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靶向程序性死亡-1(PD-1)的免疫检查点抑制剂(ICI)的抽象背景处理可以产生持久的抗肿瘤反应,但并非所有患者都对ICIS做出反应。当前可以从抗PD-1治疗中受益的患者的当前方法不足。血浆衍生的无细胞DNA(CFDNA)的5-羟基甲基化(5HMC)分析提出了一种鉴定治疗反应生物标志物的新型非侵入性方法,可以应对与肿瘤活检(如肿瘤异质性和序列样品收集)相关的挑战。方法在治疗开始之前,在治疗期间从多个时间点收集了31例非小细胞肺癌(NSCLC)患者的血液样本。血液样品以获得血浆来源的CFDNA,然后通过两步化学通过生物素化来富集5HMC-含有CfDNA片段,并与链霉亲蛋白涂层的珠结合。5HMC增强的CFDNA和整个基因组库是并行制备的,并测序分别获得整个羟基甲基甲基和整个基因组血浆谱。的结果比较了相同患者的治疗时间点与匹配的预处理样品的结果比较表明,抗PD-1治疗诱导了反应患者的血浆CFDNA 5HMC概况的明显变化,相对于非响应者,固体瘤的反应评估标准判断。在响应者中,5HMC积累了参与免疫激活的基因,例如Inteferon(IFN) - γ和IFN-α反应,炎症反应和肿瘤坏死因子(TNF) - α信号传导,而在非反应者中,5HMC在5HMC中的5HMC对膜层面上的质量增加了5HMC。分子对抗PD-1处理的反应,如第一个治疗周期,从初期观察到血浆CFDNA谱的5HMC变化。对预处理血浆样品的比较表明,抗PD-1治疗反应和耐药性相关基因可以通过5HMC的血浆衍生CFDNA分析来捕获。此外,预处理血浆样品的5HMC分析能够使用T细胞发炎的基因表达谱区将反应者与非反应者区分开,该基因表达谱是先前通过组织RNA分析鉴定的。

游离DNA羟甲基化谱分析显示抗PD

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