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World File Search System四倍体
由CRISPR/CAS9
摘要：Kiwifruit属于Actinidia属，有54种物种显然在功能上都是外胞菌的。XX/XY型的性别确定因素，具有男性异型剂，独立于倍性水平。最近，Sygi蛋白被描述为女性发育的抑制剂。在本研究中，我们通过针对Sygi基因中的两个不同位点来利用CRISPR/CAS9技术，以在两个四倍体男性辅助中诱导Chinensis var的两个四倍体男性饰品中稳定的基因敲除。chinensis。两种基因型的再生效率分别为58％和73％。尽管尚未能够验证表型对浮动结构的影响，但由于组织培养的奇异果植物需要长时间才能使其振动，但我们获得了两条再生线，表明其基因组的唯一构度固定近来固定，这两种情况都构成了替代构成的构成，这两种情况都构成了构成的基因构成。对两个再生植物的GRNA1基因座的评估导致与单个核苷酸不同的靶向区域不同的次要变体的共同值。可以假定该区域的基因组重复。
奥尔堡大学高效基因编辑策略......
马铃薯 ( Solanum tuberosum ) 是一种高度多样化的四倍体作物。优良品种杂合性极强，品种内和品种间短片段多态性 (indel) 和单核苷酸多态性 (SNP) 的发生率很高，在 CRISPR/Cas 基因编辑策略和设计中必须考虑这些因素才能获得成功的基因编辑。在本研究中，对马铃薯品种 Saturna 和 Wotan 中葡聚糖水双激酶 (GWD)1 和抗霜霉病 6 (DMR6-1) 基因分别进行深入测序，结果显示与杂合二倍体 RH 基因组序列相比，四倍体与二倍体相比，存在 indel 和 1.3 – 2.8 的高 SNP 发生率。这使向导 RNA (gRNA) 和诊断性 PCR 设计变得复杂。细胞库（原生质体）水平的高编辑效率对于实现四倍体中的完全等位基因敲除以及减少下游繁琐而精细的植株再生至关重要。在这里，CRISPR/Cas 核糖核蛋白颗粒 (RNP) 通过聚乙二醇 (PEG) 介导的转化瞬时递送到原生质体中。对于 GWD1 和 DMR6-1 中的每一个，设计了 6 – 10 个 gRNA 来靶向包含两个基因的 5 ' 和 3 ' 端的区域。与包括多种生物体的其他研究类似，单个 RNP/gRNA 的编辑效率差异很大，并且一些产生了特定的插入/缺失模式。尽管与靶向 3′ 端相比，靶向 GWD1 5′ 端的 RNP 产生的编辑效率明显更高，但 DMR6-1 5′ 端和 3′ 端的编辑效率似乎有些相似。当仅靶向 GWD1 基因的 3′ 端时，同时用两个 RNP 靶向 5′ 端或 3′ 端（多路复用）对总体编辑产生了明显的正协同效应。与单个 RNP/gRNA 转化中获得的编辑效率相比，位于不同染色体上的两个基因的多路复用对单个 RNP/gRNA 编辑效率没有影响或略有负面影响。这些初步发现可能会引发更大规模的研究，以促进和优化植物的精准育种。
![植物生物技术 23.0611a (2023) [adv.pub.]](/simg/8\886d12a05c6e0ea5545c8dfe272b81f8a9782723.webp)
植物生物技术 23.0611a (2023) [adv.pub.]
摘要 马铃薯 (Solanum tuberosum L.) 具有四倍体基因组。要制造缺乏特定基因功能的突变体，必须将突变引入所有四个基因等位基因中。为了实现这一目标，我们开发了一种强大的基因组编辑工具 CRISPR/dMac3-Cas9，它安装了翻译增强子 dMac3，大大增加了下游开放阅读框的翻译。采用三种向导 RNA (gRNA) 的 CRISPR/dMac3-Cas9 系统大大提高了突变的发生率。该系统能够创建颗粒结合淀粉合酶 (GBSS) 和淀粉分支酶 (SBE) 的 4 等位基因突变体。这些突变体显示出功能缺陷的特征，表明我们成功地对马铃薯四倍体基因组进行了有效的基因组编辑。在这里，我们展示了使用 GBSS1 基因突变体时 gRNA 数量对目标基因有效诱变的影响。采用三个 gRNA 基因的 CRISPR/dMac3-Cas9 比采用两个 gRNA 的 CRISPR/dMac3-Cas9 实现了更高的突变效率，表明突变效率受靶区域 gRNA 数量的剂量效应影响。SBE3 基因的等位基因含有导致 gRNA 序列差异的 SNP，但这些 gRNA 有效发挥作用。然而，诱导了许多重排事件和大量缺失。这些结果支持 gRNA 与靶序列准确结合的重要性，这可能为避免脱靶位点的意外突变提供线索。
通过操纵胡萝卜 (Daucus carota) 中的 CENH3 引起染色体水平的变化和基因组消除
杂交品种因其高产量、一致性和其他理想性状而在许多作物物种中很有价值。双单倍体具有两组相同的染色体，对于杂交育种很有价值，因为它们可以在一代内产生，而通常用于生产杂交亲本的近交系需要多代过程。生产单倍体植物的一种方法是操纵着丝粒组蛋白 H3 (CENH3)。到目前为止，这种生产单倍体的方法已在拟南芥、玉米 (Zea mays) 和小麦 (Triticum aestivum) 中成功实现。本文我们描述了胡萝卜 (Daucus carot a) 中 CENH3 的修饰，以测试这些修饰诱导单亲基因组消除的能力，这是单倍体诱导的基础。使用碱基编辑来制作 cenh3 突变植物，其中 CENH3 编码组蛋白折叠结构域的区域具有氨基酸替换。然后将这些 cenh3 突变植物与 CENH3 野生型植物进行杂交。使用基于 PCR 的基因分型检测，我们确定了两个基因组消除候选物。一个候选物被归类为假定的非整倍体植物，其中 7 号染色体处于单拷贝状态。另一个候选物被描述为假定的四倍体，其在发生过程中可能为单倍体。我们的结果表明，这个假定的四倍体从 CENH3 野生型亲本继承了所有染色体，并且 cenh3 突变植物的基因组丢失了。这项研究提供了证据，表明胡萝卜中 CENH3 的修饰有可能诱导胡萝卜的基因组消除和倍性变化。
公司研究实验室首席技术与创新办公室
• Artificial Intelligence: - Trustworth Ai to ensure properties of robustness of models based on machines learning (neural networks etc.) - Continue Learning to train nets that learn continuously from new data without forgetting the knowledge learned from previous data - parallelization of the training of neural networks through distributed techniques (we would need particularly) • HPC: - HPC Software HPC: HPC.评估和优化•量子加密后： - 非对称算法PQ的计算硬数学问题。 对各种原始类别及其脆弱性的分析也参考了呼叫NIST。 <关于原始候选人和/或新的加密分析路径的Diva提案 - 已知候选人。 •机器人技术： - 使用四倍体的不均匀地形上的运动和导航 - 自动移动掌握和操纵通用对象 - 语义映射 - quasi -direct -direct -drive -drive -actuary >• Artificial Intelligence: - Trustworth Ai to ensure properties of robustness of models based on machines learning (neural networks etc.) - Continue Learning to train nets that learn continuously from new data without forgetting the knowledge learned from previous data - parallelization of the training of neural networks through distributed techniques (we would need particularly) • HPC: - HPC Software HPC: HPC.评估和优化•量子加密后： - 非对称算法PQ的计算硬数学问题。对各种原始类别及其脆弱性的分析也参考了呼叫NIST。<关于原始候选人和/或新的加密分析路径的Diva提案 - 已知候选人。•机器人技术： - 使用四倍体的不均匀地形上的运动和导航 - 自动移动掌握和操纵通用对象 - 语义映射 - quasi -direct -direct -drive -drive -actuary >
转录组和基因编辑分析揭示了MOF1A缺陷改变了在减数分裂阶段与木薯发育和染色体行为相关的基因的表达，从而导致四倍体水稻的花粉生育能力
Zijun Lu 1,2,3 , Xiaotong Guo 1,2,3 , Zhiyu Huang 1,2,3 , Juan Xia 1,2,3 , Xiang Li 1,2,3 , Jinwen Wu 1,2,3 , Hang Yu 1,2,3 , Muhammad Qasim Shahid 1,2,3, * and Xiangdong Liu 1,2,3,4, * 1 State中国南部农业大学的亚热带农业库库保护和利用的主要实验室，中国510642； zjlu@stu.scau.edu.cn（Z.L.）; xtguo@stu.scau.edu.cn（X.G.）; zyhuang@stu.scau.edu.cn（Z.H.）; XJ516025647@163.com（J.X.）; xiangli@scau.edu.cn（X.L.）; jwwu@scau.edu.cn（J.W.）; hyu@stu.scau.edu.cn（H.Y。）2广东植物分子繁殖植物繁殖省主要实验室，南中国农业大学，广州510642，中国3中国农业大学农业学院，中国农业大学，510642，普通中国4号广场，兰格诺现代农业实验室，中国南部农业大学，地址： qasim@scau.edu.cn（M.Q.S. ）; xdliu@scau.edu.cn（X.L. ）;电话。 /传真： + 86-208-528-0205（M.Q.S. < / div> ＆X.L.）2广东植物分子繁殖植物繁殖省主要实验室，南中国农业大学，广州510642，中国3中国农业大学农业学院，中国农业大学，510642，普通中国4号广场，兰格诺现代农业实验室，中国南部农业大学，地址： qasim@scau.edu.cn（M.Q.S.）; xdliu@scau.edu.cn（X.L.）;电话。/传真： + 86-208-528-0205（M.Q.S. < / div>＆X.L.）
毒力表型是由病原体倍性和遗传背景相互作用产生的
图 1 白色念珠菌遗传背景对健康宿主适应性有不同的影响。 （a）未感染（仅暴露于大肠杆菌食物源，灰色）或感染不同白色念珠菌菌株（图例中所示）的健康野生型线虫宿主种群的生存曲线。误差线表示±SE。每个处理中分析的宿主数量（n）如表 S1 所示。使用生存曲线的成对比较和 Log-rank（Mantel-Cox）检验来检验统计学显着性。星号表示与未感染对照相比具有统计学显着性（* 表示 p < .05；**** 表示 p < .0001）。具有相同字母的白色念珠菌处理没有显著差异，而具有不同字母的处理在统计学上存在差异。 (b) 宿主谱系生长的箱线图，以 7 天内产生的单个创始宿主的 F1 和 F2 后代的总种群大小表示。方框表示 25 到 75 分位数，平均值表示为一条线。误差线是标准化的数据范围，圆圈表示异常值。未感染对照处理的平均值和 95% 置信区间分别用灰色虚线和阴影灰色方框表示。使用单因素方差分析检验统计显著性。星号表示与未感染对照相比的统计差异（* 表示 p < .05；*** 表示 p < .001）。事后 Dunn 多重比较检验表明，字母相同的白色念珠菌处理没有显著差异，而字母不同的处理有统计学差异。 （c）感染白色念珠菌的宿主成年期第 1-3 天（正常繁殖时间）产生的（d）宿主幼虫总数和宿主幼虫百分比。数据和统计分析与（b）相同。（e）二倍体（dip）和四倍体（tet）白色念珠菌菌株在第 7 天的宿主存活率（彩色符号表示特定的白色念珠菌遗传背景）。使用 Wilcoxon 配对符号秩检验检验统计学意义，并标明 p 值。（f）感染白色念珠菌二倍体和四倍体菌株的宿主的谱系生长、（g）幼虫数量和（h）繁殖时间。数据和统计分析与（e）相同
四倍的钙钛矿氧化物CACU3CR2RE2O12的高压合成具有高铁磁库里温度
摘要：AA'3 B 2 B'2 O 12 -type四倍的CACU 3 Cr 2 Re 2 Re 2 O 12的氧化四倍体氧化物在18 GPA和1373 K中合成。都经过了A -和B-位订购的四倍的perovskite perovskite perovskite Crystal结构，并与空间组Pn -3一起观察。通过键价总计计算和同步加速器X射线吸收光谱验证，价态被证实为CACU 3 2+ CR 2 3+ RE 2 5+ O 12。Cu 2+，Cr 3+和Re 5+之间的自旋相互作用在约360 K处产生了库里温度（T C）的铁磁过渡。本研究提供了一种有前途的四倍钙钛矿氧化物，其室温高于房间的铁磁性和可能的半金属特性，这表明使用了Spintronic设备的使用可能性。
石墨烯 - 电解质双层的恒定化学势 - Quantum机械 - 分子动力学模拟
摘要：双人操作对于它在与环境交互时为机器人提供增加功能的潜力以及扩大可用的操作动作的数量而有价值。但是，要使机器人执行双字操作，系统必须具有一个强大的控制框架，以对每个子系统进行定位和生成轨迹和命令，以允许成功进行合作操作以及对每个单个子系统的足够控制。提出的方法建议使用多个通过使用光学跟踪定位方法充当单个双层操作系统的多个移动操纵器平台。框架的性能取决于本地化的准确性。由于命令主要是高级的，因此可以在此框架内使用移动操纵器和固定操纵器的任何数字和组合。我们使用两个不同的全向移动操纵器在Pybullet仿真环境中进行测试来证明该系统的功能，以及使用两个四倍体操纵器的真实实验。
基因组编辑引起的植物的未知可能性 - 零发射
1）Abe F.等。（2019）基因组编辑的三重衰退突变改变了小麦的种子休眠状态。细胞报告28，1362-1369。2）Cong L.等。（2013）使用CRISPR/CAS9系统的多重基因组工程。科学339，819-823。3）Ito Y.等。（2017）RIN突变的重新进化和RIN在诱导番茄成熟诱导中的作用。自然工厂3，866-874。4）Jinek M.等。（2012）适应性细菌免疫中可编程的双RNA引导的DNA核酸内切酶。科学337，816-821。5）Jinek M.等。（2013）人类细胞中的RNA编程基因组编辑。Elife 2，E00471。6）Mali P.等。（2013）通过CAS9通过RNA引导的人类基因组工程。科学339，823-826。7）Yasumoto S.等。（2020）通过农业感染通过短暂的talen表达在四倍体马铃薯中靶向基因组编辑。植物生物技术37，205-211。