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摘要：炎症是由外部刺激触发的一种保护应力反应，5-脂氧合酶（5LOX）作为白细胞素（LTS）炎症途径的有效介质起着关键作用。Nordihydroguaiarovicac（NDGA）充当5LOX的天然正常抑制剂，而3-乙酰基-11-酮β-β-β-β-β-oboswordic Acid（AKBA）起着天然的变构抑制剂的靶向5LOX。但是，抑制的确切机制尚不清楚。在这项研究中，使用高斯加速分子动力学（GAMD）模拟来阐明5LOX上NDGA和AKBA的抑制作用机制。发现正构抑制剂NDGA紧密结合在蛋白质的活性口袋中，占据了活性位点，并通过竞争性抑制抑制了5LOX酶的催化活性。变构抑制剂AKBA的结合引起了远端活性位点的显着变化，从而导致残基168-173从环向α-螺旋变为α-螺旋，以及残基285-290和375-400之间的显着负相关运动，从而减少了这些细分之间的距离。在模拟中，蛋白质稳定构象中的活性腔体积减少，阻碍了底物进入活性腔，从而通过变构效应抑制了蛋白质活性。最终，Markov状态模型（MSM）用于识别和分类蛋白质的亚稳态状态，从而揭示了不同构象状态之间的过渡时间。总而言之，这项研究提供了Akba和NDGA对5LOX抑制机制的理论见解，为开发专门针对5LOX的新型抑制剂提供了新的观点，对抗炎药发育具有潜在的影响。
抑制剂和5-脂氧合酶之间的相互作用
主要关键词
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