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利用农作物生物多样性和基因组学协助 -
农业创新对于扩大农作物的遗传多样性至关重要，专注于提高产量，对生物和非生物应力因素的耐受性营养价值以及对新环境的适应性，尤其是在响应气候变化方面。利用各种遗传资源，包括在包括局部陆地等基因库中维持的农场多样性和种质，以及次级基因库，也必须变得势在必行。传统品种，陆地和其他未充分利用的种系很少被育种者使用，主要是由于不必要的联系。基因组学工具可以有效地处理这一问题。例如，大米中的“ SD1基因与干旱耐受性QTL之间的遗传联系”是一个显着的繁殖挑战，最近通过标记辅助育种克服了。另一个例子是“ Cimmyt-发现的种子（种子）”计划，该计划使用基因组学工具来大量使用小麦种质库。先进的基因组学工具和技术通过知识丰富为制定育种计划的知识发展提供了有希望的途径。通过识别和融合新等位基因来整合未充分利用的遗传多样性和解锁遗传多样性，可以扩大培养品种的遗传基础。这种方法称为“基因组学辅助杂种”，包括多样性分析，功能基因组学和结构基因组学，以及用于作物改善所需的先进统计工具。拥抱“基因组辅助 - 预育”对于满足全球粮食，燃料和鱼的需求而言至关重要。
Asteraceae基因组学的综合平台
Asteraceae是最大的被子植物家族，因其出色的药用，园艺和观赏价值引起了广泛的关注。然而，关于星形科植物的研究由于复杂的遗传背景而面临挑战。随着测序技术的持续发展，从星状科物种中积累了大量的基因组和遗传资源。这促使对这个多样化的植物群中对全面的基因组分析的需求。为了满足这种需求，我们开发了Asteraceae基因组学数据库（AGD; http://cbcb.cdutcm.edu.cn/agd/）。AGD充当集中和系统的资源，赋予了各种领域的研究人员，例如基因注释，基因家族分析，进化生物学和遗传育种。AGD不仅包含高质量的基因组序列和细胞器基因组数据，而且还提供了广泛的分析工具，包括BLAST，JBROWSE，SSR FINDER，HMMSEARZER，HMMSEARCH，HEMMAP，HEATMAP，PRIMER3，PLANTIMSISMASH和CRISPRCASFINDER。这些工具使用户能够方便地查询，分析和比较各种星际科中的基因组信息。AGD的建立在推进Asteraceae基因组学，促进遗传育种并通过为研究人员提供全面且用户友好的基因组资源平台来维护生物多样性方面具有巨大的意义。
转化基因组学的临床混合基因组外显子组（CBGE）
另一个利用CBGE高质量和低价点的项目是南方研究。在Myome支持的情况下，他们最近推出了Catalyst，该计划将为整个阿拉巴马州的患者提供免费的基因测试和有关某些慢性疾病的药物和风险的临床见解，重点是服务不足的社区。
约翰霍普金斯基因组学 DNA 诊断实验室
亨廷顿病 (HD) 是一种渐进性、致命性、遗传性神经退行性疾病，通常在成人时期发病。亨廷顿病是由 HTT 基因第一个编码区 CAG 重复扩增引起的，这会导致大脑中亨廷顿蛋白异常积聚。人们认为，亨廷顿病的症状是由亨廷顿蛋白沉积物的渐进性积聚引起的。亨廷顿病以常染色体显性模式遗传，这意味着两个 HTT 等位基因中只需有一个扩增即可发病。患有亨廷顿病的父母有 50% 的机会将扩增的 CAG 区域遗传给他们的每个孩子。通过 PCR 和片段大小测定进行的亨廷顿病检测会分析 HTT 基因的 CAG 重复区域以测量重复次数。重复次数可以判断一个人是否有患亨廷顿病的风险。了解一个人的重复次数可以洞察这个人未来的情况、其他家庭成员是否可能有患病风险以及这个人可能生育的孩子的风险。
JCS 2022 Shewry 等人小麦改良基因组学.pdf
传统育种在提高作物产量以满足不断增长的全球人口需求方面取得了巨大成功，特别是小麦，在过去 60 年中，小麦产量增长了三倍多，而耕地面积却没有显著增加。然而，传统育种的改良速度缓慢，并且受到小麦及其杂交品种的变异范围的限制。基因组学可以定义为“专注于基因组结构、功能、进化、绘图和编辑的跨学科生物学领域”（维基百科）。因此，它有可能通过加快进展速度和增加可用的变异范围来彻底改变作物改良。尽管有这种潜力，但生物技术在小麦改良中的应用进展缓慢，特别是在应用于加工和营养谷物的质量时。因此，我们将考虑其中的原因并确定未来研究的重点。
作物野生亲戚的基因组学和现象学（CWRS）用于作物改善
作物野生亲戚（CWRS）与驯养的作物（农业园艺，药物和芳香，观赏性和林业物种）表现出密切的关系，并形成了农作物基因库的一部分，具有基因交换的潜力。大量的CWR是潜在的捐助者，但受到驯养作物的关注少。cwrs也遭受了遗传侵蚀，导致遗传多样性严重丧失（Maxted等，2006； Von Wettberg等，2020）。驱动遗传多样性损失的因素已分为对进化力作用的远程驱动因素和近端驱动因素：突变，迁移/基因流，遗传漂移和选择（Khoury等，2022）。在此研究主题中，Trainin等人。从解剖学的角度记录了参与选择非色的光合作用性状的进化力，与商业杏仁相比（P. Dulcis（Mill。D. A. Webb）。P.Arabica的茎有利于STEM光合作用，以通过多种策略获得额外的碳增益。Higher stem photosynthesis in P. arabica than in P. dulcis is attributed to selective anatomical features such as the presence of a high density of sunken stomata in their stems, a chloroplast-rich mesophyll-like parenchymatous cell layer, higher chlorophyll content, better chlorophyll fl uorescence and quenching parameters, and its ability to ef fi ciently regulate water loss at温度升高。
基于 CRISPR/Cas 的植物功能基因组学和计算建模
博士Prasenjit Saikia 博士阿吉特·辛格博士Biswajit Saha 博士P. Yuvaraj 先生帕萨·马宗德博士Hridoy Jyoti Mahanta 博士Pankaj Bharali 博士Tridip Phukan 博士Romi Wahengbam 博士Saikat Haldar 博士奥雅纳罗伊博士百夏凛空博士Atul Ashok More 博士Leon Raj 博士Pravin G. Ingole 博士吉滕德拉·辛格·维尔马博士萨钦吉德先生Dhanjit Das 博士Jyoti Kumar Doley 博士Biswajit Gogoi 博士Debasis D. Mohanty 博士Hemanta Sankar Dutta 博士Jayashi Phukan 博士桑迪普·戴伊先生Rama Shankar Sharma先生JL Khongsai 先生Vaskar Rajkhowa先生Praveen Mohan Verma 先生希玛塔·萨基亚
有关鱼类种群基因组学区域培训课程
水产养殖是增长最快的领域之一，预计将进一步增长，以便为不断增长的人口提供食物。彩虹鳟鱼的文化（Oncorhynchus mykiss）是拉丁美洲和加勒比海地区（LAC）地区的主要水产养殖活动之一，是世界第二大生产国。水产养殖主要是由经济资源低的农村社区开发的。因此，该地区的许多国家缺乏足够的基础设施。合格人员；流行病学监测；和足够的卫生控制。由于没有及时的诊断，该地区由于进入边境病原体的进入而经历了鳟鱼种植的死亡率提高。该项目旨在加强鳟鱼种植，以降低由于感染性胰坏死病毒（IPNV）和新兴疾病而引起的彩虹鳟鱼的高死亡率。该项目完全符合区域战略概况（RSP）2022 - 2029年《区域合作协议促进拉丁美洲核科学和技术》和加勒比海（Arcal）（ARCAL）的核科学和技术协议（ARCAL），该协议广泛面向贫困，通过通过内地进行粮食的粮食安全，从而终止荒原和康复，从而降低了贫困。核与核技术的应用，例如分子工具在动物生产和健康中，将发展和升级参与国家的检测和分化鳟鱼疾病的能力，以及鉴定与病毒疾病抵抗的免疫反应以及与免疫反应和遗传机制相关的遗传模式。新的生物技术用于通过分子表征和诊断不同病原体的诊断来促进该部门的健康（RSP 2022 - 2029）。这将有助于积极影响脆弱的社区，并将水产养殖和将水产养殖定位为自我 - 在该地区足够的活动。