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World File Search System脂氧合酶
环氧合酶、脂氧合酶和……的多态性
◥ 阿司匹林和二十碳五烯酸 (EPA) 可降低结肠直肠腺瘤性息肉风险并影响氧化脂质的合成，包括前列腺素 E2 。我们在随机 2 2 析因 SEAFOOD 试验中研究了氧化脂质代谢基因中的 35 个 SNP，例如环氧合酶 ( PTGS ) 和脂氧合酶 ( A LOX )，以及已经与阿司匹林降低结肠直肠癌风险相关的 7 个 SNP（例如 TP53；rs104522），是否改变了阿司匹林和 EPA 对结肠直肠息肉复发的影响。通过对 SNP 基因型结肠直肠息肉风险进行负二项式和泊松回归分析，将治疗效果报告为发病率比 (IRR) 和 95% 置信区间 (CI)。统计显著性通过调整 P 值和 q 值以错误发现率表示。542 名（共 707 名）试验参与者同时具有基因型和结肠镜检查结果数据。与未服用阿司匹林的人相比，服用阿司匹林的人结肠息肉风险降低仅限于 rs4837960（PTGS1）常见纯合子[IRR，0.69；95% 置信区间 (CI)，0.53 – 0.90)；q = 0.06]、rs2745557（PTGS2）复合杂合子稀有纯合子
抑制剂和5-脂氧合酶之间的相互作用
摘要：炎症是由外部刺激触发的一种保护应力反应，5-脂氧合酶（5LOX）作为白细胞素（LTS）炎症途径的有效介质起着关键作用。Nordihydroguaiarovicac（NDGA）充当5LOX的天然正常抑制剂，而3-乙酰基-11-酮β-β-β-β-β-oboswordic Acid（AKBA）起着天然的变构抑制剂的靶向5LOX。但是，抑制的确切机制尚不清楚。在这项研究中，使用高斯加速分子动力学（GAMD）模拟来阐明5LOX上NDGA和AKBA的抑制作用机制。发现正构抑制剂NDGA紧密结合在蛋白质的活性口袋中，占据了活性位点，并通过竞争性抑制抑制了5LOX酶的催化活性。变构抑制剂AKBA的结合引起了远端活性位点的显着变化，从而导致残基168-173从环向α-螺旋变为α-螺旋，以及残基285-290和375-400之间的显着负相关运动，从而减少了这些细分之间的距离。在模拟中，蛋白质稳定构象中的活性腔体积减少，阻碍了底物进入活性腔，从而通过变构效应抑制了蛋白质活性。最终，Markov状态模型（MSM）用于识别和分类蛋白质的亚稳态状态，从而揭示了不同构象状态之间的过渡时间。总而言之，这项研究提供了Akba和NDGA对5LOX抑制机制的理论见解，为开发专门针对5LOX的新型抑制剂提供了新的观点，对抗炎药发育具有潜在的影响。
通过基因组编辑删除脂氧合酶基因的大豆......
大豆突变体 lox3 具有 Lox3 基因座中的突变等位基因，是利用 CRISPR/Cas9 系统通过定点诱变生成的。为了评估种子中 LOX3 活性降低的影响，检测了 lox3 在温度胁迫下的发芽能力。在所有温度条件下，lox3 种子都比野生型种子发芽更早。随着温度的升高，这种差异变得更加明显。随后，为了模拟种子的长期储存，通过将种子暴露在高温高湿条件下进行老化处理。虽然大多数野生型种子在老化处理后没有发芽，但大约 80% 的 lox3 种子发芽了。这表明 LOX3 活性的降低导致种子对长期储存的耐受性增强。为了阐明生理机制，对老化处理后的种子进行了测量，测量了通常用于评估脂质过氧化的丙二醛 (MDA) 含量。lox3 样品中的 MDA 含量低于野生型样品。这一结果表明 lox3 种子中的脂质过氧化降低了。为了评估基因表达水平，对 lox3 和野生型样本进行了转录组分析。转录组分析显示，野生型种子中应激反应基因的表达增加。这表明野生型种子比 lox3 种子受到的应激更严重。因此，我们证明种子中 LOX 活性的降低可能即使在高温胁迫或种子长期储存下也能保持发芽能力。日本大豆蛋白研究 23，35-40，2020。
12-脂氧合酶抑制可延缓人类基因替代小鼠自身免疫性糖尿病的发作
简介 1 型糖尿病 (T1D) 的发病机制涉及胰岛内多种细胞类型之间的复杂相互作用，包括先天免疫细胞（巨噬细胞、树突状细胞）、胰岛素分泌细胞（β 细胞）和适应性免疫细胞（T 细胞、B 细胞）(1)。尽管传统上认为该疾病是由免疫耐受的原发性缺陷引起的，但一种新兴观点认为，环境因素（如病毒或其他全身性炎症性疾病）可能会加剧巨噬细胞和 β 细胞之间的相互作用，促进 β 细胞中的氧化和内质网 (ER) 应激途径 (2–4)。这些途径促进 β 细胞新表位的产生，进而引发适应性自身免疫 (5, 6)。疾病改良疗法（改变疾病发病机制而不是纠正潜在疾病表型的疗法）主要集中于适应性免疫系统，并在临床试验中取得了一些成功。例如，针对活化 T 细胞的抗 CD3 单克隆抗体 (teplizumab) 已被证明可将高危人群的 1 型糖尿病发病时间延迟长达 2 年 (7)。鉴于先天免疫细胞和 β 细胞在 1 型糖尿病早期发病机制中的作用越来越受到重视，针对这些细胞类型的药物的鉴定提出了联合治疗方法可能提供更持久疗效的可能性。脂氧合酶 (LOX) 包含一个参与脂质代谢的酶家族，可促进多不饱和脂肪酸的氧合形成二十烷酸，其中一些具有促炎性质 (8)。在小鼠中，12/15-LOX 由 Alox15 基因编码，是巨噬细胞和 β 细胞中存在的主要活性 LOX，并产生促炎性二十烷酸 12-羟基二十碳四烯酸 (12-HETE) 作为底物花生四烯酸的主要产物 (9)。 Alox15 的整体删除
硫化物依赖性噻唑合酶耐氧性的定向进化
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可下可用（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2022 年 10 月 16 日发布。；https://doi.org/10.1101/2022.10.16.512417 doi：bioRxiv 预印本
用于筛选环氧合酶的分子对接分析...
炎症反应在肿瘤发生和癌变中都起着重要作用。在这项研究中，乳酸乳球菌亚乳球菌的继发代谢产物化合物。乳酸（LAC3），并通过分子对接和分子动力学（MD）分析筛选对COX-2受体的潜在抑制活性。抗炎剂Mofezolac和布洛芬用作阳性对照配体。结果表明5--（（4-氨基-6-氨基-4-甲氧蛋白-4-基-1,3,5-三嗪-2-基）氨基）氨基] -2-甲基苯甲磺酸盐的甲基苯甲酸酯，该氢键在活性位点的Cox-2的Cox-2具有–9.0 kcal/mol/mol/mol/mol的亲和力的活性位点Tyr385。是COX-2抑制剂的另一个候选者，被指定为3-吲哚丙酸，在COX-2的重要残基Ser530上结合氢，亲和能量为–6.9 kcal/mol。确认结合特异性，还针对COX-1进行了分子对接分析。使用MD模拟确认结合稳定性和灵活性。此外，根据Lipinski的规则和煮熟的蛋型建模预测了潜在配体的毒性和溶解度。5- [（（4-氨基-6-甲酚-4-基-1,3,5-三嗪-2-基）氨基] -2-甲基苯甲磺酸盐磺酸盐表明，通过胃肠道无源吸收的倾向倾向，而三3- indolopropropropropropionic Acid a intolointestinal tract均表现出较高的血液中脑溶液的概率。总而言之，这项研究通过分子对接分析确定了潜在化合物，该分析可以作为COX-2抑制剂开发。
尿嘧啶DNA糖基酶产品处理指南
储存和稳定性： 尿嘧啶 DNA 糖基酶采用干冰或蓝冰运输。到货后储存于 -20°C 下，以获得最佳稳定性。 有效期： 在外包装盒标签上的有效期内，在推荐条件下储存并正确处理时，试剂盒可保持完整活性。 单位定义： 一个单位是指每分钟催化含尿嘧啶双链 DNA 释放 60 pmol 尿嘧啶的酶量。通过 37°C 下 30 分钟内在含有 0.2 mg DNA （ 10 4 -10 5 cpm/mg ）的 50 mL 反应预混液中释放 [ 3 H]- 脲嘧啶来测量活性。 安全预防措施： 处理试剂前请阅读并理解 SDS （安全数据表）。首次发货时提供 SDS 的纸质版文件，此后可应要求提 供。 质量控制： Meridian 遵守 ISO 13485 质量管理体系运行。尿嘧啶 DNA 糖基酶在放行前经过广泛的活性测试。
新型糖基化酶碱基编辑器(GBE
Anzalone, AV、Koblan, LW 和 Liu, DR (2020)。使用 CRISPR–Cas 核酸酶、碱基编辑器、转座酶和主要编辑器进行基因组编辑。《自然生物技术》，1-21。
