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将微生物组和基因组数据结合的机会和限制进行复杂性状预测
摘要背景：使用微生物组数据与主机基因组信息结合使用的复杂性状的分析和预测是一个最引起关注的话题。但是，仍然有许多问题要回答：微生物组对复杂性状预测的有用程度如何？微波性可靠的估计值吗？可以回收宿主基因组，微生物组和现象之间的潜在生物学联系吗？方法：在这里，我们通过（i）制定一种新型的模拟策略来解决这些问题，该策略使用真实的微生物组和基因型数据作为输入，以及（ii）使用方差 - 组件方法（贝叶斯复制的核心kernel hilbert space（RKHS）和贝叶斯变量选择方法（Bayes c）（贝叶斯），以量化contiper and centery centery andy型依次的变化。提出的模拟方法可以通过保留数据的分布性能的置换程序模仿微生物组和基因型数据之间的遗传联系。结果：使用奶牛的实际基因型和瘤胃微生物群的丰度，无论某些微生物群的丰度是否受宿主的直接遗传控制，微生物组数据都可以显着提高表型预测的准确性。此改进在逻辑上取决于微生物组随着时间的推移而稳定。总体而言，尽管通常高度高度的微生物群丰度分布，但随机效应线性方法对于方差构成估计似乎是可靠的。贝叶斯C的预测性能高，但对因果效应的数量比RKHS更敏感。贝叶斯的准确性部分取决于影响表型的微生物类群的数量。结论：我们得出的结论是，可以使用方差成分估计值来表征基因组微生物组 - 链接，但我们对识别影响微生物群的病变遗传效应的可能性不太乐观，而这些宿主遗传效应影响了微生物群的丰富度，而基因组 - 微生物组 - 菌群 - 基因组 - 型号可能需要更大的样本量。复制分析的R代码位于https：//github。com/migue lpere zenci so/simub iome中。
左心室转录组和细胞外囊泡-...
（未经同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者此版本于 2025 年 1 月 24 日发布。；https://doi.org/10.1101/2025.01.22.634193 doi：bioRxiv preprint
BAT GBP5的基因组和功能适应
。cc-by-nc 4.0国际许可（未获得同行评审证明），他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2025年2月15日。 https://doi.org/10.1101/2025.02.11.637683 doi：Biorxiv Preprint
使用CSF-BAM脑脊液的基因组和免疫细胞表征对人脑癌的检测
使用CSF-BAM Alexander H. Pearlman 1,2,3,4，*，Yuxuan Wang 1,2,3,4，*，*，Anita Kalluri 5，Anita Kalluri 5，Megan Parker 5，Joshua D Cohen 1,2,3,3,3,4，JONATH 3,4，JONATH 3,4，JONTHEL，JON 3，乔迪娜·林肯·托罗埃拉1,2,3,4,5，Yuanxuan Xia 1,2,3,4,5，Ryan Gensler 5，Melanie Alfonzo Horwitz 5，John Theodore 5，John Theodore 5，Lisa Dobbyn 1,2,3,4 1,2,3,4，Maria Popoli 1,2,3,3,3,4，Janine Ptan，Janniim ptan，NAT 1,2,2,4，NAT 1,2,4，NAT NAT NAT NAT NAT NATNAT NAT NAT NAT NAT NAT NAT NAT NAT NAT NAT NAT NAT NAT NAT NAT NAT NAT NAT NAT NAT NAT 1,2,3,4 , Kathy Judge 1,2,3,4 , Mari Groves 5 , Christopher M. Jackson 5 , Eric M. Jackson 5 , George I. Jallo 7 , Michael Lim 8 , Mark Luciano 5 , Debraj Mukherjee 5 , Jarushka Naidoo 9 , Sima Rozati 10 , Cole H. Sterling 1,4 , Jon Weingart 5 , Carl Koschmann 11 , Alireza Mansouri 12 , Michael Glantz 12 , David Kamson 4,13 , Karisa C. Schreck 4,13 , Carlos A. Pardo 13 , Matthias Holdhoff 4 , Suman Paul 1,2,4 , Kenneth W. Kinzler 1,2,3,4 , Nickolas Papadopoulos 1,2,3,4 , Bert Vogelstein 1,2,3,4,14 , Christopher Douville 1,2,3,4，＃，Chetan Bettegowda 1,2,3,4,5，＃
表面重组和六角形硼硼的游离激子的平面外扩散率
1 Laboratory of Study of Microstructures, Onera-CNRS, University Paris-Saclay, BP 72, 92322 CHECTILLON CEDEX, France 2 University Paris-Saclay, UVSQ, CNRS, GEMAC, 78000, Versailles, France 3 Tim Taylor Department of Chemical Engineering, Kansas State University Manhattan, KS 66506, USA 4 Laboratory of Multimate and Interfaces, UMR CNRS 5615, Univ Lyon University Claude Bernard Lyon 1, F-69622 Villeurbanne, France 5 Laboratory Mateis, UMR CNRS 5510, Univ Lyon, INSA Lyon, F-69621 Villeurbanne, France 6 Research Center for Materials Nanoarchitectonics, National Institute for Materials Science, 1-1 Namiki, Tsukuba 305-0044，日本7电子和光学材料研究中心，国家材料科学研究所，1-1 Namiki，Tsukuba，Tsukuba 305-0044，日本（日期：
大脑局部结构连接组和内侧颞叶的亚型
结果：（1）在局部大脑连接组中，整个网络特征表现出低特征路径长度，并配对中度至高全球效率，这表明局部脑连接组构建的有效性。杏仁核连接组表现出比同侧海马和帕拉希公接连接组显示更长的特征路径长度和更弱的全球效率。（2）杏仁核连接组的轮毂分散在腹侧额叶，嗅觉区域，边缘，顶部，顶部区域和皮层下核，以及枢轴的海马连接组主要位于山缘，皮层和皮层下区域内。帕拉希公接连接组的轮毂分布类似于海马结构连接组，但缺乏半球间连接以及与皮层核的连通性。（3）每个ROI的大脑局部结构连接组的亚型通过层次聚类进行分类，双侧杏仁核连接组的亚型是杏仁核 - 前额叶连接组；杏仁核 - 外侧或对侧边缘连接组和杏仁核 - 伴随连接组。双侧海马连接组的亚型主要包括域半球中的海马冲向或对侧边缘连接组和前颞张 - 海马 - 腹部颞叶枕骨。parahampocampal连接组的亚型与海马的亚型表现出相似之处。
通过调节肠道切除型造成的骨质疏松症的总黄酮类黄酮对减少肠道切除型造成骨质疏松的影响的综合宏基因组和代谢组分析，通过调节肠道微生物群和相关的代谢物
tfrd已在中国广泛用于治疗骨质疏松症（OP）。然而，尚未完全阐明TFRD对OP的特定分子机制。我们以前的研究也证明了TFRD可以减弱OP，临床当量剂量为67.5mg/ kg/ d是TFRD治疗的有效剂量。因此，这项研究使用67.5mg/kg作为TFRD与多磁术结合使用的剂量，以研究TFRD在OP处理中的作用机理。这项研究的目的是进一步阐明基于宏基因组和代谢组分分析的TFRD的分子机制来治疗OP。在这项研究中，使用苏木精 - 欧洲蛋白（H＆E）染色，微计算机断层扫描（Micro-CT）和骨矿物质密度（BMD）分析来观察TFRD对Ovariectomized（OVX）的药理作用（OVX）。随后，进行了多组学分析，包括宏基因组学，未靶向和短链脂肪酸（SCFAS）代谢组学，以识别TFRD的抗骨质疏松机制是否与肠道微生物和相关代谢物有关。我们的结果表明，TFRD可以改善OVX大鼠小梁骨的微观和密度。17种差异物种，主要来自Akkermansia，bacteroides和phascolatcoltcontocterium Genus，OVX在SCFA中有14种相关的差分代谢产物和乙酸与TFRD相反。此外，根据未靶向的代谢组学分析的结果，发现几种代谢途径，例如苯丙氨酸代谢，苯丙氨酸，酪氨酸和色氨酸生物合成，因此可能在TFRD中起重要作用。为了进一步研究肠道微生物群和相关代谢产物之间的关系，使用了长矛人的相关分析，并表明肠道菌群（如akkermansia粘膜粘膜）可能与几种代谢物和代谢途径密切相关。
具有不同分化的间充质细胞的细胞 - 细胞融合触发基因组和转录组重塑朝着肿瘤侵袭性
细胞 - 细胞融合是一种生理过程，在肿瘤发生过程中被劫持并促进肿瘤的演变。细胞融合的主要影响是在流动白细胞和增殖肿瘤细胞之间融合后促进转移性杂化细胞的形成。我们在这里表明，通过基因组不稳定性和特定的转录组谱的表达，永生化的成肌细胞和转化的成纤维细胞之间的细胞融合会导致杂交细胞的出现获得传播特性。这与融合细胞获得克隆的能力有关。此外，通过遗传父母的特性，发现杂种肿瘤模仿肉瘤特定组织的组织学特征：未分化的多形性肉瘤，肌肉分化不完全。这一发现表明，作为宏观进化事件的细胞融合会根据父细胞的分化谱系有利于特定的肉瘤发育。
硝酸盐对高血压患者口服微生物组和唾液生物标志物的影响潮汐流与风能：与混合系统中短期存储结合使用的循环功率的值
摘要：本研究量化了使用潮汐流或风力涡轮机的混合系统的技术，经济和环境性能，以及短期电池存储和备用油发电机。该系统旨在部分位于位于英国海峡群岛的奥尔德尼岛上的石油发生器。每天每天提供每天四个发电周期的潮汐涡轮机。这种相对较高的频率循环将油发电机的使用限制为1.6 GWH/年。相比之下，较低的风能时期可以持续数天，迫使风混合动力系统长期依靠备用油发电机，总计2.4 gwh/年（高50％）。因此，假设在此期间，潮汐混合动力系统的燃油量减少了25万英镑/年，或者在25年的运营寿命中取代了640万英镑，则假设此期间的石油成本耗资成本。潮汐和风杂交系统的机油位移分别为78％和67％（与碳排放的减少相同）。对于风混合动力系统，要取代与潮汐混合动力系统相同数量的油，需要另外两个风力涡轮机。电池在高潮汐/风资源时期内存储多余的涡轮能量的能力取决于机会定期排放存储的能量。潮汐混合系统在松弛潮中实现了这一点。高风资资源的时期超过了高潮汐资源的时期，导致电池经常保持充满电，并限制过多的风力。因此，风混合动力系统会减少1.9 GWH/年，而潮汐涡轮机减少了0.2 gwh/年。如果这些利益超过其相对较高的资本和运营支出，那么潮汐型涡轮机减少缩减，燃料成本和碳排放的能力可能会提供在混合系统中实施的案例。
双向孟德尔随机化的应用来评估肠道微生物组和食管癌之间的关系
此预印本版本的版权持有人于2025年2月8日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.02.06.25321825 doi：medrxiv preprint