ML集体的研究人员在旧金山和哥伦比亚大学进行了一项研究,旨在通过使用特定类型的脑启发的人工神经网络来理解关系学习的生物学基础。他们的作品发表在自然神经科学上,对大脑过程中的过程阐明了可能是人类和其他生物的关系学习的过程。
序列 MSVDGTKTFF NPYIGARKRS LEARNGLSFS TGQNYDEKNN RRDRNSITYV TTIDEFKYIA PKCLDDKDVK QKGTHIGKLK RSPVLYKNGE EYVFLNFEDC EDVWPRRCSI WNNRSFLPAD FDPRFSRFHV YDMIETVEFA SAAIDRDKNR FLELLRPMGT IVTMMGITEC GKRVAVHVYG IKPYFYMRKV DTDTICGSRC PRELAEKLAN VVRSSVNEVA NAKRFCTPVT RTVSADCFEV DVVQRKDIYY YGTGHDEFYR VKSQSGKFIT LLCDNFYPSI IKYEGNIDAI TRMVLDNNGF STFGWYSFKV GNNGEKVQVR APCHHCTSCD IEINCTVDNL IGYPEDDAWP示例: DTNLSNLRPQ DDYLEINVQG KLLRFVKPHI RESLLAILLK DWLAMRKAIR AKIPESCDEI AVLLDKQQAA IKVVCNSVYG FCGVSNGLLP CIDVAATVTT IGRNMLLTVR DYIHKQWGTR DALLREFPNL SNFMRPEDYS VSVIYGDTDS VFIKFKGVDI HGLVTTGDDM AKRVSSDLFP KPIKLECEKT FNKLLLITKK KYMGTIHGGR MLMKGVDIVR KNNCRFINTY AKKLSDLLFL DDTVAKAAAT VAEKPPSFWA TSPLPEGLNS FGGVLAEAYT RMMINNITEV EDFAMSAELS RPPDAYTNKR IPHLTVYYKL AMRSEQLPVV KDRISYVIAA ATPEVVRDSA RVAEFRGELD LCHQNSNTSC PGDSVMTNKE TYVRHSPRNK LLISDMAEDP KYLLANNIPL NTDYYLSHLL GTLCVTFKAL FGNDVKITET VLRRFIPETF TEDCSYTERV SSEMFTTIRS GIGLQVNEEE ETRRKLNIAF RILTATPHRY
摘要 人类疱疹病毒 6 (HHV-6) A 和 B 是普遍存在的β-疱疹病毒,感染了大多数人类。它们包含大型基因组,我们对它们的蛋白质编码潜力的了解还远未完成。在这里,我们采用核糖体分析和系统转录分析来实验性地定义 HHV-6 翻译产物。我们确定了数百个新的开放阅读框 (ORF),包括上游 ORF (uORF) 和内部 ORF (iORF),从而生成了完整的 HHV-6 蛋白质组无偏图谱。通过整合原型β-疱疹病毒人类巨细胞病毒的系统数据,我们发现了在β-疱疹病毒中保守的大量 uORF 和 iORF,并且我们表明 uORF 在晚期病毒基因中富集。我们鉴定出三种含量丰富的 HHV-6 编码长非编码 RNA,其中一种可产生非多聚腺苷酸化的稳定内含子,这似乎是 β 疱疹病毒的保守特征。总体而言,我们的研究揭示了 HHV-6 基因组的复杂性,并突出了 β 疱疹病毒之间保守的新特征,为未来的功能研究提供了丰富的资源。
背景:已知性别和事先暴露于病原体会影响对免疫挑战的反应,但是在人类中,它们的综合作用尚未得到很好的确定,尤其是在早期的先天反应中,对于塑造随后的结果至关重要。方法:我们采用了系统免疫学方法来研究男性和女性天真或以前暴露于HSV的男性和女性中对复制缺陷,单纯疱疹病毒(HSV)2疫苗的反应。结果:疫苗接种后第1天,血液转录组和细胞种群分析显示出很大的变化,但反应取决于性别以及疫苗是天真的还是先前暴露于HSV的。在HSV幼稚的女性中,早期转录反应的大小最大,I型干扰素(IFN)特征是突出的,并且与疫苗诱导的中和抗体滴度呈负相关,这表明强大的早期抗病毒反应降低了这种复制感染性病毒疫苗的摄取。HSV血清染色疫苗的配方在I型IFN(IFN-α /β)反应中的基因集上调时,HSV2血清氧化疫苗受体的受体倾向于对II型IFN(IFN-γ)基因的反应更多地集中在反应上。结论:这些结果共同表明,事先暴露和性别相互作用以塑造早期的先天反应,从而影响随后的适应性免疫表型。资金:NIH的壁内研究计划,国家过敏和传染病研究所以及其他支持人类免疫学,自身免疫和炎症中心的机构。临床试验编号:NCT01915212。通过美国国家过敏和传染病研究所与赛诺菲巴斯德(Sanofi Pasteur)之间的临床试验协议支持了疫苗试验。
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证(未经同行评审认证)是作者/资助者,他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是
87483 通过核酸(DNA 或 RNA)检测传染性病原体;中枢神经系统病原体(例如脑膜炎奈瑟菌、肺炎链球菌、李斯特菌、流感嗜血杆菌、大肠杆菌、无乳链球菌、肠道病毒、人类副肠孤病毒、1 型和 2 型单纯疱疹病毒、人类疱疹病毒 6 型、巨细胞病毒、水痘带状疱疹病毒、隐球菌),包括多重逆转录(如果执行)和多重扩增探针技术、多种类型或亚型、12-25 个目标
2 孟加拉国吉大港大学生物科学学院遗传工程与生物技术系,3 印度浦那 Sinhgad 技术教育协会 Sinhgad 药学院药物化学系,4 孟加拉国达卡圣母学院,5 孟加拉国吉大港国际伊斯兰大学药学系,6 内蒙古自治区高校人畜共患病预防与控制重点实验室,内蒙古民族大学医学院,中国通辽,7 郑州大学第二附属医院脑血管病科,中国郑州,8 加拿大阿尔伯塔省卡尔加里大学微生物学、免疫学和传染病系,9 孟加拉国吉大港大学生物科学学院微生物学系
摘要 马立克氏病 (MD) 是由与致命淋巴瘤相关的马立克氏病病毒 (MDV) 引起的一种主要鸡病。目前的 MD 疫苗可以预防淋巴瘤,但无法预防感染和脱落。控制 MDV 脱落对于根除这种高度传染性的病毒至关重要。与致病性 MDV 一样,MD 疫苗会感染皮肤的羽毛毛囊,然后脱落到环境中。MD 疫苗是研究病毒与羽毛相互作用的极佳模型,羽毛是这些病毒的唯一排泄源。在此,我们研究了一种 MD 疫苗——重组火鸡疱疹病毒 (rHVT-ND) 的病毒在羽毛中的持久性。我们报告说,大多数鸟类在 41 周内表现出持续的羽毛 HVT 感染,病毒载量中等。有趣的是,20% 的鸟类被确定为低 HVT 生产者,其中六只鸟清除了感染。事实上,在 14-26 周后,这些被称为控制者的鸟类的羽毛中直到第 41 周都检测不到 HVT DNA。所有接种疫苗的鸟类都产生了针对 NDV 的抗体,95% 的鸟类(包括控制者)的抗体一直持续到第 41 周。羽毛中的 HVT 载量与 NDV 抗体滴度随时间的变化之间没有发现相关性。有趣的是,在四只控制者的脾脏中未检测到 HVT DNA。这是首次描述鸡持久清除羽毛的 MD 疫苗感染,表明宿主可以控制 Mardivirus 的脱落。
尽管疫苗已经广泛使用了多年,但他们未能控制中国田间的H9N2禽流感病毒(AIV)。针对H9N2病毒的高水平母体衍生抗体(MDA)导致家禽中的H9N2流感疫苗衰竭。这项研究旨在生成一种新的疫苗来克服鸡在H9N2疫苗接种中的MDA干扰。,我们使用火鸡疱疹病毒(HVT)作为疫苗载体来表达H9血凝集素(HA)蛋白。表达H9 HA蛋白(RHVT-H9)的重组HVT在原代鸡肉胚胎成纤维细胞(CEF)中成功产生和表征。Western印迹和间接免疫荧光测定法(IFA)表明RHVT-H9始终表达HA蛋白。此外,RHVT-H9具有与母体HVT相似的生长动力学。初步动物实验表明,与常规的全部病毒(IWV)疫苗相比,RHVT-H9刺激了用被动转移的抗体(PTA)刺激用于模拟MDA的鸡的耐受性体液免疫。传播实验表明,RHVT-H9在PTA的鸡中诱导了体液和细胞免疫。此外,我们使用数学模型来量化疫苗在防止H9N2 AIV传播方面的功效。结果表明,RHVT-H9降低了病毒脱落周期,并降低了同源挑战后PTA的鸡的繁殖比(R)值。但是,该试验中的疫苗接种尚未带来R <1。总而言之,我们生成了一种新的RHVT-H9疫苗,该疫苗刺激了强烈的体液和细胞免疫,即使在鸡中存在PTA的情况下,也可以减少H9N2 AIV的病毒脱落和传播。
摘要:(1)背景:马α疱疹病毒-1(EHV-1)是一种在全球大多数马群中流行的高度传染性病毒病原体。CRISPR/Cas9 等基因组编辑技术已成为精准 RNA 引导基因组修饰的有力工具;(2)方法:设计了单向导 RNA(sgRNA)以靶向三个必需基因(ORF30、ORF31 和 ORF7)和一个非必需基因(ORF74),并确定其对体外病毒复制动力学的影响;(3)结果:我们证明靶向必需溶解基因的 sgRNA 降低了 EHV-1 复制,而靶向 ORF74 的 sgRNA 的影响可忽略不计。靶向 ORF30 的 sgRNA 对抑制 EHV-1 复制表现出最强的效果,病毒基因组拷贝数和传染性子代病毒产量均有所减少。下一代测序鉴定出选择性sgRNA特定切割位点缺失的变异体,并评估了不同sgRNA之间的组合,发现靶向ORF30和ORF7的sgRNA双重组合与使用单个sgRNA相比,能显著抑制病毒复制至较低水平,表明存在协同效应;(4)结论:数据表明sgRNA引导的CRISPR/Cas9可用于体外抑制EHV-1复制,表明这种可编程技术可用于开发一种新颖、安全、有效的EHV-1治疗和预防方法。