表 2. 支持基因注释的证据。手工注释的柑橘木虱 Wnt 通路基因。总共有 24 个基因模型。每个基因模型都分配了一个标识符,并列出了用于验证或修改基因模型结构的证据。还列出了最能支持手工注释的 MCOT 转录组标识符。当存在从头转录组、Iso-Seq、RNA-Seq 和直系同源物支持的证据时,表中会标记“X”。MCOT:基于基因组 MAKER、Cufflinks、Oases 和 Trinity 转录本预测的综合转录组;MAKER:基因预测;从头转录组:使用 Iso-Seq 长读和 RNA-Seq 数据的独立转录组;Iso-Seq 转录本:用 Pacific Biosciences 技术生成的全长转录本; RNA-Seq:映射到基因组的读取也用作剪接点的支持证据;直系同源物证据:来自相关半翅目物种和果蝇的蛋白质。
新型植物育种技术 (NPBT) 旨在突破果树品种的传统育种限制,以获得感官性状改良、抗生物和非生物胁迫的新品种,并通过(克隆)选择保持数百年来的果实品质。了解控制特定性状的基因对于 NPBT 的使用至关重要,例如基因组编辑和同源杂交。在研究包括柑橘在内的果树品种的国际科学界框架内,NPBT 主要用于应对病原体威胁。柑橘可以利用 NPBT,因为它具有复杂的物种生物学(无籽、无融合生殖、高杂合性和长幼期)和体外操作能力。据我们所知,通过转基因对柑橘进行基因组编辑已成功利用抗性基因 CsLOB1 在甜橙和葡萄柚中诱导出对柑橘细菌性溃疡病的抗性。未来,NPBT 还将用于改善果实性状,使其更健康。应用 NPBT 后植物的再生是一个瓶颈,因此有必要优化当前协议的效率。我们将讨论使用来自幼小的离体植株和成熟植株的外植体的优缺点。本综述中讨论的其他主要问题与对无标记系统的要求以及缩短漫长的幼苗期有关。本综述旨在总结文献中适用于柑橘的方法和途径,重点关注使用 NPBT 之前观察到的原则。
一起,在商业果园,包装棚和研究界工作的人员已经由澳大利亚柑橘组织成一个名为第一个检测器网络(FDN)的小组。通过他们在常规的作物和水果监测中的活动,FDN代表了对奇异害虫监视的重要资源,因为它们在识别果园或包装棚内的非生物和生物胁迫方面具有重要的专业知识,因此在认识到新的或不寻常的害虫或症状方面都可以很好地识别出来。虽然人们认识到FDN的活动提供了显着的监视能力,但在国家一级从FDN捕获了有限的数据进行分析,以确定有害生物的存在或不存在。改善农作物监测工作的国家协调,为提供早期发现的数据和外来柑橘虫害缺失的证据提供了巨大的潜力。