图 1 超声逆向 PCR (SIP) 的可视化表示。图中使用的缩写包括 KoRV — 考拉逆转录病毒、LTR — 长末端重复、pol — 聚合酶基因。 (a) 整合到考拉基因组 DNA 中的 KoRV 原病毒以典型的 LTR 区域 (绿色框) 和逆转录病毒基因 (蓝色框) 两侧的形式显示。注意:为简单起见,仅以图表形式表示 pol 基因 (红色框) 的大致位置。 (b) 使用超声处理将考拉基因组 DNA 碎裂成平均长度为 2-7 kb 的片段。然后对碎裂的 DNA 进行平端修复和磷酸化 (未显示)。 (c) 随后将样品分成两部分:非适配器组 (c1) 和适配器组 (c2)。非接头组在环化之前未进行任何修改,而接头组在 DNA 分子的两端连接有相同的接头序列(黄色框),用于辅助解释环化和扩增后的倒置扩增子序列。(d)接头组和非接头组均环化,从而产生环状 DNA 模板。(e)环状 DNA 模板用两组针对 KoRV 的 pol 和 LTR 区域的引物进行扩增。没有这些引物结合位点的环状模板不会扩增。(f)扩增和测序产物被倒置,引物结合位点位于扩增子的侧翼。产生了两种主要类型的 PCR 产物:(i)由 LTR 引物扩增的 PCR 产物和(ii)由 pol 引物扩增的 PCR 产物
10。L. J. Rono,H。G. Yayla,D。Y. Wang,M。F. Armstrong,R。R. R. Knowles,proton耦合电子传递启用了对映射光介毒催化:开发不对称的AZA AZA-PINACOL环化。j。am。化学。Soc。135,17735–17738(2013)。
• 线性分子比环状分子整合效率更高(约 5 倍)。• 一旦进入卵母细胞,线性分子就会环化。• 通常所有整合的分子都在同一染色体上,位于同一位置。• 多个副本通常以串联、头尾相连的方式排列。• DNA 分子的大小(0.7 – 50Kb)并不是一个重要参数。• 注射 DNA 的浓度和纯度至关重要(最高 1-3 µ g/ml)。
DNA 质粒是细胞培养实验中 RNA 和蛋白质传递和表达的重要工具之一。质粒的制备通常涉及繁琐的细菌克隆、验证和纯化过程。虽然可以从合同制造商处设计和订购表达质粒,但当需要大量质粒时,成本可能会过高。我们开发了一种高效的全合成方法和协议,能够在短短 3 小时内生产出包含表达元件的环化 DNA,这些元件可供转染,从而省去了细菌克隆步骤。该协议描述了如何将使用常用软件设计并从其中一个商业制造商处订购的线性双链 DNA 片段作为输入,然后以最少的动手时间有效地环化和纯化该 DNA 片段。作为该原理的证明,我们通过生产表达扩展的 Prime 编辑向导 RNA (epegRNA) 的 DNA 来展示该方法的功能,用于细胞培养基因组编辑。该方法不仅限于基因编辑,还可用于需要表达短 RNA 和蛋白质的各种应用。速度快、成本低、使用方便,将使该方法成为基因编辑工具包中的另一个有价值的工具,而且由于反应简单,该方案可以轻松实现自动化。
b'genation 的 C3 和 C2 位尚未开发。在此,我们报道了一种无催化剂获取 1-芳基 2,3-二碘咔唑 [7,8] 的方法,其中涉及碘转位(方案 1D)。值得注意的是,我们的方案允许在三个连续位置 [9] 即 C1、C2 和 C3 对咔唑核心进行可控官能化。环化前体 (碘吲哚基)炔醇 1a \xe2\x80\x93 n 是使用已知程序由适当的吲哚-2-甲醛制备的。[5] 我们的旅程始于研究苯基取代炔醇 1a 作为模型底物的反应(表 1)。 [10] 我们研究了 1a 与几种碘化试剂(如 I 2 、NIS、ICl 和 Ipy 2 BF 4 )的反应。在碳酸钠存在下,在异丙醇中,在 15 °C 下使用 ICl [11] 可有效实现串联碘环化-碘移位。使用 1.1 倍过量的 ICl 可得到三环 2a ,产率为 50%(表 1,条目 5),而使用 2.5 倍过量的 ICl 可得到所需的杂环,产率为 60%(表 1,条目 3)。通过对粗反应混合物进行 TLC 和 1 H NMR 分析观察到总转化率,未检测到副产物或聚合反应。然而,在柱层析纯化 2,3-二碘-咔唑 2a 的过程中观察到一些分解,这可能是导致分离产率适中的原因。值得注意的是,重排的 1-苯基-2,3-二碘-咔唑 2a 是唯一的区域异构体。使用有机碱代替 K 2 CO 3 或不同的溶剂'
鉴于与肽稳定性相关的挑战,制定提高肽稳定性的策略至关重要。以下是一些可用于提高肽稳定性的策略:化学修饰可用于通过改变肽的性质(例如电荷、疏水性和构象稳定性)来提高肽稳定性。例如,环化可以通过降低构象灵活性和增加对蛋白酶降解的抵抗力来提高肽的稳定性。肽类似物是经过修饰以提高其稳定性和生物活性的肽。这些修饰可以包括添加非天然氨基酸、修饰肽键和掺入肽模拟物 [3]。
摘要:使用基于生物的聚合物是减少对石化物质的依赖的一种有前途的方法。此外,解聚引起了聚合物在寿命末期的崩溃或获得特定刺激反应功能的重大关注。但是,结合这两种功能的聚合物的设计仍然是一个挑战。在此,我们报告了一类新的自免糖聚合物,该聚合物通过硫蛋白衍生的醛通过硫醇烯击聚合化。这些聚合物可以进一步用于聚合物聚合物偶联以访问块共聚物。此外,可以通过单个polmer前体的聚合后功能化来引入各种响应式终端盖。这些基于生物的自暴力聚合物通过交替的1,6-消除和环化反应而对特定刺激进行级联反应。
图1:A)Porphyran重复部分的化学结构。硫酸化二糖 - 卟啉二糖 - 可以在D-半乳糖的位置呈现甲基,给出甲基化和未甲基化的卟啉成分。通过生物合成期间L-乳糖残基的脱硫/环化获得的琼脂糖单位是相应甲基化的。b)B。plebieus porphyran pul的组织。基于先前的转录组分析,将PUL分为三个段(PUL -PORA,-POR B和-PORC)。当在Porphyran存在下生长B. plebieus时,将BACPLE_01692到BACPLE_01699基因(称为Pul-Pora)被中度上调。这与基因的两个相邻簇:BACPLE_01668到BACPLE_01689(PUL-PORC)和BACPLE_01700到BACPLE_01706(PUL-PORB),它们被高度上调(比PUL-PORA多10倍)[16]。在(1)[16],(2)[17],[18]和(4)本研究中确定酶功能。