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kinomics数组平台
激化组是对细胞或组织裂解物中激酶信号传导的研究。激素学可以帮助阐明因治疗而改变的细胞信号传导途径（即药物或状况变化），或用于比较不同的表型（即增殖与非增生性）。我们的pamstation kinomic阵列平台测量了最多196个酪氨酸或144个丝氨酸/苏氨酸激酶底物的磷酸化，这些丝氨酸/苏氨酸激酶底物印在Pamchip微阵列上。动力学和稳态的单个肽磷酸化的变化是用FITC磷酸化抗体成像的，并且信号在Bionavigator中进行了定量。然后，将改变肽的改变的肽列表通过使用Kinexus phosphonet等工具，以及使用Genego Metacore的高级途径分析和网络建模来输出并分析可能的上游激酶。
关于临床USP1抑制剂作用机理的结构和生化见解，KSQ-4279
DNA损伤会触发介导修复的细胞信号级联。此信号在癌症中经常失调。介导该信号传导的蛋白质是治疗干预的潜在靶标。泛素特异性蛋白酶1（USP1）就是一个靶标，在临床试验中已经有小分子抑制剂。在这里，我们使用生化测定和冷冻电子显微镜（Cryo-EM）来研究临床USP1抑制剂KSQ-4279（RO7623066），并将其与已建立良好的工具化合物ML323进行比较。我们发现KSQ-4279与ML323的USP1同一隐性位点结合，但以微妙的方式破坏蛋白质结构。抑制剂结合使USP1的热稳定性大大提高，该抑制剂可以通过填充USP1中疏水隧道的抑制剂介导。我们的结果有助于理解分子水平USP1抑制剂的作用机理。
对临床USP1抑制剂作用机理的结构和生化见解，KSQ-4279
摘要：DNA损伤会触发介导修复的细胞信号传导级联。此信号在癌症中经常失调。介导该信号传导的蛋白质是治疗干预的潜在靶标。泛素特异性蛋白酶1（USP1）就是这样一个靶标，在临床试验中已经有小分子抑制剂。在这里，我们使用生化分析和冷冻电子显微镜（冷冻）来研究临床USP1抑制剂KSQ-4279（RO7623066），并将其与已建立的良好工具化合物进行比较。我们发现KSQ-4279与ML323的USP1同一隐性位点结合，但以微妙的方式破坏蛋白质结构。抑制剂结合驱动了USP1的热稳定性的大幅提高，USP1的热稳定性可以通过填充USP1中疏水隧道样口袋的抑制剂介导。我们的结果有助于理解分子水平USP1抑制剂的作用机理。■简介
双重癌症表达的apoptin的抗肿瘤作用 -
摘要。- 凋亡是一种源自鸡贫血的小分子量蛋白，它可以诱导转型细胞和肿瘤细胞的凋亡，并使原发性和未转化的细胞不受伤害。apoptin的细胞定位取决于其自身的磷酸化状态和细胞类型。在肿瘤细胞中，植酸化的凋亡可以进入细胞核，并导致细胞凋亡。而，在正常细胞中，apoptin主要存在于细胞质中。apoptin作为细胞中的无序蛋白质，与细胞信号途径中的许多蛋白质相互作用，诱导肿瘤细胞凋亡。尚未完全阐明凋亡诱导的凋亡的特定机制。因此，apoptin已成为潜在的抗癌剂。这种情况总结了我们的实验室中阿poptin的研究结果，并揭示了由Oncolytic病毒载体在多种肿瘤细胞和小鼠模型上表达的Apoptin的特定抗抗毒素机制。
JAK抑制剂：简介
自身免疫性疾病由于免疫系统的动力学反应改变了各种器官的慢性持续炎症。在这些免疫介导的炎症条件细胞因子或趋化因子中，众所周知的炎症介质通过激活Janus激酶 - 信号传感器和转录细胞信号蛋白（JAK-Stat）的激活剂来起关键作用。这些信号蛋白是一组细胞内激酶分子。细胞因子通过多种细胞表面受体调节细胞功能和细胞信号系统。细胞因子及其受体的细胞外结构域在细胞内结构域诱导构象变化，这导致激活，即细胞内激酶酶的磷酸化，从而触发信号转导事件并导致基因转录。Janus激酶（JAK）是一个细胞内酪氨酸激酶的家族，由于它们与多个细胞因子的信号传导过程相关，可调节炎症反应。1,2 Janus激酶家族由四个成员组成：JAK1，JAK2，JAK3和TYK2。1,2 JAK-1/2/3和TYK2被招募并激活
微生物学多功能性和复杂性的年度评论：LYSR型转录调节器的常见和罕见的方面
LYSR型转录调节剂（LTTR）构成了细菌调节剂最大的家族之一。它们被广泛分布，并为新陈代谢和生理学的各个方面做出贡献。大多数是同二探测器，每个亚基由N末端DNA结合结构域组成，然后是连接到效应器结合域的长螺旋。lttr通常在存在或不存在小分子配体（效应子）的情况下结合DNA。响应细胞信号，构象变化改变了DNA间断，与RNA聚合酶接触，有时与其他蛋白质接触。许多是双功能阻遏激活剂，尽管在多个启动子处可能发生不同的调节模式。本综述介绍了调节分子基础，调节方案的复杂性以及生物技术和医学中应用的最新信息。丰富的LTTR反映了它们的多功能性和重要性。虽然单个监管模型无法描述所有家庭成员，但相似性和差异的比较为将来的研究提供了框架。
内容
• MU Life Science Seminars (DSCB060 and DSCC060) - Mandators 4 Semesters • Molecular Medicine (DSMOLM01) - Mandators • Suggested Couters in English: Advanced Molecular Medicine (DSAMOLM), Synthetic Biology (BI9690EN), Molecular Mechanisms of Cell Aging (C3901), Structural Biology Methods (FB830), Biological X-Ray Crystalograpy and Cryo-Electron Microscopy (C7270), Protein-Char Interactions (C9085), RNA Metabolism (C9095), Methods In Proteomics (CG990), Genomics (CG920), Modern Genomic Technologies (DSMGT01) • Suggested Courses in Czech: New Trends in Pathological Physiology （DSNTZ01），医学免疫学的新趋势（DSTIZ01）诊断先天性疾病（C7490），病理生理过程的分子本质（C8175），分子胚胎学（BI8790），细胞和分子神经生物学（BI9260），以及免疫源性（BI9260），和分子神经元学（BI9260）。 （C3900），代谢的调节（C7150），细胞信号（C8155）
代谢组学与PD-1抑制剂加的关联...
抽象背景癌症免疫疗法（包括免疫检查点抑制剂）仅对有限的癌症患者有效。因此，预计新型癌症免疫疗法的发展。在初步研究中，我们证明了四环素增强了T细胞反应。因此，我们在这里研究了四环素对人外周T细胞，鼠模型和非小细胞肺癌患者（NSCLC）患者的抗肿瘤T细胞反应的疗效，重点是T细胞中的信号途径。使用双特异性T细胞Engager（Bite）技术（咬合分析系统）评估外周和肺肿瘤浸润的人T细胞对肿瘤细胞的细胞毒性。与抗编织细胞死亡1（PD-1）抗体Nivolumab相比，使用咬合测定系统检查了健康供体血液和NSCLC患者肿瘤组织T细胞的影响。通过流式细胞仪，ELISA和QRT-PCR分析 T细胞信号分子。为了研究四环素的体内抗肿瘤作用，在存在或不存在抗小鼠CD8抑制剂的情况下，将四环素口服给植入鼠肿瘤细胞系的BALB/C小鼠。结果获得的结果表明，四环素随着颗粒酶B的上调增强了抗肿瘤T细胞毒性，并增加了人外周T细胞中干扰素-γ的分泌，而NSCLC患者的肺肿瘤组织则增强。在相同条件下用抗PD-1抗体处理的T细胞中未观察到这些变化。T-细胞信号传导的分析表明，CD4 +和CD8 + T细胞中的CD69被米诺环素上调。T细胞受体信号传导，ZAP70磷酸化和NUR77的下游也在T细胞激活后的早期阶段被米诺环素上调。在鼠肿瘤模型中，四环素的给药表现出抗肿瘤疗效，CD69的上调和肿瘤抗原特异性T细胞的增加。通过抗小鼠CD8抑制剂的给药取消了这些变化。结论是，四环素通过ZAP70信号传导增强了抗肿瘤T细胞免疫。这些结果将有助于新型癌症免疫疗法的发展。
论文的主题
论文主题：BAP1/ASXLS复合物及其相互作用伙伴的生化和功能表征：对表观遗传调节，细胞周期控制和肿瘤抑制的影响。Affar博士的团队对表观遗传调节的复杂机制感兴趣，特别是与PolyComb组的蛋白质有关。BAP1/ASXLS复合物，表观遗传调节中的关键参与者是我们研究的核心。尽管它们的重要性，但仍然有很多事情可以发现BAP1/ASXLS蛋白如何促进表观遗传调节以及它们的放松管制如何影响癌症和其他疾病。使用先进的基因组学方法，生物信息学，蛋白质组学和小鼠遗传学（包括CRISPR/病例技术），我们旨在发现BAP1/ASXLS蛋白在表观遗传调节和癌症中的作用和机制。这个项目是在蛋白质组学，基因组学和细胞信号传导的最前沿学习方法和概念的绝佳机会。El Bachir Affar博士的研究团队旨在招募非常有动力的学生博士学位。候选人必须接受分子生物学，生物化学或生物医学科学或相关学科的培训，具有出色的注释，组织技能，并且对细胞信号传导和分子肿瘤学有生动的兴趣。年度奖学金28,000美元，有兴趣的候选人必须提交课程，大学笔记的陈述和单个PDF文档中的求职信，致为：El Bachir Affar，博士（El.bachir.affar@umontreal.ca） https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?term= el%2C+Affar选择出版物：核链接氨基酸供应（Nature Comm 2021）https://pubmed.ncbi.nlm.nlm.nih.gov/3488888888888888888888887888888715/肿瘤抑制BAP1（自然通讯2018）的去泛素酶活性工艺（自然通讯2020）https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33230107/自体泛素化保护肿瘤抑制BAP1免受胞质隔离的影响，由胞质隔离免受胞质的隔离，由dypical ubiquitin ubigitin ubase ubease ubease ubease ubease ubease ubease ubease ubease ubease ubease ubease ubease ubease ubeasual ubequel ubebase ubequarl ubequel ubequar ubequar ubequar ubequar ubequar ubequar ube ube 2014） https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24703950/
靶向蛋白质降解以克服癌症治疗中的耐药性：PROTAC 和 N-Degron 通路
摘要：对癌症生长和增殖的分子机制的理解不断深入，推动了以癌症驱动分子为靶点的药物的飞速发展。大多数靶分子是蛋白质，例如激酶和激酶相关受体，它们具有细胞信号级联所需的酶活性。这些靶分子的小分子抑制剂大大提高了治疗效果，降低了癌症治疗中的全身毒性。然而，长期大剂量使用小分子抑制剂治疗癌症也带来了其他障碍，例如对抑制剂的耐药性。在克服癌症耐药性的最新方法中，靶向蛋白质降解 (TPD) 如蛋白水解靶向嵌合体 (PROTAC) 技术采用了一种独特的作用机制，即通过细胞蛋白水解系统（例如泛素-蛋白酶体系统或自噬）破坏靶蛋白。在这里，我们回顾了目前开发的 PROTAC 作为癌症治疗的代表性 TPD 分子和 N-降解途径的 N-降解作为潜在的 TPD 配体。