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World File Search System肠道病毒
哲学硕士（微生物学）研究生课程
水、食物、奶制品、肉类、蛋类、蔬菜、水果、空气等。• 运用知识控制人群中的微生物疾病。理论：人畜共患病的概念和分类；人畜共患病的病因、宿主范围、流行病学、传播、发病机制、诊断和管理的全面描述。人畜共患病细菌，如芽孢杆菌、梭菌、分枝杆菌、假单胞菌、钩端螺旋体、布鲁氏菌、弯曲杆菌、沙门氏菌、耶尔森氏菌、李斯特菌、葡萄球菌、链球菌、大肠杆菌和弧菌、猫抓病、衣原体、伯氏疏螺旋体等：病毒性人畜共患病的详细描述：流感、狂犬病、蜱传脑炎、肠道病毒、细小病毒、腺病毒、星状病毒、钙化病毒和冠状病毒、媒介传播病毒等。日本脑炎、基亚萨努尔森林病、克里米亚-刚果出血热、登革热、西尼罗河病毒、黄热病、裂谷热、马脑炎、马蹄跳、以及一些罕见和潜在的人畜共患病毒，如新城疫、口蹄疫和痘病毒、食物传播病毒，如轮状病毒和朊病毒。真菌性人畜共患疾病：念珠菌病、皮肤癣菌病、芽生菌病、曲霉病、组织胞浆菌病、癣菌感染、球孢子菌病、隐球菌病、霉菌毒素中毒。微生物性人畜共患疾病的预防和控制措施，特别针对兽医/辅助兽医人员。实践：人畜共患病原体的分离和鉴定，人畜共患疾病的分子诊断程序。基于调查的重要区域性人畜共患病爆发研究 推荐阅读： 1. Burlage, RS, 2011. 公共卫生微生物学原理。Jones and Bartlett Learning，
针对B组Coxsackievieviruses及其重要性
肠病毒属于picornaviridae家族，智人是肠道病毒的天然宿主，已知会引起各种疾病[1，2]。在当前的分类系统中，肠病毒是基于表型和网格的相似性依次编号的，并被分类为四个不同的物种：polioviruses，polioviruses，coxsackievievieviruses，echovieviruses，echovoviruses，echoviruses，以及新鉴定的诸如EV69，EV70，EV70，EV70，EV70，EV71和EV71和EV71和4] [3，4] [3，4]。虽然呼应病毒会影响上呼吸道和中枢神经系统[5]，但Coxsack- Ievirus会影响心血管，胃肠道，内分泌，神经肌肉和皮肤系统[6-10]。coxsackievievievieviepirus根据其器官的性质，器官损伤和抗原反应分类为A组（CVA）和Coxsackievirus B组（CVB）[11，12]。尽管CVA通常与手，脚和口腔疾病的病因有关[13]，但CVB可以诱导多种疾病。CVB于1947年第一次在美国纽约的哈德逊河镇库克萨奇镇分离出来[14]。CVB的六种血清型（CVB1至CVB6）已被鉴定，并且与与心脏，胰腺，脑，脑和胃肠道有关的几种疾病有关[15-18]。CVB1主要与1型糖尿病（T1D）相关，也可能引起胸膜炎，无菌性脑膜炎和新生儿败血症[15，19]。同样，CVB4也与T1D发育有关[16]，而CVB5与诸如手，脚和口腔疾病，无菌性脑膜炎，病毒性脑炎，急性肺炎瘫痪，心肌炎，心肌炎和T1D等疾病有关[25-27]。虽然已从急性心肌炎，无菌性脑膜炎和急性脑膜脑炎的患者中分离出CVB2 [20-22]，这会导致多器官衰竭和心脏源性休克[17]，但CVB3感染与心肌炎有关，导致心肌疗法（DCM）和心脏病（DCM）和心脏失败[23,23,24]。然而，有关CVB6感染患病率的孤立报告，但据报道，急性发热性疾病，皮疹，严重急性呼吸道疾病，脑膜炎，心肌炎和/或心包炎的患者已有与CVB5共同感染[27]。尽管所有这些感染都是可以预防的，但目前尚无针对它们的疫苗，部分原因是开发血清型特异性疫苗是不切实际的。
利用宏基因组测序分析杭州市城市饮用水的微生物群落
虽然传统的依赖培养的方法可以有效检测某些微生物，但市政饮用水 (DW) 微生物组的综合组成，包括细菌、古菌和病毒，仍然未知。宏基因组测序为准确确定和分析 DW 的整个微生物群落打开了大门，全面了解 DW 物种多样性，特别是在 COVID-19 时代的公共卫生问题背景下。在这项研究中，我们发现大多数可培养细菌和一些粪便指示菌，如大肠杆菌和铜绿假单胞菌，在所有样品中均无法使用依赖培养的方法培养。然而，宏基因组分析表明，DW 样品中的主要细菌种类属于变形菌门和浮霉菌门。值得注意的是，甲基杆菌属在所有水样中最为丰富，其次是鞘氨醇单胞菌、芽生菌和固氮螺菌。虽然检测到了低水平的毒力相关因子，例如 Esx-5 VII 型分泌系统 (T7SS) 和 DevR/S，但仅在一个样本中以低丰度鉴定出红霉素抗性基因 erm (X)，一种 rRNA 甲基转移酶。在一些样本中鉴定出了与毒力和抗性基因相对应的宿主，包括分枝杆菌属。在一些 DW 样本中发现了微量的古细菌 DNA（Euryarchaeota、Cren archaeota）。使用胶体金和实时逆转录聚合酶链反应 (RT ‒ PCR) 方法，所有 DW 样本中的轮状病毒、柯萨奇病毒、人类肠道病毒和 SARS-CoV-2 等病毒均为阴性。然而，在一些 DW 样本中发现了编码新目逆转录病毒（Ortervirales）和疱疹病毒目的 DNA。整个微生物群落的代谢途径涉及细胞间通讯和信号分泌，有助于水中不同微生物种群之间的合作。本研究利用培养依赖方法和宏基因组测序结合生物信息学工具，深入了解了 COVID-19 大流行期间中国杭州 DW 的微生物群落和代谢过程。
可供未来学生使用的顶点项目列表...
S/N 项目标题 1 控制碳水化合物利用并促进肺炎链球菌上皮细胞结合的基因调控网络 2 基于 RNA 结构的新型 mRNA 设计，用于基因治疗和疫苗接种 3 延长寿命：CURATE.AI 用于定制 NMN 利用和治疗增强 (ACCURATE) 临床试验 4 人工智能识别人类癌症基因组中的癌症驱动突变 5 用于 HSC 靶向基因治疗的骨髓芯片 6 癌症治疗诊断学和新型示踪剂的开发，用于多模态分子成像和靶向放射性配体治疗与多种癌症免疫疗法相结合 7 表征减毒活黄病毒疫苗疫苗突变的分子机制 8 复杂生物疗法的化学合成 9 揭示类固醇诱导病毒感染增加的分子机制 10 揭示合成衍生物作为抗登革热病毒抗病毒剂的潜力 11 设计和研究下一代哑铃形DNA载体和反式剪接RNA 12 设计递送平台以提高细胞外囊泡的生物利用度以用于癌症治疗 13 开发受蝙蝠启发的基于蛋白质的局部抗炎疗法，用于治疗人类皮肤炎症疾病 14 开发线粒体抑制剂的药物类似物作为治疗剂 15 开发新型基于RNA的线粒体递送载体，用于线粒体靶向核酸以进行线粒体基因治疗和抗衰老 16 开发跨物种肝脏类器官模型以确定减轻肝脏胰岛素抵抗的新药物靶点 17 开发用于检测人畜共患病毒T细胞的快速全血检测方法 18 开发癌症疫苗：针对公共肿瘤抗原和个体化新抗原的RNA疫苗 19 发现用于检测肠道病毒D68感染的生物标志物 20 发现膜配体转运蛋白用于功能性药物筛选试验 21 基于 DNA 的非病毒基因治疗 22 表观遗传肿瘤突变调节药物疗效和结肠直肠癌的致癌作用 23 探索肌醇在调节妊娠糖尿病中胎盘脂质和肌醇衍生物代谢中的效用 24 细胞外囊泡 (EV) 和 EV 模拟疗法用于椎间盘再生 25 细胞外囊泡递送靶向 KRAS 的疗法用于治疗胰腺癌和转移
摘要汇编 - 纽约州立国务院
引言和致谢。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。第1页，两种不同批准的污渍对纽约市供水的病原体结果的影响 - Kerri Alderisio和Lisa Anne Blancero。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。第2页鱼类是否关心Catskill山流中的天然渠道设计修复？- 巴里·巴尔迪戈（Barry Baldigo）。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。3。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。第4页。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。第5页通过Wachusett水库流域，马萨诸塞州中部 - 辛西娅·卡斯特伦，埃里希·菲尔德，戴维·菲尔德和宝拉·里斯，二霉素副产品的表征，转化和运输。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。第6页印度布鲁克 - 克罗顿峡谷分水岭保护行动计划 - 特蕾西·科比特（Tracey Corbitt）和苏珊·达林（Susan Darling）。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。第7页。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。第9页。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。第10页第10页的签名签名到纽约流的污染物 - 查尔斯·道夫，安东尼·K·奥夫登坎普，琳达·G·C·卡特和大卫·B·阿科特。。。。。。。页。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。第12页有点加密好吗？很高的量抽样结果 - Stephen estes-Smargiassi。。。。。。。。。。第13页，马萨诸塞州中部的Wachusett水库流域建模，用于改进流域管理 - Erich Fiedler，Paula Rees和David Reckhow。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。第14页粗糙的钻石：西雅图的雪松河流域 - 苏珊娜·弗拉德（Suzanne Flagor）和达里安·戴维斯（Darian Davis）。。。。。。。第15页使用公共宣传和教育，讨论宠物废物的危险，以此作为降低饮用水供应支流中细菌负荷的工具 - 凯利·弗雷达（Kelly Freda）。。。。。。。。。。。第16页确定道路盐对地下水质量在纽约萨福克县 - 泰兰·富勒（Tyrand Fuller）的BR/CL摩尔比分析中对地下水质量的影响。。。。。。。。第17页的环境和经济影响增加了玉米土地，并将不采用管理纳入纽约奶牛场 - 卢拉·盖布雷梅尔（Lula Ghebremichael），塔米·韦思（Tamie Veith），保罗·塞罗萨雷蒂（Paul Ceroletti）和戴尔·露德（Dale Dewing）。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。第18页的白尾鹿浏览对流域森林以及DEP的评估和管理策略 - 弗雷德·胶质的影响。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。第19页使用膜微孔升级废水设施遵守纽约市分水岭规则和法规，案例研究：霍巴特，纽约 - 乔·哈比布和理查德·雷德米尔。。。。。。。。。。第20页，在哈德逊流域以西 - Myrna Hall，Prajjjwal K. Panday，Charles A. S. Hall和Mary Tyrrell的纽约市，不透水表面在未来的营养负荷中的作用。。。。。。。。。。。。。。。。Page 21 Catskill流域公司化粪池监测计划 - James Hassett和Thomas Dejohn。。。。。Page 22风暴事件监测2006年Esopus Creek的病原体 - Paul Lafiandra。。。。。。。。。。。。。。。。。。。第23页利用流域土地信息系统来管理城市拥有的供水土地和保护地役权 - Paul Lenz。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。第24页贾迪亚属的雨水负荷。和隐孢子虫属。在纽约市水库的多年生溪流中 - 克里斯蒂安·佩斯（Christian Pace），凯里·安·阿尔德里西奥（Kerri Ann Alderisio），詹姆斯·C·阿莱尔（James C.。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。第25页的肠道病毒在纽约市的Catskill和特拉华州流域 - 杰拉尔德·普拉特（Gerald Pratt）和克里·奥尔德里西奥（Kerri Alderisio）的地表水中发病率。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。第26页