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毕赤酵母基因组 DNA 提取的优化...
基因组 PCR 是分子生物学的基础，包括两个关键步骤：DNA 提取和扩增。酵母 DNA 提取的主要挑战是细胞壁的破坏，这直接影响提取效率。在本研究中，我们使用了文献中报道的几种酵母基因组提取方法，例如玻璃珠法 [7] 、LiAc [8] 和 NaOH 法 [9] 。NaOH 法利用强碱性环境溶解和变性蛋白质，破坏细胞和核膜，并使核酸酶失活，从而无需影响其一级结构即可释放 DNA。另一方面，LiAc 法使用 LiAc 和 SDS 暂时透化酵母细胞，使 DNA 自由通过。SDS 是一种阴离子洗涤剂，可去除污染蛋白质，而乙醇可沉淀和浓缩 DNA。LiCl 遵循与 LiAc 类似的原理。玻璃珠法是一种物理方法，通过高速摇晃过程中的机械摩擦破坏细胞壁。本研究还测试了一种能够水解真菌细胞壁的酶 Lyticase，并优化了直接基因组提取的方案。
Komagataella phaffii（毕赤酵母）作为一种强大的酵母...
Komagataella phaffii (K. phaffii) (Pichia pastoris)，也称为生物技术酵母，是一种在生物技术和制药行业中具有多种应用的酵母菌种。这种甲基营养酵母作为重组蛋白的生产平台引起了人们的极大兴趣。它具有许多优点，包括有效的分泌表达，便于纯化异源蛋白，细胞密度高，生长迅速，翻译后变化，以及整合到基因组中的稳定基因表达。在过去的三十年里，K. phaffii 还被精炼为一个适应性强的细胞工厂，可以在实验室环境和工业规模上生产数百种生物分子。事实上，迄今为止，使用 K. phaffii 表达方法已经生成了 5000 多种重组蛋白，占细胞总蛋白的 30% 或总释放蛋白的 80%。除了已获得许可的 300 多种工业工艺外，K. phaffii 还用于制造 70 多种商业产品。其中包括对工业生物技术有用的酶，包括木聚糖酶、甘露聚糖酶、脂肪酶和植酸酶。其他是生物制药，包括人血清白蛋白、胰岛素、乙肝表面抗原和表皮生长因子。与其他表达系统相比，这种酵母还被认为是合成亚单位疫苗的特殊宿主，而亚单位疫苗最近已被替代疫苗类型所取代，例如灭活/杀死和减毒活疫苗。此外，通过多层次优化方法，如密码子偏好、基因剂量、启动子、信号肽和环境因素，可以实现重组蛋白的高效生产。因此，尽管 K. phaffii 表达系统高效、简单且工艺流程明确，但仍需确定理想条件，因为这些条件会根据目标蛋白而变化，以确保最高的重组蛋白生成量。本综述介绍了 K. phaffii 表达系统、其在工业和生物制药蛋白质生产中的重要性，以及一些高效蛋白质生产的生物加工和遗传改造策略。K. phaffii 最终将继续作为一种强大的表达系统在研究领域和工业应用中做出贡献。
将核酸外切酶与 Cas9 融合可增强毕赤酵母中的同源重组
HR 比 NHEJ 慢得多，NHEJ 可以从 DSB 事件中拯救更多细胞。NHEJ 几乎不需要或根本不需要末端切除来直接重新连接 DSB 末端。相比之下，HR 需要短距离切除和长距离切除 DSB 以及供体来实施修复过程。此外，其他蛋白质也可能是 HR 修复途径的限制因素 [18, 19]。我们在此发现，在同时删除两个基因和整合多个片段期间，将 MRE11 与 CAS9 融合可提高 CFU 数量
重组人乳头瘤病毒双价（16、18 型）疫苗（毕赤酵母）
抗 HPV 16 个月 7 265 264 99.62 (97.92, 99.99) 8571.45 (7437.30, 9878.50) 个月 12 265 265 100.00 (98.62, 100.00) 1577.93 (1408.00, 1768.40) 个月 24 242 242 100.00 (98.49, 100.00) 1916.92 (1668.50, 2202.40) 个月 36 235 235 100.00 (98.44, 100.00) 1161.28 (1007.80, 1338.10) 个月48 206 203 98.54 (95.80, 99.70) 762.37 (650.37, 893.66) 抗 HPV 18 第 7 个月 263 262 99.62 (97.90, 99.99) 5825.80 (5087.20, 6671.70) 第 12 个月 263 262 99.62 (97.90, 99.99) 3111.29 (2687.00, 3602.60) 第 24 个月 242 241 99.59 (97.72, 99.99) 1371.08 (1168.70, 1608.50) 第 36 个月 235 235 100.00 (98.44, 100.00) 1069.23 (903.80, 1264.90) 第 48 个月 206 201 97.57 (94.43, 99.21) 742.13 (625.20, 880.91) PPS 人群由接种 3 剂疫苗且在第 1 剂之前对相关 HPV 类型血清呈阴性的个体组成。采用基于假病毒的中和试验 (PBNA) 进行抗体检测；针对 HPV 16 和 HPV 18 的中和抗体的阳性截止值为 1:40。