XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System病毒
生物信息学分析和鉴定纽卡斯尔疾病病毒F蛋白的表现区域
5-贵金[1] Alexander，D.J。，Aldous，E.W。和Fuller。 C.M. ）2012年（长期观点：对40年纽卡斯尔疾病研究的选择性评论。 禽病。 41（4），329-35。 [2] Altschul，S.F.，Gish，W。Miller，W。Myers，E.W。 和Lipman，D.J。 ）1990（基本本地对齐搜索工具。 J. Mol。 生物。 215（3），403-10。 [3] Ansori，A.N。和Kharisma，V.D。 ）2020（东南亚和东亚纽卡斯尔病毒的表征：融合蛋白基因。 eksakta：J。Sci。 数据肛门。 20（1），14-20。 [4] Ayala，A.J.，Dimitrov，K.M.，Becker，C.R.，Goraichuk，I.V.，Arns，C.W.，Bolotin，V.I. （2016）野生鸟类存在疫苗衍生的纽卡斯尔病毒。 PLOS ONE 11（9），E0162484。 [5] Brown，V.R。和Bevins，S.N。 （2017）对美国有毒纽卡斯尔病毒病毒的综述以及野生鸟类在病毒持久性和传播中的作用。 兽医。 res。 48（1），1-5。 [6] De Leeuw，O。和Peeters，B。 （1999）纽卡斯尔病毒的完整核苷酸序列：在亚家族中存在新属的证据。 J. Virol。 80（1），131-6。 [7] Dimitrov，K.M.，Ferreira，H.L.，Pantin- Jackwood，M.J.，Taylor，T.L.，Goraichuk，I.V.，I.V.，Crossley，B.M。，Killian，M.L.，M.L.，M.L.，Bergeson，N.H. 病毒学531，203-18。 2017。5-贵金[1] Alexander，D.J。，Aldous，E.W。和Fuller。C.M. ）2012年（长期观点：对40年纽卡斯尔疾病研究的选择性评论。 禽病。 41（4），329-35。 [2] Altschul，S.F.，Gish，W。Miller，W。Myers，E.W。 和Lipman，D.J。 ）1990（基本本地对齐搜索工具。 J. Mol。 生物。 215（3），403-10。 [3] Ansori，A.N。和Kharisma，V.D。 ）2020（东南亚和东亚纽卡斯尔病毒的表征：融合蛋白基因。 eksakta：J。Sci。 数据肛门。 20（1），14-20。 [4] Ayala，A.J.，Dimitrov，K.M.，Becker，C.R.，Goraichuk，I.V.，Arns，C.W.，Bolotin，V.I. （2016）野生鸟类存在疫苗衍生的纽卡斯尔病毒。 PLOS ONE 11（9），E0162484。 [5] Brown，V.R。和Bevins，S.N。 （2017）对美国有毒纽卡斯尔病毒病毒的综述以及野生鸟类在病毒持久性和传播中的作用。 兽医。 res。 48（1），1-5。 [6] De Leeuw，O。和Peeters，B。 （1999）纽卡斯尔病毒的完整核苷酸序列：在亚家族中存在新属的证据。 J. Virol。 80（1），131-6。 [7] Dimitrov，K.M.，Ferreira，H.L.，Pantin- Jackwood，M.J.，Taylor，T.L.，Goraichuk，I.V.，I.V.，Crossley，B.M。，Killian，M.L.，M.L.，M.L.，Bergeson，N.H. 病毒学531，203-18。 2017。C.M.）2012年（长期观点：对40年纽卡斯尔疾病研究的选择性评论。禽病。41（4），329-35。[2] Altschul，S.F.，Gish，W。Miller，W。Myers，E.W。和Lipman，D.J。）1990（基本本地对齐搜索工具。J. Mol。 生物。 215（3），403-10。 [3] Ansori，A.N。和Kharisma，V.D。 ）2020（东南亚和东亚纽卡斯尔病毒的表征：融合蛋白基因。 eksakta：J。Sci。 数据肛门。 20（1），14-20。 [4] Ayala，A.J.，Dimitrov，K.M.，Becker，C.R.，Goraichuk，I.V.，Arns，C.W.，Bolotin，V.I. （2016）野生鸟类存在疫苗衍生的纽卡斯尔病毒。 PLOS ONE 11（9），E0162484。 [5] Brown，V.R。和Bevins，S.N。 （2017）对美国有毒纽卡斯尔病毒病毒的综述以及野生鸟类在病毒持久性和传播中的作用。 兽医。 res。 48（1），1-5。 [6] De Leeuw，O。和Peeters，B。 （1999）纽卡斯尔病毒的完整核苷酸序列：在亚家族中存在新属的证据。 J. Virol。 80（1），131-6。 [7] Dimitrov，K.M.，Ferreira，H.L.，Pantin- Jackwood，M.J.，Taylor，T.L.，Goraichuk，I.V.，I.V.，Crossley，B.M。，Killian，M.L.，M.L.，M.L.，Bergeson，N.H. 病毒学531，203-18。 2017。J. Mol。生物。215（3），403-10。[3] Ansori，A.N。和Kharisma，V.D。 ）2020（东南亚和东亚纽卡斯尔病毒的表征：融合蛋白基因。 eksakta：J。Sci。 数据肛门。 20（1），14-20。 [4] Ayala，A.J.，Dimitrov，K.M.，Becker，C.R.，Goraichuk，I.V.，Arns，C.W.，Bolotin，V.I. （2016）野生鸟类存在疫苗衍生的纽卡斯尔病毒。 PLOS ONE 11（9），E0162484。 [5] Brown，V.R。和Bevins，S.N。 （2017）对美国有毒纽卡斯尔病毒病毒的综述以及野生鸟类在病毒持久性和传播中的作用。 兽医。 res。 48（1），1-5。 [6] De Leeuw，O。和Peeters，B。 （1999）纽卡斯尔病毒的完整核苷酸序列：在亚家族中存在新属的证据。 J. Virol。 80（1），131-6。 [7] Dimitrov，K.M.，Ferreira，H.L.，Pantin- Jackwood，M.J.，Taylor，T.L.，Goraichuk，I.V.，I.V.，Crossley，B.M。，Killian，M.L.，M.L.，M.L.，Bergeson，N.H. 病毒学531，203-18。 2017。[3] Ansori，A.N。和Kharisma，V.D。）2020（东南亚和东亚纽卡斯尔病毒的表征：融合蛋白基因。eksakta：J。Sci。数据肛门。20（1），14-20。[4] Ayala，A.J.，Dimitrov，K.M.，Becker，C.R.，Goraichuk，I.V.，Arns，C.W.，Bolotin，V.I.（2016）野生鸟类存在疫苗衍生的纽卡斯尔病毒。PLOS ONE 11（9），E0162484。[5] Brown，V.R。和Bevins，S.N。（2017）对美国有毒纽卡斯尔病毒病毒的综述以及野生鸟类在病毒持久性和传播中的作用。兽医。res。48（1），1-5。[6] De Leeuw，O。和Peeters，B。（1999）纽卡斯尔病毒的完整核苷酸序列：在亚家族中存在新属的证据。J. Virol。 80（1），131-6。 [7] Dimitrov，K.M.，Ferreira，H.L.，Pantin- Jackwood，M.J.，Taylor，T.L.，Goraichuk，I.V.，I.V.，Crossley，B.M。，Killian，M.L.，M.L.，M.L.，Bergeson，N.H. 病毒学531，203-18。 2017。J. Virol。80（1），131-6。[7] Dimitrov，K.M.，Ferreira，H.L.，Pantin- Jackwood，M.J.，Taylor，T.L.，Goraichuk，I.V.，I.V.，Crossley，B.M。，Killian，M.L.，M.L.，M.L.，Bergeson，N.H.病毒学531，203-18。2017。（2019）2018年至2019年加利福尼亚疫情及其相关病毒在年轻鸡和相关病毒中的致病性和传播。[8] Dimitrov，K.M。，Afonso，C.L.，Yu，Q。和Miller，P.J。纽卡斯尔疾病疫苗 -
激活内源性逆转录病毒和胰腺癌中MEK1/2抑制病毒模仿的诱导
虽然胰管导管腺癌（PDACS）沉迷于KRAS激活突变，但下流kras效应子的抑制剂，例如MEK1/2激酶抑制剂TRAMETINIB，却没有治疗作用。但是，由KRAS途径衰减驱动的监管电路的广泛重新布线可能会引起治疗相关性的脆弱性。在MEK1/2通过Trametinib抑制后的最初几个小时，对PDAC细胞中的转录和表观基因组变量进行了深入的分子分析，揭示了诱导内组逆转录病毒（ERV）（ERVS）的诱导，从而逃脱了表观遗传的硅烷，从而产生了双链RNAS和Interfecn of interfece and Interfecron的生产（导致了Interfef）（Interfe）的产生。我们跟踪了ERV激活，以早期诱导量写因子ELF3的早期诱导，该因子ELF3在IFN和IFN刺激的基因的激活中与IRF1（干扰素调节因子1）进行了广泛结合和激活。在免疫肿瘤学中合理设计中，可以利用 trametinib诱导的PDAC中的病毒模仿。
Zika病毒感染在怀孕的旅行者中从泰国返回丹麦，2024年，
参考文献1。Skafte-Holm A，Pedersen TR，FrølundM，Stegger M，Qvortrup K，Michaels DL等。支原体phocimorsus sp。11月，与密封件接触后，从封闭手指或化粪池关节炎的斯堪的纳维亚患者中分离出来。Int J Syst Evol微生物。2023; 73：1-10。https://doi.org/10.1099/ ijsem.0.006163 2。McCabe SJ，Murray JF，Ruhnke HL，Rachlis A.从猫那里获得的手的分枝杆菌感染。J手部外科手术。1987; 12：1085–8。 https://doi.org/10.1016/ S0363-5023（87）80119-3 3。 Khan F，Engers D，Lieberman JA，Moudgal V.从猫咬伤的先前未描述的分枝杆菌物种传播感染。 感染Dis Clin实践。 2024; 32：1-4。 https://doi.org/10.1097/ipc.0000000000001314 4。 Chomel BB，Boulouis HJ，Breitschwerdt EB。 猫刮擦疾病和其他人畜共患病。 J Am Vet Med Assoc。 2004; 224：1270–9。 https://doi.org/10.2460/ javma.2004.224.1270 5。 投手DG，尼古拉斯RA。 支原体主机特异性：事实还是虚构？ 兽医J. 2005; 170：300–6。 https://doi.org/10.1016/ j.tvjl.2004.08.0111987; 12：1085–8。https://doi.org/10.1016/ S0363-5023（87）80119-3 3。 Khan F，Engers D，Lieberman JA，Moudgal V.从猫咬伤的先前未描述的分枝杆菌物种传播感染。 感染Dis Clin实践。 2024; 32：1-4。 https://doi.org/10.1097/ipc.0000000000001314 4。 Chomel BB，Boulouis HJ，Breitschwerdt EB。 猫刮擦疾病和其他人畜共患病。 J Am Vet Med Assoc。 2004; 224：1270–9。 https://doi.org/10.2460/ javma.2004.224.1270 5。 投手DG，尼古拉斯RA。 支原体主机特异性：事实还是虚构？ 兽医J. 2005; 170：300–6。 https://doi.org/10.1016/ j.tvjl.2004.08.011https://doi.org/10.1016/ S0363-5023（87）80119-3 3。Khan F，Engers D，Lieberman JA，Moudgal V.从猫咬伤的先前未描述的分枝杆菌物种传播感染。 感染Dis Clin实践。 2024; 32：1-4。 https://doi.org/10.1097/ipc.0000000000001314 4。 Chomel BB，Boulouis HJ，Breitschwerdt EB。 猫刮擦疾病和其他人畜共患病。 J Am Vet Med Assoc。 2004; 224：1270–9。 https://doi.org/10.2460/ javma.2004.224.1270 5。 投手DG，尼古拉斯RA。 支原体主机特异性：事实还是虚构？ 兽医J. 2005; 170：300–6。 https://doi.org/10.1016/ j.tvjl.2004.08.011Khan F，Engers D，Lieberman JA，Moudgal V.从猫咬伤的先前未描述的分枝杆菌物种传播感染。感染Dis Clin实践。2024; 32：1-4。https://doi.org/10.1097/ipc.0000000000001314 4。Chomel BB，Boulouis HJ，Breitschwerdt EB。猫刮擦疾病和其他人畜共患病。J Am Vet Med Assoc。2004; 224：1270–9。 https://doi.org/10.2460/ javma.2004.224.1270 5。 投手DG，尼古拉斯RA。 支原体主机特异性：事实还是虚构？ 兽医J. 2005; 170：300–6。 https://doi.org/10.1016/ j.tvjl.2004.08.0112004; 224：1270–9。https://doi.org/10.2460/ javma.2004.224.1270 5。投手DG，尼古拉斯RA。支原体主机特异性：事实还是虚构？兽医J.2005; 170：300–6。 https://doi.org/10.1016/ j.tvjl.2004.08.0112005; 170：300–6。https://doi.org/10.1016/ j.tvjl.2004.08.011
研究表明，各种病毒群体在肠道细菌的单菌株上共存
这种称为病毒体的颗粒可用于将所需的遗传物质传递到具有广泛应用的细胞中，包括基因疗法和工程生物学。专门为所需的行动部位提供药物构成了重大挑战，并且是药物开发的关键，科学家试图在不引起负面副作用的情况下实现所需的治疗作用。这项工作有可能为这项挑战做出解决方案。
诺如病毒研究显示了母乳中的胆汁酸如何影响新生儿肠道健康
“我们知道从诺如病毒感染中受到微生物群保护的成年小鼠，我们知道新生儿很容易受到严重的诺罗维斯病毒的攻击，” UF新兴病原体研究所的成员，在UF医学学院的教授，UF医学学院的一名近期对Norovelus的Microb the Mrob the Mrob的研究。“因此，这使我们提出了一个问题：新生儿很容易受到诺如病毒的影响，因为他们的肠道菌群不成熟？”
双重缺失的疫苗病毒哥本哈根菌株针对恶性胸膜间皮瘤
恶性胸膜间皮瘤（MPM）是缺乏有效治疗的胸膜癌。使用溶瘤疫苗病毒（VV）的溶瘤免疫治疗可能代表一种治疗这种迹象的替代治疗方法。在这里，我们研究了VV百点激酶（TK） - 核糖核苷酸还原酶（RR） - /绿色荧光蛋白（GFP）的溶瘤活性。该病毒是哥本哈根菌株的VV，该VV由编码TK（J2R）和RR（I4L）的两个基因删除，并表达GFP。首先，我们在体外表明VV TK-RR-/GFP有效地感染并杀死了本研究中使用的22个人MPM细胞系。我们还表明，该病毒在所有八个测试的MPM细胞系中都复制，但是，从一个细胞系到另一个细胞系，在扩增水平上大约有10倍的差异。然后，我们研究了伴有腹膜腹膜人类MPM Tumors的非肥胖糖尿病（NOD）严重合并免疫（SCID）小鼠的VV TK-RR-/ GFP的治疗效率。与未经治疗的动物相比，VV TK-/GFP的一种腹膜内感染会导致肿瘤负担，显着增加小鼠的存活。因此，VV TK-RR-可能是MPM溶瘤免疫疗法的有前途的溶瘤病毒（OV）。
靶向病毒CCCDNA治愈慢性乙型肝炎
审查的抽象目的是由乙型肝炎病毒（HBV）引起的慢性肝炎B（CHB）是全球晚期肝病和肝细胞癌（HCC）的主要原因。HBV复制的特征在于合成共价闭合（CCC）DNA，而抗病毒核（T）IDE类似物（NUC）的靶向是护理标准标准的关键方式。尽管HBV复制成功地抑制了经过治疗的患者，但他们仍有患HCC的风险。虽然功能治疗（以HBSAG损失为特征）是新型抗病毒药疗法的第一个目标，但消除CCCDNA的治疗疗法仍然是最终目标。本评论总结了新型治疗策略的发现和发展的最新进展及其对CCCDNA生物学的影响。最近十年的最新发现，在理解CCCDNA生物学方面取得了重大进展，包括发现宿主依赖性因素，CCCDNA转录的表观遗传调节和免疫介导的降解。目前以直接或间接方式针对CCCDNA的几种方法正在发现，临床前或早期临床发育的阶段。示例包括基因组编辑方法，针对宿主依赖性因素或表演基因调控的策略，核素蛋白质调节剂和免疫介导的降解。总结直接定位的CCCDNA策略仍处于开发的临床前阶段，但带帽子装配调节器和基于免疫的方法已经达到了临床阶段。组合疗法提供了更多机会来克服当前方法的局限性。临床试验正在进行评估其对患者的功效和安全性，包括对病毒CCCDNA的影响。
对从Larimichthys鳄鱼分离的大环病毒的基因组和蛋白质组学特征的全面分析
结果：FD201807基因组包括112,214 bp的双链DNA，G + C含量为53.53％。它包含130个潜在的开放式阅读框架，编码能力范围为41至1,293个氨基酸。对全基因组序列的系统发育分析表明，与FD201807相关的最接近的巨型细胞病毒是Pompano Iridovirus，其序列身份为98.98％。在病毒感染的细胞培养上清液中鉴定了27种病毒蛋白的无标记蛋白质组学分析，而FD201807的纯病毒病毒中的46种病毒蛋白。在这些病毒感染的细胞培养上清液和纯净的病毒样品中都检测到19种病毒蛋白，而在病毒感染的细胞培养上士中仅鉴定了8种病毒蛋白。值得注意的是，有两种蛋白质来自培养的细胞系MFF-1（普通话炸细胞系-1），即细胞色素c和泛素激活酶E1，它们都存在于纯化的病毒样品和受感染细胞的培养物中。这些细胞蛋白可能与病毒宿主蛋白相互作用和/或宿主细胞凋亡有关。
内源性逆转录病毒表达在间皮瘤发育的实验小鼠模型中激活I型干扰素信号
在间皮瘤发育实验模型中，早期事件包括双链RNA（DSRNA）中编辑水平的增加。我们假设内源性逆转录病毒（ERV）的表达有助于DSRNA形成和I型干扰素信号传导。与非肿瘤样品相比，肿瘤的 ERV和干扰素刺激的基因（ISG）表达明显更高。 12个肿瘤特异性ERV（“ Mesoerv1-12”）被鉴定出来并通过qPCR在小鼠组织中验证。 与间皮瘤细胞相比，小鼠胚胎成纤维细胞（MEF）的“ Mesoerv1-12”表达较低。 “ Mesoerv1-12”水平通过脱甲基化剂5-Aza-2' - 脱氧胞苷的处理显着提高，并伴随着DSRNA和ISGS的水平升高。 与MEF相比，间皮瘤细胞中的基底ISGS表达更高，并且通过阻断IFNAR1和沉默的MAVS，JAK抑制剂r梭替尼显着降低了。 “ Mesoerv7”启动子在5-Aza-CDR处理后，与假小鼠组织以及间皮瘤细胞以及MEF细胞和MEF相比，在石棉暴露的暴露中被脱甲基化。 这些观察结果发现了石棉诱导的间皮瘤的新颖方面，从而导致ERV表达因启动子去甲基化而引起，并且与DSRNA水平的增加和IFN型信号传导的激活相似。 这些特征对于早期诊断和治疗很重要。ERV和干扰素刺激的基因（ISG）表达明显更高。12个肿瘤特异性ERV（“ Mesoerv1-12”）被鉴定出来并通过qPCR在小鼠组织中验证。与间皮瘤细胞相比，小鼠胚胎成纤维细胞（MEF）的“ Mesoerv1-12”表达较低。“ Mesoerv1-12”水平通过脱甲基化剂5-Aza-2' - 脱氧胞苷的处理显着提高，并伴随着DSRNA和ISGS的水平升高。与MEF相比，间皮瘤细胞中的基底ISGS表达更高，并且通过阻断IFNAR1和沉默的MAVS，JAK抑制剂r梭替尼显着降低了。“ Mesoerv7”启动子在5-Aza-CDR处理后，与假小鼠组织以及间皮瘤细胞以及MEF细胞和MEF相比，在石棉暴露的暴露中被脱甲基化。这些观察结果发现了石棉诱导的间皮瘤的新颖方面，从而导致ERV表达因启动子去甲基化而引起，并且与DSRNA水平的增加和IFN型信号传导的激活相似。这些特征对于早期诊断和治疗很重要。
温度影响西尼罗河病毒的演化和适应性
此预印本版的版权持有人于2025年3月3日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.28.640855 doi：Biorxiv Preprint