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World File Search System寡核苷酸
使用CRISPR-CAS9，单链DNA寡核苷酸和原生质体再生
基因组编辑需要将DNA序列插入特定位置。涉及定期间隔短的短文重复序列（CRISPRS）和CRISPR相关（CAS）蛋白质的方案依赖于同源性维修，需要费力的矢量构造，并且效率低。DNA寡核苷酸可以通过非同源末端连接用作靶向插入的供体。我们的简单协议通过使用聚乙烯乙二醇将非修饰的单链DNA DNA寡核苷酸和CRISPR-CAS9核糖核蛋白输送到原生质体中，从而消除了对昂贵的设备和矢量结构的需求。，我们在烟草本尼亚娜纳（Nicotiana Benthamiana）中实现了高达50.0％的靶向插入频率，而无需抗生素选择即可快速循环胸腺橄榄石。使用每个同源臂中包含27 nt的60 nt供体，22个再生植物中有6个显示出靶向插入，其中1个包含6 bp Eco RI位点的精确插入。全基因组测序表明，DNA仅插入靶向位置，遗传分析表明，插入到下一代的插入序列。
AMX0114的临床前开发，一种反义寡核苷酸靶向CALPAIN-2
1。eb moloney和al。Neurosci Front。2014; 8：252。 2。 我的M. Neurobiol Dis 2013; 60：61-79。 3。 asakawa k和al。 SCI生活掉了。 2021; 78（10）：4453-4465。 4。 Wang Y和Al。 单元格 2020; 9（12）：2698。 5。 Metwally E和Al。 前兽医科学 2023 9月5日; 10：10：12014; 8：252。2。我的M. Neurobiol Dis2013; 60：61-79。 3。 asakawa k和al。 SCI生活掉了。 2021; 78（10）：4453-4465。 4。 Wang Y和Al。 单元格 2020; 9（12）：2698。 5。 Metwally E和Al。 前兽医科学 2023 9月5日; 10：10：12013; 60：61-79。3。asakawa k和al。SCI生活掉了。2021; 78（10）：4453-4465。4。Wang Y和Al。 单元格 2020; 9（12）：2698。 5。 Metwally E和Al。 前兽医科学 2023 9月5日; 10：10：1Wang Y和Al。单元格2020; 9（12）：2698。5。Metwally E和Al。前兽医科学2023 9月5日; 10：10：1
基于反义寡核苷酸和RNA干扰的内分泌疾病的致病治疗方法
分子疗法使用基于核酸的治疗剂，成为对传统药物方法无反应的疾病条件的有前途的替代方法。反义寡核苷酸（ASO）和小干扰RNA（siRNA）是用于调节基因表达的两种众所周知的策略。靶向RNA的疗法可以精确地调节目标RNA的功能，具有最小的脱靶效应，并且可以基于序列数据进行合理设计。ASO和基于siRNA的药物具有在目标患者群体中使用的独特功能，或者可以作为患者抑制的N-ef-1治疗方法量身定制。反义疗法不仅可以用于治疗单基因疾病，而且还可以通过靶向涉及疾病发病机理的关键基因和分子途径来解决多基因和复杂疾病。在内分泌疾病的背景下，分子疗法在调节病原机制（例如缺陷胰岛素信号传导，β细胞功能障碍和激素失衡）方面特别有效。此外，siRNA和ASO具有下调过度活跃的信号传导途径，这些信号传导途径有助于复杂的，非发育性内分泌疾病，从而以分子起源解决这些疾病。ASOS还在全球范围内被研究为开发N-1-1疗法疗法的独特候选者。当寡核苷酸可以靶向患者的精确突变序列时，序列 - 特异性ASOS结合在N-OF-1方法中提供了非凡的精度。在这篇综述中，我们专注于内分泌系统的疾病，并讨论包括单基因β细胞糖尿病和肥胖症在内的糖尿病中潜在靶向RNA的治疗机会，包括综合征肥胖
商业寡核苷酸中 CRISPR 指南和其他不相关核苷酸序列的交叉污染
摘要 定制寡核苷酸（oligos）是生物医学研究中广泛使用的试剂。寡核苷酸的一些常见应用包括聚合酶链式反应（PCR）、测序、杂交、微阵列和文库构建。寡核苷酸在这些应用中的可靠性取决于其纯度和特异性。本文报告，市售的寡核苷酸经常被非特异性序列（即其他不相关的寡核苷酸）污染。我们设计的用于扩增成簇的规律散布回文重复序列（CRISPR）指导序列的大多数寡核苷酸都含有非特异性的 CRISPR 指导序列。这些污染物是在从位于世界三个不同地理区域的八家商业寡核苷酸供应商处采购的研究级寡核苷酸中检测到的。对一些寡核苷酸的深度测序揭示了多种污染物。鉴于寡核苷酸的应用范围广泛，寡核苷酸交叉污染的影响因领域和实验方法的不同而有很大差异。在研究设计中加入适当的对照实验有助于确保寡核苷酸试剂的质量符合预期目的。这还可以根据寡核苷酸的用途将风险降至最低。
小药大效：反义寡核苷酸在研究和药物开发中的非凡影响
摘要：反义寡核苷酸 (ASO) 是一种越来越常见的药物。这些小的核苷酸序列被设计成精确靶向其他寡核苷酸（通常是 RNA 物种），并经过修改以保护它们免受核酸酶降解。它们的特异性归因于它们的序列，因此可以靶向任何已知的 RNA 序列。这些分子非常灵活且适应性强，因为它们的序列和化学性质可以定制生产。根据所使用的化学性质，它们的活性可能会发生显著变化，并且它们对细胞功能和表型的影响可能会有很大差异。虽然有些会导致靶 RNA 衰变，但另一些只会与靶标结合并充当空间阻滞剂。它们令人难以置信的多功能性是操纵核酸功能的几个方面及其过程的关键，并改变特定细胞类型或组织的转录组谱。例如，它们可用于修改剪接或掩盖目标上的特定位点。整个设计（而不仅仅是序列）对于确保 ASO 针对其目标的特异性至关重要。因此，确保考虑到药物设计和测试的整个过程至关重要。ASO 的适应性是一个相当大的优势，在过去几十年中，它使多种新药获得批准。这反过来又对患者的生活产生了重大而积极的影响。鉴于 COVID-19 大流行带来的当前挑战，有必要找到新的治疗策略来补充全球正在使用的疫苗接种工作。ASO 可能是一种非常强大的工具，可用于靶向病毒 RNA 并提供治疗范例。ASO 作为抗病毒剂的有效性的证明由来已久，但目前尚无任何分子获得 FDA 批准。在这次健康危机期间，RNA 疫苗的出现和广泛使用可能为开发市场上首批抗病毒 ASO 提供了理想的机会。在这篇评论中，我们描述了 ASO 的故事、它们的化学不同特性以及它们的特性如何转化为研究和临床工具。
14硅纳米尼奇结构的边缘通道具有沉积的DNA寡核苷酸
研究DNA寡核苷酸性能和寻找新结构识别方法是现代科学最重要的任务。相信，当人类基因组测序的成本变得足够低以实施广泛实施时，将实施个性化的医学概念[1,2]。在这种情况下，大多数现代遗传数据分析方法基于基因组测序，进而取决于检测每个核苷酸寡核苷酸增加的技术方法[1,2]。但是，应该注意的是，测序是用于寡核苷酸鉴定和分析的多核苷酸技术，而寡核苷酸序列的性能可以整体鉴定[3,4]。为此，我们需要研究寡核苷酸分子的性能，其中可能包括DNA的介电和磁性。在此之前表明，基于实验电导率数据的比较[1]，核苷酸组合和寡核苷酸的长度在这些生物分子的介电性能形成中起着基本作用，因此，与1个寡核苷酸 - 1个相关的电势通道的电气序列相关的序列，从而研究了con- sns con- con- con- con- con- con- con- con- con- con- con- con- con- con- con- - 生物分子。寡核苷酸应用于SNS表面，反过来促进了总电容和电感，从而可以依靠伏特 - 安培特征研究中识别和确定其介电常数。这项研究的重点是这个问题 - 它没有声称要进行完整的寡核苷酸测序，但可以提供有关但是，由于电特性与磁性特性相互作用，因此有趣的是，是否可以使用其磁性特性通过非接触式方法研究寡核苷酸。
1个DNA指导的模式用于多功能验证和...
图1：SARS-COV-2的脂质体模型的制造和DNA定向图案。（a）脂质体用SARS-COV-2尖峰蛋白标记，并用单链（SS）寡核苷酸标记与胆固醇分子（橙色）结合到胆固醇分子中的寡核苷酸（橙色）。（b）脂质体的DNA指导的构图首先是通过使用传统光刻造影来对SS寡核苷酸进行构图。光致晶体师被旋转并烘烤在醛涂层的底物上，使用紫外线涂上光掩膜，然后开发。随后进行了具有胺终止的SS寡核苷酸的图案化底物上暴露的醛基的还原性胺化。光蛋白抗菌剂被丙酮剥离，以进行正交SS寡核苷酸的额外图案。（c）脂质体上寡核苷酸标签的杂交与互补的寡核苷酸在底物上的杂交产生复杂和高分辨率的模式。比例尺= 500 µm。
寡核苷酸治疗药物研发的临床药理学考量 | FDA 行业指南
I. 引言 本指南根据《联邦食品、药品和化妆品法》第 505 节（21 USC 355）和 21 CFR 第 312 和 314 部分，为协助业界开发寡核苷酸疗法提供建议。具体而言，本指南代表了 FDA 对寡核苷酸疗法开发过程中某些评估的建议，包括：(1) 表征 QTc 间期延长的可能性，(2) 进行免疫原性风险评估，(3) 表征肝肾功能损害的影响，以及 (4) 评估药物间相互作用的可能性。本指南就何时进行这些评估以及哪些类型的评估适合解决上述主题提供了建议。寡核苷酸疗法是一种新兴的治疗方式，正在开发的药物数量不断增加。2近年来，许多反义和小干扰 RNA（siRNA）寡核苷酸疗法已获得 FDA 批准。此外，目前正在开发许多寡核苷酸疗法，用于治疗罕见和常见疾病。寡核苷酸疗法包括各种合成修饰的 RNA 或 RNA/DNA 杂交体，它们专门设计用于与靶 RNA 序列结合以改变 RNA 表达和/或下游蛋白质表达。即使在治疗方式中，寡核苷酸疗法也可能存在多种差异，包括但不限于：
采用无离子对反相法和 TOF LC/MS 进行寡核苷酸分析
评估了三种流动相改性剂，以确定其对寡核苷酸 LC/MS 分离和灵敏度的影响（图 1）。本研究评估的流动相缓冲液包括碳酸氢铵、醋酸铵和甲酸铵，流动相 A 中的浓度均为 20 mM。醋酸铵和甲酸铵缓冲液用氢氧化铵调节至 pH 8.5，而碳酸氢铵缓冲液未调节 pH。LC/UV 结果表明，14、17、20 和 21 碱基 RNA 样品在 RP 柱上的分离效果相似，20 碱基和 21 碱基 RNA 之间的平均分离度为 R = 1.47。这表明进一步的梯度优化可以实现 n-1 杂质的基线分离（R = 1.5），而生物制药中经常监测这些杂质。
序列依赖性抑制CGA和TLR9 DNA通过2'-O-甲基gapmer寡核苷酸
1先天免疫和传染病中心，哈德逊医学研究所，克莱顿，维多利亚州克莱顿，澳大利亚3168，澳大利亚，2分子与转化科学系，莫纳什大学，莫纳什大学，克莱顿，维多利亚州，维多利亚州3800，澳大利亚，3800 Inc.，Coralville，IA，IA 52241，美国，5个免疫学和传染病系，John Curtin医学研究院，澳大利亚国立大学澳大利亚国立大学，澳大利亚法案，澳大利亚第2601号，6个个性化免疫学中心，John Curtin医学研究院，澳大利亚国立大学，澳大利亚州澳大利亚国立大学，澳大利亚2601年，澳大利亚州澳大利亚大学，第2601号。莫纳什大学，克莱顿，维多利亚州3800，澳大利亚9号，澳大利亚再生医学研究所，莫纳什大学，莫纳什大学，维多利亚州，维多利亚州3800，澳大利亚3800，澳大利亚3800，澳大利亚10号分子医学和创新治疗中心，默多克大学，默多克大学，澳大利亚澳大利亚6150年，澳大利亚州珀斯市，澳大利亚珀斯市，珀斯（Perth 6150），澳大利亚，维特（Perth）perronagy of 3，澳大利亚澳大利亚大学及以上少）10，澳大利亚3型澳大利亚维多利亚州克莱顿市莫纳什大学莫纳什健康的临床科学