高表达，已被证明是肿瘤靶向成像的合适生物标志物。方法：研究了高级别浆液性卵巢癌 (HGSOC) 的细胞系和异质患者来源的异种移植 (PDX) 肿瘤样本中的 CD24 表达。将单克隆抗体 CD24 与 NIR 染料 Alexa Fluor 750 结合并评估最佳药理参数 (OV-90，n = 21) 后，对原位 HGSOC 转移性异种移植 (OV-90，n = 16) 进行了实时反馈的细胞减灭术。将术中 CD24 靶向荧光引导的影响与单独的白光和触诊进行了比较，并在术后监测疾病复发（OV-90，n = 12）。在四种临床注释的转移性 HGSOC 原位 PDX 模型中进一步评估了 CD24-AF750，以验证术中引导的转化潜力。结果：与原位 HGSOC 异种移植中的标准白光手术相比，CD24 靶向术中 NIR FIG 显着（47.3%）改善了肿瘤检测和切除，并减轻了术后肿瘤负担。CD24-AF750 允许识别四种 HGSOC PDX 中肉眼无法检测到的微小肿瘤病变。解读：CD24 靶向 FIG 具有转化潜力，可作为改善卵巢癌减瘤手术的辅助手段。资金：本研究由 H2020 计划 MSCA-ITN [675743]、Helse Vest RHF 和 Helse Bergen HF [911809、911852、912171、240222、911974、HV1269] 以及挪威癌症协会 [182735] 和挪威研究理事会通过其卓越中心资助计划 [223250、262652] 资助。© 2020 作者。由 Elsevier BV 出版 这是一篇根据 CC BY-NC-ND 许可协议开放获取的文章。（http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/）
单剂量复制型 RNA 疫苗可在非人类灵长类动物中诱导产生针对 SARS-CoV-2 的中和抗体
图 1. 体外 repRNA-CoV2S 表征。（A）密码子优化的全长刺突 (S) 开放阅读框，包括 S1-、S2-、跨膜 (TM) 和胞质 (CD) 结构域，对应于 SARS-CoV-2 分离株武汉-Hu-1（GenBank：MN908947.3）中的位置 21,536 至 25,384，与 c 端 v5 表位标签融合，克隆到编码委内瑞拉马脑炎病毒株 TC-83 的 4 个非结构蛋白 (nsP1-4) 基因的 α病毒复制子中。 RNA 转录和加帽后，将 repRNA-COV2S 转染到 BHK 细胞中，24 小时后，使用 (B) 抗 v5 免疫荧光和 (C) 蛋白质印迹法分析细胞，使用恢复期人血清或抗 v5 进行免疫检测。重组 SARS-CoV2 刺突蛋白 (rCoV2-Spike) 和 repRNA-GFP 分别用作阳性和阴性对照。B 和 C 中的数据代表 2 个独立实验。57
MMR 疫苗可在初级保健机构中安全地为所有对鸡蛋过敏的儿童接种 1
背景 麻疹 麻疹仍然是可预防婴儿死亡的主要原因。它是一种病毒感染，可并发肺炎或脑炎等严重感染。 2 腮腺炎 腮腺炎是一种经常影响神经系统的病毒感染。 3 它是感音神经性听力损失的主要原因，还可引起睾丸炎、卵巢炎和脑炎，25% 的患者会留下永久性后遗症。 4 风疹 风疹是一种轻微的疾病。然而，孕早期母亲感染风疹可导致胎儿流产；婴儿可能患有先天性风疹综合症，该综合症会导致因耳聋、白内障、心脏缺陷和学习困难而终身残疾。 5 好处 麻疹、腮腺炎和风疹 (MMR) 疫苗是一种减毒活病毒疫苗，可刺激免疫系统而不会引起实际感染。该疫苗分两剂接种。该疫苗对麻疹和风疹的有效率约为 99%，对腮腺炎的有效率约为 88%。由于麻疹和腮腺炎疫苗是使用鸡胚成纤维细胞生产的，有人担心对鸡蛋过敏的儿童可能会出现过敏反应。然而，该疫苗仅含有微量的鸡蛋蛋白（pg - 1ng），不足以引起过敏反应。6 在三项对 1000 多名鸡蛋过敏患者的大型研究中，接种 MMR 疫苗后未报告任何严重反应。7,8,9,10 风险虽然 MMR 非常安全，但与其他疫苗一样，可能会发生不良反应。第一次注射后，可能会在免疫一周左右出现发烧和/或皮疹，并持续两到三天。第二次注射后不良反应的发生率要低得多。11 MMR 后的过敏反应极为罕见。12 对 MMR 疫苗本身的过敏可能是由明胶和新霉素等其他成分引起的。 13,14,15
2020 年 2 月发布公告 Oracle Analytics 可在各种环境中提供 AI 驱动的增强分析
“OAS 为我们的客户开辟了巨大的可能性。与 OAC 的功能对等使其成为长期云战略的有力先行者；无需额外投资即可加入现代分析功能，从而能够在集中、管理良好的架构中进行数据探索、可视化和自助服务。此外，围绕数据转换、自动丰富、一键式高级分析和机器学习管道的功能使我们的客户在机器学习方面领先一步。” - Jon Mead，Rittman Mead 董事总经理
有效的血脑屏障突变突变体IDH1抑制剂可在患者来源的正常异常转移模型中抑制使用IDH1突变的胶质母细胞瘤的生长
神经胶质瘤根据组织病的标准分类为WHO级I级I-IV。尽管I级肿瘤是良性的，但II级和III级肿瘤是恶性的，并且可以发展为最高级。即使在多模式治疗（包括手术，放疗和辅助化疗）（1-3）的多模式治疗后，IV级肿瘤（GBMS）的中位生存期也仅约16个月（1-3）。因此，迫切需要新型靶向疗法的开发。杂合突变，包括急性髓性白血病（AML），血管免疫细胞淋巴瘤，软骨瘤和胆管癌（4-7）。这些突变也发生在大部分II级–III级星形胶质细胞瘤和少突endrogliomas（53 - 83％）和次级GBM（54％；参考文献。8，9）。IDH1 ARG132（R132）密码子中的错义突变引起单个氨基酸取代，最常见于组氨酸（H），也是半胱氨酸（C），丝氨酸（S），甘氨酸（G），Leucine（k），lecine（k）和Isolecoine（I）。在神经胶质瘤中，最常见的突变是IDH1R132H，该突变约为所有IDH突变的90％，而很少检测到IDH2突变，与AML不同（4.4％；参考；参考。1，9）。野生型IDH是使用nADPÞ将异晶酸酯转换为-Ketogoglutarate（A -kg）的酶，而IDH1和IDH2分别位于细胞质和线粒体中。突变体IDH催化A-kg转换为oncometabolite 2-羟基谷物酸盐（2-HG;ref。11 - 16）。 在临床前广泛分析了突变体IDH在肿瘤发生中的作用11 - 16）。在临床前广泛分析了突变体IDH在肿瘤发生中的作用10），竞争性地抑制-kg - 依赖性双氧酶，包括表观遗传调节剂（十个易位和组蛋白脱甲基酶）等（EGL九种同源物和胶原蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白酶和胶原蛋白4-羟基酶；参考；参考。2-Hg的抑制作用导致CpG岛和组蛋白甲基化的异常DNA甲基化（11-13，17）以及缺氧诱导因子1 A的稳定，从而促进了肿瘤发生（18）。
CRISPR/Cas 与核糖核蛋白复合物和瞬时选择端粒载体可在灰葡萄孢菌中实现高效的无标记和多重基因组编辑
。CC-BY 4.0 国际许可永久有效。它是在预印本下提供的（未经同行评审认证），作者/资助者已授予 bioRxiv 许可，可以在
一种工程仿生 MPER 肽疫苗可在小鼠体内诱导弱 HIV 中和抗体
摘要 — 诱导针对人类免疫缺陷病毒 (HIV) 的广谱中和抗体 (bnAbs) 的疫苗将有助于控制该疾病。膜近端外部区域 (MPER) 肽是一种有吸引力的抗原候选物，因为它是保守的并且是几种人类 bnAbs 的靶标，例如 2F5。我们之前发现含有钴卟啉磷脂 (CoPoP) 的脂质体可以与带有 his 标记的 MPER 肽结合，从而在脂质双层上产生仿生抗原呈递。本研究生成了各种带有 his 标记的合成 MPER 片段，这些片段与含有 CoPoP 和合成单磷酰脂质 A (MPLA) 的脂质体结合，并评估了小鼠的免疫原性。与较短的 MPER 肽相比，氨基酸片段源自膜插入点且长度至少为 25 个氨基酸的 MPER 肽具有更高的 2F5 反应性并诱导更强的抗体反应。与 Alum 和 Montanide 佐剂相比，用脂质呈递的 MPER 免疫可引发更强的抗体反应，后者可识别含有 MPER 序列的重组 gp41 和 gp140 蛋白。诱导的抗体可中和对中和抗体 (W61D(TCLA)0.71) 敏感的 1A 级病毒，但不能中和另一级 1A 级或 2 级毒株。MPER 肽与无关疟疾蛋白抗原 (Pfs25) 共同配制，该抗原与含有 CoPoP 和 MPLA 的脂质体有效佐剂结合，可引发更高的 MPER 抗体水平，但不会改善中和，可能是由于干扰了膜中正确的肽呈递。产生了产生 MPER 抗体的鼠杂交瘤，但它们是非中和性的。这些结果并不
pBCI 可在真实飞行条件下预测注意力错误
摘要 — 事故分析表明，飞行员可能无法处理诸如警报之类的听觉刺激，这种现象称为注意力缺失性失聪。这项研究的目的是开发一种被动脑机接口，可以预测在真实飞行条件下这种关键现象的发生。十名配备干脑电图系统的志愿者必须飞行一个具有挑战性的飞行场景，同时通过按下按钮来响应听觉警报。行为结果显示，飞行员错过了 36% 的听觉警报。ERP 分析证实，由于潜在的注意力瓶颈机制，这种现象会影响早期（N100）和晚期（P300）阶段的听觉处理。使用稀疏表示分类 (SRC)、稀疏和密集表示 (SDR) 以及更传统的方法（例如线性判别分析 (LDA)、收缩 LDA 和最近邻 (1-NN)）对警报响起前三秒提取的频率特征进行受试者间分类。在最佳情况下，SRC 和 SDR 分别给出了 66.9% 和 65.4% 的正确平均分类率来预测注意力不集中性耳聋的发生，优于 LDA (60.6%)、sLDA (60%) 和 1-NN (59.6%)。这些结果为神经自适应自动化的实施开辟了光明的前景，最终目标是增强警报刺激传递，使其被感知和采取行动。