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World File Search System核糖体
修订的JBC_2012_400564
总结大多数核糖体蛋白在核糖体生物发生和功能中起重要作用。在此，我们研究了在酵母酵母酿酒酵母中这些过程中必需的核糖体蛋白L40的贡献。删除RPL40A或RPL40B基因以及L40损害60S核糖体亚基生物发生的体内耗竭。多层体剖面分析揭示了半摩尔人的积累和自由60s核糖体亚基的中等减少。脉冲 - 脉冲追踪，北部印迹和底漆扩展分析，清楚地表明，前RRNA加工反应并不是严格必需的L40，但有助于最佳27SB 27SB前RRNA成熟。此外，L40的耗竭阻碍了60年代前核糖体颗粒的核总质出口。重要的是，所有这些缺陷最有可能是NMD3受损和RLP24从细胞质前60年代核糖体释放的直接结果
布拉瓦尼克奖 - 面向年轻科学家
Arnaud Vanden Broeck 博士在理解核糖体（负责蛋白质合成的分子机器）如何在人体细胞中组装方面取得了重大进展。尽管核糖体发挥着至关重要的作用，但我们之前对真核核糖体组装的大部分理解都来自对酵母的研究。通过使用基因组编辑和低温电子显微镜 (cryo-EM) 等先进技术，Vanden Broeck 成功绘制了人体细胞中关键组装中间体的结构。他的发现揭示了人类核糖体组装中涉及的独特机制和因素，为这些关键细胞成分的形成方式提供了一个新模型。这项工作填补了我们知识领域的长期空白，并为治疗与核糖体功能障碍相关的癌症和疾病奠定了基础。
激活的淋巴细胞蛋白合成能力和快速分裂速率
抽象的快速淋巴细胞细胞分裂对蛋白质合成机制提出了巨大的需求。通过翻译起始抑制剂处理细胞或小鼠后，纯种核糖体相关的核糖体相关链的流式细胞仪测量表明，乳腺细胞的典型率在典型的体外静止淋巴细胞和体内细胞中，核糖体在体内延长。有趣的是，通过体内激活或体外的发热温度，可以提高长制速率30％。静止和活化的淋巴细胞具有丰富的单体群体，其中大多数在体内积极翻译，而在体外，几乎所有的都可以在激活之前停滞不前。定量淋巴细胞蛋白质量和核糖体计数表明，细胞蛋白与核糖体的矛盾之比不足以支持其快速的体内分裂，这表明活化的淋巴细胞蛋白质组在体内可能以不寻常的方式产生。我们的发现证明了蛋白质合成在淋巴细胞和其他快速分裂的免疫细胞中的全球构成的重要性。
KMT2D 缺乏会促进易受核糖体生物合成抑制的髓系白血病
KMT2C 和 KMT2D 是人类癌症中最常见的突变表观遗传基因。虽然 KMT2C 被确定为急性髓系白血病 (AML) 中的肿瘤抑制因子，但 KMT2D 在这种疾病中的作用仍不清楚，尽管它的缺失会促进 B 细胞淋巴瘤和各种实体癌。据报道，KMT2D 在 AML 中下调或突变，并且通过 shRNA 敲低或 CRISPR/Cas9 编辑导致其缺陷会加速小鼠的白血病形成。造血干细胞和祖细胞以及 Kmt2d 缺失的 AML 细胞的核糖体生物合成显著增强，并且核仁持续增大，rRNA 和蛋白质合成率增加。从机制上讲，发现 KMT2D 缺陷会导致小鼠和人类 AML 细胞中 mTOR 通路的激活。 Kmt2d 直接调节 Ddit4 的表达，Ddit4 是 mTOR 通路的负调节因子。与核糖体生物合成异常一致，研究表明，RNA 聚合酶 I 抑制剂 CX-5461 可显著抑制体内 Kmt2d 缺失的 AML 生长，并延长白血病小鼠的生存期。这些研究证实 KMT2D 是 AML 中事实上的肿瘤抑制因子，并揭示了对核糖体生物合成抑制前所未有的脆弱性。
大麦 MLA 免疫受体被真菌非核糖体肽效应物激活，从而增加疾病易感性
大麦 Mla 基因座含有功能多样化的基因，这些基因编码细胞内核苷酸结合的富含亮氨酸重复受体 (NLR)，并赋予针对活体营养和半活体营养真菌病原体的菌株特异性免疫力。在本研究中，我们分离了一个大麦基因 Scs6 ，它是 Mla 基因的等位基因变体，但赋予对死体营养真菌 Bipolaris sorokiniana 分离株 ND90Pr (Bs ND90Pr) 的敏感性。我们生成了 Scs6 转基因大麦品系，并表明 Scs6 足以赋予天然缺乏受体的大麦基因型对 Bs ND90Pr 的敏感性。 Scs6 编码的 NLR（SCS6）被 Bs ND90Pr 产生的非核糖体肽（NRP）效应物激活，从而诱导大麦和本氏烟细胞死亡。MLA 和 SCS6 之间的域交换表明，SCS6 亮氨酸富集重复域是 NRP 效应物激活受体的特异性决定因素。Scs6 在野生和驯化大麦种群中均有保留。我们的系统发育分析表明 Scs6 是大麦特有的创新。我们推断 SCS6 是一种真正的免疫受体，很可能被 Bs ND90Pr 的非核糖体肽效应物直接激活，从而导致大麦易患疾病。我们的研究为未来开发不易受死体营养病原体修饰的作物合成 NLR 受体奠定了基础。
核酸在蛋白质合成过程中的作用
摘要：核酸在蛋白质合成过程中起着至关重要的作用，而蛋白质合成是细胞遗传调控的核心。这个过程涉及 DNA、RNA 和核糖体协调工作的复杂机制。DNA（脱氧核糖核酸）起着遗传蓝图的作用，储存蛋白质合成的信息。通过转录过程，DNA 在细胞核中转录成信使 RNA（核糖核酸）（mRNA）。mRNA 将遗传密码携带到细胞质中，核糖体在细胞质中充当翻译中心。核糖体与转移 RNA（tRNA）一起读取 mRNA 上的密码子序列，以确定将组装成多肽的氨基酸序列。这个称为翻译的过程涉及 mRNA、tRNA 和核糖体之间复杂的相互作用，以确保产生的蛋白质符合遗传指令。此外，microRNA、核糖开关等非编码RNA在转录后调控基因表达中也发挥着重要作用。对DNA、RNA和核糖体机制的深入了解为生物技术和医学带来了巨大的机遇，例如基因治疗和基于RNA的药物开发。因此，对核酸作用的分析成为探索分子生物学和遗传学的重要基础。关键词：蛋白质合成、遗传调控、核酸
上下文依赖性翻译抑制作用作为一种新型的肿瘤学治疗方式
Title: Context-dependent translation inhibition as a novel oncology therapeutic modality Authors: Paige D. Diamond*, Paul V. Sauer*, Mikael Holm, Canessa J. Swanson-Swett, Lucas Ferguson, Natalie M. Bratset, Grant W. Wienker, Justin Seiwert Sim, Hailey K. Adams, Lillian Kenner, Margot Meyers, David Gygi，ZefA.Könst，Sogole Sami Bahmanyar，Lawrence G. Hamann＆Anthony P. Schuller ***这些作者应针对：aschuller@interdictbio.com供应：真核核糖体的（PTC）抑制翻译。最近的工作表明，某些PTC结合抗生素以序列选择性作用，在多肽参与PTC时抑制特定氨基酸的翻译伸长。然而，这种现象尚未记录在抑制人核糖体翻译的化合物中。在这里，我们使用基于结构的设计来指导与人核糖体PTC结合并以上下文选择性的方式作用以抑制翻译延伸的分子的合成。使用核糖体分析，结合体外生物化学和冷冻电子显微镜，我们表征了独特类似物的上下文选择性，并观察到它们与具有互补特性的新生链残基的首选相互作用。此外，我们提出了一个结构约为1.9Å分辨率与MYC蛋白结合的结构，并确定了新生链和核糖体RNA中产生的结构重排。在细胞中，我们记录了这些化合物如何差异地影响核糖毒性应激响应途径，该核糖毒素反应途径可以监测核糖体碰撞并触发凋亡。最后，我们使用三阴性乳腺癌的MDA-MB-231模型在细胞系中口服衍生异种移植物的口服给药后证实了它们的肿瘤生长抑制活性。一起，我们的数据建立了对翻译的序列选择性抑制作用，作为一种新型的小分子治疗方式，可以通过靶向人核糖体PTC中的致癌依赖性因子的翻译来解决癌症。关键字：翻译抑制剂，限制者，核糖体，低温电子显微镜（冷冻 - EM），核糖毒性应激反应，癌症，MYC
diaphorin，一种由亚洲柑橘cyllid的细菌内共生菌产生的聚酮化合物，不利地影响了来自Escherichia coli和bacillich coli和bacillus bacillus coli和bacillus bacillus coli
diaphorin是由“ candidatus profftella armatura”（伽马马环状）产生的聚酮化合物，这是重要的农业害虫的强制性互助者，亚洲柑橘cyllid psyllid-ina-ina citri- citri（hemiptera）。我们先前的研究表明，diaphorin在d的生理浓度下。citri，抑制枯草芽孢杆菌（Firmicutes）的生长和细胞分裂，但促进了大肠杆菌（γ-蛋白酶菌）的生长和代谢活性。这种独特的diaphorin特性可以帮助D。citri，可能会影响“念珠菌自由杆菌属”的传播。 （字母杆菌），最具破坏性柑橘疾病的病原体。此外，可以利用该特性来促进微生物生产工业材料的效率。但是，此活动的基础机制尚不清楚。diaphorin属于Pederin-型化合物的家族，该家族通过与真核生物核糖体结合来抑制真核生物中的蛋白质合成。因此，作为评估diaphorin对细菌基因表达的直接影响的第一步，这项研究检查了使用b的核糖体使用diaphorin对体外翻译的影响。枯草和e。大肠杆菌，量化绿色荧光蛋白的产生。结果表明涉及b的基因表达。枯草和e。大肠杆菌核糖体以及五毫米透明蛋白分别为29.6％和13.1％，而不是对照。这表明diaphorin对b的不良影响。枯草液至少部分地归因于其对基因表达的抑制作用。此外，由于翻译系统的成分是常见的，除了核糖体以外，b骨出现了更大的抑制作用。枯草核糖体暗示核糖体是diaphorin的潜在靶标之一。另一方面，结果也暗示diaphorin对E的积极影响。大肠杆菌是由于转录和翻译的核心机制以外的目标。这项研究首次进行了pederin同类体影响细菌基因表达的情况。