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了解目标蛋白质降解
1. 什么是蛋白质？它们有什么作用？：MedlinePlus Genetics。访问日期：2021 年 5 月 3 日。https://medlineplus.gov/genetics/understanding/howgeneswork/protein/ 2. Klaips CL、Jayaraj GG、Hartl FU。衰老和疾病中的细胞蛋白质稳态途径。J Cell Biol。2017；217(1):51-63。doi:10.1083/jcb.201709072 3. Ciechanover A。蛋白水解：从溶酶体到泛素和蛋白酶体。Nat Rev Mol Cell Biol。2005；6(1):79-87。doi:10.1038/nrm1552 4. Oprea TI、Bologa CG、Brunak S 等人。人类基因组中未探索的治疗机会。天然药物发现评论。2018；17(5):317-332。doi:10.1038/nrd.2018.14 5. Hopkins AL、Groom CR。可用药基因组。天然药物发现评论。2002；1(9):727-730。doi:10.1038/nrd892 6. Collins I、Wang H、Caldwell JJ、Chopra R。通过调节泛素-蛋白酶体途径进行靶向蛋白质降解的化学方法。Biochem J。2017；474(7):1127-1147。doi:10.1042/BCJ20160762 7. Ito T、Ando H、Suzuki T 等人。确定沙利度胺致畸性的主要靶点。Science。 2010;327(5971):1345-1350。doi:10.1126/science.1177319 8. Krönke J、Udeshi ND、Narla A 等。来那度胺可导致多发性骨髓瘤细胞中 IKZF1 和 IKZF3 选择性降解。Science。2014;343(6168):301-305。doi:10.1126/science.1244851 9. Lu G、Middleton RE、Sun H 等。骨髓瘤药物来那度胺可促进 cereblon 依赖性 Ikaros 蛋白破坏。Science。2014;343(6168):305-309。 doi:10.1126/science.1244917 10. Gandhi AK、Kang J、Havens CG 等。免疫调节剂来那度胺和泊马度胺通过调节 E3 泛素连接酶复合物 CRL4(CRBN.) 诱导 T 细胞阻遏物 Ikaros 和 Aiolos 降解，从而共刺激 T 细胞。Br J Haematol。2014；164(6):811-821。doi:10.1111/bjh.12708 11. Chamberlain PP、Lopez-Girona A、Miller K 等。人类 Cereblon–DDB1–来那度胺复合物的结构揭示了对沙利度胺类似物反应的基础。Nat Struct Mol Biol。2014；21(9):803-809。 doi:10.1038/nsmb.2874 12. Ito T, Handa H. Cereblon 及其下游底物作为免疫调节药物的分子靶点。Int J Hematol。2016；104(3):293-299。doi:10.1007/s12185-016-2073-4 13. Matyskiela ME, Lu G, Ito T 等人。一种新型 cereblon 调节剂将 GSPT1 募集到 CRL4 CRBN 泛素连接酶中。Nature。2016；535(7611):252-257。doi:10.1038/nature18611 14. Chamberlain PP, Cathers BE。Cereblon 调节剂：低分子量蛋白质降解诱导剂。Drug Discov Today Technol。 2019；31：29-34。doi：10.1016/j.ddtec.2019.02.004 15. Baek K、Schulman BA。分子胶概念固化。Nat Chem Biol。2020；16(1)：2-3。doi：10.1038/s41589-019-0414-3 16. Scheepstra M、Hekking KFW、van Hijfte L、Folmer RHA。药物发现中用于蛋白质降解的双价配体。Comput Struct Biotechnol J。2019；17：160-176。doi：10.1016/j.csbj.2019.01.006
食物和饲料的替代蛋白质；程序
德国联邦风险评估研究所（BFR）是德国联邦食品和农业部（BMEL）投资组合中的科学独立机构。它就食品，化学和产品安全性问题建议联邦政府和联邦州（“ laender”）。BFR对与其评估任务密切相关的主题进行了自己的研究。
使用蛋白质序列和结构
抗生素传统上用于治疗细菌感染。但是，细菌可以对药物产生免疫力，使其无效，从而对全球健康构成严重威胁。识别和分类负责这种抗药性的基因对于预防，诊断和治疗感染以及对其机制的理解至关重要。为此目的开发的先前方法主要是基于序列的，这取决于与现有数据库或经过序列特征训练的机器学习模型的比较。但是，具有可比功能的基因可能并不总是具有相似的序列。因此，在本文中，我们开发了一种深度学习模型，该模型使用蛋白质结构作为对序列的补充来对新型抗生素抗生素抗生素基因（ARGS）进行分类，我们期望与单独的序列相比，该抗生素抗生素抗生素的基因（ARGS）提供了更多的有用信息。建议的方法包括两个步骤。首先，我们利用了备受瞩目的字母模型，以预测其氨基酸序列的3D结构。然后，我们使用基于变压器的蛋白质语言模型来处理序列，并将图神经网络应用于从结构中提取的图。我们在标准基准数据集上评估了所提出的体系结构，我们发现它以优于最先进的方法。
蛋白质的定性分析旨在识别...
o布拉德福德测定法：库马西亮蓝色G-250染料试剂。o用于BCA测定：BCA试剂A和B，CUSO₄解决方案。o用于洛瑞测定法：碱性铜试剂，叶核酸试剂。o用于紫外线吸收：磷酸盐缓冲盐水（PBS）或其他合适的缓冲液。4。微板读取器或分光光度计5。移液器和移液器提示6。测试管或微板井7。卧式（用于UV吸收方法）8。Vortex Mixer 9。孵化器（对于某些测定）10。蒸馏水
大麻素蛋白质综合征
摘要随着越来越多的州将大麻素产品合法化，用于娱乐用途和药物目的，大麻素蛋白质综合征的流行率变得越来越普遍。然而，对于许多医疗保健提供者以及最有效的治疗方法，它仍然无法识别。大麻素蛋白质综合征最常见于几个月至几年的慢性每日大麻中呈现情节性呕吐。患者经常抱怨通过服用热水淋浴或洗澡来改善恶心和腹痛。症状在6-12个月的时间内停止使用大麻会缓解症状。急性攻击的治疗通常由住院环境中的肠胃外苯并二氮卓类药物组成。长期管理和预防进一步攻击的三环抗抑郁药，例如阿米替林，剂量范围为50-200 mg/d。一旦患者缓解，阿米替林就可以缓慢锥形。随着大麻在美国大陆上的广泛使用和接受，因此必须对大麻素蛋白质综合征和治疗策略进行诊断的教育。
蛋白质生产的无细胞未来
尽管自发现遗传密码（9）以来，无细胞的系统就已经存在，但其产量低，无法正确实施PTM，并且缺乏可伸缩性限制了其主要用于研究实验室的使用。通过克服这些广泛采用的这些关键障碍，像爱丽丝这样的多功能细胞系统开始改变蛋白质生产中的当前范式。实现可伸缩性是朝着这一目标迈出的重要一步。快速合成能力，以及它们大规模表达广泛功能蛋白的能力，无细胞的系统设置为重新定义生物制造。