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三重阴性乳腺癌干细胞途径中的药物靶标识别：使用布尔网络对基因调节途径的计算研究
抽象的三阴性乳腺癌（TNBC）是一种侵略性的乳腺癌形式，与年龄的年龄相关，转移的倾向更大，临床结果较差。IT占新诊断的乳腺癌病例的10％至20％，并不成比例地影响非裔美国人种族的个人。虽然TNBC对化学疗法敏感，但也容易复发。这是因为化学疗法成功地靶向原发性TNBC肿瘤细胞，但通常无法靶向TNBC干细胞的亚群。TNBC干细胞显示出癌性特征，例如细胞周期进展，生存，增殖，凋亡抑制和上皮 - 间质转变。研究了TNBC干细胞的癌症启动行为，我们使用布尔网络（BN）研究了它们的潜在信号通路。bns可有效捕获信号通路中发生的因果相互作用。我们从途径文献中建立了BN，并用它来评估11种靶向抑制性药物在抑制癌症促进基因方面的效果。我们在通路具有单个或多个突变时模拟了BN，一次最多三个突变。我们的发现表明STAT3，GLI和NF-κB是最佳抑制靶标。这些基因是途径中癌症基因的已知调节因子，因此我们的模型与现有的生物学文献一致。因此，抑制这三个基因具有预防TNBC复发的潜力。此外，我们的研究发现，随着途径中突变的增加，药物效率降低。此外，我们注意到药物的组合比单一药物更好。
钴介导氨基喹啉导向苯甲酰胺脱氢二聚化的机制细节
调查。加深对这些转化的根本理解有助于设计更有效、选择性更强、成本更低的催化剂，用于第一排过渡金属介导的脱氢联芳烃合成。在这里，我们受到 Daugulis 等人（方案 1a）16 关于钴介导的 AQ 苯甲酰胺自偶联的初步报告的启发，开展了一项联合实验和计算研究，以阐明该反应的机理和控制因素。这项工作补充并补充了越来越多的探索钴介导有机转化的机理和理论研究，这些研究突出了 Co 复合物计算研究中涉及的多个挑战，包括低位多电子和自旋态以及色散相互作用的重要作用。18 – 24
基于石墨烯的纳米载体：一项计算研究Niyazi Bulut Firat University，科学系，物理系，Elazig-Türkiye电子邮件：
在本演讲中，我将首先引入石墨烯，并提供范德华骨料的概述以及分散力在分子系统中的作用，然后讨论从头算电子结构计算，概述标准计算技术，例如密度功能理论（DFT）及其相关的计算成本。谈话还将专注于使用分析公式的分子间电位的表示，并将这些方法应用于日益复杂的分子系统。最后，我将描述用于精确模拟DFT函数基准测试的计算方法。此外，我将分析对总体相互作用能量的物理贡献，从而提供有关选择适当功能的见解，以优化石墨烯作为纳米载体的性能。
针对 SARS-CoV-2 主要蛋白酶和刺突糖蛋白模型对近期 FDA 批准的抗癌药物进行潜在探索：一项计算研究
摘要：COVID-19 已成为全球几乎所有国家医疗保健系统的全球风险，该病毒起源于中国武汉。迄今为止，尚无可用于治疗该疾病的特定药物。SARS-CoV-2 的确切来源尚不清楚，尽管早期病例与华南华南海鲜市场有关。本文报告了最近 FDA 批准的抗癌药物（Capmatinib、Pemigatinib、Selpercatinib 和 Tucatinib）的计算机分子建模，以了解它们对 COVID-19 靶标的抑制作用。将选定的抗癌药物对接在 SARS-CoV-2 主蛋白酶（PDB ID：6LU7）和 SARS-CoV-2 刺突糖蛋白（PDB ID：6M0J）上，以确定这些药物的结合能力。评估了药物的 ADMET 参数，此外，还进行了 DFT 计算以研究药代动力学、热参数、偶极矩和化学反应性描述符。讨论了对接能 (ΔG) 和相互作用的氨基酸残基。已经得出了有希望的分子对接结论，证明了所选抗癌药物具有开发用于对抗 COVID-19 的合理药物的潜力。对该药物的进一步优化可能会支持缓解疫情所急需的快速反应。
内部
注意：1。赞助的研究收入包括所有资金，以支持该机构外部所有来源的赠款，合同或捐款形式收到的研究。2。财务数据是从加拿大统计局获得的，除非指出。3。财政2022财政数字可能已随着更准确的信息提供了调整。4。2022-2023学年的教师队长用于计算研究强度 - 每位教师。包括完整/兼职：提供/可用的完整，助理和助理排名。数据是从研究Infosource的加拿大大学研发数据库中获得的。5。学年的研究生入学人数2022-2023用于计算研究强度 - 每位研究生$。包括参加研究生级别（硕士和博士学位）课程和课程的完整和兼职学生，导致学位，证书或文凭。不包括参加与健康相关的实习/居住和第一个专业计划的学生。数据是从海上省级高等教育委员会获得的
简历 Helmut G. Katzgraber
量子计算 算法开发和新型计算范式 使用新兴技术（量子、机器学习、HPC、...）解决工业问题 无序系统（自旋、电子、量子、涡旋和结构玻璃） 空间辐射模拟 一般计算研究（冷气体、雪崩和磁滞、单分子磁体等）
附件2023 DGIST研究生院暑期实习生计划实验室
- 基于软件建模，验证和测试的高可靠软件开发的条件 - 为自动驾驶汽车软件安全性 - 生成数字双虚拟环境驾驶方案 - 分布式计算研究，以确保云/边缘计算的可靠性 - 使用VR/AR设备和Unity Game Engine实施交互式软件内容
Abdullah al Ashraf
氨基吡啶（APS）”，2011年9月至2012年2月。该项目基于“ 2、3、4-氨基吡啶的计算研究”。计算化学是解决有趣的化学问题的最有用工具之一。在我的研究项目中，这些AP的电荷密度及其红外频率是通过半经验，AB-Initio（Hartree Fock）和密度函数理论计算理论计算方法通过“高斯-09”软件来计算的。
