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细胞学DNA甲基化用于宫颈癌筛查
子宫宫颈癌是全球妇女（1）和中国（2）中与癌症相关死亡的最常见原因之一，中国患者占全球新宫颈癌总数的28％（3）。鲁棒和标准筛查计划将显着降低宫颈癌的发生率（4）。目前，宫颈细胞学和/或高危人乳头瘤病毒（HRHPV）测试是主要筛查方法（5，6）。但是，细胞学和HRHPV测试都在其诊断准确性方面都有局限性（7，8）。一种具有很高准确性和可行性的成本益处对于宫颈癌筛查的决策至关重要（9），并且在中国等发展中国家也迫切需要。DNA甲基化是一种表观遗传机制，可导致基因的遗传沉默，而不会改变其编码序列（10，11）。已有100多个人类（宿主）基因可能是宫颈癌的甲基化生物标志物（12），其中一些基因已得到与宫颈癌发展相关的验证（13）。HPV整合事件下组蛋白修饰的变化与附近基因和内源性逆转录病毒的上调相关（14）。基因分型和甲基化标记是客观的，即使在尿液样本（15）中，也可以与自我获得的样品一起使用（9），在低收入和中等收入设置中具有很大的优势。多个面板已被用作分类器，由数十个候选宿主基因，病毒基因或两者以及其各种组合组成（16）。众多研究表明，甲基化对宫颈上皮内肿瘤（CIN）2或更严重的病变具有有利的筛查敏感性（CIN2+或高级上皮内病变[HSIL]）作为阳性HRHPV状态的女性的三叶叶方法。甲基化测试作为宫颈癌筛查的未来方法之一。但是，大多数研究仅针对宫颈癌筛查程序中甲基化测定的分类作用，而不是其独立的诊断能力。先前的宫颈程序和子宫肾脏或卵巢疾病对细胞学甲基化测定的影响几乎没有得到研究。果酱（连接粘附分子）家族是免疫球蛋白超家族的一部分，对上皮细胞和内皮细胞的紧密连接功能有直接影响（19）。jam3已被广泛研究为粘附和移民的调节剂（20）。最近的研究揭示了JAM3在肿瘤进展过程中肿瘤生长调节中的关键作用（21）。红细胞膜蛋白蛋白4.1像3（EPB41L3），也称为蛋白4.1b/dal-1，是一种膜骨骼蛋白，参与了各种细胞骨架相关的过程。其功能包含单元格
在“诊断和治疗策略”中，对 p16/Ki- 67 细胞学检测作为高危 HPV 阳性女性的分类检测进行评估
。CC-BY 4.0 国际许可 它是永久可用的。 是作者/资助者，已授予 medRxiv 许可以显示预印本（未经同行评审认证）预印本 此版本的版权所有者于 2025 年 1 月 29 日发布。；https://doi.org/10.1101/2025.01.26.25321149 doi：medRxiv 预印本
检查的问题I.细胞学和一般组织学
1。组织学（特征，与其他医学学科的关系，实际意义）2。组织学幻灯片的制备3。组织学染色4。细胞膜5。单元连接6。单元格的内部体系结构7。lamina basalis 8。细胞表面专长9.膜运输10。外周血的组成（一般特征）11。红细胞生成（骨髓，外周血）12。粒状粒子（骨髓，外周血）13。巨型摩毛虫（骨髓，外周血）14。上皮组织（一般特征）15。上皮组织的再生16。覆盖上皮17。腺上皮18。结缔组织的细胞19。细胞外基质20。结缔组织的类型21。软骨22。骨头23。膜内和内软骨骨化24。平滑肌25。骨骼肌26。心肌27。神经元，神经元的类型28。突触29。Neuroglia 30。神经纤维和周围神经末端的类型31。T和B淋巴细胞32。免疫反应的形态基础33。人类吞噬系统34。凋亡（组织形态）35。脂肪结缔组织36.伤口愈合（皮肤）37。免疫组织化学原理及其在组织学上的重要性
深度学习驱动的细菌细胞学分析以确定结核分枝杆菌的抗菌机制
结核病 (TB) 是由结核分枝杆菌引起的，仍然是全球健康的重大威胁，估计 2022 年将影响 1060 万人。耐多药和广泛耐药菌株的出现迫使人们开发新型有效药物。加快确定这些药物的作用机制 (MOA) 对于推进结核病治疗至关重要。本研究介绍了 MycoBCP，这是针对结核分枝杆菌量身定制的独特细菌细胞学分析 (BCP)，利用 BCP 中的卷积神经网络 (CNN) 来克服传统图像分析技术带来的挑战。使用 MycoBCP，我们分析了各种抗菌化合物对结核分枝杆菌的形态学影响，捕捉广泛的模式而不是依赖精确的细胞分割。这种方法避免了结核分枝杆菌中普遍存在的细胞聚集和染色不均匀等问题。在盲测中，MycoBCP 准确识别了 96% 化合物的作用机理，只有一次错误分类，即利福布汀，它被错误地归类为影响翻译而不是转录。转录和翻译抑制产生的相似形态表明需要进一步改进以更有效地区分它们。将 MycoBCP 应用于一系列抗结核药物，成功识别了已知的作用机理并揭示了独特的作用，证明了其在早期药物发现和开发中的实用性。我们的研究结果强调了基于 CNN 的 BCP 在提高作用机理测定的准确性和效率方面的潜力，特别是对于结核分枝杆菌等具有挑战性的病原体。MycoBCP 代表了结核病药物开发的重大进步，为高通量筛选抗菌化合物提供了一种强大且适应性强的方法。
评估HPV-DNA患病率和基因型分布和细胞学检查结果评估HPV-DNA患病率和基因型分布和细胞学检查结果
结论：人乳头瘤病毒患病率和基因型根据该地区和研究组而有所不同。在Türkiye中，据报道HPV阳性在3.2％至80.0％之间。 在这项研究中，HPV-DNA阳性为40.4％，而细胞学异常患者的率提高到51.6％。 在研究中仅检查了高风险的基因型。 虽然HPV 16和18最常见于世界上遇到的，但以下基因型可能有所不同。 在我们的研究中，HPV 16最经常发现，其次是HPV 56，HPV 18和HPV 51。。 在25.1％的样品中检测到细胞学异常，最常见的是ASC-US/ASC/H（55.9％），其次是LSIL（23.6％）和HSIL（11.7％）。 在细胞学检查中没有异常情况的37％的病例中检测到 HPV-DNA，发现其中56.4％为HPV 16和/或18。 总而言之，这项研究支持HPV 16是最常检测到的基因型，并且以下基因型可能会有所不同。 需要大量女性的多中心研究来揭示区域差异并阐明疫苗研究。 此外，在研究中未检测到的病理学的样品中检测高风险的HPV基因型在强调HPV-DNA测试在预防和早期诊断宫颈癌中的重要性方面也很有价值。在Türkiye中，据报道HPV阳性在3.2％至80.0％之间。在这项研究中，HPV-DNA阳性为40.4％，而细胞学异常患者的率提高到51.6％。在研究中仅检查了高风险的基因型。虽然HPV 16和18最常见于世界上遇到的，但以下基因型可能有所不同。在我们的研究中，HPV 16最经常发现，其次是HPV 56，HPV 18和HPV 51。细胞学异常，最常见的是ASC-US/ASC/H（55.9％），其次是LSIL（23.6％）和HSIL（11.7％）。HPV-DNA，发现其中56.4％为HPV 16和/或18。总而言之，这项研究支持HPV 16是最常检测到的基因型，并且以下基因型可能会有所不同。需要大量女性的多中心研究来揭示区域差异并阐明疫苗研究。此外，在研究中未检测到的病理学的样品中检测高风险的HPV基因型在强调HPV-DNA测试在预防和早期诊断宫颈癌中的重要性方面也很有价值。
与人乳头瘤病毒亚型的Ascus，LSIL和HSIL患者的PAP涂片的细胞学发现之间的相关性
1。伊朗Zabol医学科学大学Amir Al Momenin医院医学院内科学系，伊朗2。伊斯兰阿扎德大学兽医系（DVM），伊朗Shahrkord Shahrkord分公司3。 伊斯兰阿扎德大学基础科学学院微生物学系，伊朗科尔曼分公司，伊朗4。 Zabol医学科学大学的药用植物研究中心，伊朗Zabol 5。 伊朗德黑兰哈拉兹米大学生物科学学院蜂窝和分子生物学系6. 伊斯兰艾萨德大学生物学系，德黑兰中央分支，德黑兰，伊朗7。 医学工厂医学院研究中心妇产科，伊朗Zabol医学科学大学Amir Al Momenin医院Amir Al Momenin医院 Zabol医学科学大学医学院病理学系，伊朗Zabol伊斯兰阿扎德大学兽医系（DVM），伊朗Shahrkord Shahrkord分公司3。伊斯兰阿扎德大学基础科学学院微生物学系，伊朗科尔曼分公司，伊朗4。Zabol医学科学大学的药用植物研究中心，伊朗Zabol 5。伊朗德黑兰哈拉兹米大学生物科学学院蜂窝和分子生物学系6.伊斯兰艾萨德大学生物学系，德黑兰中央分支，德黑兰，伊朗7。医学工厂医学院研究中心妇产科，伊朗Zabol医学科学大学Amir Al Momenin医院Amir Al Momenin医院Zabol医学科学大学医学院病理学系，伊朗Zabol
细胞学 - 诊断 - 乳液 - 液体 - 癌症筛查。 ...
对服务的描述除了寻求对乳腺癌的更有效治疗外，研究旨在通过早期检测来降低死亡率。对乳腺导管液中发现的上皮细胞的细胞学检查已被研究为乳腺癌的早期指标。可以通过导管灌洗或乳头吸入获得导管液。导管灌洗是一种侵入性手术，可以通过将微导管通过乳头插入乳房导管来去除导管液。乳头抽吸也可以使用细针抽吸或无创进行。导管液，该管道镜检查允许使用非常薄的内窥镜直接可视化乳房导管。纤维导管镜检查可与抽吸细胞学，活检或手术切除一起评估异常的乳头排放。临床证据导管灌洗（DL）国家癌症研究所（NCI）指出，虽然已经提出了分析乳腺组织恶性肿瘤的各种方法来筛查乳腺癌的乳腺癌，包括细针吸入，乳头抽吸和导管灌洗，但没有一个与死亡率降低有关（NCI，2024）。国家综合癌症网络（NCCN）乳腺癌筛查和诊断指南不建议使用DL。此外，乳头涂片细胞学很少有帮助，并且不建议患有乳头排出但没有明显症状的患者（NCCN，2024年）。do conto等。最重要的顶部两个途径是Wnt和ERBB（P <0.0001）。Cyr等。 全部进行了导管灌洗。 Francescatti等。Cyr等。全部进行了导管灌洗。Francescatti等。（2016）对单侧乳腺癌患者的乳腺导管液进行了microRNA分析（n = 22），发现肿瘤之间的17个差异表达的miRNA和来自导管乳腺癌患者的成对正常样品。对这些差异表达的miRNA的系统生物学分析指向可能被描述为在乳腺癌中起重要作用的可能途径和细胞过程。其中，几种途径是癌症分子信号传导的标志，包括用于乳腺癌，Wnt，ERBB，MAPK，TGF-β，MTOR，PI3K-AKT和p53信号通路（数据未显示）。作者报告说，他们的结果表明对乳腺导管液的miRNA分析是可行的，对于检测乳腺癌非常有用。研究限制在各个阶层中都是样本量，这将通过未来的大型研究来解决。（2011）进行了一项前瞻性的单中心研究，以确定哪些组织学病变在灌洗样本中产生细胞异型，以及导管镜是否为评估非典型灌洗细胞学的高危患者提供了有用的信息。总共招募了患乳腺癌的高风险35岁的女性。妇女发现非典型人接受了导管镜检查的导管切除（第1组）。观察到没有非典型性的妇女（第2组）。 中位年龄为49岁（34-73）年，中位随访时间为80（5-90）月。 总体上，有27（26％）具有非典型的灌洗细胞学（第1组），而75（74％）具有良性细胞学（第2组）。 随访时，三名患者患上了乳腺癌，其中包括一名1组患者和两名2组患者。观察到没有非典型性的妇女（第2组）。中位年龄为49岁（34-73）年，中位随访时间为80（5-90）月。总体上，有27（26％）具有非典型的灌洗细胞学（第1组），而75（74％）具有良性细胞学（第2组）。随访时，三名患者患上了乳腺癌，其中包括一名1组患者和两名2组患者。在第1组中的随后的导管切除表明11（44％）的良性组织学，9（36％）的乳头状瘤，4（16％）的非典型增生（AH）和1（4％）的原位（DCIS）中的4（16％）和导管癌。尽管有20％的高危女性具有导管性灌洗症的妇女在随后的切除时患有AH或恶性肿瘤，但大多数人却没有。作者得出结论，即使在这种高危人群中，通过导管灌洗确定的非单独症与患乳腺癌的风险无关。在一项队列研究中，Carruthers等。（2007）评估了导管灌洗是否可以预测乳腺癌的发生，并进一步分层高危患者的乳腺癌。在116名高危患者中进行了导管灌洗（Gail风险评分>或= 1.7％，先前的乳腺癌，强大的家族病史，以前的可疑活检标本）。如果确定了非典型细胞或乳头状细胞，则启动了标准的评估方案。对116例患者进行了233次灌洗。25例患者的27个灌洗液产生非典型或乳头状样细胞。对非典型人士进行进一步评估的15例患者没有癌性或癌性病变的证据。所有患者均经过跟进：2种乳腺癌，两者都有以前的灌洗正常。在随访期间，没有异常灌洗的患者会出现癌症。作者得出结论，导管灌洗在筛查高危患者方面的价值有限。（2005）评估了120例高危乳腺癌患者的导管灌洗的结果。32例患者被排除在外，因为29例没有产生乳头抽吸液，并且外科医生无法在3例患者中插管产生的废水管道。15例（17％）的上皮不足
通过对细胞学阴性脑脊液进行纳米孔测序快速诊断脑淋巴瘤
影响中枢神经系统的血液系统肿瘤，最突出的是侵袭性 B 细胞淋巴瘤，需要快速诊断（通常通过立体定向活检）以启动治疗，从而促使采用非侵入性方式 [6]。在具有挑战性的病例中，脑脊液 (CSF) 的 DNA 甲基化 (DNAmeth) 和拷贝数变异 (CNV) 分析可能满足这一需求。健康和肿瘤细胞，包括中枢神经系统淋巴瘤 [11]，可能会将 DNA 片段脱落到血液和脑脊液中作为无细胞 DNA (cfDNA)。此外，细胞碎片可以形成沉淀 DNA (seDNA)。在几例儿童高级别脑肿瘤中，CSF 含有足够量的肿瘤衍生 cfDNA (cf-tDNA)，可通过基于连接的纳米孔测序进行基于甲基化和 CNV 的肿瘤分类 [ 1 ]，并通过各种方法进行疾病监测 [ 15 ]。目前，这些方法需要费力的样品处理和昂贵的基础设施。在这里，我们已经将我们的快速无监督机器学习 (ML) 方法 [ 9 ] 改编为 CSF，用于对淋巴瘤和其他恶性脑肿瘤（包括转移瘤）进行鉴别诊断的病例。我们在两例 CNS 淋巴瘤病例中展示了它的临床应用。允许第二天将纳米孔测序衍生的甲基化模式与泛癌表观基因组和 CNV 数据进行比较
糖尿病中颊和牙龈粘膜的去角质细胞学2
摘要。患者的糖尿病易于在口腔中增加细菌的增加，这可能会导致颊和牙龈粘膜细胞异常。本研究旨在通过使用GIEMSA染色和周期性酸SCHIFF（PAS）分析2型糖尿病的高血糖水平以及颊和牙龈细胞学细胞的状况。这项研究是对横截面方法的一项观察性研究，使用了16位糖尿病的受访者，其血糖水平为321.87±91.86 mg/dl。颊细胞的观察结果表明，有10人患有正常细胞（62.5％），而6人的损害较弱（37.5％）。牙龈细胞状况发现8人患有正常细胞（50％），6人的细胞损伤（37.5％）弱（37.5％），2人患有中等细胞损伤（12.5％）。PAS染色的上皮细胞的结果显示出10人（62.5％）的正常情况，在3人中略有损坏（18.8％），3人（18.8％）中等损坏。基于统计分析的结果，获得了血糖水平与牙龈和牙龈粘膜异常之间没有显着关系，p值= 0.105（Buccal），p值= 0.151（牙龈）（牙龈）（牙龈）（牙龈），但在PAS（p-value = 0.048）的上皮细胞中的血糖水平= 0.151（牙龈）（牙龈）（牙龈）（牙龈），但具有显着的关系。将来可以进行前瞻性和比较研究，以观察糖尿病患者（DM）患者的PAS染色的发展。这可以帮助探索与血糖控制有关的波动变化
人类乳头瘤病毒（HPV）和细胞学测试申请
•资格标准：25岁及以上的子宫颈的人曾经有过性活跃并且具有有效的OHIP编号。•可以在ontariohealth.ca/ocsp-recmummendations上找到安大略省宫颈筛查计划的宫颈筛查建议和戒烟标准。•免疫屈辱的人群包括患有艾滋病毒/艾滋病的人（不管CD4细胞计数如何），先天性（原发性）免疫缺陷，全身性狼疮性红细胞，无论是否接受肾衰竭，是否需要接受免疫抑制剂治疗，需要连续或需要透射的人（固体或疾病）（固体或植物）（固体或异源）（固体）或异垂态（同源性）频繁的间隔）与导致免疫抑制3年或更长时间的药物。•任何可见的宫颈异常都需要转介给专家。