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846749.pdf - 亚琛工业大学出版物
应变促进炔烃-叠氮化物环加成 (SPAAC) 已成为生物正交结合和表面固定中不可或缺的工具。虽然许多研究都集中于增强环辛炔的反应性，但是仍然缺少一种无需任何复杂设施即可评估环辛炔-叠氮化物固定化结合效率的简便方法。在本研究中，与荧光团或生物素部分连接的二苯并环辛炔/双环壬炔 (DBCO/BCN) 的不同衍生物被图案化在超低污染聚合物刷上，这可以在不进行任何先前的封闭步骤的情况下避免非特异性蛋白质污染。聚合物刷由防污底部嵌段和叠氮化物封端的顶部嵌段组成。使用普通荧光显微镜对通过微通道悬臂点样 ( μ CS) 点样的有序阵列进行结合效率的评估。两种环辛炔均通过 μ CS 与含叠氮化物的二嵌段聚合物刷表现出可靠的结合性能，但根据蛋白质结合试验，DBCO 显示出更高的分子固定表面密度。这项工作为选择合适的环辛炔与叠氮化物偶联提供了参考，并可用于设计用于分析物检测、细胞捕获和其他生物应用的生物传感器或生物平台。
双螺旋硫醇烯/ ... div>的高分辨率3D打印
高分辨率3D打印在微观尺度上对聚合物材料的定制处理可轻松访问光学，微功能，组织工程和生命科学领域中的高级应用程序。然而，在数十万微米（例如封闭的微流体通道）中，封闭结构的3D打印仍然是一个挑战，因为通道结构通常被残留的固化树脂堵塞。基于渗入硫醇二烯和硫醇/环氧化学的双粘液系统在制造或注射模压的微型流体设备中以无粘合性键合为众所周知。在此，提出了自定义的微流体设备的制造的显微镜中的第一个高分辨率立体光刻3D打印。在第一个固化步骤中，通过高分辨率3D打印开放的微流体结构。连续地，微通道在热启动时通过无粘性干键密封，产生良好的控制结构，通道尺寸降至80μm。在键合之前，中间材料允许用生物素定制表面修饰，从而可以连续固定各种生物分子。密封芯片中显示了具有特定模式的DNA生物测定。所提出的工作铺平了朝着制造自定义的微流体设备的道路，用于大量特定的生物测定。
金纳米粒子靶向递送顺铂
摘要：球形金纳米粒子 (GNP) 因其在生物医学应用方面的独特性质而受到广泛研究，作为药物靶向递送系统 (DTDS) 中的纳米载体而备受关注。表面功能化的可能性，特别是在延长血液中的半衰期和增强细胞摄取方面，为克服流行抗癌药物 (如顺铂) 的局限性提供了机会，这些药物由于非选择性运输而导致严重的副作用。在此，我们介绍了金纳米粒子-顺铂体系形成的研究 (关于反应动力学和平衡)，其中证明形成效率和稳定性在很大程度上取决于纳米粒子表面功能化。在本研究中，首次使用毛细管电泳结合电感耦合等离子体串联质谱 (CE-ICP-MS/MS) 来监测金-药物纳米缀合物的形成。研究包括优化 CE 分离条件和使用 CE-ICP-MS/MS 开发的方法确定反应动力学。为了表征纳米载体并描绘其表面过程引起的物理化学性质的变化，通过动态光散射 (DLS) 测量进行了额外的流体动力学尺寸和 ζ 电位。对三种功能化 GNP（GNP-PEG-COOH、GNP-PEG-OCH 3 和 GNP-PEG-生物素）的检查区分了药物结合效率和纳米结合物稳定性的本质差异。
虚拟筛选加速磷酸二酯酶9抑制剂在海藻酸盐毒性中具有神经保护作用的体外模型
寻求更可持续的策略来对比石材文化遗产的生物偏端化，因为它们对环境和健康的毒性和潜在影响，以找到合成杀菌剂的替代品。在这项研究中，测试了牛至和百里香精油（EOS）的应用，以控制佛罗伦萨大教堂外部大理石上的微生物生长，受到延长变暗影响。在原位应用之前，进行了预先测试，以评估EOS对大理石的干扰（在大理石样本上说比色和吸水）及其在抑制大理石菌群中的效率（对营养媒体的敏感性测试）。eos以非常低的浓度抑制从大教堂大理石中采样的整个可栽培的微生物群，而当它们用作2％溶液时，它们不会干扰未殖民大理石样品的颜色和吸水能力。然后，在佛罗伦萨大教堂的两个户外研究地点中，将两个EOS和商业生物剂生物素T用于大理石的原位试验中。通过多学科的原位非侵入性（比色法和ATP分析，显微镜）和EX PET（微生物可行滴度）测试来评估治疗方法的有效性。关于结果，我们发现了用于评估生存能力（可行和真菌可行滴度）的参数与活动（ATP测定）的良好对应关系，其中这些对应关系以及这些对应关系以及显微镜和比色。发现了一些差异，特别是通过可行的滴度，考虑到整个数据，在越来越多的情况下，使用牛至和百里香EOS的治疗对微生物群落有效。
Ancistrocladinium A诱导蛋白酶体抑制剂多发性骨髓瘤细胞的凋亡：一种有希望的治疗剂
摘要：N，C耦合的萘二喹啉生物碱Ancistrocladinium a属于具有有效抗体活性的新型天然产物。然而，尚未探索其对肿瘤细胞的影响。我们证明了多发性骨髓瘤（MM）中Ancistrocladinium a的抗肿瘤活性，这是一种无法治愈的血液癌，代表了适应蛋白毒性应激的模型疾病。生存能力测定显示，Ancistrocladinium a在MM细胞系中具有有效的凋亡诱导作用，包括具有蛋白酶体抑制剂（PI）耐药性和原代MM细胞的细胞系，但在非电气细胞中却没有。与PI CAR纤维纤维或组蛋白脱乙酰基酶抑制剂Panobinostat的伴随治疗强烈增强了Ancistrocladinium a诱导的细胞凋亡。质谱法具有生物素化的Ancistrocladinium a揭示了与RNA-剪接相关蛋白的显着富集。影响与RNA相关的RNA相关途径包括参与蛋白毒性应激反应的基因，例如PSMB5相关基因和热休克蛋白HSP90和HSP70。此外，我们发现了ATF4和ATM/H2AX途径的强烈诱导，在蛋白毒性和氧化应激之后，这两者都与综合细胞反应有关。综上所述，我们的数据表明，Ancistrocladinium a靶向MM中的细胞应激调节，并改善对PIS或克服PI耐药性的治疗反应，因此可能代表有希望的潜在治疗剂。
通过一致反馈抑制控制酶活性*
最近的研究-4关于微生物中天冬氨酸家族氨基酸生物合成的最终产物调节的研究揭示了存在几种神经控制模式。本报告描述了在光合细菌中观察到的一种现象，该现象为一个控制方案提供了一个基本元素，即，在分支的生物合成途径中，通过两种氨基酸源产物的同时作用。我们认为，这种效应可能被认为是一致的反馈抑制，它将被证明具有一般意义，尤其是在分支或相互连接的生物合成途径中。Materials and Methods.-Growth of bacteria: The strain of Rhodopseudomonas capsulatus used was a new isolate, with properties closely corresponding to those described by van Niel.5 It was grown photosynthetically in a synthetic medium identical to that specified by Ormerod et al.,6 except that the nitrogen source was 0.1 per cent L-glutamate instead of ammonium sulfate, and thiamine添加盐酸盐（1 mg/L）代替生物素。细胞，以制备提取物。酶制备：提取物是通过悬浮在0.05 m磷酸钾 + 0.02 m的声音破坏（10-kc示波器）中制备提取物，在氩气的大气下，磷酸钾 + 0.02 m，F-磁乙醇缓冲液pH 7.2。通过以18,500 x g离心30分钟来阐明Sonicate，然后在30,000 rpm下进行第二个离心16小时（Spinco RotorN1O。30）。饱和硫酸铵溶液，
二级代谢物具有由高海拔热液系统嗜热细菌产生的抗菌活性
嗜热微生物具有多种适应性在高温下繁殖的适应性，这反映为蛋白质和可热稳定分子的生物合成，隔离和培养代表了巨大的挑战，因此，高吞吐量测序可以使整个细菌基因组的筛查能够筛选出功能潜力，从而为识别和成本化的培养物进行识别，以识别鉴定和成本化的培养物。在这项研究中，我们从Atacama沙漠中的微生物垫中分离了两个与芽孢杆菌LB7和链霉菌LB8相对应的嗜热细菌菌株。通过结合基因组挖掘，靶向培养物和生化特征，我们旨在确定其与抗菌特性合成生物活性化合物的能力。此外，我们确定了在受控的体外测定下产生生物活性化合物的能力，并通过通过薄层色谱/质谱法（TLC/MS）确定其质量来检测。总体而言，这两种分离株都可以产生抗菌剂（例如，粘胺C副产物）和抗氧化剂（例如二羟基丙氨酸，酰胺生物素和黄酮副产物）化合物。Bacillus LB7菌株具有更多样化的曲目，其中51.95％的总代谢产物无与伦比，而链霉菌LB8主要偏爱抗氧化剂，但未分类的化合物中有70％以上，突显了研究和阐明新颖化合物结构的必要性。基于这些结果，我们假设未经文化或
发现参与的 RUF6 ncRNA 相互作用蛋白......
非编码 RNA（ncRNA）是恶性疟原虫免疫逃避和传播的新兴调节因子。RUF6 是一个由 RNA 聚合酶 III 转录但积极调节 Pol II – 转录 var 毒力基因家族的 ncRNA 基因家族。目前尚不清楚 RUF6 ncRNA 如何与下游效应物连接。我们开发了一种 RNA 引导的蛋白质组学发现 (ChIRP-MS) 方案来识别体内 RUF6 ncRNA - 蛋白质相互作用。用生物素化的反义寡核苷酸纯化 RUF6 ncRNA 相互作用组。定量无标记质谱法鉴定出几种与基因转录相关的独特蛋白质，包括 RNA Pol II 亚基、核小体组装蛋白和 DEAD 盒解旋酶 5 (DDX5) 的同源物。 Pf-DDX5 的亲和力纯化鉴定出最初由我们的 RUF6-ChIRP 方案发现的蛋白质，验证了该技术在鉴定恶性疟原虫中的 ncRNA 相互作用组方面的稳健性。核 Pf-DDX5 的诱导置换导致活性 var 基因的显着下调。我们的工作鉴定出一种 RUF6 ncRNA - 蛋白质复合物，它与 RNA Pol II 相互作用以维持 var 基因表达，包括一种可能解决 var 基因中 G-四链体二级结构以促进转录激活和进展的解旋酶。
基因组的随机组织和基于生物 - 安特纳阵列的能量信息进化学说
摘要。本文继续对真核基因组和原核基因组中长单链DNA序列的随机（概率）组织的矩阵tensor研究的矩阵tensor研究。作者揭示了每个基因组DNA的n文本表示中N型概率的相应矩阵在数值上以这种代数形式相互关联，该代数形式具有与已知的张量张量 - 数字天线阵列理论的形式主义的类比。这些阵列将许多单独的天线结合到单个协调的合奏中，并具有独特的新兴特性，因此天线阵列被广泛用于医学，天体物理学，航空电子学等。著名的类比允许提出作者的假设，即基因组DNA的随机组织与生物 - 安特纳纳阵列有关。从这个假设的角度来看，在与基因组DNA的单个分组中收集了许多有关使用天线阵列原理的已知事实。关于天线阵列有利可图的特性生物学含义的这个新主题包括生物进化的问题，遗传密码的起源，再生医学和代数生物学的发展。这些问题与作者对基因组DNA随机特征的量子信息分析的结果共同讨论。关键字：基因组DNA，概率，矩阵，张量产物，HADAMARD产品，天线阵列，光子晶体，液晶，生物素器，量子信息学
（DNA-结合蛋白Pull-down） 货号
NCOA3是通过ESRRB招募到目标基因座的ERRE的。（a）使用先前描述的野生型（WT）或ERRE突变序列的DNA下拉测定法（Feng et al。2009）或Nanog（van den Berg等人 2008）。 生物素化探针（40–50-50碱基对[BP]）与来自Flag-EsRRB和NCOA3转染的COS-1细胞的提取物一起孵育，并在链霉亲蛋白珠上回收，并通过Western Blotting可视化与DNA相关的蛋白质。 （b）ESRRB，KLF4，NANOG和SOX2 ERRES的ESRRB和NCOA3富集水平以及一个基因（Inter。） 通过CHIP和QPCR评估的ESC中的控制区域，并相对于输入表示。 数据是三个生物学重复的平均6 SEM。 （c）ESRRB耗竭后的候选基因座的NCOA3和ESRRB富集水平相对于输入表示。 在每个实验中，富集SHGFP转染的细胞的富集设置为100％。 数据是至少两个独立实验的平均6 SD。 B和C中的虚线表示对照IgG（Santa Cruz Biotechnology）的背景富集。 （d）蛋白质印迹显示特定的ESRRB蛋白耗竭后48小时用ShesRRB转染。 请注意，此时NCOA3和OCT4级别不变。 （E）使用Nanog野生型或ERRE突变探针的DNA下拉分析，该探针还包含相邻的OCT – SOX位点（Van Den Berg等人 2008），并从NCOA3，OCT4和SOX2转染的COS-1提取细胞提取物。2009）或Nanog（van den Berg等人2008）。 生物素化探针（40–50-50碱基对[BP]）与来自Flag-EsRRB和NCOA3转染的COS-1细胞的提取物一起孵育，并在链霉亲蛋白珠上回收，并通过Western Blotting可视化与DNA相关的蛋白质。 （b）ESRRB，KLF4，NANOG和SOX2 ERRES的ESRRB和NCOA3富集水平以及一个基因（Inter。） 通过CHIP和QPCR评估的ESC中的控制区域，并相对于输入表示。 数据是三个生物学重复的平均6 SEM。 （c）ESRRB耗竭后的候选基因座的NCOA3和ESRRB富集水平相对于输入表示。 在每个实验中，富集SHGFP转染的细胞的富集设置为100％。 数据是至少两个独立实验的平均6 SD。 B和C中的虚线表示对照IgG（Santa Cruz Biotechnology）的背景富集。 （d）蛋白质印迹显示特定的ESRRB蛋白耗竭后48小时用ShesRRB转染。 请注意，此时NCOA3和OCT4级别不变。 （E）使用Nanog野生型或ERRE突变探针的DNA下拉分析，该探针还包含相邻的OCT – SOX位点（Van Den Berg等人 2008），并从NCOA3，OCT4和SOX2转染的COS-1提取细胞提取物。2008）。生物素化探针（40–50-50碱基对[BP]）与来自Flag-EsRRB和NCOA3转染的COS-1细胞的提取物一起孵育，并在链霉亲蛋白珠上回收，并通过Western Blotting可视化与DNA相关的蛋白质。（b）ESRRB，KLF4，NANOG和SOX2 ERRES的ESRRB和NCOA3富集水平以及一个基因（Inter。）通过CHIP和QPCR评估的ESC中的控制区域，并相对于输入表示。数据是三个生物学重复的平均6 SEM。（c）ESRRB耗竭后的候选基因座的NCOA3和ESRRB富集水平相对于输入表示。在每个实验中，富集SHGFP转染的细胞的富集设置为100％。 数据是至少两个独立实验的平均6 SD。 B和C中的虚线表示对照IgG（Santa Cruz Biotechnology）的背景富集。 （d）蛋白质印迹显示特定的ESRRB蛋白耗竭后48小时用ShesRRB转染。 请注意，此时NCOA3和OCT4级别不变。 （E）使用Nanog野生型或ERRE突变探针的DNA下拉分析，该探针还包含相邻的OCT – SOX位点（Van Den Berg等人 2008），并从NCOA3，OCT4和SOX2转染的COS-1提取细胞提取物。富集SHGFP转染的细胞的富集设置为100％。数据是至少两个独立实验的平均6 SD。B和C中的虚线表示对照IgG（Santa Cruz Biotechnology）的背景富集。（d）蛋白质印迹显示特定的ESRRB蛋白耗竭后48小时用ShesRRB转染。请注意，此时NCOA3和OCT4级别不变。（E）使用Nanog野生型或ERRE突变探针的DNA下拉分析，该探针还包含相邻的OCT – SOX位点（Van Den Berg等人2008），并从NCOA3，OCT4和SOX2转染的COS-1提取细胞提取物。