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collinsella aerofaciens作为对益生菌治疗反应的预测标记
摘要益生菌是在IBS中用于辅助治疗的，但是缺乏选择适当的益生菌以采用不同形式的IBS的可靠指导。我们旨在识别识别非注解（NC）IBS患者的标志物，这些患者可能会在用益生菌乳酸乳酸乳酸菌DG（LDG）治疗时显示出明显的临床改善。为此，我们对在多中心，双盲，平行组，安慰剂对照试验中收集的样本进行了事后分析，其中NC-IBS患者被随机分配以接收至少240亿CFU LDG或安慰剂胶囊B.I.D。持续12周。主要的临床终点是基于改善腹痛和粪便类型的复合反应。研究了肠道（PV1和Zonulin），肝脏和肾功能的粪便微生物组和血清标记。我们发现，益生菌中的响应者（R）（25％）与非反应者（NR）不同，基于18种细菌分类群，包括Coriobacteriaceae，Dorea spp。和Collinsella aerofaciens，在R患者中代表过多。这些分类单元还区分了R（但没有NR）患者与健康对照组。益生菌干预显着降低了这些细菌在R中的丰度，但在NR中没有显着降低。通过对先前对具有相同益生菌的IB的数据的数据进行分析，出现了Aerofaciens的类似结果。最后，C。aerofaciens与浆膜囊泡相关蛋白-1（PV-1）和肝功能标志物正相关。总而言之，LDG对NC-IBS患者有效，NC-IBS患者具有较大的潜在病原体。在其中，Aerofaciens已成为益生菌功效的潜在预测指标。
gC1qR/HABP1/p32 是治疗间皮瘤的潜在新靶点
间皮瘤是一种侵袭性浆膜癌，尽管联合治疗包括手术、放疗和铂类化疗，但预后仍然不佳。靶向治疗（包括免疫疗法）的成功率有限，这表明需要额外的治疗靶点。本研究调查了一种潜在的新治疗靶点 gC1qR/HABP1/p32 (gC1qR)，该靶点在间皮瘤的所有形态亚型中均过度表达。gC1qR 是一种补体受体，与多种细胞功能有关，包括细胞增殖和血管生成。使用双相间皮瘤细胞系 MSTO-211H (MSTO) 进行了体外和体内实验，以检验以下假设：使用特定的 gC1qR 单克隆抗体 60.11 靶向 gC1qR 可减少间皮瘤肿瘤生长。体外研究表明 MSTO 细胞在细胞表面和细胞外表达 gC1qR，而 gC1qR 阻断 60.11 抗体可使细胞增殖适度减少 25.3 ± 1.8% (n = 4)。这种抑制专门针对 gC1qR 的 C1q 结合域，位于 aa 76–93，而针对氨基酸 204–218 的单独单克隆抗体 74.5.2 没有明显影响。使用小鼠原位异种移植模型的体内研究表明，与对照组相比，使用 60.11 抗体治疗的小鼠的 MSTO 肿瘤生长（抑制率 50%）进一步减少。切除肿瘤的免疫组织化学研究显示，与对照组相比，60.11 治疗的肿瘤中 caspase 3 和 TUNEL 染色显示细胞凋亡增加，并且 CD31 染色减少导致血管生成受损。综合起来，这些数据表明 gC1qR 是具有抗增殖和抗血管生成特性的间皮瘤的潜在新治疗靶点。
选择性CAR T细胞介导的B细胞耗竭抑制IFN SLE
引言全身性红斑狼疮（SLE）代表了一种原型自身免疫性疾病，其特征是慢性炎症和进行性炎症相关的多个器官（包括儿童，关节和皮肤）的组织相关组织损伤（1）。SLE被认为是由于全身免疫耐受性破裂而导致的，患有SLE的患者表现出针对无处不在的核抗原（如双链DNA和组蛋白）的自身抗体（2）。b细胞在SLE的发病机理中似乎发挥了关键作用，在那里它们被认为是产生自身抗体的浆膜和浆细胞的前体，并在自动记忆B细胞的形式下提供了致病性免疫学记忆的基础，能够维持持续自动免疫性（3）。SLE的另一个标志是，在外周血单核细胞（PBMC）中，以增强多个IFN诱导基因表达的形式增加了I型IFN签名，这表明IFN在SLE开发中的另一个关键作用（4-6）。根据一系列导致I型IFN产生或重组I型IFN本身治疗增加的遗传疾病可以触发类似SLE的疾病病理学的发作（7，8）。I型IFN受体的阻滞已成为针对一部分SLE患者的有效疗法（9）。在一起，这些发现不仅引发了有关I型IFN的细胞来源和TAR的重要问题，而且还引发了触发因素和一系列因果关系，这些事件最终分别促进了SLE患者的IFN IFN产生和B细胞激活。先前对研究B细胞耗竭患者的临床试验产生了差异结果（10），这部分是由于组织B细胞对治疗性CD20抗体的响应效率低下（11）。同时，CD19 CAR T细胞已成为一种潜在的新型治疗工具，在B细胞淋巴瘤治疗期间，在抗体介导的B细胞耗竭方面表现出优势
儿童期SLE中有针对性的多组学揭示了与疾病活动相关的不同生物学表型：探索性研究的结果
抽象的目标是将靶向的转录组和蛋白质组学数据结合在无监督的分层聚类方法中，以将儿童发作的SLE（CSLE）患者分类为相似的生物学表型，并研究表征簇的免疫学细胞景观。在CSLE患者中确定靶向全血基因表达和血清细胞因子的方法，以疾病活性状态预先选择（诊断时，低狼疮疾病活动状态（LLDAS），耀斑）。无监督的分层聚类，不可知对疾病特征，用于鉴定具有不同生物学表型的簇。疾病活性由临床塞莱纳·塞莱达（Selena-Sledai）评分（全身性红斑狼疮国家评估 - 系统狼疮性红斑狼疮疾病活动指数中的雌激素的安全性）。高维40彩色流式细胞仪用于识别免疫细胞子集。结果鉴定出三个独特的簇，每个群集以一组差异表达的基因和细胞因子为特征，疾病活性状态：群集1主要包含LLDAS中的患者，群集2在诊断中主要含有未接受治疗的患者，而群集3包含一组混合的患者，即LLDA的患者，即在诊断和疾病中含有混合的患者。生物学表型不能反映以前的器官系统的参与，随着时间的流逝，患者可以从一个簇转移到另一个簇。健康对照组聚集在群集1。特定的免疫细胞亚群，包括CD11C+ B细胞，常规的树突状细胞，浆膜和早期效应的CD4+ T细胞在簇之间有所不同。使用有针对性的多构方法结论，我们将患者聚集在不同的生物学表型中，这些表型与疾病活动状态有关，但与器官系统的参与无关。这支持了一个新概念，其中治疗和逐渐变细策略的选择不仅基于临床表型，而包括测量新型的生物学参数。
SLC4A10突变引起与GABA能传播受损相关的神经系统疾病
SLC4A10是一种血浆膜结合的转运蛋白，它利用Na +梯度驱动细胞HCO 3-摄取，从而介导酸挤出。在哺乳动物大脑中，SLC4A10在主要神经元和中间神经元以及脉络丛的上皮细胞中表达，该器官调节CSF的产生。使用五个无关家庭的样本中的下一代测序，包括九个受影响的个体，我们表明双重性SLC4A10功能丧失变体会导致人类临床上可识别的神经发育障碍。该病情的基本临床特征包括婴儿期肌张力障碍，所有领域的精神运动延迟发展和智力障碍。受影响的个体通常显示出与自闭症谱系障碍有关的特征，包括焦虑，多动症和刻板动作。在两种情况下，据报道，在生命的最初几年中，癫痫发作的发作是分离的，进一步影响的儿童在没有明显的临床癫痫发作的情况下在脑电图上表现出了暂时性的癫痫发作。据报道枕骨围在出生时正常，但在10个受影响的个体中，有7个进化了出生后的小头畸形。神经放射学特征包括与枕骨圆周相比的相对保留，特征性狭窄有时“裂开”的侧脑室和call体异常。SLC4A10 - / - 小鼠，缺乏SLC4A10，还显示出小的侧脑室和轻度的行为异常，包括延迟的习惯和两目标新颖对象识别任务的改变。在SLC4A10 - / - 小鼠和受影响的个体中崩溃的脑腹膜cles cles表明SLC4A10在CSF的生产中起着重要作用。然而，值得注意的是，尽管CSF在发育中的大脑和成年大脑中的各种作用，但SLC4A10 - / - 小鼠的皮质似乎非常完整。与突触标记的共同染色表明，在神经元中，SLC4A10定位于抑制性，但不能兴奋性的午睡。这些发现得到了我们的功能研究的支持，该研究表明，在SLC4A10 - / - 小鼠中释放了抑制性神经肌群的释放，而兴奋性神经递质谷氨酸的释放则保留了。对细胞内pH的操纵部分挽救了GABA释放。我们的研究共同定义了一种与SLC4A10中双重性致病变异相关的新型神经发育障碍，并强调了SLC4A10功能丧失对脑发育，突触传播和网络特性的进一步分析的重要性。
引用 Ye X, Yu F, Zhou J, Zhao C, Wu J 和 Ni X (2023) 使用 metatag 分析胃食管反流病儿童的肠道菌群
胃食管反流病(GERD)是指胃内容物反流至食管，引起相应食管症状和/或并发症的疾病，典型症状为烧心、反流、胸痛，还可引起慢性咳嗽、哮喘、吸入性肺炎、咽炎等食管外症状，严重影响患者生活质量。GERD在西方国家的发病率为10%～20%，在亚洲为5.2%～18.3%（Jung，2011）。根据内镜表现分为非糜烂性反流病(NERD)、反流食管炎(RE)和Barrett食管(BE)三种类型。传统观点认为GERD的病理改变主要是胃酸或十二指肠胆汁反流刺激食管黏膜产生的化学性损伤所致，随着病情进展，病变逐渐累及黏膜层、黏膜下层、肌层及浆膜层。但大多数GERD患者在内镜下并无黏膜损伤，提示可能存在其他致病过程（Boeckxstaens et al., 2014; D'Souza et al., 2021; Sharma and Yadlapati, 2021）。近期研究表明，肠道菌群与宿主免疫系统的相互作用在胃肠道疾病（包括食管相关疾病）的发病机制中起关键作用（Gorkiewicz and Moschen, 2018; Dicks, 2022）。肠道菌群的多样性、稳定性、弹性和对生理、病理和环境变化的响应性使其成为许多疾病的有用生物标志物、诊断工具或治疗靶点（Magnusdottir et al., 2017; von Frieling et al., 2018）。虽然对GERD患者菌群的研究取得了一些进展，但之前的研究大多集中在食管和胃内的微生物。研究表明，正常人食管菌群主要由厚壁菌门中的革兰氏阳性链球菌组成（Hunt and Yaghoobi，2017；Deshpande et al., 2018）。然而，研究发现GERD患者食管内以拟杆菌门、变形菌门和梭杆菌门中的革兰氏阴性厌氧菌和微量需氧菌为主（Yang et al.，2009；Yu et al.，2019）。此外，慢性炎症已被证明在多种胃肠道疾病（如BE和食管癌）的发展中发挥作用，而慢性炎症引起的肠道菌群变化则进一步加速疾病的发生和发展（Ghoshal et al.，2012）。脂多糖（LPS）是革兰氏阴性菌外膜的重要组成部分，可能通过诱导NF-κB的表达来促进组织炎症。在动物模型中，高脂饮食通过调节肠道菌群上调炎症信号通路中的 IL-8/CXCL1 来促进 BE 进展为食管癌（Munch et al., 2019），证实了肠道菌群在疾病进展中的作用。GERD 患者肠道菌群的组成和功能仍在很大程度上未知，并且已经证明肠道菌群通过将宿主营养物质转化为