药物 - 靶相互作用(DTI)被认为是基因组药物发现的重要组成部分,DTI的计算预测可以加速到靶标的铅药物,这可以弥补缺乏耗时且昂贵的湿湿技术技术。当前,许多计算方法基于药物和靶标的顺序组成或理化特性来预测DTI,但是需要进一步的努力来改善它们。在本文中,我们提出了一种基于序列的新方法,以准确识别DTI。对于目标蛋白质,我们使用来自变压器(BERT)的预训练的双向编码器表示探索,以提取序列特征,这些序列特征可以提供独特而有价值的模式信息。对于药物分子,使用离散小波变换(DWT)来从药物分子纤维固定物中产生信息。然后,我们将DTI的特征向量加以连接,然后将它们输入由批处理层,矩阵线性激活层和线性层组成的特征提取模块,称为BRL块和称为卷积神经网络模块,以进一步提取DTIS。随后,将BRL块用作预测引擎。基于对比度损失和跨透明镜损失优化模型后,它给出了G蛋白偶联受体,离子通道,酶和核受体的靶族的预测准确性,最高为90.1、94.7、94.9和89%,这表明该建议的方法可以超过现有的预测者。提出的方法也可能是其他DIT的潜在选择。为了使研究人员尽可能方便,新预测器的Web服务器可自由访问:https://bioinfo.jcu.edu.edu.cn/dtibert或http://http://121.36.221.79/dtibert/。
摘要:碳纳米植物是一类碳纳米 - 合金支出,已通过来自各种前体的不同途径和方法合成。所选的前体,合成方法和条件可以强烈改变所得材料及其预期应用的理化特性。在此,通过将热解和化学氧化方法结合使用D-葡萄糖从D-葡萄糖中合成碳纳米植物(CND)。在产物和量子产率上研究了热解温度,氧化剂的等效物和回流时间的影响。在最佳条件下(300°C的热解温度,4.41等于H 2 O 2,90分钟的回流)CNDS分别获得了40%和3.6%的产品和量子收率。获得的CND被负电荷(ζ - -potential = - 32 mV),非常分散在水中,平均直径为2.2 nm。此外,在CNDS合成过程中,引入了氢氧化铵(NH 4 OH)作为脱水和/或钝化剂,导致产物和量子产率的显着提高约为1.5和3.76倍。合成的CND显示出针对不同革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌菌株的广泛抗菌活性。两个合成的CND都会导致高度菌落形成单位还原(CFU),大多数测试细菌菌株的范围从98%至99.99%。然而,在没有NH 4 OH的情况下合成的CND,由于充满氧化基团的负电荷的表面,在区域抑制和最小抑制浓度方面表现更好。含有高氧纳米模型的抗菌活性升高与其ROS形成能力直接相关。关键字:D-葡萄糖,热解,氧化,细菌感染,最小抑制浓度,CFU降低■简介
Salmonella Kentucky带来的全球公共卫生风险(S。肯塔基州)正在上升,特别是由于人类和动物种群中抗菌抗性基因的传播。这种血清在非洲普遍存在,已成为人类非脑性胃肠炎的显着原因。在这项研究中,我们使用了一种生物信息学方法来开发基于肽外膜蛋白A,C和F的基于肽的疫苗。肯塔基州。此外,我们采用了鼠伤寒沙门氏菌的鞭毛蛋白(FLIC)(s。鼠伤寒)作为增强疫苗有效性的佐剂。通过这种方法,我们确定了14个CD8+和7个CD4+ T细胞表位,这些表位预先限制为各种MHC I类和MHC II类等位基因。预计的表皮预计将在疫苗配方中使用时达到94.91%的覆盖率。此外,我们确定了七个高度免疫原性的线性B细胞表位和三个构象B细胞表位。然后,使用适当的接头将这些T细胞和B细胞表位连接起来,以创建多角色疫苗(MEV)。增强了肽构建体的免疫原性,从s。鼠伤寒在N末端包括在内。由此产生的MEV结构表现出高结构质量和有利的理化特性。通过Toll样受体1、2、4和5进行了分子对接研究,然后进行分子动力学模拟,表明疫苗受体综合在能量上是可行的,稳定的和健壮的。免疫模拟结果表明,MEV引起的显着反应,包括IgG,IgM,CD8+ T细胞,CD4+ T-细胞和各种细胞因子(IFN-γ,TGF-β,IL-2,IL-10和IL-12),以及抗原水平的显着降低。尽管有这些有希望的内部发现结果,但进一步验证
环境问题激发了人们寻求更可持续和更安全的溶剂,旨在取代工业过程中的侵略性和有害化学产品。响应这种需求,深层溶剂(DES)已成为离子液体的逐步进化。这些创新的溶剂是由两种或多种化学化合物的协同组合引起的,当在特定的摩尔级分中混合时,熔点显着降低,最终在室温下实现了液态。近年来,一种自然变体称为天然深色溶剂(NADE)已获得突出。这种环境友好的替代方法是通过巧妙地结合糖,氨基酸或有机酸等化合物的巧妙结合,为可持续和环保化学过程提供了有希望的途径。这些“绿色”溶剂超出了化学或材料工程中的应用,在诸如生物催化,提取过程和二氧化碳捕获等不同领域中找到了应用。尽管他们的顾问众多,包括低成本,易于准备,可调性和生物效果,但由于理解不足,DES的全部潜力仍然难以捉摸,从而阻碍了他们无缝整合到工业应用中。虽然先前的评论主要集中于定义和展示DES的应用,但它们经常忽略物理化学表征的关键方面。类似于其他溶剂类别,DES的理化特性,例如极性,粘度,密度和电导率在确定其适用性方面起着关键作用。认识到这一差距,本综述的主要目标是提供一个实用的指南,其中包括DES的准备,表征和应用,从而为研究人员和从业人员都提供了对这些溶剂的全面理解。此外,手稿将深入研究DES的各种类型,探索其独特的物理化学特性和针对各种不同领域的各种应用程序量身定制的潜在修改。
摘要:当前的研究趋势已在各种空间任务中大规模地使用了“绿色推进剂”的使用;主要出于环境可持续性和安全问题。小型卫星,尤其是微型和纳米卫星,从被动行星孔发展到能够执行可能需要高推动冲动能力的主动轨道操作。因此,需要在船上和辅助推进系统上执行此类轨道操作。初级推进系统设计中的新颖性要求特别关注微型化,这可以通过上述轨道传递能力来实现,通过使用绿色单核剂,由于其相对的高性能以及与气态和二线化剂相比,尤其是用于微型型系统的相比,它们的相对高性能以及更好的可保持性。由于绿色 - 普罗普尔领域正在进行的快速研究活动,有必要广泛研究和收集各种绿色单opelt剂性能和绩效的数据,这些数据将进一步帮助分析师和设计师进行液体推进系统的研究和开发。这篇评论追溯了绿色单opello剂的历史和起源,以及经过深入研究此类推进剂的理化特性后,可以将绿色单opel剂分类为三个主要类别:能量离子液体(EILS),液体NOX NOX单核纤维素和氢过氧化物溶液(HPAS)。通过不同的推进系统配置讨论了绿色单opell剂的某些应用,例如:多模式,二模式和化学 - 电动推进。此外,列表的数据和性能比较将在使用分析工具(例如:火箭推进分析(RPA)和NASA CEA)方面为工程师和科学家提供有关化学推进系统分析和设计的工程师和科学家。尽管在许多空间应用中广泛提出和使用了空间(即AF-M315E和LMP-103S)(即AF-M315E和LMP-103S),但调查的调查表明,NOX燃料混合物具有最高的性能,而HPA的HPAS也会产生最低的性能。
消费发动机的处置由于其有毒和持续性的性质而引起了重大的环境挑战。这项研究旨在隔离能够降解用过的发动机油的微生物,并具有开发生态友好的生物化策略的最终目标。收集了来自自动修复设施和工业场所的土壤和水样,并使用矿物质盐琼脂培养基(MSA)培养基筛选用于耗尽的机油降解微生物。隔离菌株,以获取利用用过的发动机油的能力。监测的其他参数是温度和pH。采用16S rRNA基因测序来鉴定分子水平的分离的微生物。BLAST计划显示,包括细菌(3)和真菌(2)群体在内的七(5)个分离株的多样化阵列,表明涉及丰富的微生物多样性,涉及耗尽发动机油的脱机。分离株被鉴定为细菌(Sa1-苏云金芽孢杆菌,Sa6-bacillus Cereus和SB5-Alcanivorax borkumensis)和真菌(Sa5- aspergillus Niger和SC3-Aspergillus flavus)。石油降解率的百分比为SA5(43.80%)> SA1(29.17%)> SB5(28.82%)> SC3(6.07%)。与细菌相比,真菌分离物,尼日尔SA5-刺激性尼日尔的发动机油降解速率显着(P <0.05)。这项研究不仅证明了细菌的潜力,而且还表明了本地真菌群落在减轻用过的发动机油的环境影响方面的潜力。它还为未来的研究提供了一个基础,该研究重点是优化复杂的烃污染物的生物降解。关键字:生物修复,酶活性,碳氢化合物降解细菌,碳氢化合物真菌简介主要由碳和氢组成的碳氢化合物是原油的必不可少的组成部分,一种复杂的混合物,它包含氧气,硫,硫,氮气,氮气以及跟踪的含量。固化后的石油产物获得了改变的理化特性,从而增强了复杂性并可能阻碍其生物降解(Logeshwaran等,2018)。石油工业的污泥中含有污染物,例如碳氢化合物,硫化物和氨
近来,啤酒厂和饮料公司对开发有别于传统啤酒风格的创新啤酒品种很感兴趣,这些啤酒要么酒精含量低(<2.5% 体积酒精度 (ABV))要么完全不含酒精(<0.5% ABV)。传统啤酒(ABV 高达 10%)含有许多内在和外在因素,可防止病原体增殖或繁殖。低 pH 值、乙醇和啤酒花酸的存在、有限的氧气以及特殊的加工技术(包括麦汁煮沸、巴氏灭菌、过滤、冷藏和处理)等理化特性均有助于微生物稳定性和安全性。这些抗菌屏障中的一个或多个可能发生变化或缺失,可能导致最终产品易受病原体存活和生长的影响。本研究评估了 pH 值、储存温度和乙醇浓度对低酒精和无酒精啤酒中食源性病原体生长或死亡的影响。 pH 值和乙醇浓度分别从初始值 3.65 和 <0.50% ABV 调整为 pH 4.20、4.60 和 4.80;以及 3.20 ABV。样品分别接种大肠杆菌 O157:H7、肠道沙门氏菌和单核细胞增生李斯特菌的五种菌株混合物,然后在两个不同的温度(4 和 14°C)下储存 63 天。使用选择性琼脂在 35°C 下孵育进行微生物计数。结果表明,与低酒精啤酒相比,无酒精啤酒允许病原体生长和存活。大肠杆菌 O157:H7 和肠道沙门氏菌在 14°C 时生长约 2.00 对数,但在 4°CL 下未观察到生长,单核细胞增生李斯特菌更敏感,在所有测试条件下都迅速降至或低于检测限。结果表明,储存温度对于防止病原体的生长至关重要。pH 值似乎对病原体的存活没有显著影响(p < 0.05)。这项挑战性研究表明,饮料制造商需要优先考虑和维护食品安全计划,以及针对低酒精和无酒精啤酒制造商的具体做法。
背景:肝细胞癌(HCC)是癌症相关死亡的主要原因之一。Sorafenib是该疾病的一线疗法,与降低的治疗功效有关,可以通过与selumetinib结合来克服这种疗效。在这种情况下,这项工作的主要目标是开发一个新的纳米系统,该系统由含有靶向配体GalNAC的脂质双层涂层的聚合物核心组成,以专门有效地将两种药物分配到HCC细胞中,以显着提高其治疗效率。方法:混合纳米系统(HNP)的物理化学表征及其成分是通过动态光散射,ZETA电位,基质辅助激光解吸电离的电离 - 飞行质量光谱的时间 - 飞行质量光谱的时间和透射电子微观。细胞结合,摄取和HNP的特异性通过流式细胞和共聚焦显微镜评估。通过Alamar Blue Assay评估了治疗活性:通过:细胞活力;使用FITC-ANNEXIN V通过流式细胞术进行细胞死亡;胱天蛋白酶活性通过发光;通过流式细胞仪的线粒体膜电位;通过蛋白质印迹和分子靶水平。结果:获得的数据表明,这些混合纳米系统具有两种药物的较高稳定性和载荷能力,以及合适的理化特性,即在大小和表面电荷方面。此外,生成的制剂允许绕过耐药性并具有高特异性,从而促进了HCC细胞中的大细胞死亡水平,但不能在非肿瘤细胞中。通过增加的编程细胞死亡来实现共同载体药物的抗肿瘤作用的增强,这与线粒体膜电位的强烈降低相关,caspase 3/7和caspase 9的活性显着增加,并大量增加附属蛋白V-v-p-p-p-p-p-py-py-py-PORSISTIS的细胞。结论:开发的配方产生了较高且协同的抗肿瘤作用,揭示了改善针对HCC治疗方法的转化潜力。关键字:肝细胞癌,混合纳米系统,药物输送,Galnac,Sorafenib,Selumetinib
目标策略[3]。这篇综述的目的是全面概述一般抽样方法以及在体内研究中收集的皮肤组织样品的相应预处理和提取方法,以通过液态色谱量化小分子在体内研究中,通过液相色谱偶联到质谱(LC – MS)。从血浆中的药物分布到皮肤的分布具有临床重要性,例如为了改善皮肤感染的治疗策略。皮肤中药物的摄取取决于药物的理化特性和所使用的管理途径。局部给药对于皮肤相关疾病的局部治疗有效,例如arthralin乳霜和局部类固醇用于治疗牛皮癣[4]。系统给药是例如用于治疗真菌皮肤感染[5]或基于注射的生物学(如adalimumab)治疗牛皮癣[6](6]),用于治疗真菌皮肤感染[5]。皮肤采样技术的侵入性以及所得的皮肤样品的性质对在这些样品中提取,检测和量化分离的生物分析程序具有各种影响。组织样品通常仅在体积中很小,而与血浆样品相比,生物分析测定的量化量相对较低。皮肤组织被分类为“硬”组织,这意味着样品需要更强大的样品制备,而将其分类为“软”或“硬” [2]。由于这些因素,两种超敏感生物分析方法,例如从这些皮肤样品(角质层,表皮和真皮层)中释放出感兴趣的分析物需要严格的样品预处理方法,同时导致许多其他许多内源性基质成分的释放。矩阵效应往往更为明显[7]。与血浆相比,从组织样品中确定分析物的真实回收也更具挑战性[8]。使用与串联质谱法(LC -MS/MS)结合的液相色谱法,以及适当的样品制备和提取方法对于分析皮肤组织样品分析物的分析至关重要。据我们所知,尚未发表有关皮肤组织样品的样品制备,用于提取和定量药物化合物的样品。 本综述进一步阐述了有关组织样品测量的质量和复杂性的生物分析考虑因素。据我们所知,尚未发表有关皮肤组织样品的样品制备,用于提取和定量药物化合物的样品。本综述进一步阐述了有关组织样品测量的质量和复杂性的生物分析考虑因素。
Location (TBD) Monday & Thursday 10:20 am-11:40 am KiBum Lee , Distinguished Professor Office Hours: Mon & Thurs after class and by appointment Department of Chemistry and Chemical Biology Office: CCB 3312, Chemistry Building Rutgers, The State University of New Jersey Email: kblee@rutgers.edu TEL: 848-445-2081 Websites: http://kblee.rutgers.edu/课程描述和目标:“纳米化学中的概念”是一门课程,探讨了纳米科学和纳米技术的边界,这两个领域彻底改变了材料科学并扩展了化学应用。该课程的重点是纳米科学和纳米技术,将化学科学和生物学的精度与纳米级材料的变革潜力结合在一起。本课程探讨了熟练的化学家可以创建,合成和修饰具有独特物理化学特性的纳米材料的想法,从而产生从分子到纳米级的复杂纳米结构。超越了传统的化学/材料教育,该课程增强了学生的技能和知识基础。学生将探索创新的纳米材料的合成和定制,例如石墨烯,脂质纳米颗粒和磁性纳米颗粒,及其在实际应用中的作用,尤其是在药物设计,开发和提供治疗分子中。该课程将研究纳米材料如何彻底改变制药行业,通过提高药物溶解度,生物利用度,有针对性的交付和受控释放来解决现代医学的挑战。❖模块1:纳米化学的基础本课程的重要部分着重于了解所需的药物设计应用如何影响纳米材料的理化特性,从而指导其合成和功能化过程。本课程的目的是为纳米化学提供全面的了解,尤其是其与药物科学的交汇处,向各个学术层面的学生提供。课程涵盖了关键主题,例如纳米医学,分子成像,晚期药物/基因输送系统以及纳米比奥设备和系统的开发。这些主题不仅代表了纳米化学中的核心应用,而且还强调了纳米技术在药物发现和治疗策略中的变革性影响。在课程结束时,学生将在纳米化学方面获得理论基础,并在其在药物设计和交付治疗剂中的应用方面具有实践见解。这种知识对于有抱负的科学家和创新者至关重要的是,旨在将纳米化学原则应用于开发更有效,有针对性和患者友好的治疗解决方案,从而有助于尖端的药物研究和开发。