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World File Search System组蛋白
人类生物学 2022-2023
病毒对染色质的操纵 我们的实验室专注于研究病毒劫持染色质的机制。由于测序和成像技术的重大进步以及表观遗传学领域的扩展，利用病毒研究染色质生物学具有巨大的潜力。我们的目标是推进对病毒对染色质操纵的基本理解并揭示染色质生物学的新方面。与细胞基因组非常相似，病毒基因组必须用小的碱性分子压缩在病毒颗粒中，以最大限度地利用空间并准备好进行基因表达。一些 DNA 病毒使用细胞组蛋白来压缩其基因组，而另一些则使用小的碱性分子。腺病毒编码自己的组蛋白样蛋白，称为蛋白 VII，它与病毒基因组形成“串珠”组装。通过检查宿主染色质中的蛋白质 VII，我们发现蛋白质 VII 隔离了染色质中的免疫危险信号 HMGB1，从而阻断了宿主细胞周期并抑制了下游炎症（Lynch 等人，Current Biology 2021，Avgousti 等人，Nature 2016）。这一发现为揭示腺病毒如何操纵宿主染色质以及更广泛地说 DNA 病毒如何利用组蛋白或组蛋白样蛋白发挥双重功能奠定了基础：压缩其基因组并控制宿主基因组。实验室的研究工作采用多学科方法来解决以下问题：
针对肿瘤可塑性和癌症干细胞行为的表观遗传修饰因子
摘要：肿瘤异质性是成功治疗癌症的最大挑战之一。肿瘤细胞群由具有不同表型和基因型特征的不同亚群组成。这种多变性对同时成功靶向所有肿瘤亚群提出了挑战。治疗后的复发以前曾使用癌症干细胞模型和克隆进化模型进行解释。癌症干细胞是调节肿瘤可塑性并决定治疗耐药性的重要肿瘤细胞亚群。肿瘤可塑性受与癌细胞存活、生长和转移有关的关键基因的遗传和表观遗传变化控制。靶向与癌症干细胞存活相关的表观遗传调节剂可以开启一种彻底根除癌症的有希望的治疗方法。本文回顾了控制癌症干细胞表观遗传失调的各种因素，包括组蛋白和 DNA 甲基转移酶、组蛋白去乙酰化酶、组蛋白甲基转移酶等表观遗传介质的作用，以及与癌症干细胞调节相关的各种信号通路。我们还讨论了针对这些因素的当前治疗方案以及临床试验中其他有希望的抑制剂。
遗传学
Cas，CRISPR 相关；CRISPR，成簇的规律间隔的短回文重复序列；CRISPRa，CRISPR 介导的转录激活；CRISPRi，CRISPR 介导的转录抑制；crRNA，CRISPR RNA；crRNP，CRISPR 核糖核蛋白；dCas9，核酸酶失活 Cas9；DSB，双链断裂；dsDNA，双链 DNA；dsODN，双链寡脱氧核苷酸；gRNA，向导 RNA；H3K27ac，组蛋白 H3 赖氨酸 27 乙酰化；H3K4me1，组蛋白 H3 赖氨酸 4 单甲基化；LAM-PCR，线性扩增介导的 PCR；LSD1，赖氨酸特异性组蛋白去甲基化酶 1；MCP，MS2 外壳蛋白；MOI，感染复数； p65AD，核因子-κB反式激活亚基激活结构域；PAM，原型间隔区相邻基序；RNAi，RNA干扰；scFV，单链可变片段；sfGFP，超折叠GFP；sgRNA，单向导RNA；ssRNA，单链RNA。
在各种实验影响下的脑组蛋白能系统的个体发生中疾病 生物传感器用于监测种植体周围炎
组胺在大脑发育中起着重要作用，在许多生理和病理过程中进行了研究。中央组胺参与了许多病理状况和疾病的发病机理：肌肉hy potonia，potonia，阿尔茨海默氏病，帕金森氏病，癫痫，癫痫，莫尔·菲尼克成瘾，酒精中毒，自闭症等。[1]。但是，文献中几乎没有关于各种因素对组胺能系统本身的影响的影响的数据。在这篇综述中，我们在病理状况（例如糖尿病和糖尿病的糖尿病和糖尿病，性疾病，低甲状腺功能亢进症，自闭症谱系障碍，自闭症谱系障碍，多巴胺能信号传导的变化以及多巴胺的数量的变化）中，在病理状况（例如糖尿病和糖尿病）中的抄袭障碍，表现出多巴胺的变化丙戊酸，多巴胺和大脑组胺能系统发展中的其他因素。实验性糖尿病
组蛋白去乙酰化酶复合物 MiDAC 调节神经发育基因表达程序以控制神经突生长
摘要有丝分裂脱乙酰酶复合物 (MiDAC) 是一种最近发现的组蛋白脱乙酰酶 (HDAC) 复合物。虽然其他 HDAC 复合物与神经发生有关，但 MiDAC 的生理作用仍然未知。在这里，我们表明 MiDAC 是神经分化的重要调节器。我们证明 MiDAC 可作为神经发育基因表达程序的调节器，并与神经突生长的重要调节器结合。MiDAC 通过一种暗示启动子和增强子上 H4K20ac 去除的机制上调促神经基因（例如编码分泌配体 SLIT3 和 NETRIN1 (NTN1) 的基因）的表达。相反，MiDAC 通过减少神经发生负调节因子的启动子近端和远端元件上的 H3K27ac 来抑制基因表达。此外，MiDAC 的缺失会导致神经突生长缺陷，可以通过补充 SLIT3 和/或 NTN1 来挽救。这些发现表明 MiDAC 在调节 SLIT3 和 NTN1 信号轴的配体以确保神经突发育的正确完整性方面发挥着至关重要的作用。
实时监测爪蟾鸡蛋提取物中单个DNA分子的压实
DNA压实是在有丝分裂过程中凝结和分辨率的凝结和分辨率所必需的，但是单个染色质因子对该过程的相对贡献知之甚少。我们使用高速爪蟾卵提取物和光学镊子开发了一种生理，无细胞的系统，以研究实时有丝分裂染色质纤维的形成，并在单个DNA分子上进行力诱导的拆卸。与将DNA压缩约60％的相间提取物相比，中期提取物将DNA的长度降低了90％以上，这反映了这两种情况下全染色体形态的差异。抑制核小体组装的核心组蛋白伴侣ASF1的耗竭，将中期纤维压实的最终程度降低了29％，而接头组蛋白H1的耗竭效果更大，将总压实降低了40％。 与对照组相比，两种耗竭都降低了压实率，导致了更短的分解时间，并提高了力诱导的纤维拆卸速度。 相比之下，中期提取物中冷凝蛋白的耗竭强烈抑制纤维组件，从而导致瞬态压实事件在高力下迅速逆转。 总的来说，这些发现支持了一种投机模型，在该模型中，冷凝蛋白在有丝分裂DNA压实中起主要作用，而核心和接头组蛋白起作用，可在循环挤出过程中减少滑移并调节DNA压实程度。抑制核小体组装的核心组蛋白伴侣ASF1的耗竭，将中期纤维压实的最终程度降低了29％，而接头组蛋白H1的耗竭效果更大，将总压实降低了40％。与对照组相比，两种耗竭都降低了压实率，导致了更短的分解时间，并提高了力诱导的纤维拆卸速度。相比之下，中期提取物中冷凝蛋白的耗竭强烈抑制纤维组件，从而导致瞬态压实事件在高力下迅速逆转。总的来说，这些发现支持了一种投机模型，在该模型中，冷凝蛋白在有丝分裂DNA压实中起主要作用，而核心和接头组蛋白起作用，可在循环挤出过程中减少滑移并调节DNA压实程度。
衰老的表观遗传改变：简短的审查
结果：衰老伴随着表观遗传标记的各种改变，包括DNA甲基化（非CPG区域中的全球低甲基化和CPG岛的高甲基化），染色质的重排（整体减少组蛋白和组蛋白的重新分布和组织纳修饰）和NCRNA（尤其是miRNA）。表观遗传学是一种可逆的分子机制，可允许治疗干预措施改善或逆转与衰老相关的发病机理。可以开发基于化学的表观遗传操作和基于生活方式的表观遗传重编程策略来改善或逆转与衰老相关的条件。
实时监测爪蟾鸡蛋提取物中单个DNA分子的压实
DNA压实是在有丝分裂过程中凝结和分辨率的凝结和分辨率所必需的，但是单个染色质因子对该过程的相对贡献知之甚少。我们使用高速爪蟾卵提取物和光学镊子开发了一种生理，无细胞的系统，以研究实时有丝分裂染色质纤维的形成，并在单个DNA分子上进行力诱导的拆卸。与将DNA压缩约60％的相间提取物相比，中期提取物将DNA的长度降低了90％以上，这反映了这两种情况下全染色体形态的差异。抑制核小体组装的核心组蛋白伴侣ASF1的耗竭，将中期纤维压实的最终程度降低了29％，而接头组蛋白H1的耗竭效果更大，将总压实降低了40％。 与对照组相比，两种耗竭都降低了压实率，导致了更短的分解时间，并提高了力诱导的纤维拆卸速度。 相比之下，中期提取物中冷凝蛋白的耗竭强烈抑制纤维组件，从而导致瞬态压实事件在高力下迅速逆转。 总的来说，这些发现支持了一种投机模型，在该模型中，冷凝蛋白在有丝分裂DNA压实中起主要作用，而核心和接头组蛋白起作用，可在循环挤出过程中减少滑移并调节DNA压实程度。抑制核小体组装的核心组蛋白伴侣ASF1的耗竭，将中期纤维压实的最终程度降低了29％，而接头组蛋白H1的耗竭效果更大，将总压实降低了40％。与对照组相比，两种耗竭都降低了压实率，导致了更短的分解时间，并提高了力诱导的纤维拆卸速度。相比之下，中期提取物中冷凝蛋白的耗竭强烈抑制纤维组件，从而导致瞬态压实事件在高力下迅速逆转。总的来说，这些发现支持了一种投机模型，在该模型中，冷凝蛋白在有丝分裂DNA压实中起主要作用，而核心和接头组蛋白起作用，可在循环挤出过程中减少滑移并调节DNA压实程度。
组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）抑制剂 - valproic Acid将人黑色素瘤细胞敏感到达卡巴嗪和PARP抑制剂
摘要：文明疾病被定义为影响很大一部分人群的非传染性疾病。此类疾病的例子是抑郁症和心血管疾病。重要的是，世界卫生组织警告说这两者都会增加。此叙述性评论旨在根据现有文献总结有关CVD和抑郁症的可测量风险因素的可用信息。本文回顾了抑郁症和心血管疾病共存的流行病学和主要危险因素。作者强调，有抑郁症与心血管疾病之间有联系的证据。在这里，我们重点介绍了抑郁症和心血管疾病的常见危险因素，包括肥胖，糖尿病和身体不活动，以及预防和治疗CVD在预防抑郁症和其他精神疾病中的重要性。相反，有效的CVD治疗也可以帮助预防抑郁症并改善心理健康结果。似乎建议出于心脏原因对患者进行抑郁症的筛查测试。重要的是，在接受情绪障碍治疗的患者中，值得控制CVD风险因素，例如，在常规就诊期间检查血压和脉搏。也值得关注CVD患者的心理状况。这项研究强调了跨学科合作的重要性。
靶向组蛋白去乙酰化酶增强Erastin诱导的铁死亡对EGFR激活突变肺腺癌的治疗效果
肺癌是死亡率最高的恶性肿瘤，而肺腺癌（LUAD）占所有肺癌的40%（1）。在亚洲，表皮生长因子受体（EGFR）是LUAD最常见的驱动突变，发生率为55%（2-4），其中EGFR激活突变在全球占17.4%，在中国占37.3%（5）。表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂（EGFR-TKI）目前是EGFR突变LUAD患者的标准一线治疗方案（6）。尽管使用EGFR-TKI已为晚期EGFR突变型NSCLC患者带来显著的临床获益和前所未有的生存率提高（7-10），但不可避免地会产生获得性耐药。继发性EGFR突变，包括EGFR-T790M突变和EGFR结构域内的其他突变、MAPK、PI3K和细胞周期基因的突变以及EGFR或其他致癌基因如MET的扩增，导致LUAD细胞获得性EGFR-TKI耐药（11-13）。但有些患者在缺乏已知耐药机制的情况下获得了EGFR-TKI耐药。因此，内在性EGFR-TKI耐药是临床上的一个挑战。据报道，大约20%-30%的EGFR突变型LUAD对EGFR-TKI具有内在性耐药（14）。因此，如何克服这些获得性和内在性的EGFR-TKI耐药一直是临床关注的焦点。