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针对肝细胞癌的新型尿液游离 DNA 甲基化标记
开发了一种优化的针对肝细胞癌 (HCC) 的甲基化下一代测序检测方法，可直接从尿液中发现与 HCC 相关的甲基化标记物，以进行 HCC 筛查。从 31 名非 HCC 和 30 名 HCC 患者的发现队列中分离的尿液无细胞 DNA (ucfDNA) 用于生物标志物发现，鉴定出 29 个具有差异甲基化区域 (DMR) 的基因。开发了甲基化特异性 qPCR (MSqPCR) 检测方法以验证对应于 8 个基因 (GRASP、CCND2、HOXA9、BMP4、VIM、EMX1、SFRP1 和 ECE) 的选定 DMR。使用存档的 ucfDNA，发现 HCC 患者和非 HCC 患者的 GRASP、HOXA9、BMP4 和 ECE1 的甲基化存在显著差异 (p < 0.05)。使用逻辑回归模型，在 87 名非 HCC 患者和 78 名 HCC 患者的独立训练队列中，将这四种标记物与之前报道的 GSTP1 和 RASSF1A 标记物作为 6 种标记物组合进行评估。6 种标记物组合与 AFP 的 AUROC 为 0.908（95% CI，0.8656–0.9252），显著高于单独使用 AFP（AUROC 0.841（95% CI，0.778–0.904），p = 0.0026）。应用后向选择方法，发现 4 种标记物组合与 6 种标记物组合的性能相似，AFP 的敏感性为 80%，而单独使用 AFP 的敏感性为 29.5%，特异性为 85%。这项研究支持甲基化跨肾 ucfDNA 在 HCC 筛查中的潜在应用。
发现游离糖化胺和糖化尿素作为糖尿病肾病的潜在标志季节性脑收缩和再生的分子机制
（未通过同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。此预印本版的版权持有人于2024年2月23日发布。 https://doi.org/10.1101/2023.10.02.560485 doi：Biorxiv Preprint
Au纳米颗粒装饰了还原的石墨烯氧化石墨烯及其用于标签游离多巴胺检测的电分析表征
基于Au纳米颗粒（NPS）的新型杂化纳米复合材料的胶体合成，通过– rating在1-氨基吡啶（AP）功能官能化的氧化石墨烯（RGO）上堆叠进行了优化，以探索实验参数对最终纳米结构的影响的影响。所得的纳米复合材料在有机溶剂中表现出可分散性，以修饰筛网碳电极。电化学分析揭示了多巴胺检测能力。AP链接器促进了NP-RGO电子耦合，影响电导率和AU NP大小依赖性电分析活性。混合纳米植物对多巴胺的确定表现出了优越的电效率，展示了现代医学中护理生物标志物监测的潜力。
游离DNA羟甲基化谱分析显示抗PD
靶向程序性死亡-1（PD-1）的免疫检查点抑制剂（ICI）的抽象背景处理可以产生持久的抗肿瘤反应，但并非所有患者都对ICIS做出反应。当前可以从抗PD-1治疗中受益的患者的当前方法不足。血浆衍生的无细胞DNA（CFDNA）的5-羟基甲基化（5HMC）分析提出了一种鉴定治疗反应生物标志物的新型非侵入性方法，可以应对与肿瘤活检（如肿瘤异质性和序列样品收集）相关的挑战。方法在治疗开始之前，在治疗期间从多个时间点收集了31例非小细胞肺癌（NSCLC）患者的血液样本。血液样品以获得血浆来源的CFDNA，然后通过两步化学通过生物素化来富集5HMC-含有CfDNA片段，并与链霉亲蛋白涂层的珠结合。5HMC增强的CFDNA和整个基因组库是并行制备的，并测序分别获得整个羟基甲基甲基和整个基因组血浆谱。的结果比较了相同患者的治疗时间点与匹配的预处理样品的结果比较表明，抗PD-1治疗诱导了反应患者的血浆CFDNA 5HMC概况的明显变化，相对于非响应者，固体瘤的反应评估标准判断。在响应者中，5HMC积累了参与免疫激活的基因，例如Inteferon（IFN） - γ和IFN-α反应，炎症反应和肿瘤坏死因子（TNF） - α信号传导，而在非反应者中，5HMC在5HMC中的5HMC对膜层面上的质量增加了5HMC。分子对抗PD-1处理的反应，如第一个治疗周期，从初期观察到血浆CFDNA谱的5HMC变化。对预处理血浆样品的比较表明，抗PD-1治疗反应和耐药性相关基因可以通过5HMC的血浆衍生CFDNA分析来捕获。此外，预处理血浆样品的5HMC分析能够使用T细胞发炎的基因表达谱区将反应者与非反应者区分开，该基因表达谱是先前通过组织RNA分析鉴定的。
游离DNA检测早期胰腺癌
ben-ami ，1 Qiao-li Wang，Ana Babic，2 Ehsan Irajizas，4个桌子David，6 Zick的6福音，6 Ayala Hubert，6 Daniel Neiman，Natalia，Natalia，Natalia Boos，2 Jajoo Society，2 Jajoo Society，2 Jajoo Society，8 Linda Lee，Stanganger，Stanganger，，，Stanger，，，Stanger，，，Stanger，，，Stanger，，，Stanger，，Stanger，，Stanger，，，Stanger，，Stanger，，Stanger，，，地，
供体来源的游离 DNA：有吸引力的生物标记物寻求使用环境
寻找用于肾移植监测临床应用的生物标志物有时似乎是一项诱人的折磨。关于供体来源的游离 DNA (dd-cfDNA) 在移植后监测中的潜在应用的第一个暗示可以追溯到 25 年前 [ 1 ]。dd-cfDNA 主要在细胞死亡时由供体组织细胞（移植物细胞或移植物内的供体造血细胞）特异性释放，与移植物状态紧密相关，因此是一种很有前途的非侵入性生物标志物（图 1 ）。更全面、可扩展的 DNA 测序技术的进步，再加上 cfDNA 的易获取性和较短的半衰期，为开发用于测量移植接受者血浆中 dd-cfDNA 的商业化检测方法铺平了道路。在过去 10 年中，在证明了分析的稳健性之后，这些检测方法已在肾移植接受者的临床实践中得到验证，并始终证明血浆 dd-cfDNA 水平与移植物损伤之间存在显着相关性 [2-5]。这些有希望的发现促使临床采用 dd-cfDNA 检测来监测美国肾移植接受者的移植物排斥和损伤的发生情况。这得益于 2017 年的医疗保险报销以及多家商业支付方的积极承保决定。然而，在欧洲，dd-cfDNA 检测在临床实践中的应用
供体来源的游离 DNA (dd-cfDNA)
27. Shultz, J., MD、Stehlik, J., MD、FACC 和美国心脏病学会 (2022) 供体来源的无细胞 DNA 监测在心脏移植中的出现：排斥监测的未来。网址：https://www.acc.org/latest-in-cardiology/articles/2022/05/05/12/45/emergence-of-donor-derived-cell-free-dna-monitoring-for-heart-transplant。
1671 例晚期胆道癌患者的游离 DNA 变异的临床情况
1 美国波士顿哈佛医学院丹娜—法伯癌症研究所肿瘤内科系；2 法国维尔瑞夫巴黎萨克雷大学、古斯塔夫·鲁西研究所、法国国家健康与医学研究院 U981、肿瘤学预测生物标志物和新型治疗策略；3 波士顿麻省总医院/哈佛医学院病理学系综合诊断中心；4 波士顿哈佛医学院麻省总医院癌症中心医学系；5 杰克逊维尔梅奥诊所血液学/肿瘤学分部；6 达勒姆杜克大学医学院；7 帕洛阿尔托斯坦大学医学院医学系肿瘤学分部；8 旧金山加州大学旧金山分校海伦·迪勒家庭综合癌症中心；9 美国图森亚利桑那大学癌症中心；10 巴西圣保罗以色列爱因斯坦医院； 11 华盛顿大学实验室医学与病理学系，西雅图；12 芝加哥大学医学院，芝加哥；13 美国德克萨斯大学 MD 安德森癌症中心胃肠道肿瘤内科肿瘤医学分部，休斯顿；14 上海嘉会国际肿瘤中心，吉豪医疗；15 上海天境生物制药有限公司，中国；16 华盛顿大学医学系，圣路易斯；17 梅奥诊所血液学/肿瘤学分部，斯科茨代尔；18 Guardant Health 医学事务部，雷德伍德城，美国
血浆游离 DNA 中甲基组学和片段组学的多模态分析用于多癌症早期检测和定位
保留所有权利。未经许可不得重复使用。 （未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 medRxiv 永久展示预印本的许可。