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![铁摄取调节剂（Fur）的C末端结构域结合了A [2FE-2S]](/simg/c\c903eaf948a8c6bf5be5cd11bfd902bd0d7df85c.webp)
铁摄取调节剂（Fur）的C末端结构域结合了A [2FE-2S]
建议基础模型利用大型语言模型（LLM）通过将建议任务转换为自然语言任务来推荐。它可以像传统推荐模型中直接生成项目的生成性建议，而不是为每个候选项目计算每个候选项目的排名分数，从而简化了从多阶段过滤到单阶段过滤的推荐管道。在决定要推荐的项目时，要避免产生过长的文本和幻觉推荐，请创建与LLM兼容的项目ID，以唯一地识别每个项目对于建议基础模型至关重要。在这项研究中，我们以P5为示例LLM的一个示例，从系统地检查了建议基础模型的项目ID创建和索引问题。要强调项目索引的重要性，我们首先讨论了几种微不足道的索引方法的问题，例如随机索引，标题索引和独立索引。然后，我们提出了四种简单但有效的解决方案，包括索引，协作索引，语义（基于内容）索引和混合索引。我们的研究强调了项目索引方法对基于LLM的建议性能的显着影响，而我们对现实世界数据集的结果验证了我们提出的解决方案的有效性。该研究还证明了语言建模和索引等传统IR原则的最新进展如何帮助彼此更好地学习和推论。源代码和数据可在https://github.com/wenyueh/llm-recsys-id上找到。
人质恶性疟原虫CSP C末端抗体的分子和功能特性
人类单克隆抗体（mAb）进行了针对恶性疟原虫外孢子菌蛋白（PFCSP）的中央重复和连接结构域（PFCSP）的研究，以指导与针对PFCSP c c c c c c c c c c c c c t extime的抗体。在这里，我们描述了73种种系的分子特征和保护潜力，并突变的人物mAb针对高度免疫原性PFCSP C末端结构域。两个mAb在C末端连接器中重复的线性表位，具有序列与重复和连接基序的序列相似，而其他所有靶向构象表位的a -thrombospondin重复（A -TSR）域中的构象表位。多态TH 2 r /th 3 r的特异性，而不是A -TSR中保守的RII + /cs.t 3区与IGHV 3-21 /IgVl 3-11或IgLV 3-1基因使用相关。与抗重复mAb相比，C末端特异性mAb显示出更有效的亲和力成熟和类转换的迹象，但活体孢子岩结合和抑制活性仅限于单个C链链反应MAB，具有与中央重复和Junc-tion的交叉反应性。数据提供了人类抗C-链链和抗A -TSR抗体响应的新见解，这些抗体响应支持将PFCSP C末端排除在疟疾疫苗设计中。
α-突触核蛋白 C 末端结构域的构象转换可控制其纤维多形性
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证下可用（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2024 年 12 月 22 日发布。；https://doi.org/10.1101/2022.02.10.479831 doi：bioRxiv 预印本
高档名优绿茶柔性采摘指研制 - 金小俊
传感器与微系统 第 ４４ 卷 殊形状的刀片完成剪切，采摘成功率达 ９７ ． ３６ ％ 。进一步 设计了一种提拉断梗的机械手，舵机带动主动手指和从动 手指转动，将茶梗折弯并拉断，采摘成功率为 ７４ ． ３ ％ 。华 中农业大学 ［ ６ ］ 设计了一种结构为曲柄滑块剪切机构的末 端执行器，通过刀片闭合将鲜叶掐断，利用真空装置将剪切 后的茶叶吸入容纳箱。四川农业大学 ［ ７ ］ 设计了一种可夹 提式采摘茶叶嫩梢的末端执行器，通过预设夹持力使夹持 件夹断嫩梢叶柄，对一芽一叶和一芽两叶都达到较高的采 摘率。纵观现有大宗茶采摘末端执行器的结构和特点，多 以刀片切割的方式作为采摘原理，无法保证芽叶的完整，这 将在很大程度上降低茶叶的品质，不能用于高档名优绿茶 采摘。南京林业大学 ［ ８～１２ ］ 基于机器视觉、颜色特征、并联 机器人等技术，研发了对新梢有选择性采摘的机器人，研制 了一种气动采摘指，设置固定阈值，确定采摘指夹持嫩芽时 的闭合间隙，通过提拉动作完成采摘，成功率达到 ９０ ％ 。 由于自然生长的新梢枝条粗细不一，夹持时的夹持力波动 较大，会存在打滑或夹断现象。 针对现有采茶末端执行器导致嫩芽完整性的不足，本 文设计了一种柔性可感知的仿生采摘指作为采茶机器人的 末端执行器，模仿人工“提手采”的动作，通过固定和提拉 动作实现嫩芽采摘，并增加夹持力测量电路，在夹持过程中 检测夹持力，提高采摘成功率。
表征有利于 Cas9 诱导的双链断裂处替代末端连接的序列背景
替代末端连接 (alt-EJ) 机制，例如聚合酶θ介导的末端连接，越来越多地被认为是导致双链断裂修复不准确的重要因素。我们之前提出了一个 alt-EJ 模型，其中双链断裂附近的短 DNA 重复退火形成二级结构，从而引发有限的 DNA 合成。然后，新生的 DNA 与另一个断裂端的微同源序列配对。这种合成依赖性微同源介导的末端连接 (SD-MMEJ) 解释了果蝇 I-SceI 核酸酶切割后恢复的许多 alt-EJ 修复产物。然而，影响 SD-MMEJ 修复的序列特异性因素仍有待充分表征。在这里，我们通过对 1100 种不同序列环境中 Cas9 诱导的双链断裂处的修复产物进行计算分析，扩展了 SD-MMEJ 模型的实用性。我们在单核苷酸分辨率下发现了成功修复 SD-MMEJ 的序列特征的证据。这些特征包括最佳引物重复长度、重复与断裂的距离、引物重复之间的 DNA 序列灵活性以及微同源模板相对于首选引物重复的定位。此外，我们还表明 DNA 聚合酶 theta 是 Cas9 断裂处大多数 SD-MMEJ 修复所必需的。本文描述的分析包括一个计算流程，可用于表征任何序列环境中 alt-EJ 修复的首选机制。
cesin是一种短自然变体，尽管缺乏两个C末端大环
摘要尼我们是一种广泛使用的脂肪生物，由于其有效的抗菌活性及其食品级状态。其作用方式包括细胞壁合成抑制和孔形成，分别归因于脂质II结合和形成孔形成域。我们发现了Cesin，这是尼生蛋白的短自然变体，是由精神嗜血杆菌卵巢卵巢卵石产生的。与其他天然尼宁变体不同，Cesin缺少构成孔形成域的两个末端大环。目前的研究旨在异源表达和表征Cesin的抗小胞活性和物理化学特性。在乳酸乳酸球菌在乳酸菌中成功的Heterolo gous表达之后，甘西生酰生物表现出与Nisin相当的广泛而有效的抗菌谱。使用脂质II和Lipoteichoic Acid结合测定法确定其作用方式，将有效的抗菌活性与脂质II结合和与Teichoic Acids的静电相互作用联系起来。荧光显微镜表明Cesin缺乏自然形式的孔形成能力。稳定性测试表明，在不同的pH值和温度条件下，盐脂型在高度稳定，但可以通过胰蛋白酶降解。然而，一种生物工程的类似物Cesin R15G克服了胰蛋白酶降解，同时保持了全抗菌活性。这项研究表明，Cesin是一种新颖的（小）尼生变体，通过抑制细胞壁合成而没有孔隙形成，可以有效地杀死靶细菌。
步态和平衡康复设备：基于末端执行器的机械手的一般分类和叙述性回顾
摘要：步态和平衡直接影响患者的独立性和生活质量。由于预期寿命的提高，患有神经系统疾病的患者数量呈指数级增长，步态和平衡障碍是主要副作用。在此背景下，使用康复机器人设备作为恢复步态和平衡功能的有效补充工具应运而生。在康复设备中，末端执行器具有一些优势，并已显示出令人鼓舞的结果。本研究的目的有两个：提出步态和平衡康复设备的一般分类，并回顾现有的用于此类目的的末端执行器。我们将设备分为五类：跑步机、外骨骼、患者引导系统、扰动平台和末端执行器。总体而言，文献中确定了 55 种末端执行器，其中 16 种已商业化。我们发现，能够提供两种康复类型的末端执行器（2/55）和专注于平衡（21/55）或步态（32/55）的数量不成比例。从机械角度（自由度、拓扑和训练模式）分析它们的特征，使我们能够确定并联机械手作为末端执行器装置驱动机制的潜力，并提出了几个未来的研究方向。
Qiime 2可以对各种微生物组数据和比较研究进行全面的末端分析
Qiime 2是基于流行的Qiime平台的完全重新设计的微生物组生物信息学平台，已更换。QI-IME 2促进了全面且完全可重复的微生物组数据科学，从而通过添加多个用户界面来提高对不同用户的可访问性。Qiime 2可以与基于开源Web的平台Qiita结合使用，以重新利用可用的荟萃分析数据。以下基本供应托有描述了如何在单台计算机上安装Qiime 2并分析Mi-Crobiome序列数据，从原始DNA序列的处理通过生成可发布的交互式图形来读取。这些交互式数字允许对研究的读数与作者相同的数据进行互动，从而提高了微生物组科学的透明度和可重复性。我们还展示了社区开发的插件如何在Qiime 2中安装和使用分析功能，从而增强了微生物组分析的各个方面，例如提高了分类学分类精度。最后，我们说明了用户如何使用Qiita轻松使用的公共数据来执行荟萃分析。在本教程中，我们分析了儿童早期抗生素和微生物组（ECAM）研究的一部分，该研究跟踪了从出生到2岁的美国43名婴儿的微生物组组成和发育，从而确定了与抗体暴露，递送模式和饮食的微生物组关联。有关Qiime 2的更多信息，请参见https://qiime2.org。进行故障排除或询问有关Qiime 2和
靶向细胞应力途径的新兴治疗剂可减轻1型糖尿病的末端损伤
抽象1型糖尿病（T1D）是一种自身免疫性疾病，其特征是胰岛素缺乏和葡萄糖调节受损。虽然每日胰岛素治疗是挽救生命的，但许多患者努力获得最佳的血糖控制，导致微血管并发症影响各种器官，包括肾脏和肝脏。本综述旨在总结有关T1D肝和肾脏并发症发病机理的当前知识状态，重点介绍了潜在的治疗靶标的最新进展，并提供了基于证据的建议来减轻最终器官损害。慢性高血糖通过多种相互关联的机制驱动糖尿病并发症，包括增加多元醇通路，晚期糖基化终产物产物（年龄）形成，蛋白激酶C激活和线粒体反应性氧的产物过多。在肝脏中，这些过程有助于非酒精性脂肪肝病，其中多达50％的T1D患者患有肝脂肪变性。糖尿病性肾病，影响25％–40％的长期T1D患者，其特征是肾小球基底膜增厚，介膜膨胀和微管间质纤维化。T1D管理的最新创新包括基因组学和精度医学方法，肠道微生物组调制，纳米医学和人工智能驱动的葡萄糖监测系统。新兴的免疫疗法旨在从根本上修改T1D中的自身免疫反应。减轻T1D并发症需要密集的血糖控制，有针对性的药物治疗和生活方式改变。新兴疗法和精确医学方法提供了有前途的途径。对分子机制的持续研究对于制定新的干预措施和改善T1D患者的长期结局仍然至关重要。关键字：1型糖尿病，糖尿病性肾病，糖尿病肝病，氧化应激，纤维化
clasp2识别以核苷酸状态敏感方式在微管加末端暴露的小管蛋白
clasps（细胞质接头相关蛋白）是微管动力学的无处不在稳定剂，但是它们在微管加末端的分子靶标尚不清楚。使用基于DNA折纸的重建，我们表明，人类clasp2的簇在Sta-Bilized微管尖端上与末端非GTP小管形成负载键。此活性依赖于CLASP2的非常规的TOG2结构域，该结构域在转化为聚合竞争性的GTP小管蛋白时将其高亲和力与非GTP二聚体释放。CLASP2识别核苷酸特异性小管蛋白构象并稳定灾难性的非GTP微管与末端肾小管上GDP和GTP之间的交换相互交换的能力。我们提出，偶发存在的非GTP小管蛋白的TOG2依赖性稳定性代表了一种独特的分子机制，可以抑制自由组装的微管处于自由组装的微管末端的灾难，并促进持久的小管蛋白在负荷骨螺栓固定的末端，例如在射精的细胞中，例如在射电室中。