背景:胶质母细胞瘤(GBM)的治疗一直非常具有挑战性,不仅是由于存在血脑屏障(BBB),而且还因为对耐药性的敏感性。最近,簇状的定期间隔短的短质体重复序列(CRISPR) - 相关蛋白9(CRISPR/CAS9)彻底改变了基因编辑技术,并且能够治疗包括人类肿瘤在内的各种遗传疾病,但缺乏安全且有效的靶向靶向输送系统,尤其是在中枢神经系统中,尤其是在中枢神经系统中(CNS)。方法:构建了脂质聚合物杂化纳米颗粒(LPHNS-CRGD),用于靶向O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)的CRISPR/CAS9质粒的效率和靶向递送,这是一种药物抗性基因至替莫佐利瘤(TMZ)。聚焦的超声(FUS) - 微泡(MB)用于非侵入性和局部打开BBB,以进一步促进基因在体内递送到胶质母细胞瘤中。在体外和体内评估了基因编辑效率和药物敏感性的变化。结果:成功合成了基因的LPHNS-CRGD,可以保护PCAS9/MGMT免受酶降解。lphns-crGD可以靶向GBM细胞,并通过pCAS9/MGMT的转染以下调MGMT的表达,从而提高了GBM细胞对TMZ的敏感性。MBS-LPHNS-CRGD复合物可以安全地增加BBB的螺旋性,并在体内fus辐照,并促进纳米颗粒在正常肿瘤的小鼠中的肿瘤区域的积累。关键字:CRISPR/CAS9,LPHN,FUS,微泡,胶质母细胞瘤此外,FUS辅助的MBS-LPHNS PCAS9/MGMT -CRGD增强了TMZ在胶质母细胞瘤中的治疗作用,抑制了肿瘤的生长,并具有高水平的生物保护症。结论:在这项工作中,我们构建了用于靶向CRISPR/CAS9系统的LPHNS-CRGD,并与FUS-MBS结合使用以打开BBB。MBS-LPHNS-CRGD递送系统可能是有效靶向基因递送以治疗胶质母细胞瘤的替代方法。
脂质,包括脂肪和油,高度降低。当脂质分解代谢时,与碳水化合物或蛋白质相比,它具有每克每克的电子对,因此能量更多的潜力(1)。这个过程是由酶脂肪酶引起的,并且具有酶脂肪酶的生物称为脂肪溶解生物。产生脂肪酶的微生物的生长会导致牛奶和高脂肪乳制品的风味。脂肪酶作用释放的一些游离脂肪酸具有低风味阈值,并且可以在低浓度下赋予腐烂的味道。精神蓝色琼脂,以检测和枚举脂解微生物。这是一种基础培养基,添加了脂类底物,以检测,枚举和研究脂解微生物。在starr之前实践中的制剂,包括染料作为脂解的指标有时是对微生物的抑制作用。starr表现出蓝色的蓝色,是脂解的理想指标,可视化为殖民地周围清晰的光环。介质中的胰酮和酵母提取物是碳,氮,维生素和矿物质的来源。精神蓝色是一种染料,充当脂解的指标。建议用作脂质源的脂肪酶试剂是棉花粉,奶油,橄榄油等。可以通过在400毫升温暖的蒸馏水中溶解10克相思或1毫升多氧化盐,加入100毫升棉花或橄榄油并剧烈搅拌以乳化而制备令人满意的乳液。
arrowia lipolytica 属于子囊菌门、酿酒菌亚门和双足菌科 (1)。除了工业用途 (2) 之外,Y. lipolytica 还广泛存在于食品、环境和动物中 (1)。由于其能够在 32°C 以上不稳定地生长,因此通常认为该菌种可安全用于工业用途 (1)。Yarrowia lipolytica 是一种机会性病原体,可引起侵袭性念珠菌病 (3)。在体外,该菌种被认为对氟康唑敏感 (4)。第一个 Y. lipolytica 基因组 (CLIB122) 于 2004 年发布 (5)。我们报告了对氟康唑有抗性的 Y. lipolytica 临床分离株的基因组草图,该分离株是从溃疡性结肠炎手术后的血培养中采集的。有趣的是,尽管之前曾接触过唑类药物,但使用梯度浓度试纸法(Etest;bioMérieux),该菌株的氟康唑 MIC 为 0.256 mg/mL。患者成功地用卡泊芬净治疗。该菌株在 35°C 的显色琼脂平板(CAN2;bioMérieux)上生长,并使用 Vitek 基质辅助激光解吸电离 - 飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 仪器(bioMérieux)进行鉴定。在溶菌酶细胞壁消化后,使用 QIAmp DNA minikit(Qiagen)提取基因组 DNA。使用 Illumina DNA 制备标记试剂盒(Illumina)构建文库。简而言之,使用珠状转座子技术和集成 DNA 技术 (IDT) 的 Illumina DNA/RNA 独特双重 (UD) 索引集将 30 ng 总 DNA 片段化并进行索引。使用 Qubit 高灵敏度试剂盒 (Thermo Fisher Scienti ) 对文库进行扩增、纯化和定量。最后,将 9 pM 汇集和变性文库放入 2 250-bp v2 试剂盒 (Illumina) 中,并使用 MiSeq 仪器 (Illumina) 进行测序。使用 CLC Genomics Workbench v22.0 (Qiagen) 中的 Trim Reads v2.5 和 De Novo Assembly v1.5 工具对原始读取进行修剪、组装成重叠群并进行搭建。使用覆盖率与长度图丢弃覆盖率为 , 10 且长度为 , 500 bp 的重叠群 (6)。使用 QUAST v5.0.2 对最终的 scaffold 集进行质量分析 (7)。总基因组大小为 20,255,408 bp,分布在 521 个 scaffold 上(覆盖率为 100 ),N 50 值为 105 kbp(最长 scaffold,397 kbp),GC 含量为 49.03%。AUGUSTUS v3.4.0 (8) 使用白色念珠菌训练数据集预测了 6,151 个蛋白质编码基因,使用 tRNAscan-SE 2.0 检测到了 484 个 tRNA 基因 (9)。使用 BUSCO v5.3.2 和 saccharomycetes_odb10 谱系数据集 (10) 估计基因组完整性为 95.3%。平均核苷酸同一性 (ANI) 计算
摘要:γ-癸内酯作为重要的香料原料,在食品工业中有着广泛的应用。6个过氧化物酶体酰基辅酶A氧化酶(POX)是解脂耶氏酵母中γ-癸内酯代谢的限速酶,但该家族各成员的功能均存在诸多未解决的问题,限制了γ-癸内酯的菌株优化和工业产能效率。本研究在对POX1~POX6的ORF及Flanking序列保守性分析的基础上,基于Cre/LoxP系统设计特异性较高的基因敲除验证引物,基于CRISPR/Cas9系统筛选出2个特异性较高的靶位,实现解脂耶氏酵母POX3基因的特异性敲除,旨在探究POX3的功能,进而细化γ-癸内酯的生产工艺。该研究结果为γ-癸内酯的微生物生产能力提供了新的基因工程设计思路,深入揭示POX基因家族的功能,有助于优化γ-癸内酯的生产效率,为工业化应用奠定理论基础。
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抗体自然产生了免疫系统为与入侵入侵者作斗争的保护蛋白。几个世纪以来,它们已被人为地生产并用来消除各种传染病。鉴于Covid-19-Pandemics在全球范围内构成的持续威胁,抗体已成为防止感染和挽救数百万生命的最有前途的治疗方法之一。当前,在计算机技术中,为开发抗体提供了一种创新的方法,从而显着影响抗体的制剂。这些技术通过使用计算工具和算法开发了针对诸如SARS-COV-2等疾病的特异性和效力的抗体。用于设计和开发抗体的常规方法通常是昂贵且耗时的。但是,在计算机方法中,提供了一种当代,有效和经济的范式来创建下一代抗体,尤其是根据生物信息学的最新发展。通过利用多种抗体数据库和高通量方法,可以在硅中设计独特的抗体构建体,从而促进精确,可靠和安全的抗体开发,以供人类使用。与传统上开发的等效物相比,大量由硅固定的抗体已迅速发展为临床试验,并更快就可以使用。本文通过使他们可以访问有关抗体创建的计算方法的当前信息,从而帮助研究人员更快,更迅速地开发SARS-COV-2抗体。
铃木隆之 东京大学艺术与科学研究生院 tkykszk@g.ecc.u-tokyo.ac.jp,https://tkykszk.net