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World File Search System子区
使用真实子场定义评估基于表面的海马配准
海马体是一种皮层结构，由具有独特回路的子区组成。了解其微观结构（以这些子区为代表）可以提高我们对学习和记忆的机制理解，并且对多种神经系统疾病具有临床潜力。一个突出的问题是如何在两个形态截然不同的海马体之间划分、注册或检索同源点。在这里，我们提出了一种基于表面的配准方法，该方法以对比度无关、拓扑保持的方式解决了这个问题。具体而言，首先对整个海马体进行分析展开，然后根据厚度、曲率和脑回在 2D 展开空间中注册样本。我们在七个 3D 组织学样本中演示了这种方法，并且与更传统的配准方法相比，使用此方法对子区进行了更出色的对齐。
使用玻璃对海马进行长期横向成像...
摘要 海马由沿隔颞轴重复的刻板神经元回路组成。该横向回路包含具有刻板连接的不同子区，支持关键的认知过程，包括情景记忆和空间记忆。然而，现有技术无法对体内横向海马回路进行全面测量。在这里，我们开发了一种通过植入玻璃微潜望镜对清醒小鼠的横向海马平面进行双光子成像的方法，允许光学访问主要的海马子区和锥体神经元的树突树突。使用这种方法，我们追踪了 CA1 顶端树突的树突形态动态并描述了树突棘周转。然后我们使用钙成像来量化位置和速度细胞在子区中的普遍性。最后，我们测量了空间信息的解剖分布，发现空间选择性沿 DG 到 CA1 轴分布不均匀。这种方法扩展了现有的海马回路结构和功能测量工具箱。
生产针对重金属的基因组编辑水蚤……
水体重金属污染日益受到关注。为了便于水体重金属监测，我们开发了对重金属高度敏感且反应迅速的转基因水蚤。从大型蚤中获得了金属反应基因金属硫蛋白A及其启动子区。利用TALEN技术将其启动子区与绿色荧光蛋白（GFP）基因融合的嵌合基因整合到大型蚤中，产生了转基因水蚤，名为大型蚤MetalloG。当大型蚤MetalloG暴露于重金属溶液1 h时，GFP仅在中肠和肝胰腺中诱导表达。激活GFP表达的最低重金属浓度分别为1.2 µM Zn 2+ 、130 nM Cu 2+ 和70 nM Cd 2+ 。重金属暴露24 h可进一步降低阈值。 D. magna MetalloG 有助于检测水中的重金属，并可能增强水质监测。
VIIIA ORDER CEP 认证 - 新泽西州
关于 PL 2023、C.158 的事项，该法案在某些情况下延长了某些太阳能发电设施的完工和商业运营的最后期限，PJM INTERCONNECTION LLC（“PJM”）的收费事件通知和认证以及协议处理 HAMMS LANDFILL SOLAR FARM, LLC – 太阳能法案第 (T) 款，区块 14，地块 33.01 OXFORD MILL SOLAR FARM 申请第 (T) 款，太阳能法案，区块 33，地块 4.02 和 4.03 SOUTHERN OCEAN WARETOWN SOLAR FARM, LLC – 第 (T) 款，区块 6，地块4.04 和 4.05；第 7 区块，第 1.01、2、3、5 和 6.01 地段贝尔福德港太阳能发电场 – 子区 (T) 太阳能法案申请，第 306 区块，第 66 地段，贝尔福德垃圾填埋场米德尔敦镇，蒙茅斯县 CEP 可再生能源 VINELAND NEWFIELD 太阳能发电场有限责任公司 CHANGEWATER 太阳能发电场 – 子区 (T) 太阳能法案申请，第 82 区块，第 16 地段，180 E. ASBURY-ANDERSON 路，华盛顿镇，沃伦县 CEP 可再生能源 HERITAGE 太阳能发电场有限责任公司。
心血管疾病中的转录调控
心血管疾病是最危险的疾病，可导致人体循环系统功能障碍，并最终导致心源性猝死风险增加（1，2）。越来越多的证据表明，转录失调导致的基因异常表达是多种心血管疾病的主要原因之一（3-5）。转录调控是一个复杂的过程，它通过促进DNA调控元件和转录调控因子之间的通讯来控制基因表达。随着测序技术的发展和大量心血管多组学数据的发布，从组学角度识别致病转录调控因子或顺式调控元件是揭示心血管疾病病理分子机制和开发新药理学策略的有效方法。最近，多项研究强调了几种转录调节因子在心血管疾病发展中的生物学功能，例如 Tbx1 抑制心肌梗死区域内的自身免疫反应，IRX2 诱导扩张型心肌病中的心肌纤维化水平，BACH1 促进血管平滑肌细胞的去分化表型（6-8）。从机制上讲，转录调控是真核细胞细胞核中最关键的步骤，它将遗传信息从 DNA 传递到 RNA。转录调控过程发生在近端启动子区或远端增强子区，并由多种转录因子、染色质重塑复合物和
#LiverCancerSummit easl.eu/lcs2024
OS-1 组蛋白 H1.4 乳酸化激活 MZF1 促进肝细胞癌进展 安娜·阚 1，黄叶星 1，赖志成 1，何敏科 1，石明 1 1 中山大学肿瘤防治中心，广州，中国 电子邮件：annakan@sysucc.org.cn 背景与目的：细胞内乳酸诱导的核心组蛋白赖氨酸乳酸化（Kla）驱动致癌过程。在本研究中，我们探讨 Kla 对组蛋白 H1.4 的调控以及其对致癌基因 MZF1 和肝细胞癌进展的调控。 方法：进行 ChIP-seq、ATAC-seq、RNA-seq 和 snRNA-seq 的交叉分析，以在肝癌细胞系和患者样本中寻找 Kla 靶基因。分选出 MZF1 并用 ChIP PCR 进行验证。然后构建了体外和体内实验来验证Kla和MZF1对HCC行为的作用。采用DNA pull down分析结合质谱技术来寻找MZF1的上游调节剂。识别了组蛋白H1.4，并通过ChIP PCR识别其与MZF1启动子区的直接结合。利用RNA-seq和scRNA-seq数据来搜索MZF1的下游通路。结果：对有肺转移（M1）或无肺转移（M0）的HCC患者的肿瘤活检样本进行单核RNA测序。鉴定出14个HCC细胞簇（图1A）。调节葡萄糖稳态、碳水化合物稳态、调节糖酵解过程和正向调节Wnt信号通路的通路在M1组特异性簇中富集（图1B）。因此，检查了糖酵解产物乳酸和乳酸刺激的Kla的影响。细胞功能实验显示乳酸可以增强细胞迁移（图1C）和侵袭（图1D），而乳酸抑制剂则抑制细胞功能（图1E、1F）。构建体内模型，结果与体外实验一致（图1G-1L）。随后进行多组学分析，揭示乳酸刺激的Kla的下游调控，唯一重叠的靶点为MZF1（图1M、1N）。WB结果显示在HCC细胞系（图1O、1P）和体内模型（图2B、2C）中，MZF1在乳酸和葡萄糖处理后增加，在OXA和DCA处理后降低。CUT和Tag qPCR验证了Kla在MZF1启动子区的结合（图2A）。质谱结果显示组蛋白H1.4是MZF1 DNA的直接结合蛋白（图2D）。 CUT和Tag qPCR对突变的H1.4残基进行检测，证实了其与MZF1启动子区的结合，其中K90残基的突变最为显著（图2E）。富集分析表明，在136个差异基因中，Wnt信号富集（图2F，2G）。乳酸和/或FX-11处理的HCC细胞的WB结果（图2H，2I）也证实了这一点。结论：我们发现了乳酸刺激Kla对HCC转移的潜在机制。组蛋白H1.4乳酸化直接结合在MZF1启动子区可能有助于其活化，促进HCC细胞的增殖和转移（图2J）。图：
SIRT1 基因 SNP rs932658 与药物相关 - IRIS
药物相关性颌骨坏死 (MRONJ) 是一种罕见但严重的药物不良反应。我们之前的全外显子组测序研究发现，SIRT1 内含子区单核苷酸多态性 (SNP) rs7896005 与接受静脉 (iv) 双膦酸盐 (BP) 治疗的癌症患者的 MRONJ 相关。本研究旨在确定这种关联的因果变异。计算机模拟分析发现，SIRT1 启动子区中有三个 SNP (rs3758391、rs932658 和 rs2394443) 与 rs7896005 处于高度连锁不平衡 (r 2 > 0.8)。为了验证这些 SNP 与 MRONJ 之间的关联，我们对 104 名接受静脉 BP 治疗的欧洲血统癌症患者 (46 例病例和 58 例对照) 的种系 DNA 上的这三个 SNP 进行了基因分型。多变量逻辑回归分析显示，这三个 SNP 的次要等位基因与 MRONJ 的发生率较低相关。rs3758391 的比值比（95% 置信区间）和 p 值分别为 0.351（0.164–0.751；p = 0.007）、rs932658 的比值比（95% 置信区间）和 p 值分别为 0.351（0.164–0.751；p = 0.007）和 rs2394443 的比值比（0.331（0.157–0.697；p = 0.0036）。在报告基因测定中，含有变异等位基因 A 的 rs932658 的构建体比参考等位基因具有更高的荧光素酶活性，而含有 SNP rs3758391 和/或 rs2394443 的构建体对活性没有显著影响。这些结果表明启动子 SNP rs932658 调节 SIRT1 的表达，并可能通过增加 SIRT1 表达来降低 MRONJ 的风险。
利用 CRISPR-Cas9 精准基因组编辑技术，针对超级巴斯马蒂大米的主要易感基因，实现对细菌性枯萎病的抗性
巴斯马蒂大米因其风味、香气和长粒而闻名于世。全球对它的需求不断增加，尤其是在亚洲。然而，其生产受到田间各种问题的威胁，导致农作物严重损失。其中一个主要问题是水稻白叶枯病菌 (Xoo) 引起的细菌性枯萎病。Xoo 通过激活易感基因（OsSWEET 家族基因）来劫持宿主机制，利用其内源性转录激活因子样效应物 (TALE)。TALE 在 OsSWEET 基因的启动子区具有效应物结合元件 (EBE)。在 Clade III SWEET 基因中发现的六个著名 TALE 中，有四个存在于 OsSWEET14 基因的启动子区。因此，针对 OsSWEET14 的启动子对于产生广谱抗性非常重要。为了设计出对细菌性枯萎病的抗性，我们通过靶向 OsSWEET14 启动子中存在的 4 个 EBE，在超级巴斯马蒂大米中建立了 CRISPR-Cas9 介导的基因组编辑。我们能够获得四个不同的超级巴斯马蒂品系（SB-E1、SB-E2、SB-E3 和 SB-E4），这些品系具有三个 TALE（AvrXa7、PthXo3 和 TalF）的 EBE。然后通过选择一种带有 AvrXa7 的当地分离的毒性 Xoo 菌株并感染超级巴斯马蒂，对编辑品系进行三次重复的抗细菌性枯萎病评估。AvrXa7 EBE 缺失的品系对 Xoo 菌株表现出抗性。因此，证实了编辑的 EBE 具有对 Xoo 菌株中存在的各自 TALE 的抗性。在这项研究中，获得了高达 9% 的编辑效率。我们的研究结果表明，可以利用 CRISPR-Cas9 来使本土品种对细菌性枯萎病产生抗性，以抵抗当地流行的 Xoo 菌株。
靶向生物分子凝聚物：药物发现的新机遇
生物分子凝聚物是一种无膜细胞器，它以动态和可逆的方式将生物分子区室化，以执行细胞功能。越来越多的证据支持这样一种模型，即凝聚物是癌症和神经退行性疾病等复杂疾病中失调的中心节点。因此，凝聚物修饰药物或 c-mods 是一种新颖的治疗方法。C-mods 表现出多种作用方式，包括从凝聚物中降解特定蛋白质或粘合生物分子以保持相关状态。在这张海报中，我们提供了基于凝聚物的药物发现活动的见解，并讨论了当前和未来的应用。