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蔬菜作物遗传学与育种 - 园艺科学
入学指导（第 1 周） 1 月 14 日，星期二 介绍、教学大纲和讨论主题 1 月 16 日，星期四 辣椒育种计划简介 蔬菜作物的性质（第 2 周） 1 月 21 日，星期二 蔬菜作物的性质和种子来源 1 月 23 日，星期四 植物的无性和有性生殖 1 月 23 日，星期四 活动 1。温室和实地参观。作业 孟德尔遗传学（第 3 周） 1 月 28 日，星期二 孟德尔遗传学的定性性状和复习 1 月 30 日，星期四 孟德尔遗传学的定性性状和复习 1 月 30 日，星期四 活动 2。准备移植托盘和播种 诱变（第 4 周） 2 月 4 日，星期二 作物遗传资源和原产地中心 2 月 6 日，星期四 诱变 2 月 6 日，星期四 活动 3。筛选诱变种群 2 月 6 日，星期四 作业 1研究计划大纲草案 1 数量遗传学（第 5 周） 2 月 11 日，星期二 数量性状简介 2 月 13 日，星期四 方差和方差分析 2 月 13 日，星期四 活动 3。进行遗传杂交 - 演示和活动 数量遗传学（第 6 周） 2 月 18 日，星期二 数量遗传学 - I 2 月 20 日，星期四 数量遗传学 - II 2 月 20 日，星期四 作业 2 截止。修订的研究计划 数量遗传学（第 7 周） 2 月 25 日，星期二 数量遗传学 - III 2 月 27 日，星期四 数量遗传学 - IV 2 月 27 日，星期四 表型数据收集 植物组织培养（第 8 周） 3 月 4 日，星期二 植物组织培养 3 月 6 日，星期四 活动 5. 花药培养 - 实验室实践（第 9 周） 3 月 11 日，星期二 QTL 映射 1 3 月 13 日，星期四 QTL 映射 2、3 月 13 日，星期四 考试 1 3 月 15 日 -22 日 春假 DNA 标记（第 10 周） 3 月 25 日，星期二 活动 5. 基于 DNA 的标记 3 月 27 日，星期四 作业 3. 反思性论文截止时间为下午 5 点。
课程结构 - 植物生物学（PLBL）
Course unit contents - Plant Biology (PLBL) Semester 1 Course Code BIOL 11522 Course Name Genetics Credit Value 2 Core / Optional Core Pre-requisites GCE A/L Biology Co-requisites - Hourly Breakdown Theory Practical Independent Learning 30 hrs 15 hrs 55 hrs Course Aim / Intended Learning Outcomes : Upon successful completion of this course unit, the student should be able to, (i) describe the principles of inheritance, （ii）解释分子遗传学和（iii）在遗传学背景下解决基本问题所获得的知识。课程内容：审查孟德尔遗传学和孟德尔继承模式的扩展。等位基因变异的分子基础。链接和基因映射。具有农业和生物医学相关性的复杂性状的定量遗传学。遗传变异和种群遗传学应用的来源。遗传物质的分子组织。DNA复制和修复。核基因组，基因，基因表达和基因表达调节的简介：乳糖操纵子。人类基因组项目，选定遗传疾病的遗传和分子基础，基因检测和基因治疗的介绍。选定模型生物基因组的基本原理。分子生物学和遗传学的应用。实验室：显微镜，细胞分裂：有丝分裂和减数分裂，强硬韦恩伯格平衡和自然选择的演示，人类遗传教学 /学习方法：讲座，实验室会议和教程评估策略：持续评估和结束课程单位书面考试< / div> < / div> < / div> < / div> < / div> < / div>
谷物、咖啡和茶中人工甜味剂的摄入与 2 型糖尿病风险之间的关联：遗传相关性、中介作用和孟德尔随机化分析
糖尿病 (DM) 是全球范围内一个重大而紧迫的健康问题 [ 1 ]，其中 2 型糖尿病 (T2DM) 约占全球所有糖尿病病例的 90% [ 2 ]。世界卫生组织 (WHO) 估计，目前全球糖尿病患者超过 4.22 亿，到 2045 年将达到 6.29 亿 [ 3 , 4 ]。值得注意的是，包括中国和巴基斯坦在内的发展中国家的糖尿病患病率呈上升趋势，给社会带来了巨大的直接和间接经济压力 [ 5 ]。因此，识别 T2DM 新的可改变风险因素对于指导临床管理策略和缓解疾病的发生和发展至关重要。随着生活方式的改变，对甜食的需求正在逐渐增加。人工甜味剂 (AS) 作为低热量和无糖的替代品，已越来越受欢迎，作为减少热量摄入的糖替代品 [6]。最受欢迎的人工甜味剂包括阿斯巴甜、糖精、乙酰磺胺酸钾和三氯蔗糖 [7]，常用于谷物 [8]、咖啡 [9] 和茶 [10] 等食品和饮料中，以满足人们对甜味的需求。目前的研究已经发现了人工甜味剂与 2 型糖尿病之间的关联；然而，该领域的观察性研究结果往往不一致。某些研究报告称，每天每增加一份人工甜味剂，患 2 型糖尿病的相对风险就会增加 3% [11-14]，而其他研究则表明，与水相比，摄入人工甜味饮料会使 2 型糖尿病发病率上升 21% [15]。此外，其他研究并未显示 AS 与 2 型糖尿病之间有相关性 [ 16 ， 17 ]。尽管 AS 在日常饮食中广泛使用且在 2 型糖尿病患者中很受欢迎，但由于研究结果不一致，因此并未就 AS 与糖尿病之间的因果关系达成共识。先前的研究在建立暴露因素与结果变量之间的明确因果关系方面遇到了挑战，这主要归因于混杂变量和反向因果关系带来的复杂性。鉴于观察性研究在确定因果关系方面的限制，遗传研究领域的孟德尔随机化 (MR) 等替代方法被证明是无价的。采用 MR 的实验利用通过全基因组关联分析确定的遗传变异作为工具变量 (IV)。这些 IV 有助于衡量环境暴露与期望结果之间的因果关系。在某些条件下，该技术允许使用遗传变异作为环境暴露的替代来得出因果推断 [ 18 ]。MR 被认为是一种自然的随机对照试验，它基于孟德尔遗传定律，该定律将父母的等位基因分配给其后代。这种方法提供了更可靠的证据，降低了混杂因素的影响。与观察性流行病学研究相比，MR 提供了更高水平的证据。这
2025 年 1 月 22 日 1 课程大纲
课外学时：108.00 总学习学时：270.00 课程描述：这是为生命科学专业的学生开设的两个学期课程的第一门，重点介绍生物化学、细胞生物学和遗传学。主题包括：细胞化学；生物分子；原核细胞和真核细胞的结构和功能；细胞运输；生物能量学和酶；细胞代谢（包括呼吸和光合作用）；细胞通讯；细胞繁殖及其控制；孟德尔和非孟德尔遗传学；分子遗传学；DNA 结构和功能；基因表达；生物技术；生命的起源和进化以及分子进化；科学探究。（C-ID：BIO 190）先决条件：BIO 10、BIO 12 或 ENVS 1 成绩为“C”或更高，或 AP 或荣誉生物学成绩为“B”或更高（过去五年内完成）； CHEM 1A 成绩为“C”或更高，MATH 240 或中级代数或同等课程成绩为“C”或更高。强烈建议具备高中水平的阅读和写作技能。先决条件：（以 UG 形式完成 BIO 10，成绩为 C 或更高。或以 UG 形式完成 BIO 12，成绩为 C 或更高。或以 UG 形式完成 ENVS 1，成绩为 C 或更高。并且以 UG 形式完成 CHEM 1A，成绩为 C 或更高。以 UG 形式完成 MATH 240，成绩为 C 或更高。
与脑老化相关的遗传变异和致病生物标志物的研究
与脑衰老相关的遗传变异和因果生物标志物的研究 Jangho Kim、Junhyeong Lee 和 Seunggeun Lee 首尔国立大学数据科学研究生院，韩国 通讯作者：Seunggeun Lee 首尔国立大学数据科学研究生院，韩国首尔 lee7801@snu.ac.kr 摘要 年龄差异是脑衰老的生物标志物，可以捕捉实际年龄与脑部 MRI 预测年龄之间的差异。本研究通过分三步分析英国生物银行数据，探究了高年龄差异的可解释因果基础。脑区域的视觉显著性图显示，穹窿和丘脑下部体积较小是高年龄差异的关键预测因素。对单一变异和基因区域进行的遗传关联分析发现，与致癌作用、免疫反应和神经元存活相关的基因与高年龄差异有关。所有代谢组生物标志物和血液相关表型的孟德尔随机化 (MR) 表明，免疫相关表型对增加年龄增量具有因果影响。综合起来，这些观察结果揭示了大脑中易受衰老过程影响的区域，并提供了免疫反应与大脑衰老之间存在因果和遗传联系的证据。关键词：年龄增量、大脑衰老、因果关系、CNN、可解释的人工智能、GWAS、孟德尔随机化、免疫
临界COVID-19，Victivallaceae丰度和腹腔疾病：介导门德尔随机研究
腹腔疾病在2019年冠状病毒疾病患者中表现出更高的患病率。然而，共同-19对乳糜泻的潜在影响仍然不确定。考虑了肠道微生物群改变，Covid-19和乳糜泻之间的显着关联，采用了两步的孟德尔随机方法来研究Covid-19和腹腔疾病之间的遗传因果关系，以及肠道菌群作为潜在的介体。我们采用了全基因组关联研究来选择与暴露有关的遗传仪器变量。随后，这些变量被用来评估Covid-19对腹腔疾病风险及其对肠道菌群的潜在影响的影响。采用两步的孟德尔随机方法实现了潜在因果关系的检查，包括：1）COVID-19感染，住院COVID-19和关键的Covid-19对腹腔疾病风险的影响； 2）肠道菌群对乳糜泻的影响； 3）肠道微生物群在covid-19和腹腔疾病风险之间的介导影响。我们的发现表明，临界值得联盟-19和腹腔疾病的风险升高（反向差异加权[IVW]：p = 0.035）之间存在显着关联。此外，我们观察到批评-19与victivallaceae的丰度之间存在逆相关性（IVW：p = 0.045）。值得注意的是，增加的维多拉曲科的丰度对腹腔疾病的风险具有保护作用（IVW：p = 0.016）。总而言之，我们的分析提供了支持关键covid-19和降低维多拉曲科的因果关系的遗传证据，从而增加了腹腔疾病的风险。
降低脂质药物与骨关节炎结局的关联
骨关节炎（OA）是一种复杂的关节疾病，具有多因素病因，其特征在于关节疼痛，受限关节迁移率和功能障碍的潜力。OA的发病机理的特征是滑膜炎，软骨损伤，骨形成过多和软骨下骨重塑，通常会影响多个关节，包括手，臀部和膝盖[1，2]。目前，大约25％的全球人口患有OA，膝盖骨关节炎（KOA）是最普遍的形式[3]。oa主要影响中年和老年妇女，其病因仍然难以捉摸，导致缺乏有效的治疗方法。近年来，大量研究表明，OA的发展与代谢综合征（MetS）之间存在潜在的关联，这特别涉及脂质代谢[4，5]。随着饮食模式的转变，高脂血症已成为中年和老年人的重大健康危害，导致心血管疾病，例如冠心病，动脉粥样硬化和催眠。越来越多的证据表明OA患者存在异常脂质代谢，表明高脂血症可能是OA的危险因素[6-8]。降低脂质的剂是高脂血症的治疗干预措施，并且除了降低脂质的效应外，多项研究已降低了其抗氧化剂，抗增生性和抗炎特性。因此，降脂药物具有关节炎治疗的治疗选择[9-11]。降脂药对OA的影响在研究人员中引起了极大的关注。但是，到目前为止的发现高度分歧，一些研究表明，使用降低脂质的药物降低了OA的风险，而其他研究则没有提示OA的影响甚至增加了OA的风险[12，13]。这些研究主要依赖于观察性临床数据，这些数据本质上容易受到混杂因素，并且在可行性，成本和道德考虑方面存在局限性。因此，迫切需要探索替代的天然研究方法，以研究降低脂质药物对OA的影响。孟德尔随机分析（MR）分析是一种新兴的流行病学方法，它可以从全基因组关联研究（GWAS）中获得全面的统计数据，以在特定疾病和暴露因素之间建立因果关系，从而确定潜在的风险因素。通过将遗传变异作为启动因素的仪器变量，孟德尔随机分析克服了观察性研究中通常遇到的混杂因素[14，15]。在这项研究中，我们采用了一种针对药物的孟德尔随机方法来检查常见靶向脂质剂的遗传预测的脂质调节作用与
PSS 3421 - 遗传学基本原理
遗传学是研究生物遗传和变异的科学。PSS3421 - 遗传学基本原理全面深入地介绍了遗传原理、理论及其应用。主题包括遗传的染色体基础、孟德尔遗传学、遗传连锁、基因结构、基因表达、数量遗传学、群体遗传学、基因组图谱、基因克隆和基因工程。我们将使用动物、人类、微生物和植物的例子。在讨论/实验课上，我们将对农作物进行杂交实验以进行遗传分析，并回顾有关动物/人类/植物基因组图谱、比较基因组学、功能基因组学、QTL 图谱、基因工程和用于改良动物和植物的基因编辑的令人兴奋的遗传发现的最新文章。