检测DNA甲基化的常见方法使用硫酸盐或酶将未甲基化的C转换为在测序数据中读取为T。这导致核苷酸多样性低的文库很难对齐。亚硫酸盐治疗损害DNA的恶劣条件,在基因组数据中留下了很大的差距。Illumina 5基本化学直接以简单的单步直接将5MC转换为t,该步骤非启示DNA并保留了库复杂性。
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摘要 MRI 已被广泛用于识别自闭症谱系障碍 (ASD) 的解剖和功能差异。然而,许多这些发现已被证明难以复制,因为研究依赖于小规模的队列,并且建立在许多复杂、未公开的分析选择之上。我们进行了一项国际挑战,以根据 MRI 数据预测 ASD 诊断,我们提供了来自 2,000 多人的预处理解剖和功能 MRI 数据。对预测的评估是严格盲测的。146 名挑战者提交了预测算法,这些算法在挑战结束时使用未见数据和额外的采集站点进行了评估。对于最佳算法,我们研究了 MRI 模式、大脑区域和样本量的重要性。我们发现证据表明 MRI 可以预测 ASD 诊断:10 个最佳算法可靠地预测了诊断,AUC~0.80 - 远远优于目前使用 20 倍大队列中的基因分型数据可以获得的结果。我们观察到功能性 MRI 对预测比解剖性 MRI 更重要,并且增加样本量可以稳步提高预测准确性,从而为改进生物标志物提供了一种有效的策略。我们还观察到,尽管有强烈的动机将其推广到看不见的数据,但给定数据集上的模型开发面临着过度拟合的风险:在现有数据的交叉验证中表现良好,但不能推广。最后,我们能够在挑战结束后添加的外部样本 (EU-AIMS) 上预测 ASD 诊断,尽管预测准确性较低 (AUC=0.72)。这表明,尽管基于大型多站点队列,但我们的挑战仍然产生了在数据集变化面前脆弱的生物标志物。
蓝藻是唯一已知的光合原核生物,是一种古老的生物,被认为是地球氧气大气的生产者和植物叶绿体的祖先。当代蓝藻已进化为广泛多样的生物,在大多数水生和土壤生物圈中定居,它们面临着各种环境挑战以及与其他生物的竞争或共生。蓝藻表现出广泛的形态多样性(单细胞/多细胞、圆柱形/球形),许多物种分化出专门的细胞以在恶劣条件下生长和生存。它们高效地转化捕获的太阳能,将大量二氧化碳中的碳固定为巨大的生物质,以维持大部分食物链,并且它们能够耐受气流中高浓度的二氧化碳。它们还合成大量生物活性代谢物,对人类健康和工业具有重要意义。因此,由于其简单的营养需求、代谢稳健性和可塑性以及某些模型菌株的强大基因,它们被视为有前途的“低成本”细胞工厂,可用于碳中性化学品的生产。
随后,这些组织样本在加州大学圣地亚哥分校的 Hibbs 实验室和最近开放的 Goeddel Family Technology Sandbox 进行分析,该实验室配备了先进的低温电子显微镜 (cryo-EM) 仪器。低温电子显微镜快速冷却组织,将样本“冻结”在原地,从而以新的方式可视化其他方式无法实现的复杂细节。研究人员还使用电生理学测量 GABA A 受体如何发挥作用以及对药物的反应。
[1] Abdullah X. Ali、Meredith Ringel Morris 和 Jacob O. Wobbrock。2019 年。Crowdlicit:一种用于开展分布式最终用户诱导和识别研究的系统。2019 年 CHI 计算机系统人为因素会议论文集。ACM,美国纽约州纽约,1-12。https://doi.org/10.1145/3290605.3300485 [2] Khalil J. Anderson、Theodore Dubiel、Kenji Tanaka、Marcelo Worsley、Cody Poultney 和 Steve Brenneman。2019 年。化学舱:一种用于课堂的多模式实时回顾工具。2019 年国际多模式交互会议(ICMI '19)论文集。 ACM,纽约,纽约州,美国,506–507。https://doi.org/10.1145/3340555.3358662 [3] Muhammad Zeeshan Baig 和 Manolya Kavakli。2020 年。多模态系统:分类、方法和挑战。arXiv:2006.03813 [cs.HC]
通过茎/接头区域控制微管相关蛋白的含力特性:来自NDC80复合体Ilya B. Kovalenko的见解俄罗斯莫斯科的莫斯科州立大学Lomonosov;中国深圳市MSU-BIT大学B深圳; C俄罗斯莫斯科物理学药理论理论问题中心。*应将通信发送至p.s.o和n.b.g(orekhov_p@smbu.edu.cn,ngudimch@gmail.com)在机械载荷下许多微管相关蛋白(MAPS)功能。在其中,运动蛋白和被动耦合器将微管与其他细胞骨骼细丝,膜结构和不同的支架联系起来,以实现细胞形状的变化,运动和其他重要过程。NDC80的键动力学复合物将力从微管拆卸到细胞分裂期间的染色体运动。最近,与沿正端方向拉动相比,当朝着微管的负末端拉动时,该复合物已被证明可以更容易从微管脱离。在这里,我们使用了粗粒的分子动力学和布朗动力学模拟来解释方向载荷对从微管的NDC80复合物解开的不对称效应,然后将我们的发现概括为其他地图。我们发现,由朝向微管的正端倾斜的NDC80的僵硬茎产生的杠杆臂对于这种复合物的不对称解开至关重要,类似于Dynein的络合物。,EB蛋白,微管交联PRC1和驱动蛋白预计缺乏明显的解体不对称性,这是由于它们几乎垂直于微管壁上的垂直锚固,或者是由于其接头区域的较高灵活性与微管结构域紧密相关。因此,我们的研究突出了地图的一些设计原理,并解释了它们的远端部分如何赋予,调节或消除解开外部载荷方向的依赖性。此信息加深了我们对载荷特性和各种图的功能的理解,并可能指导具有预定义机械特性的合成蛋白系统的设计。
双相情感障碍 (BD) 是一种复杂的精神健康状况,其特征是情绪和精力发生剧烈变化,这种变化可能非常明显,以致于扰乱患者处理日常任务的能力,甚至使日常活动也感到难以承受 ( 1 )。双相情感障碍躁狂发作的早期症状之一是性欲亢进 ( 2 )。受此病影响的患者往往性欲增强,远远超出社会预期,这可能导致冲动甚至危险的性行为 ( 2 )。双相情感障碍患者性欲亢进的确切病因尚不完全清楚,但可能与躁狂发作期间大脑化学变化和激活的奖赏通路有关。多巴胺、内啡肽和催产素等改善情绪的神经递质激增,会产生强烈的愉悦感,这可能会驱使患者寻求性唤起 ( 3 )。躁狂期的性欲亢进可能是激素失衡以及雌激素与睾酮相互作用所致 ( 3 )。
摘要:大量研究报告称,在肥胖、2 型糖尿病 (T2D) 和衰老中,循环和组织脂质含量升高与代谢紊乱之间存在关联。这种不受控制的组织脂质积累状态被称为脂毒性。后来发现,过量的脂质通量主要在脂质滴中以甘油三酯的形式中和,而几种生物活性脂质种类,如二酰甘油 (DAG)、神经酰胺及其衍生物,通过拮抗胰岛素信号和作用在肝脏和骨骼肌等代谢器官中,与胰岛素抵抗 (IR) 的发病机制有机制上的联系。骨骼肌和肝脏是体内葡萄糖处理的主要部位,这些组织中的 IR 在 T2D 的发展中起着关键作用。在这篇综述中,我们批判性地审查了最近的文献,这些文献支持 DAG 和神经酰胺在 IR 发展中的因果作用。特别强调了转基因小鼠模型对总 DAG 和神经酰胺池的调节,以及对特定亚种的调节,与胰岛素敏感性的关系。总的来说,尽管大量研究都得出了 DAG 和神经酰胺都会导致代谢器官 IR 的结论,但它们的作用机制仍然存在一些不确定性。最近的研究表明,亚细胞定位和酰基链组成是这些脂毒性脂质生物活性的决定因素,应进一步研究。