计算:OS,GIT,计算机视觉,Web Dev,Linux,MicroControllers,Python,IoT,Matlab,Shell,Shell,Command Line Wet Law Lav Lab:细胞培养,基因工程和克隆,生物打印设计和模拟:固体工作,流利/comsol,fluent/comsol,comsol,生物制造,逻辑设计。认证:加州大学圣地亚哥分校的生物信息学在Coursera上(2020年5月),John Hopkins University on Coursera的基因组数据科学(2020年5月)
目前,大型结构的健康监测方法主要依赖于分布式传感器网络和现场检查的组合。本文提出了一种针对受多种故障模式影响的结构的新型在线诊断和预测框架,并使用多个数据源(即应变计和图像)通过高保真有限元模型演示了所提出的方法。该方法旨在准确模拟不同故障特征之间的相互作用,随后基于生成的结构物理对损伤状态进行有效估计和预测。使用动态贝叶斯网络,该网络结合不同的数据源来评估不同类型的劣化机制下的结构。在诊断中,动态贝叶斯网络用于近似与损伤相关的参数并估计与时间相关的变量。在预测中,动态贝叶斯网络根据故障的演变对结构的剩余使用寿命进行概率预测。研究发现,所提出的框架在使用组合数据源进行在线诊断和预测方面非常有效。
碱基编辑器 (BE) 是一种基因组编辑剂,可高效、特异地安装点突变。由于 BE 依赖于尿嘧啶和肌苷 DNA 损伤中间体(而不是双链 DNA 断裂或 DSB),因此有人推测 BE 依赖于比 DSB 依赖型基因组编辑方法更普遍的 DNA 修复途径,而 DSB 依赖型基因组编辑方法需要仅在细胞周期的某些阶段活跃的过程。我们在此报告了使用细胞同步实验对碱基编辑的细胞周期依赖性进行的首次系统研究。我们发现,切口酶衍生的 BE(在尿嘧啶或肌苷碱基对面引入 DNA 骨架切口)独立于细胞周期发挥作用,而非切口 BE 高度依赖于 S 期(DNA 合成期)。我们发现,胞嘧啶碱基编辑过程中 G1(生长期)的同步会导致 C • G 到 A • T“副产物”引入率显著增加,这可用于发现精确 C • G 到 A • T 碱基编辑的新策略。我们观察到 DNA 损伤修复途径的内源表达水平足以将碱基编辑中间体加工成所需的编辑结果,并且碱基编辑过程不会显著扰乱转录水平。总体而言,我们的研究提供了机制数据,证明了切口酶衍生的 BE 在整个细胞周期内进行基因组编辑的稳健性。
2022 年 6 月 10 日 提交入学申请并获得秋季学期注册日期和时间的截止日期。截止日期后提交申请的学生将在公开注册期间注册。 2022 年 8 月 21 日 ��������������������������������������������������居住地确定日期(适用于所有学期) 2022 年 9 月 5 日 ���������������������������������������������������节日 - 劳动节* 2022 年 9 月 17 日 ������������������������������������������������宪法日(正在上课) 2020 年 11 月 12 日 �������������������������������������������������节日 - 退伍军人节* 2022 年 11 月 15 日 ���������������������������������������������������提交 2022 年秋季完成副学士学位或成就证书毕业申请的最后一天。 2022 年 11 月 21 日至 23 日 ����������������������������������课程停课2022 年 11 月 24 日和 25 日 ��������������������������������假期 – 感恩节* 2022 年 12 月 19 日 – 2023 年 1 月 28 日 ���寒假
圣地亚哥老年人社区基金会的“圣地亚哥老年中心总体规划”阐明了我们地区在获得优质老年中心方面存在的差距。本报告是对加利福尼亚州“老龄化总体规划”和州长加文·纽森呼吁各县和城市制定社区所需具体行动计划的直接回应。我们希望该计划将为社区对话和行动奠定基础,确保圣地亚哥县所有老年人都有一个充满活力和安全的地方来学习、成长、社交和茁壮成长。本手册总结了一些最重要的要点。
对于好奇,创造性,认真和雄心勃勃的学生来说,参加结构化的合作研究计划非常具有挑战性。完成了研究计划的任何人都满足了寻找导师的要求,然后可能是研究团队的负责成员,露面,快速(在行动和思想中),分享想法,打入障碍和前进。这项工作带有可能改变生活的回报。除了取得具体的结果外,专门的研究人员还为自己打开了对研究生或专业学校的兴趣,或者通过著名的国家和国际机构的后库后奖学金,或在工业或政府中获得领导地位。今年,我们的学生面临着新的挑战,从被拒绝进入实体工作空间到数字困境,以及对于许多人来说,住房和粮食不安全。,但是这些学生坚持不懈;他们表现出了韧性,持久性和愿意寻求帮助的意愿。这个目录尊重他们对奖学金,对导师和研究伙伴的承诺,对家庭和社区的奉献以及对学习的不可变的信念。随着时间的流逝,他们在这里庆祝的结果的情况将不如杰出的工作本身重要。
目标:与其他能源相比,通过向该地区的居民实施新服务,可以增加大都市地区的最终使用。时间范围:2030年野心的背景:智利大都市地区是该国一半居民的故乡(约820万),占国家温室气体(GHG)排放量的19.2%。根据最新的可用数字(2018年)排放的21,867 kt二氧化碳主要对应于政府,商业和住宅建筑(32%)中发电和热源的陆地运输(41%)和燃料燃烧。Currently, each residential electricity customer in the Metropolitan Region consumes 197 kWh per month on average (according to CNE Open Energy figures) and the per capita consumption of liquefied gas is 23.48 kg/month, which highlights the space that exists to electrify the consumption of the second energy source, thus reducing both GHG emissions and intra-domiciliary pollution, which has beneficial effects on other aspects of people's lives (主要是减少呼吸系统疾病的发生)。有机会向城市中的新用途开放电能,以减少排放,同时提供直接通过电动性和用电动空调设备更换燃木炉灶来使居民生活质量的服务。这涉及增加区域公共交通舰队中电动巴士的份额(目前为26%);增加电动汽车的充电基础设施(目前为81
基因组资源联盟(简称“联盟”)由 7 个知识库项目共同努力而成:酵母菌基因组数据库、WormBase、FlyBase、小鼠基因组数据库、斑马鱼信息网络、大鼠基因组数据库和基因本体资源。联盟致力于提供多种益处:为这些项目服务的各个社区提供更好的服务;为所有生物医学研究人员、生物信息学家、临床医生和学生提供统一的数据视图;以及提供更可持续的基础设施。联盟已统一了跨生物体数据,以提供基因功能、基因表达和人类疾病相关性的有用比较视图。比较视图的基础是直系同源关系的共享调用和通用本体的使用。关键的数据类型是等位基因和变异、基于基因本体注释的基因功能、表型、与人类疾病的关联、基因表达、蛋白质-蛋白质和遗传相互作用以及参与途径。信息呈现在统一的基因页面上,便于轻松总结所涵盖的 7 种生物(芽殖酵母、线虫秀丽隐杆线虫、果蝇、家鼠、斑马鱼、褐家鼠和人类)中每种基因的信息。统一的知识可在 alliancegenome.org 门户网站上免费获取,以可下载文件和 API 的形式提供。我们希望其他现有和新兴知识库能够加入这一努力,提供每个知识库目前提供的有用数据和功能的统一。
简介胶质母细胞瘤 (GBM;世界卫生组织 IV 级胶质瘤) 是成人中最常见、最具侵袭性的原发性恶性脑肿瘤 (1)。尽管进行了最大限度的手术切除,然后进行放化疗和辅助化疗 (2-4),GBM 仍然普遍致命。GBM 表现出显著的细胞异质性,含有干细胞样 GBM 干细胞 (GSC;也称为脑肿瘤起始细胞),导致治疗耐药性和快速复发 (5-8)。与非干细胞或分化 GBM 细胞 (DGC) 相比,GSC 表达干细胞标志物,在无血清条件下产生球体,并在体内快速形成肿瘤 (9, 10)。体细胞突变导致 GBM 的发生和发展,但精准医疗迄今为止在其治疗中取得的成功有限 (11, 12)。表观遗传改变也可能促进神经胶质瘤的形成,从而提供治疗靶点(13-15)。肿瘤生物学的一个最新进展是将改变的 A-to-I RNA 编辑归因于多种致瘤途径(16,17)。在哺乳动物中,RNA 编辑会改变表达 RNA 的转录序列,而不会影响 DNA 序列(18-20)。A-to-I RNA 编辑由 ADAR(作用于 RNA 的腺苷脱氨酶)催化,是哺乳动物中最常见的 RNA 编辑事件,超过 85% 的 RNA 可能在编码和/或非编码区域进行编辑(19,21)。三种酶在 A-to-I RNA 编辑中起着重要作用。
摘要 作用于 RNA 的腺苷脱氨酶 (ADAR) 可以重新用于实现可编程的 RNA 编辑,然而它们的外源递送会导致转录组范围的脱靶,此外,对某些 RNA 基序(尤其是那些由 5' 鸟苷侧翼的 RNA 基序)的酶活性非常低,因此限制了它们作为转录组工程工具集的效用。为了解决这些问题,我们首先对 ADAR2 脱氨酶结构域进行了新的深度突变扫描,直接测量了 261 个残基上每个氨基酸替换对 RNA 编辑的影响。这使我们能够创建一个域范围的诱变图,同时还揭示了一种新的高活性变体,其在 5'-GAN-3' 基序处具有改进的酶活性。由于 ADAR 酶(尤其是高活性变体)的过度表达会导致转录组范围内的显著脱靶,我们接下来设计了一种分裂的 ADAR2 脱氨酶,与全长脱氨酶过度表达相比,其 RNA 编辑特异性提高了 100 倍以上。总之,我们预计 ADAR2 脱氨酶结构域的这种系统工程将使 ADAR 工具集在 RNA 生物技术应用中具有更广泛的用途。